Propgation du variant britannique en Israël |
Une éude à l'Université de Tel Aviv (TAU) sur la base des données de 300 000 tests pour le COVID-19.
Une nouvelle étude de l'Université de Tel Aviv a révélé que le variant britannique (appelé B.1.1.7) du Covid-19 est 45% plus contagieux que le virus d'origine. Les chercheurs se sont appuyés sur les données d'environ 300 000 tests PCR pour le Covid-19 obtenus du laboratoire de test COVID-19, qui a été créé en collaboration avec le groupe Electra.
La nouvelle étude a été menée par le professeur Ariel Munitz et le professeur Moti Gerlitz du département de microbiologie clinique et d'immunologie de la faculté de médecine Sackler, en collaboration avec le Dr Dan Yamin et l'étudiant au doctorat Matan Yechezkel du laboratoire de modélisation et d'analyse des épidémies (LEMA) au Département de génie industriel, le tout à l'Université de Tel Aviv. Les résultats de l'étude ont été publiés dans l'éminente revue scientifique Cell Reports Medicine.
Le laboratoire Electra-TAU a été créé en mars 2020, juste après le déclenchement de la première vague de la pandémie en Israël. À ce jour, il a analysé des centaines de milliers de tests provenant de tout le pays - à partir d'installations publiques de tests au volant, ainsi que de programmes ciblant des populations spécifiques - tels que le 'Shield for Fathers and Mothers' qui effectuait régulièrement des tests chez les points chauds à risque comme les maisons de retraite.
Le professeur Ariel Munitz explique: «Nous utilisons un kit qui teste trois gènes viraux différents. Dans le variant britannique, également connu sous le nom de B.1.1.7, l'un de ces gènes, le gène S, a été effacé par la mutation. Par conséquent, nous avons pu suivre la propagation du variant même sans séquençage génétique.»
Selon le professeur Munitz, les données du laboratoire montrent que la propagation du variant britannique a été très rapide: le 24 décembre 2020, seuls 5% des résultats positifs étaient attribués au variant britannique. À peine six semaines plus tard, en janvier 2021, ce variant était responsable de 90% des cas de Covid-19 en Israël. Le chiffre actuel est d'environ 99,5%.
«Pour expliquer cette augmentation spectaculaire, nous avons comparé le nombre R du virus SARS-CoV-2 avec le R du variant britannique. En d'autres termes, nous avons posé la question, combien de personnes, en moyenne, contractent la maladie de chaque personne qui a l'un ou l'autre variant? Nous avons constaté que la variant britannique est 45% - près de 1,5 fois - plus contagieux»
Dans la deuxième étape de l'étude, les chercheurs ont segmenté la contagion par groupes d'âge. Les résultats ont indiqué que le tournant pour la population de 60 ans et plus par rapport aux autres groupes d'âge s'est produit deux semaines après que 50% de la population israélienne de 60 ans et plus ont reçu leur première dose de vaccin.
«Jusqu'en janvier, nous avons constaté une dépendance linéaire de près de 100% entre les différents groupes d'âge dans les nouveaux cas pour 1 000 personnes», explique le Dr Dan Yamin. «Deux semaines après que 50% de la population de 60 ans et plus aient reçu la première dose du vaccin, ce graphique s’est brusquement et significativement cassé. En janvier, une baisse spectaculaire a été observée dans le nombre de nouveaux cas dans le groupe des 60 ans et plus, parallèlement à une augmentation continue du reste de la population. En termes simples, puisque plus de 90% des personnes décédées du Covid-19 avaient plus de 60 ans, nous pouvons dire que le vaccin a sauvé des centaines de vies, même à court terme. "
De plus, la nouvelle étude prouve que la surveillance active des populations à risque fonctionne. «Il existe une valeur seuil pour déterminer si un test spécifique est positif ou négatif pour le virus - une valeur inférieure indiquant une charge virale plus élevée», explique le professeur Munitz. «Lorsque nous avons comparé les valeurs seuils des différents gènes chez plus de 60 résidents de maisons de retraite avec les valeurs mesurées chez plus de 60 personnes dans la population générale, nous avons constaté des valeurs nettement plus élevées dans les maisons de retraite. Cela signifie que la charge virale dans les maisons de retraite était plus faible que le reste de la population.»
Étant donné que les résidents des maisons de retraite sont testés régulièrement, alors que d'autres personnes ne sont généralement testées que lorsqu'elles ne se sentent pas bien ou ont été en contact avec une personne qui avait été testée positive pour le virus, nous concluons qu'une surveillance constante des populations à risque est une méthode qui fonctionne. Il est important de le souligner: la charge virale relativement faible a été constatée dans les maisons de retraite alors que le variant britannique avait déjà commencé à se répandre dans toutes les populations. Par conséquent, nous montrons que la surveillance des maisons de retraite, associée à une vaccination qui donne la priorité aux populations vulnérables, prévient la maladie et la mortalité.
Le Dr Yemin conclut: «En raison des conditions de surpeuplement, des ménages importants et de la répartition par âge de la population israélienne, le coronavirus avait un environnement plus favorable pour se propager en Israël par rapport à la plupart des pays occidentaux. Notre message au monde est que si avec notre point de départ problématique un net déclin a été identifié, d'autres pays occidentaux peuvent certainement s'attendre à une rupture de la courbe - malgré la forte contagion du variant britannique - avec une baisse spectaculaire des cas graves suite à la vaccination de 50% de la population âgée, parallèlement à des tests ciblés dans les épicentres à risque.»
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