De l'intérêt du traitement par des aérosols de peroxyde d'hydrogène activé par plasma froid dans la décontamination de produits frais

iHP ou peroxyde d'hydrogène ionisé

Voici un article, paru dans Journal of Food Protection, qui présente une étude qui a pour titre, «Résidus de peroxyde d'hydrogène sur des tomates, pommes, melons cantaloups et laitues romaine après un traitement avec des aérosols de peroxyde d'hydrogène activé par plasma froid».

Résumé

Le peroxyde d'hydrogène (H₂O₂) a longtemps été étudié comme désinfectant aqueux pour améliorer la sécurité microbienne des produits frais. Récemment, nous avons démontré que des aérosols de H₂O₂ activés par plasma froid, ci-après dénommés peroxyde d'hydrogène ionisé (iHP pour ionized hydrogen peroxide), réduisaient les populations de Salmonella, Listeria et E. coli jusqu'à 5,5 log sur des surfaces de divers produits. Cependant, la quantité et le devenir du résidu H₂O₂ laissé sur les produits frais après les traitements n'ont pas été évalués.

Dans la présente étude, les taux de résidus de H₂O₂ sur des pommes, des tomates, des melons cantaloups et des laitues romaine ont été analysés après traitement par 7,8% d'iHP dans des conditions qui avaient été optimisées et adaptées pour les réductions de Salmonella et chaque produit produit.

Les résultats ont montré que des taux de résidus plus élevés ont été retrouvés sur les laitues que sur les melons cantaloups, les tomates et les pommes immédiatement après traitement. Pendant le stockage à 10 et 22°C, les taux de H₂O₂ ont diminué rapidement et sont tombés en dessous de <1 mg/kg dans le jour suivant le traitement pour tous les produits frais. De plus, la diminution était plus rapide à 22°C qu'à 10°C. Plus important encore, les niveaux de résidus de H₂O₂ sur les produits frais étaient inférieurs à ceux après lavage avec 1% de H₂O₂ pendant 1 minute.

Dans l'ensemble, nos résultats ont démontré que les taux de résidus de H₂O₂ sur les surfaces de produits frais se décomposaient rapidement après le traitement avec l'iHP et ne semblaient pas poser de problème de sécurité sanitaire après 1 jour de stockage.

Etats-Unis : Alerte de santé publique pour plus de 96 tonnes de viande de dinde hachée crue pour cause de présence de Salmonella

Je ne sais pas combien de tonnes de produits alimentaires ont été jetés, depuis septembre 2019, à cause de la présence d'oxyde d'éthylène en France, et on ne le saura probablement pas, mais cela ne devrait pas être loin de cette alerte de santé publique aux Etats-Unis en ce qui concerne plus de 96 tonnes de viande de dinde hachée crue ...

«Le FSIS publie une alerte de santé publique pour de la viande de dinde hachée crue liée à des cas de maladie à Salmonella Hadar», source FSIS du 10 avril 2021.

Le Food Safety and Inspection Service (FSIS) de l'USDA a publié une alerte de santé publique pour environ 96 tonnes (211 405 pounds) de viande de dinde hachée crue, produites par Plainville Brands, LLC, un établissement de Pennsylvanie, en raison de préoccupations liées aux produits qui pourraient avoir causé des cas de maladie à Salmonella Hadar maladies. Un rappel n'a pas été demandé, car on pense que les produits ne sont plus disponibles pour les consommateurs.

Le FSIS craint que certains produits soient congelés et dans les congélateurs des consommateurs. Les consommateurs qui ont acheté ces produits sont priés de ne pas les consommer. Ces produits doivent être jetés ou retournés au lieu d'achat. Les points de vente en distribution susceptibles de recevoir des produits retournés par les consommateurs doivent détruire ce produit immédiatement.

Les produits de dinde hachée crue ont été produits du 18 décembre 2020 au 29 décembre 2020.

Les produits portent le numéro d'établissement EST. P-244 à l'intérieur de la marque d'inspection USDA. Ces articles ont été expédiés vers des points de vente à travers le pays.

