jeudi 22 avril 2021

Combien y a-t-il de bulles de CO2 dans un verre de bière?

«Ouvrir le mystère du nombre de bulles dans un verre de bière», source ACS.

Bonne question, mais au fait «Combien y a-t-il de bulles de CO2 dans un verre de bière?», source ACS Omega.

Après avoir versé de la bière dans un verre, des jets de petites bulles apparaissent et commencent à monter, formant une tête mousseuse. Au fur et à mesure que les bulles éclatent, le dioxyde de carbone gazeux libéré confère la saveur souhaitable à la boisson. Mais combien de bulles y a-t-il dans cette boisson? En examinant divers facteurs, les chercheurs rapportant dans ACS Omega estiment qu'entre 200 000 et près de 2 millions de ces minuscules sphères peuvent se former dans une bière blonde légèrement versée.

Dans le monde entier, la bière est l'une des boissons alcoolisées les plus populaires. Les lagers légèrement aromatisées, qui sont particulièrement appréciées, sont produites par un processus de fermentation froide, convertissant les sucres des grains maltés en alcool et en dioxyde de carbone. Lors du conditionnement commercial, plus de carbonatation peut être ajoutée pour obtenir le niveau de pétillement souhaité. C’est pourquoi les bouteilles et les canettes de bière sifflent lorsqu’elles sont ouvertes et libèrent des bulles d’un micromètre de large lorsqu'elles sont versées dans une verre. Ces bulles sont des éléments sensoriels importants de la dégustation de la bière, similaires aux vins effervescents, car elles transportent des composés d'arômes et d'odeurs. La carbonatation peut également chatouiller le nez du goûteur. Gérard Liger-Belair avait précédemment déterminé qu'environ 1 million de bulles se formaient dans une flûte de champagne, mais les scientifiques ne connaissaient pas le nombre créé et libéré par la bière avant qu'elle ne soit plate. Alors, Liger-Belair et Clara Cilindre ont voulu le savoir.

Les chercheurs ont d'abord mesuré la quantité de dioxyde de carbone dissoute dans une bière blonde commerciale juste après l'avoir versée dans un verre incliné, comme le ferait un serveur pour réduire sa mousse de surface. Ensuite, en utilisant cette valeur et une température de dégustation standard de 7°C, ils ont calculé que le gaz dissous s'agrégerait spontanément pour former des courants de bulles partout où les crevasses et les cavités du verre avaient plus de 1,4 µm de largeur. Ensuite, des photographies à grande vitesse ont montré que les bulles augmentaient de volume lorsqu'elles flottaient à la surface, capturant et transportant du gaz dissous supplémentaire dans l'air au-dessus de la boisson. Au fur et à mesure que la concentration de gaz résiduelle diminuait, le bullage cesserait finalement. Les chercheurs ont estimé qu'il pourrait y avoir entre 200 000 et 2 millions de bulles libérées avant qu'une demi-pinte de bière ne disparaisse. Étonnamment, les défauts dans un verre influenceront la bière et le champagne différemment, avec plus de bulles se formant dans la bière par rapport au champagne lorsque de plus grandes imperfections sont présentes, disent les chercheurs.

Les auteurs remercient le financement par le Centre national de la recherche scientifique (CNRS).

Les autorités espagnoles saisissent des tonnes de nourriture destinées aux personnes vulnérables

«Les autorités espagnoles saisissent des tonnes de nourriture destinée aux personnes vulnérables», source Food Safety News.

Les autorités espagnoles ont saisi 176 tonnes de denrées alimentaires dans une organisation à but non lucratif pour non-conformité aux règles de qualité et de sécurité des aliments.

La Guardia Civil a confisqué 176 tonnes de produits, notamment des conserves de légumes, de fruits et de poisson du groupe Amigos de Galicia, basé dans la ville espagnole de La Corogne. La valeur des aliments confisqués a été estimée à plus de 285 000 euros, même si une partie a par la suite été autorisée à être distribuée.

L'opération Phyllos a débuté en décembre 2019 après une inspection par les autorités de Galice auprès de l'organisation appartenant à un réseau chargé de fournir un soutien dans le cadre du Fonds européen d'aide aux plus démunis (FEAD).

Lors de ces inspections, il a été appris que l'une de ces organisations associées à la distribution, qui avait déjà été temporairement expulsé du programme auparavant, distribuait des aliments avec un étiquetage modifié et manipulé, après des altérations présumées du nombre de personnes défavorisées qu'elle déclarait servir.

D'autres inspections ont porté sur le centre logistique et quatre sièges provinciaux de l'organisation. Les autorités ont trouvé 176 tonnes de nourriture du programme qui auraient dû être distribuées aux personnes qui en avaient besoin les années précédentes.

Cela n'avait pas été constaté lors des inspections précédentes dans le cadre du programme et présentait différents types d'irrégularités avec les réglementations sur la qualité et la sécurité des aliments ainsi que la gestion des programmes d'aide, selon la Guardia Civil.

