Une épidémie à Campylobacter liée au poulet se poursuit au Danemark

« Une épidémie à Campylobacter liée au poulet se poursuit au Danemark », source article de Joe Whitworth paru le 16 janvier 2020 dans Food safety News.

Près de 90 personnes font partie d'une épidémie au Danemark à Campylobacter après avoir consommé de la viande de poulet d’un abattoir.

Le Statens Serum Institut (SSI), l'Administration vétérinaire et alimentaire danoise (Fødevarestyrelsen) et le DTU Food - National Food Institute ont investigué sur l'épidémie à Campylobacter jejuni.

Dans le cadre d'un projet de l'année dernière impliquant le Département de microbiologie clinique (KMA) à Aalborg, l'Administration vétérinaire et alimentaire danoise et SSI, des isolats de Campylobacter provenant de patients diagnostiqués à Aalborg à partir de mars 2019 ont été collectés, envoyés au SSI et le génome complet a été séquencé.

Chute des infections vers la fin de l'année

Les isolats de Campylobacter ne sont pas systématiquement soumis et séquencés, de sorte que l'épidémie a probablement été détectée en raison du projet, selon les responsables. La séquence type 122 de Campylobacter jejuni a été identifiée chez des patients par séquençage du génome complet.

Ce type a également été retrouvé dans de la viande de poulet d'un abattoir appartenant à HKScan à Vinderup, une ville du nord-ouest du Jutland. Les produits de ce site sont vendus dans toutes les grandes chaînes de magasins danoises. Il a été précédemment révélé que l'Administration vétérinaire et alimentaire danoise avait envoyé des agents pour aider l'entreprise à rechercher et à éliminer la source d'infection.

Entre février 2019 et le 9 janvier 2020, 88 patients avec le même type de Campylobacter ont été identifiés. Parmi les malades, 35 femmes et 53 hommes âgés de 2 à 91 ans. L'épidémie semble diminuer avec moins de cas d'infection vers la fin de 2019.

Steen Ethelberg, de SSI, a déclaré que le projet s'est déroulé en 2019 mais se poursuivra sous une forme modérée en 2020. Les isolats humains du laboratoire clinique d'Aalborg seront séquencés en temps réel cette année.

« Nous continuerons à le suivre, mais il est principalement entre les mains de la Danish Veterinary and Food Administration. Il a travaillé avec l'industrie pour contenir et arrêter l'épidémie. Il n'est pas tout à fait clair si elle est finie, mais le nombre de nouveaux cas a diminué », a-t-il déclaré à Food Safety News.

Meilleure compréhension de l'épidémie

Ethelberg a déclaré que le séquençage des isolats de Campylobacter nous avait beaucoup appris, mais que les partenaires du projet n'avaient pas encore eu la chance de se rencontrer, de discuter et de digérer toutes les données. Une publication scientifique est prévue sur les résultats.

« Nous avons eu une reconfirmation du fait que de nombreux cas groupés et d’épidémies jusqu'ici inconnus ont été découverts par le séquençage et que les produits de poulet sur le marché peuvent être associés à une partie de ceux-ci. Nous avons également découvert une énorme épidémie. Nous n'aurions probablement pas compris cela aussi bien que nous le faisons sans le séquençage. »

Campylobacter est la principale cause d'infections intestinales bactériennes au Danemark. En 2019, 5 300 cas ont été enregistrés, en hausse par rapport aux 4 500 infections enregistrées en 2018.

« Campylobacter est une grande préoccupation. Les chiffres ont tendance à augmenter ou à diminuer avec quelques centaines de cas d'année en année, ce qui est probablement une variation naturelle. En 2019, nous pensons qu'une partie de l'explication de l'augmentation est la grande épidémie », a déclaré Ethelberg.

« Les cas que nous avons dénombré sont basés sur le nombre d'isolats séquencés, donc en réalité il pourrait y avoir plusieurs fois plus de cas si nous supposons que l'épidémie a affecté l'ensemble du pays. Et encore une fois, nous n'aurions pas compris cela sans le séquençage. »