Le FSIS et ses partenaires de santé publique, y compris les Centers for Disease Control and Prevention (CDC), les responsables de la santé publique et de la réglementation enquêtent sur une épidémie multi-états de 28 cas de maladie à Salmonella Hadar dans 12 États avec des dates d'apparition allant du 28 décembre 2020 au 4 mars 2021. L'enquête de traçabilité pour un cas patient a identifié le patient comme ayant consommé de la dinde hachée produite par Plainville Brands, LLC. Un emballage intact et non ouvert de dinde hachée de Plainville Brands prélevé au domicile de ce patient a été testé positif pour Salmonella Hadar et était étroitement lié génétiquement à l’échantillon chez le patient. Les preuves recueillies à ce jour ne relient pas toutes les cas de maladie à cet établissement. Sur la base de l'enquête en cours, des produits supplémentaires provenant d'autres établissements peuvent être impliqués. Le FSIS continue de travailler avec le CDC et les partenaires de santé publique des États et locaux sur cette investigation et fournira des informations à jour dès qu'elles seront disponibles.

Le FSIS conseille à tous les consommateurs de préparer en toute sécurité leurs produits de viande crue, y compris les produits réfrigérés et congelés, et de ne consommer que de la dinde hachée crue qui a été cuite à une température de 73,8°C. La seule façon de confirmer que le produit de volaille est cuit à une température suffisamment élevée pour tuer les bactéries dangereuses est d'utiliser un thermomètre alimentaire qui mesure la température interne, voir ici.

De la sécurité sanitaire des insectes comestibles, selon une nouvelle publication de la FAO

«Aspects liés à la sécurité des aliments des insectes comestibles», source publication de la FAO.

Les insectes comestibles peuvent diversifier les régimes alimentaires, améliorer les moyens de subsistance, contribuer à la sécurité alimentaire et nutritionnelle et avoir une empreinte écologique inférieure par rapport à d'autres sources de protéines. Ces avantages potentiels, combinés à un intérêt accru pour l'exploration de sources alternatives d'aliments à la fois nutritives et écologiquement durables, stimulent la production commerciale d'insectes en tant que denrées alimentaires et aliments pour animaux.

Tout en reconnaissant les différentes opportunités que le secteur pourrait offrir, cette publication analyse les implications en matière de sécurité des aliments associées aux insectes comestibles. Certains dangers potentiels pour la sécurité alimentaire des insectes comestibles sont considérés dans cette publication - biologiques (bactéries, virus, champignons, parasites), chimiques (mycotoxines, pesticides, métaux lourds, antimicrobiens) et physiques. Le potentiel de risques allergènes associés aux insectes comestibles est également discuté.

Les risques sanitaires liés à la consommation d'insectes dépendent fortement des espèces d'insectes, de l'environnement dans lequel ils sont élevés ou dans lesquels ils sont collectés, de ce qu'ils mangent et des méthodes de production et de transformation utilisées. Une évaluation approfondie des dangers pour la sécurité alimentaire aidera à établir des pratiques d'hygiène et de fabrication appropriées, qui demeurent un défi pour le secteur.

Combler les lacunes dans les connaissances, élaborer des cadres réglementaires appropriés et encourager une collaboration étroite entre les parties prenantes facilitera l'établissement d'une voie multidisciplinaire pour le secteur afin de promouvoir la sécurité sanitaire des aliments.

Référence : FAO. 2021. Looking at edible insects from a food safety perspective. Challenges and opportunities for the sector. Rome.

Ces plantes qui nous veulent du bien, sauf quand Salmonella est présent. Un exemple avec des compléments alimentaires au Danemark

Un des produit concerné par les rappels

L'Anses avait alerté sur «Les compléments alimentaires, nécessité d'une consommation éclairée».

Il est malheureux qu'une phytothérapie destinée à lutter contre la diarrhée et la constipation rende des personnes malades avec Salmonella. Telle pourrait être la conclusion de cet article de Joe Whitworth paru le 12 avril 2021 dans Food safety News, «La phytothérapie liée à l'épidémie à Salmonella au Danemark». Article adapté par mes soins -aa.

Une épidémie à Salmonella au Danemark touchant 25 personnes a été attribuée à une marque de complément alimentaire base de plantes, selon les responsables de la sécurité alimentaire.

La majorité des personnes sont tombées malades en mars et Orkla Care A/S, le vendeur des produits concernés, a émis un rappel de plusieurs lots.

Le Statens Serum Institut (SSI), l'Agence danoise des médicaments, l'Administration vétérinaire et alimentaire danoise (Fødevarestyrelsen) et le DTU Food Institute ont enquêté sur l'épidémie.