Les vérifications ont déterminé que 70 pour cent des aliments ont été endommagés, ce qui équivaut à environ 122 tonnes de nourriture d'une valeur de plus de 132 000 euros. Cependant, 30 pour cent ont été jugés aptes à la consommation humaine. Ces 54 tonnes ont été distribuées via d'autres associations qui font partie du programme.

Réponse de l'organisation à but non lucratif

Deux personnes ont fait l'objet d'une enquête pour crime contre la santé publique et l'organisation a été empêchée de faire partie du programme FEAD.

En réponse, la Fundación Amigos de Galicia a déclaré que les aliments concernés faisait partie du programme 2015-2016 lorsqu'elle a été suspendue de la distribution de produits dans la province de La Corogne et qu'il n'y avait pas de d'aliments expirés en attente de distribution.

Les travaux dans le cadre du réseau FEAD se sont poursuivis à partir des provinces d'Ourense, Pontevedra et Lugo sans incident et les audits connexes ont été réussis.

La Guardia Civil a scellé une installation en février 2020 à la suite d'une inspection dans le cadre du Fonds espagnol de garantie agraire (FEGA). La marchandise avec une date de consommation appropriée pour la distribution, principalement du thon, a été livrée en février 2021 à d'autres organisations.

La Fundación Amigos de Galicia aide les personnes dans le besoin depuis 1996 et le groupe a déclaré qu'il n'avait jamais reçu de signalement de personnes traitées pour une intoxication alimentaire à cause des aliments livrés.

NB : Une vidéo est dispobible sur ce lien.

Une nouvelle étude met en évidence le risque de Listeria dans les produits de poissons prêts à consommer

Source ECDC
Le blog vous avait proposé une étude en Suisse sur Les poissons fumés, quels risques pour la santé ?

«Une nouvelle étude met en évidence le risque de Listeria dans les produits de poissons prêts à consommer», source article de Joe Whitworth paru le 22 avril 2021 dans Food Safety News, complété par mles soins -aa.

Le risque de Listeria monocytogenes dans les produits de poissons prêts à consommer nécessite une attention supplémentaire, selon une étude tant attendue de l'EFSA et de l'ECDC.

Le Centre européen de contrôle et de prévention des maladies (ECDC), l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) et le Laboratoire de référence de l'Union européenne (EURL) pour Listeria monocytogenes hébergé à Anses, ont lancé la Exercice européen de typage de Listeria (ELiTE) en 2010 pour décrire la listériose chez l'homme et Listeria monocytogenes dans les aliments.

Les chercheurs ont découvert un degré élevé de dissémination de certaines bactéries Listeria dans la chaîne alimentaire et chez les personnes à travers l'Union européenne. Il existait un lien fort avec les produits de poisons prêts à consommer dans plusieurs clusters (cas groupés) identifiés.

Un cluster signifie que les isolats sont génétiquement similaires et proviennent donc probablement d'une source commune. Si les isolats humains et alimentaires sont dans le même groupe, c'est une forte indication que l'aliment peut avoir causé des cas d'infection. Cependant, les résultats microbiologiques à eux seuls ne suffisent pas pour relier les aliments aux cas d'infection, des preuves épidémiologiques étant également nécessaires, selon les auteurs du rapport.

Focus sur les produits de poissons

La prévention et la maîtrise de la contamination par Listeria dans les installations de production de poisson pourraient réduire la contamination des aliments et potentiellement les maladies humaines. Un examen de la conformité des entreprises aux critères microbiologiques devrait également être envisagé, en particulier pour les produits de poissons, selon l'étude.

Les travaux ont porté sur des données de santé publique et des aliments de 13 et 23 États membres de l'UE, respectivement, et ont concerné trois catégories d'aliments prêts à consommer, le poisson fumé à chaud ou fumé à froid ou «gravad» (salé) conditionnés, les fromages à pâte molle ou semi-molle et les produits de viande traités par la chaleur et conditionnés. Au total, 580 isolats humains et 413 isolats alimentaires ont été inclus dans la recherche, la majorité provenant d'échantillons de poissons. D'après les données humaines, au moins 75 personnes sont décédées.

L'étude a utilisé le typage moléculaire, qui est un moyen d'identifier des souches spécifiques de micro-organismes, en examinant leur matériel génétique. La méthode était l'électrophorèse en champ pulsé (PFGE), qui était une approche normalisée et bien établie pendant la période couverte par l'étude.

Le PFGE est maintenant éliminé et remplacé par le séquençage du génome entier (WGS). Les bases de données WGS de l'ECDC et de l'EFSA devraient être opérationnelles d'ici juin 2022. Le projet a cartographié les types de PFGE en cluster avec les complexes clonaux (CC) respectifs caractérisés par le WGS.

Il y avait 78 clusters séparés par profils PFGE, impliquant 573 isolats de Listeria monocytogenes. Parmi ceux-ci, 21 comprenaient des isolats humains et alimentaires de Listeria monocytogenes, 47 étaient uniquement humains et 10 uniquement issus des aliments.