Plus tôt cette semaine, le SSI a révélé que 23 personnes avaient été infectées par le même type de Salmonella Typhimurium entre la mi-novembre et mars. La mise à jour présente deux autres patients portant le total à 25. Ils sont âgés de 2 à 92 ans et vivent à travers le pays. Au total, 13 sont des femmes et 12 sont des hommes. Quatorze personnes ont eu besoin d'un traitement hospitalier.

Efforts pour retrouver l'origine de la contamination

Des entretiens avec les patients ont montré que la plupart avaient mangé des cosses de psyllium HUSK sous forme de capsules. Une comparaison avec des témoins en bonne santé à qui on a posé des questions sur la consommation du même produit a montré que les malades avaient consommé de la phytothérapie beaucoup plus que les sujets témoins.

Les cosses de psyllium HUSK ont été approuvées comme phytothérapie pour la diarrhée, la constipation, le syndrome du côlon irritable et le cholestérol élevé par l'Agence danoise de la santé et des médicaments en 1996.

Luise Müller, épidémiologiste au SSI, a dit qu'il était malheureux qu'une phytothérapie destinée à lutter contre la diarrhée et la constipation rende les gens malades avec Salmonella.

«Il est très possible que les personnes qui ont déjà des problèmes d'estomac soient plus vulnérables à une infection grave à Salmonella», a-t-elle dit.

Des analyses effectués par l'Administration vétérinaire et alimentaire danoise ont révélé la présence de Salmonella dans le produit restant que deux patients avaient à la maison.

Orkla Care a déclaré que ses propres analyses et de contrôle de qualité n’ont pas montré de lien entre le produit et l’épidémie, mais qu’elle émettait un rappel sur la base du principe de précaution et conformément à la recommandation de l’Agence danoise des médicaments.

Les consommateurs qui ont acheté des cosses de graines de psyllium HUSK, des capsules à base de plantes ou des capsules HUSK Psyllium Gut Balance Basic de certains lots doivent les jeter ou rapporter les produits au magasin où ils ont été achetés. Les articles ont été vendus dans les magasins spécialisés et les pharmacies ainsi qu'en ligne. Orkla Care A/S rappelle également les compléments alimentaires REMEMBER Psyllium Stomach Balance.

Les dates d'expiration vont de mai à octobre 2023.

Complément du 17 avril 2021. Rappel au Luxembourg le 16 avril 2021 de complément alimentaire Psyllium-Froskaller de la marque Husk. Cela fait suite à une notification d'alerte au RASFF de l'UE le 12 avril 2021 par le Danemark. A noter que le Luxembourg ne faisait pas partie des pays concernés par la distribution du produit.

Mise à jour du 18 avril 2021. Épidémie de Salmonella au Danemark liée aux produits à base de plantes. Une récente épidémie à Salmonella au Danemark s'est avérée liée à la consommation d'un produit à base de plantes qui a désormais touché 33 personnes, dont 19 ont été hospitalisées et 3 personnes sont décédées.

Le scandale du sésame contaminé à l'oxyde d'éthylène, l'histoire d'un fiasco de l'UE

Sur le scandale du sésame contaminé à l'oxyde d'éthylène ou sésamegate, on pourra lire dans Le Parisien du 9 avril 2021 (article réservé aux abonnés), ce qui se veut une enquête, «Après le sésame, le scandale des contaminations à l’oxyde d’éthylène s’étend à d’autres aliments».

De la présence d’oxyde d’éthylène sur des aliments, on ignorait presque tout. Jusqu’à ce qu’en septembre dernier, une entreprise belge découvre des résidus de ce pesticide classé cancérogène sur des graines de sésame importées d’Inde. Depuis, le scandale s’est étendu à du riz, du thé, mais surtout des épices, contaminant en cascade des quantités de plats cuisinés.

Le tout dans le plus grand silence de toutes nos autorités sanitaires et de l'Anses en France ... peu ou pas d'informations, pas d'évaluation des risques ...

Aujourd'hui, nous savons qu'il n'y a pas que le scandale du sésame contaminé à l'oxyde d'éthylène, mais il y aussi celui des épices, du psyllium, du thé, du riz, liste non limitative ...

«Le scandale du sésame contaminé à l'oxyde d'éthylène», source ABE-RTS. Merci à Franck Valayer du site Oulah! de m'avoir signalé cette vidéo.