Liens épidémiques

Dans les 21 clusters aliments humains, près de 90 pour cent des isolats alimentaires provenaient de produits de poissons, avec près de 10 pour cent de la viande de charcuterie et 1 pour cent de fromages. Il y avait neuf clusters dans plusieurs pays avec plus de 10 cas et trois impliquaient 13, 14 et 15 pays.

La quantité de Listeria dans les poissons était généralement faible, mais dans 48 échantillons dépassait la limite microbiologique de 100 unités formant des colonies par gramme (ufc/g). Seuls six produits de viande et un fromage avaient des valeurs supérieures à 100 ufc/g.

Sur 78 clusters selon les profils PFGE, 57 étaient petits, jusqu'à cinq isolats de Listeria monocytogenes par cluster Le plus important était le clone CC8 de Listeria monocytogenes. Il concernait 30 isolats humains et 56 isolats alimentaires de de Listeria monocytogenes provenant de 15 pays. Cela indique qu'il peut être courant dans plusieurs pays et qu'il a potentiellement circulé dans les usines de production de poisson prêts à consommer, selon l'étude.

Les experts ont déclaré que, compte tenu de la capacité de Listeria à persister dans la chaîne alimentaire pendant des années, ce clone est susceptible de provoquer de grandes épidémies transfrontalières. Il était liée à 12 cas d'infection dans trois pays de 2015 à 2018 et à 22 cas d'infection impliquant cinq pays de 2014 à 2019.

Un autre clone, CC121, était lié à quatre clusters avec très peu d'isolats humains, suggérant une virulence plus faible des souches et pouvant nécessiter une dose infectieuse plus élevée. Il y avait un groupe de neuf pays de 30 isolats alimentaires de Listeria monocytogenes et aucune correspondance avec des cas d'infection humaine.

Les résultats de ce projet montrent que le risque de L. monocytogenes dans les produits de poissons prêts à consommer nécessite une attention particulière. Un examen de la conformité des exploitants du secteur alimentaire aux critères microbiologiques réglementaires pourrait être envisagé, en particulier pour les produits de poissons. Dans l'UE et dans l'Espace économique européen (EEE), il y a une proportion croissante de populations âgées et des défis liés à l'évaluation de l'exposition dans ce groupe. Une bibliothèque génétique d'isolats de L. monocytogenes d'origine alimentaire auxquels tout isolat humain pourrait être comparé pourrait maximiser la vitesse d'identification des sources dans les enquêtes sur les éclosions. Les données collectées dans cette étude et la méthodologie appliquée fournissent une bonne base pour une telle bibliothèque.

Agribashing et manipulation sur France 3 TV

 On a là une authentique manipulation. Insidieuse, bête, militante.

Dans un tweet, seppi indique, 
Un monument de stupidité et propagande digne de passer à la postérité (avec explications).
1. La France exporte du maïs.
2. Ce serait étonnant que du maïs soit livré dans le port de Sète.
3. Chargement et déchargement sont automatisés.
4. Et bien sûr, OGM ne signifie pas danger. 

mercredi 21 avril 2021

SARS-CoV-2 : L’infection induit des anticorps capables de tuer les cellules infectées quelle que soit la sévérité de la maladie

 «SARS-CoV-2 : L’infection induit des anticorps capables de tuer les cellules infectées quelle que soit la sévérité de la maladie», source Institut Pasteur.

En s’appuyant sur des études épidémiologiques de terrain et sur la cohorte hospitalière FrenchCOVID coordonnée par l’Inserm, des équipes de l’Institut Pasteur, du CNRS et du Vaccine Research Institute (VRI, Inserm/université Paris Est Créteil) ont étudié les anticorps induits chez des individus infectés par le SARS-CoV-2 de manière asymptomatique ou symptomatique. Les chercheurs et chercheuses ont montré que l’infection induit des anticorps polyfonctionnels, c’est à dire possédant une activité neutralisante mais aussi capables d’activer d’autres mécanismes de défense tels que les cellules tueuses NK (Natural Killer) ou les molécules du complément. Les niveaux d’anticorps sont légèrement plus faibles chez les personnes asymptomatiques en comparaison à celles symptomatiques, mais des anticorps polyfonctionnels sont retrouvés chez tous les individus. Ces résultats montrent que l’infection induit des anticorps capables de tuer les cellules infectées quelle que soit la sévérité de la maladie. L’étude fait l’objet d’une publication dans la revue Cell Reports Medicine, le 21 avril 2021.

Près de la moitié des personnes infectées par le SARS-CoV-2 ne développe pas de symptôme. Cependant, la réponse immunitaire induite par les formes asymptomatiques de la Covid-19 est encore mal caractérisée. L’étendue des fonctions antivirales des anticorps anti-SARS-CoV-2 est également mal comprise. En effet, les anticorps sont capables de neutraliser le virus, mais aussi d’activer des fonctions dites « non neutralisantes ». Parmi elles, la cytotoxicité dépendante des anticorps (antibody-dependent cellular cytotoxicity ; ADCC) et l’activation du complément sont des constituants majeurs de la réponse immunitaire et de l’efficacité de certains vaccins. L’ADCC est un phénomène en deux étapes, durant lequel les cellules infectées sont d’abord reconnues par les anticorps, puis détruites par les cellules NK. Le complément est un ensemble de protéines plasmatiques qui permet également l’élimination des cellules ciblées par les anticorps. La capacité des anticorps à activer ces fonctions non neutralisantes est encore très peu décrite dans le contexte de l’infection par le SARS-CoV-2.

Dans un premier temps, les équipes de l’Institut Pasteur, du CNRS et du VRI (Inserm/université Paris Est Créteil) ont mis au point de nouveaux tests permettant de mesurer les différentes fonctions des anticorps. Elles ont développé des tests pour étudier la mort cellulaire induite par les cellules NK ou par le complément en présence d’anticorps. En étudiant les cultures en temps réel grâce à la vidéo-microscopie, les chercheurs et chercheuses ont montré que les cellules NK, en présence des anticorps, peuvent tuer les cellules infectées, démontrant une nouvelle activité antivirale des anticorps.

Les scientifiques ont ensuite étudié des sérums de patients atteints de formes symptomatiques ou asymptomatiques de la Covid-19. En plus de leurs nouveaux tests, ils ont analysé les anticorps avec différentes méthodes préalablement développées à l’Institut Pasteur, telles que le test S-Flow pour rechercher la présence d’anticorps dirigés contre la Spike du SARS-CoV-2 et le test S-Fuse qui mesure la capacité de neutralisation de ces anticorps.

«Cette étude a permis de montrer que les individus infectés par le SARS-CoV-2 possèdent des anticorps capables d’attaquer le virus de différentes manières, en l’empêchant d’entrer dans les cellules (neutralisation) ou en tuant les cellules infectées grâce à l’activation des cellules NK (via la fonction ADCC). On parle donc d’anticorps polyfonctionnels», explique Timothée Bruel, co-auteur principal de l’étude et chercheur au sein de l’unité Virus et immunité à l’Institut Pasteur et au VRI. En comparant différents groupes de patients, les scientifiques ont ensuite montré que les personnes asymptomatiques possèdent également des anticorps polyfonctionnels et que leur réponse est légèrement plus faible que celle des patients atteints de formes modérées de la Covid-19.

«Cette étude révèle de nouveaux modes d’action des anticorps et suggère que la protection induite par une infection asymptomatique est très proche de celle observée après une infection symptomatique», conclut Olivier Schwartz, co-auteur principal de l’étude et responsable de l’unité Virus et immunité à l’Institut Pasteur et au VRI (Inserm/université Paris Est Créteil).

L'ADNe et l'ARNe peuvent jouer un rôle clé dans la surveillance d'agents pathogènes tels que le SARS-CoV-2

Schéma des méthodologies ADNe pour la détection environnementale de pathogènes et d'espèces endémiques (généré en utilisant Biorender).
«L'ADN et l'ARN environnementaux peuvent jouer un rôle clé dans la surveillance d'agents pathogènes tels que le SARS-CoV-2», source American Institute of Biological Sciences via EurekAlert!

La surveillance des maladies et des parasites dans le monde réel est souvent entravée par l'incapacité des approches traditionnelles à échantillonner facilement de vastes zones géographiques et un grand nombre d'individus. Cela peut entraîner des données inégales qui ne répondent pas à ce dont les chercheurs ont besoin pour anticiper et traiter les épidémies. Écrivant dans BioScience, Jessica Farrell (Université de Floride), Liam Whitmore (Université de Limerick) et David Duffy (Université de Floride) décrivent la promesse de nouvelles techniques moléculaires pour surmonter ces lacunes.

En échantillonnant l'ADN et l'ARN environnementaux (ADNe et ARNe), disent les auteurs, les chercheurs seront mieux en mesure de déterminer la présence d'agents pathogènes humains et dans la vie sauvage. L'approche ADNe et ARNe fonctionne grâce à la collecte d'un échantillon (souvent à partir d'une source aquatique), dont le contenu génétique est ensuite séquencé pour révéler la présence et la prévalence d'agents pathogènes. Cet ADNe ou ARNe donne aux chercheurs une vue opportune de la propagation de la maladie, ce qui «peut aider à prédire à l'avance la propagation d'agents pathogènes vers des zones géographiques et des populations nouvelles et sensibles à proximité, offrant des opportunités de mettre en œuvre des stratégies de prévention et de réduction», expliquent les auteurs.