En automne 2020, un scandale a traversé toute l’Europe : des centaines de produits sont retirés des magasins. En cause, un pesticide interdit détecté dans les graines de sésame : l’oxyde d’éthylène, un gaz qui a des propriétés antiseptiques. Ce produit a la capacité de préserver la qualité des graines lors du transport en luttant contre les moisissures et les bactéries. Mais comment ce pesticide cancérogène s’est-il retrouvé dans nos assiettes ? ABE a remonté le fil de cette contamination pour comprendre pourquoi le système de surveillance a failli. Première étape en Belgique où l’alerte a été lancée en septembre 2020. (très précisément le 9 septembre 2020).

Complément. il y a eu au 9 avril 2021, selon la DGCCRF, 4 396 rappels (lots et références).

Mise à jour du 14 avril 2021. Il y a eu au premier trimestre 2021:

• 302 rappels pour cause de présence d'oxyde d'éthylène.
• 152 rappels pour une autre cause que la présence d'oxyde d'éthylène.

50,3% des rappels sont donc liés à la présence d'oxyde d'éthylène selon mon calcul, et pourtant, la revue PROCESS Alimentaire rapporte qu'il y a eu 75 % des rappels liés à l’oxyde d’éthylène depuis le début de 2021.

Explication. Cette différence tient au fait qu'il y a eu, de la part de la revue, une sous-estimation des rappels de produits alimentaires pour une cause autre que la présence d'oxyde d'éthylène, tout simplement ... ah, comment naissent des petites fake news !

Putain de métier ! (Par Jean-Paul Pelras)

Voici un édito de Jean-Paul Pelras, Putain de métier ! paru dans l'agri le 10 avril 2021.

Putain de métier, répètent en boucle ces jours-ci celles et ceux qui ont une nouvelle fois tout perdu, car quelques petits degrés ont eu la mauvaise idée d’aller se balader au-dessous de zéro. Putain de métier, quand les rivières débordent et emportent tout sur leurs passages, car le paysan n’est plus autorisé à les nettoyer, quand le vent souffle un peu trop fort et arrache les bâches des tunnels ou des multi-chapelles, quand le ciel, plus souvent sans Dieu que sans nuages, menace les semis et les plantations, quand une neige lourde et inattendue fait s’effondrer des hectares de serres, quand la lumière pulvérulente de l’été dévore tout ce qui pousse dans les champs, dans les prés, dans les vignes, dans les vergers, quand une épidémie oblige à faire abattre le troupeau, quand la grêle en quelques minutes détruit une année de travail, quand le loup égorge l’agneau, quand les marchandises importées viennent usurper les marchés traditionnels, quand les contraintes administratives deviennent inadaptables et inadaptées, quand la maladie, l’insecte, le ravageur, les éléments ou les caprices du destin  ne laissent pas le temps de récolter, quand le dépôt de bilan pousse à l’irréparable ceux qui ne peuvent supporter l’inacceptable, quand les écologistes stigmatisent le paysan et dictent leurs dogmes pour faire accélérer la disparition de ce putain de métier.  Putain de métier où ceux qui veulent imposer un changement de modèle depuis Paris, ne connaissent de l’outil, ni l’usage, ni le prix.  Putain de métier que seulement 400 000 français osent encore pratiquer. 400 000 rescapés d’une érosion qui progresse un peu plus chaque année.

Après les beaux discours

Terrible ! Peut-être parce que les paysans ne sont pas en représentation, peut-être parce qu’ils ne confondent pas l’être et le paraître, peut-être parce qu’ils n’ont pas le temps d’idéaliser et de s’occuper des affaires des autres. Peut-être, tout simplement, parce qu’ils sont victimes de leur dignité ! Putain de métier où l’on a expliqué à leurs aïeuls voilà plus d’un siècle qu’il fallait mutualiser, cotiser, capitaliser… Putain de métier où ils regardent désormais filer les bénéfices des multinationales qu’ils ont eux-mêmes créées. Putain de métier où ceux qui sont censés le défendre confondent parfois défense et intérêt, dans le protocole de ses relations avec un pouvoir qu’il faut éviter de malmener. Putain de métier méprisé par ceux qui font pisser le chien dans le verger d’à côté, par ceux qui se servent impunément à la nuit tombée là où ils ne supportent plus, dans la journée, ni la mouche, ni la poussière du labour, ni le bruit de la benne à vendanger, ni le traitement, ni l’odeur du lisier. Putain de métier auquel, dans son immense mansuétude et à grands renforts de communication, l’Etat va accorder quelques deniers forcement dilués dans le grand boustrophédon des critères d’attributions. Putain de métier où, après les beaux discours et le temps des émotions, chacun le sait bien, les miettes de l’indemnisation seront, une fois de plus, proportionnelles à la franchise des considérations. A moins, mais nous pouvons toujours rêver, que, cette fois ci et les fois suivantes, ceux qui défendent ce « beau métier » et prétendent, dans les journaux ou devant les caméras de télévision, qu’il est impossible de s’en passer, décident une bonne fois pour toutes de le considérer pour ce qu’il est et pour ce qu’il fait.