Par exemple, au cours de la pandémie de COVID-19, les chercheurs ont utilisé l'analyse de l'ARNe des eaux usées pour suivre l'épidémie de maladie à grande échelle, constatant que «la détection dans les eaux usées de l'ARNe du SARS-CoV-2 augmentait rapidement avant la détection médicale d'épidémies humaines dans ces régions, avec un pic de concentration de virus dans l'environnement au même moment ou avant le nombre de cas détectés par l'homme, ce qui permet d'avertir à l'avance d'une augmentation du nombre d'individus infectés.» Grâce à ces connaissances avancées, des ressources médicales cruciales et limitées peuvent être fournies là où elles seront le plus nécessaires.

Les avantages de l'analyse ADNe et ARNe ne se limitent pas à la détection d'agents pathogènes humains; les auteurs décrivent la manière dont ces outils aident également à comprendre la présence et la transmission d'agents pathogènes qui entravent les efforts de conservation de la faune, tels que le virus à ADN spécifique de la tortue, Chelonid alphaherpesvirus 5. La surveillance de l'ADNe de ce pathogène peut aider les chercheurs à évaluer la propagation de la maladie, en particulier, l'idée que le virus est le plus fréquemment transmis par des individus «super-répandeurs».

L'avenir de ces technologies est prometteur, disent Farrell, Whitmore et Duffy, «avec le potentiel de dépasser largement les méthodes de détection traditionnelles et la capacité d'améliorer la détection et la surveillance des agents pathogènes aquatiques et de leurs espèces hôtes vulnérables, y compris les humains.»

Une étude révèle la complexité de la pollution microplastique

Les microplastiques sont fabriqués avec une variété de polymères, augmentés d'une gamme d'additifs qui peuvent être transformés en une multitude de produits.

«Une étude révèle la complexité de la pollution microplastique», source EurekAlert!

Les microplastiques, de petits morceaux de plastique de moins de 5 millimètres de longueur, sont omniprésents dans l'environnement et peuvent avoir des effets importants sur la faune. Une nouvelle étude publiée dans Environmental Toxicology and Chemistry (article disponible en intégralité) révèle qu'il existe de multiples impacts de différents microplastiques, de tailles, de formes et de compositions chimiques variables ,sur la survie, la croissance et le développement des larves de tête-de-boule, une espèce de proie importante dans les lacs. et les rivières en Amérique du Nord.

En démontrant que les microplastiques sont à la fois des facteurs de stress physiques et chimiques, l'étude soutient la nécessité d'une recherche qui considère les microplastiques comme un facteur de stress multiple plutôt qu'un seul contaminant. Il est important de noter que les méthodes d'essai actuelles utilisées dans la plupart des études sur les microplastiques n'examinent pas suffisamment la dimension chimique de la pollution liée aux microplastiques.

«Le cocktail chimique associé aux microplastiques dans l'environnement se compose d'additifs provenant de la fabrication et de contaminants sorbés dans l'environnement environnant; cependant, cette dimension est souvent absente des tests de toxicité, où des microplastiques vierges achetés auprès d'un fabricant sont souvent utilisés», a dit l'auteur correspondant, Kennedy Bucci, étudiant en doctorat à l'Université de Toronto. «Nos travaux montrent que le cocktail chimique est un important moteur d'effets et suggèrent qu'un nouveau cadre d'évaluation des risques qui saisit la multidimensionnalité de la pollution microplastique peut être nécessaire.»

Les sources de pollution microplastique sont diverses
Ainsi commence l'article,

Les microplastiques ne sont pas des microplastiques ne sont pas des microplastiques, tout comme les pesticides ne sont pas des pesticides ne sont pas des pesticides. «Les microplastiques», comme d'autres classes de contaminants chimiques, est un terme fourre-tout pour une variété de composés chimiques uniques. Pourtant, de nombreuses publications scientifiques, rapports politiques et articles de presse présentent les microplastiques comme s'il s'agissait simplement d'un seul composé ou type de matériau.

Ces communications simples ont des conséquences, conduisant à des études et des protocoles simplifiés qui peuvent être inadéquats pour nous informer des sources et du devenir des microplastiques, ainsi que de leurs implications biologiques et écologiques. Par exemple, étudier le devenir et les effets d'un type de plastique avec une forme et une taille spécifiques ne nous dit pas le sort et les effets des microplastiques en général. De plus, ne pas reconnaître la diversité des matériaux dans un échantillon de microplastiques peut négliger la complexité nécessaire pour éclairer une analyse et un contrôle de qualité robustes nécessaires dans les techniques d'échantillonnage et de mesure analytique. Par exemple, certaines méthodes sont plus efficaces pour récupérer des tailles, des formes ou des types de microplastiques spécifiques.

La simplification des microplastiques en tant que composé unique a également conduit à une confusion quant à la nécessité de nouvelles politiques et stratégies pour réduire les futures émissions de microplastiques. Par exemple, certains décideurs et scientifiques ont l'impression que l'interdiction de microbilles des produits de soins personnels à rincer a éliminé les rejets futurs de microplastiques en général dans l'environnement. En réalité, de telles interdictions n'éliminent qu'une seule source de la série de contaminants mondiaux émergents divers et complexes que sont les «microplastiques». Cela peut être comparé à l'interdiction d'une utilisation spécifique d'un pesticide (par exemple, à la maison), laissant le marché plein d'autres applications de divers pesticides qui doivent continuer à être évalués pour la persistance environnementale, la biodisponibilité et la toxicité.

Mise à jour du 21 mai 2021. On lira ce document de l'AnsesMicroplastiques et nanomatériaux. 

Le lavage des mains responsable des bactéries dans les siphons des éviers

«Le lavage des mains responsable des bactéries dans les siphons des éviers, selon la plus grande étude non hospitalière», source University of Reading.

Le lavage des mains forme des communautés de bactéries qui vivent et se développent dans la plomberie des éviers domestiques, selon des scientifiques.

Dans la plus grande étude sur les bactéries des éviers menée à l'extérieur des hôpitaux, des scientifiques de l'Université de Reading ont découvert des communautés de bactéries similaires qui restent en grande partie dans nos égouts après le lavage des mains.

Les chercheurs ont découvert qu'il existe des différences significatives entre les familles de bactéries dominantes en fonction de l'emplacement dans les siphons des éviers, et que les systèmes de plomberie tels que le siphon hydraulique (P-trap) ou le coude en U (U-bend) offrent des environnements idéaux pour la croissance des bactéries.

Le Dr Hyun Soon Gweon, maître de conférences en bioinformatique pour la génomique à l'Université de Reading, a dir:

«Le mantra 'lavez-vous les mains' pour lutter contre la transmission du coronavirus a souligné non seulement l'importance d'une bonne hygiène des mains, mais aussi la nécessité d'éviers bien conçus et régulièrement nettoyés.

«Notre étude révèle que la différence significative dans les familles bactériennes entre les différents bâtiments montre qu'un certain nombre de facteurs, y compris l'occupation et la conception des bâtiments, peuvent avoir une grande influence sur les types de bactéries avec lesquelles nous entrons en contact.»

Des échantillons ont été prélevés dans 123 éviers situés dans des environnements non cliniques de l'Université de Reading, tels que des toilettes dans des espaces d'enseignement, de recherche et sociaux et montrent que les éviers ont un microbiome distinct dominé par certaines bactéries.

La zone de plomberie présente sous les éviers a révélé des communautés microbiennes dominées par un groupe de bactéries appelées les protéobactéries. Ce phylum comprend des agents pathogènes tels que Salmonella et E. coli, qui peuvent provoquer des maladies graves, bien que la proportion de bactéries de cette famille soit faible. Des concentrations plus élevées ont été retrouvées pour les bactéries communes Moraxellaceae et Burkholderiaceae, qui peuvent provoquer des infections mais sont pour la plupart inoffensives pour l'homme.

Le type de système de plomberie avait un effet significatif sur la famille la plus abondante. On a découvert que les bondes sous l'évier contenaient des bactéries Moraxellaceae, tandis que les éviers hydraulique qui ont un style de drainage hydraulique contenaient des quantités plus élevées de Burkholderiaceae.

L'auteur principal de l'étude Zoe Withey, chercheuse en doctorat à l'Université de Reading, a dit: «Les bactéries qui vivent dans nos siphons d'évier sont façonnées par ce que nous les déposons directement. Alors que nous nous attendions à ce que les bactéries de l'intestin aient un impact plus important, causé par l'environnement plus large d'une toilette, il semble que dans l'ensemble des bactéries vivant sur la peau de nos mains nourrissent la communauté dans les siphons sous les éviers.»

«Cela signifie que nous devons être très conscients que ce que nous déposons nos éviers affecte la communauté bactérienne en dessous. Ces zones peuvent ne pas être atteintes pendant le nettoyage de routine, et cela pourrait conduire à des communautés contenant des microbes plus résistants.»

Les scientifiques soulignent que tous les éviers où des prélèvements ont été effectués étaient régulièrement nettoyés.

Le Dr Gweon a dit : «Nous espérons que nos découvertes rappelleront aux personnes que les bactéries présentes sur vos mains restent souvent vivantes et capables de se développer même après avoir été lavées, même en présence de savon et d'eau chaude. Il est possible de propager des bactéries dans les zones environnantes de votre évier, où ils peuvent se développer et persister. Pour réduire la transmission des bactéries, il faut désinfecter en profondeur les éviers et les zones environnantes et pas seulement se mouiller les mains.»

L'étude a été menée en 2019, avant la pandémie mondiale causée par le Covid-19 et il n'y a donc aucune influence directe de l'augmentation du lavage des mains ou d'autres comportements d'hygiène associés à la pandémie sur cette étude. Cependant, les auteurs soulignent que l'importance des bactéries de la peau signifie que le lavage des mains aura un effet significatif sur les communautés bactériennes de nos éviers.