Commentaire. Voici les propos d'un authentiquei salopard tenus sur une chaîne de télévision sans risque d'être contredit ...

Bougrain-Dubourg veut en finir avec la “surproduction” agricole. La faim dans le monde n’est pas son souci..pic.twitter.com/WeVfE7yKcj

— François Momboisse (@fmomboisse) April 11, 2021

Des bactéries lactiques et leurs métabolites tuées par la chaleur peuvent stimuler la croissance de bifidobactéries dans des communautés fécales fermentées humaines

Lactobacillus

Selon un article paru dans AEM, «Un postbiotique composé de Lactobacilli traité thermiquement a un effet bifidogène en culture pure et dans des communautés fécales fermentées humaines.»

Des bactéries lactiques et leurs métabolites tuées par la chaleur peuvent stimuler la croissance de bifidobactéries dans des communautés fécales fermentées humaines et en culture pure.

Résumé

Le microbiote intestinal a un impact significatif sur la santé de l'hôte. Les interventions diététiques utilisant des probiotiques, des prébiotiques et des postbiotiques ont le potentiel de modifier la composition et la fonction du microbiote. Il a également été démontré que d'autres interventions thérapeutiques, telles que les antibiotiques et la transplantation de microbiote fécal, modifient considérablement le microbiote et ses métabolites. La supplémentation d'un modèle de fermentation fécale de l'intestin humain avec un produit postbiotique, Lactobacillus LB, a conduit à des changements dans la composition du microbiome (c'est-à-dire une augmentation des bifidobactéries bénéfiques) et des changements métaboliques associés (c'est-à-dire une production d'acide accrue). Lactobacillus LB est une préparation traitée thermiquement de biomasse cellulaire et d'un fermentat généré par Limosilactobacillus fermentum CNCM MA65/4E-1b (anciennement Lactobacillus fermentum CNCM MA65/4E-1b) et Lactobacillus delbrueckii subsp. delbrueckii CNCM MA65/4E-2z, souches médicalement pertinentes utilisées pour produire des préparations antidiarrhéiques. En culture pure, Lactobacillus LB stimule également la croissance d'une gamme d'espèces et de souches de bifidobactéries Les préparations de type Lactobacillus LB générées à l'aide d'autres Lactobacillaceae, y compris des bactéries probiotiques disponibles dans le commerce, n'ont pas eu le même impact sur une souche modèle (Bifidobacterium longum subsp. Infantis ATCC 15697). Cette activité bifidogène est stable à la chaleur et aux enzymes et ne peut être attribuée au lactose, qui est un constituant majeur de Lactobacillus LB. L. fermentum CNCM MA65/4E-1b est en grande partie responsable de l'activité observée, et il y a un rôle clair pour les composés inférieurs à 1 kDa.

Importance

En général, les perturbations du microbiote intestinal sont associées à de multiples troubles chez l'homme. La présence de niveaux élevés de Bifidobacterium spp. dans l'intestin humain est généralement considéré comme bénéfique. Les bifidobactéries peuvent être complétées dans l'alimentation (sous forme de probiotiques), ou des bifidobactéries déjà présentes dans l'intestin peuvent être stimulées par la consommation de prébiotiques tels que l'inuline. Nous démontrons que Lactobacillus LB (un produit composé de deux bactéries lactiques tuées par la chaleur et de leurs métabolites) peut stimuler la croissance des bifidobactéries dans des communautés fécales fermentées humaines et en culture pure. Compte tenu du traitement thermique appliqué lors du processus de production, il n'y a pas de risque que les bactéries lactiques colonisent (ou provoquent une bactériémie chez les consommateurs vulnérables comme les nourrissons, les immunodéprimés, etc.). Lactobacillus LB a le potentiel d'affecter la santé humaine en favorisant sélectivement la croissance de bactéries bénéfiques.