Référence. Withey Z, Goodall T, MacIntyre S, Gweon HS. Characterization of communal sink drain communities of a university campus. Environmental DNA. 2021;00:1-11. https://doi.org/10.1002/edn3.196

mardi 20 avril 2021

Israël : Le variant britannique est 45% plus contagieux que le virus d'origine

Propgation du variant britannique en Israël
«Le variant britannique est 45% plus contagieux que le virus d'origine», source Tel-Aviv University via EurekAlert!

Une éude à l'Université de Tel Aviv (TAU) sur la base des données de 300 000 tests pour le COVID-19.

Une nouvelle étude de l'Université de Tel Aviv a révélé que le variant britannique (appelé B.1.1.7) du Covid-19 est 45% plus contagieux que le virus d'origine. Les chercheurs se sont appuyés sur les données d'environ 300 000 tests PCR pour le Covid-19 obtenus du laboratoire de test COVID-19, qui a été créé en collaboration avec le groupe Electra.

La nouvelle étude a été menée par le professeur Ariel Munitz et le professeur Moti Gerlitz du département de microbiologie clinique et d'immunologie de la faculté de médecine Sackler, en collaboration avec le Dr Dan Yamin et l'étudiant au doctorat Matan Yechezkel du laboratoire de modélisation et d'analyse des épidémies (LEMA) au Département de génie industriel, le tout à l'Université de Tel Aviv. Les résultats de l'étude ont été publiés dans l'éminente revue scientifique Cell Reports Medicine.

Le laboratoire Electra-TAU a été créé en mars 2020, juste après le déclenchement de la première vague de la pandémie en Israël. À ce jour, il a analysé des centaines de milliers de tests provenant de tout le pays - à partir d'installations publiques de tests au volant, ainsi que de programmes ciblant des populations spécifiques - tels que le 'Shield for Fathers and Mothers' qui effectuait régulièrement des tests chez les points chauds à risque comme les maisons de retraite.

Le professeur Ariel Munitz explique: «Nous utilisons un kit qui teste trois gènes viraux différents. Dans le variant britannique, également connu sous le nom de B.1.1.7, l'un de ces gènes, le gène S, a été effacé par la mutation. Par conséquent, nous avons pu suivre la propagation du variant même sans séquençage génétique.»

Selon le professeur Munitz, les données du laboratoire montrent que la propagation du variant britannique a été très rapide: le 24 décembre 2020, seuls 5% des résultats positifs étaient attribués au variant britannique. À peine six semaines plus tard, en janvier 2021, ce variant était responsable de 90% des cas de Covid-19 en Israël. Le chiffre actuel est d'environ 99,5%.

«Pour expliquer cette augmentation spectaculaire, nous avons comparé le nombre R du virus SARS-CoV-2 avec le R du variant britannique. En d'autres termes, nous avons posé la question, combien de personnes, en moyenne, contractent la maladie de chaque personne qui a l'un ou l'autre variant? Nous avons constaté que la variant britannique est 45% - près de 1,5 fois - plus contagieux»

Dans la deuxième étape de l'étude, les chercheurs ont segmenté la contagion par groupes d'âge. Les résultats ont indiqué que le tournant pour la population de 60 ans et plus par rapport aux autres groupes d'âge s'est produit deux semaines après que 50% de la population israélienne de 60 ans et plus ont reçu leur première dose de vaccin.

«Jusqu'en janvier, nous avons constaté une dépendance linéaire de près de 100% entre les différents groupes d'âge dans les nouveaux cas pour 1 000 personnes», explique le Dr Dan Yamin. «Deux semaines après que 50% de la population de 60 ans et plus aient reçu la première dose du vaccin, ce graphique s’est brusquement et significativement cassé. En janvier, une baisse spectaculaire a été observée dans le nombre de nouveaux cas dans le groupe des 60 ans et plus, parallèlement à une augmentation continue du reste de la population. En termes simples, puisque plus de 90% des personnes décédées du Covid-19 avaient plus de 60 ans, nous pouvons dire que le vaccin a sauvé des centaines de vies, même à court terme. "

De plus, la nouvelle étude prouve que la surveillance active des populations à risque fonctionne. «Il existe une valeur seuil pour déterminer si un test spécifique est positif ou négatif pour le virus - une valeur inférieure indiquant une charge virale plus élevée», explique le professeur Munitz. «Lorsque nous avons comparé les valeurs seuils des différents gènes chez plus de 60 résidents de maisons de retraite avec les valeurs mesurées chez plus de 60 personnes dans la population générale, nous avons constaté des valeurs nettement plus élevées dans les maisons de retraite. Cela signifie que la charge virale dans les maisons de retraite était plus faible que le reste de la population

Étant donné que les résidents des maisons de retraite sont testés régulièrement, alors que d'autres personnes ne sont généralement testées que lorsqu'elles ne se sentent pas bien ou ont été en contact avec une personne qui avait été testée positive pour le virus, nous concluons qu'une surveillance constante des populations à risque est une méthode qui fonctionne. Il est important de le souligner: la charge virale relativement faible a été constatée dans les maisons de retraite alors que le variant britannique avait déjà commencé à se répandre dans toutes les populations. Par conséquent, nous montrons que la surveillance des maisons de retraite, associée à une vaccination qui donne la priorité aux populations vulnérables, prévient la maladie et la mortalité.

Le Dr Yemin conclut: «En raison des conditions de surpeuplement, des ménages importants et de la répartition par âge de la population israélienne, le coronavirus avait un environnement plus favorable pour se propager en Israël par rapport à la plupart des pays occidentaux. Notre message au monde est que si avec notre point de départ problématique un net déclin a été identifié, d'autres pays occidentaux peuvent certainement s'attendre à une rupture de la courbe - malgré la forte contagion du variant britannique - avec une baisse spectaculaire des cas graves suite à la vaccination de 50% de la population âgée, parallèlement à des tests ciblés dans les épicentres à risque.»

Un probiotique semble prometteur pour le traitement des maladies inflammatoires de l'intestin

«Un probiotique, Lactobacillus acidophilus, semble prometteur pour le traitement des maladies inflammatoires de l'intestin et d'autres conditions inflammatoires de l'intestin», source The American Journal of Pathology.

La souche probiotique LA1 a un effet thérapeutique qui à la fois prévient et traite les troubles inflammatoires intestinaux causés par une hyperperméabilité intestinale ou syndrome de l'intestin qui fuit, rapportent des chercheurs dans The American Journal of Pathology

Les jonctions serrées (JTs) intercellulaires des cellules épithéliales de l'intestin agissent comme une barrière fonctionnelle et structurelle contre les antigènes dangereux qui favorisent l'inflammation intestinale dans les maladies inflammatoires de l'intestin (MII) et d'autres conditions inflammatoires de l'intestin. Une barrière intestinale défectueuse de Jts joue un rôle important dans l'exacerbation et la prolongation de l'inflammation intestinale. Une nouvelle étude rapportée dans The American Journal of Pathology, publiée par Elsevier, montre que la souche probiotique Lactobacillus acidophilus (L. acidophilus) connue sous le nom de LA1 peut générer une amélioration rapide et durable de cette barrière intestinale défectueuse et traiter efficacement l'inflammation intestinale en préservant et en restaurant la barrière intestinale.

L'utilisation de probiotiques est apparue comme thérapie pour un certain nombre de troubles intestinaux, y compris les MII et l'entérocolite nécrosante; cependant, des bactéries probiotiques spécifiques ayant de véritables effets bénéfiques sur les maladies intestinales doivent être identifiées.

Dans cette étude, les chercheurs ont utilisé un criblage à haut débit pour évaluer plus de 20 bactéries probiotiques afin de déterminer leur capacité à augmenter la fonction de la barrière intestinale, en utilisant à la fois un modèle de culture cellulaire de la muqueuse épithéliale intestinale et des souris vivantes.

L'espèce bactérienne probiotique L. acidophilus, en particulier la souche LA1, a produit une augmentation rapide et marquée de la barrière intestinale des JTs; d'autres souches de L. acidophilus n'ont eu aucun effet. Les chercheurs ont découvert que cette souche particulière interagissait avec les cellules intestinales d'une manière unique pour activer les voies qui resserraient la barrière intestinale, traitant l'inflammation intestinale. Elle se fixe à la surface de la membrane épithéliale intestinale en interagissant directement avec le complexe récepteur-2 de type Toll, qui alerte l'intestin pour déclencher une réponse immunitaire.

Les chercheurs ont également réalisé des études de validation de principe in vivo chez des souris vivantes pour étudier l'effet de LA1 et d'une autre souche, LA3, dans l'amélioration de la barrière intestinale de la souris et l'efficacité thérapeutique de LA1 dans le maintien de la barrière intestinale et la protection contre la colite induite. Ils ont constaté que LA1, mais pas LA3, provoquait une amélioration rapide et marquée de l'intestin grêle et de la barrière épithéliale du côlon chez la souris. Les études de traitement après le début de la colite ont montré que LA1 était également efficace dans la guérison de la barrière intestinale et de la colite.

«Nos données indiquent que LA1 est capable de prévenir la formation de l'inflammation du côlon et de favoriser la guérison de la colite», a dit le chercheur principal Thomas Ma, Penn State College of Medicine, Hershey Medical Center, Hershey, Pennsylvanie, États-Unis. «Les implications des présents résultats sont que cette souche bactérienne peut être utilisée dans une grande variété de troubles de la perméabilité intestinale, y compris les MII, la maladie cœliaque, la maladie alcoolique du foie, la stéatose hépatique non alcoolique et l'entérocolite nécrosante, pour traiter l'inflammation associée à l'intestin qui fuit.»

L. acidophilus se trouve dans diverses marques de yogourt (aux Etats-Unis), notamment Chobani, Dannon, Siggi's, Stonyfield et Yoplait.