Epidémie transfrontalière de cas à Salmonella Bareilly entre la République tchèque et la Slovaquie, de 2017 à 2018

 Une étude parue dans Eurosurveillance fait le point sur une épidémie transfrontalière de cas à Salmonella Bareilly confirmée par séquençage du génome entier entre la République tchèque et la Slovaquie, de 2017 à 2018.

Salmonella spp. sont la troisième cause de maladies bactériennes d'origine alimentaire dans le monde et le deuxième agent zoonotique le plus fréquemment signalé dans l'Union européenne (UE). Le genre bactérien Salmonella comprend les espèces Salmonella enterica et Salmonella bongori. Plus de 2 500 sérotypes de Salmonella enterica ont été identifiés à ce jour, dont beaucoup infectent couramment les animaux (par exemple la volaille, les porcs, les bovins) et les humains. La distribution des sérotypes prédominants dans chaque pays est affectée par les changements dans le commerce mondial des aliments et le bétail, les voyages internationaux et les migrations humaines.

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly (S. Bareilly) appartient au sérogroupe C1 (formule antigénique 6, 7,14:y:1,5) et a été identifié pour la première fois en Inde en 1928. Au Royaume-Uni (Royaume-Uni), 31% de tous les cas humains à S. Bareilly identifiés entre 2005 et 2009 ont été attribués à un voyage depuis l'Inde. Depuis 2004, S. Bareilly a été le plus souvent isolé des épices. Les graines de haricot mungo contaminées ont probablement été à l'origine d'une épidémie de S. Bareilly au Royaume-Uni en 2010, avec un total de 231 cas. Lors d'une épidémie de salmonellose aux États-Unis, qui comprenait 410 cas à S. Bareilly dans 28 États et dans le district de Columbia, les miettes de thon importées d'Inde ont été identifiées comme étant la source en utilisant des méthodes basées sur le séquençage du génome entier (WGS).

Depuis 2016, S. Bareilly fait partie des 20 principaux sérotypes de Salmonella associés aux maladies humaines dans l'Union européenne/Espace économique européen (UE/EEE). Entre 2006 et 2016, S. Bareilly figurait parmi les 25 premiers sérotypes détectés chez l'homme en République tchèque, avec une incidence annuelle allant de 0,04 à 0,23 pour 100 000 habitants (données du système national tchèque de notification électronique des maladies transmissibles). Selon les données du programme national tchèque de lutte contre Salmonella chez la volaille, S. Bareilly a été identifié dans des troupeaux de poulets de chair avec une prévalence allant jusqu'à 0,06%.

La salmonellose est une maladie à déclaration obligatoire en République tchèque et en Slovaquie depuis 1951. Les responsables régionaux de la santé publique notifient les données basées sur les cas au système national de notification électronique des maladies transmissibles (EpiDat/ISIN en République tchèque et Epidemic Intelligence Information System (EPIS) en Slovaquie). Les deux systèmes enregistrent des données sur tous les cas qui répondent à la définition d'un cas confirmé conformément à la décision d'exécution 2119/98/CE de la Commission européenne. Les informations sur le sérotype de Salmonella, fournies par les laboratoires microbiologiques de routine manipulant des échantillons humains, sont incluses dans les systèmes de notification. Ces laboratoires testent généralement un spectre limité de sérotypes uniquement, et S. Bareilly n'est généralement pas inclus. Les laboratoires nationaux de référence (LNR) tchèques et slovaques (le LNR tchèque fait partie de l'Institut national de la santé publique de Prague, le LNR slovaque fait partie de l'autorité de santé publique de Bratislava) fournissent le sérotypage des sérotypes moins courants et confirment les résultats de laboratoires microbiologiques de routine sur demande.

Il existe plusieurs options pour confirmer la parenté des isolats de Salmonella dans les laboratoires. L'analyse par macro-restriction suivie d'une électrophorèse sur gel en champ pulsé (PFGE) est généralement une méthode appropriée pour la détection et l'investigation des épidémies à Salmonella. Cependant, dans certains cas, cela ne fournit pas un pouvoir discriminatoire suffisant pour distinguer les isolats d'épidémie. Par conséquent, les méthodes de typage basées sur le WGS sont maintenant de plus en plus appliquées comme outils d'épidémiologie moléculaire pour aider aux enquêtes sur les épidémies.

Détection de l'épidémie

En août 2017, le nombre de cas humains à S. Bareilly signalés en République tchèque a dépassé le nombre total annuel maximal de cas des 5 années précédentes (n = 25). Cela s'est accompagné d'un nombre accru de demandes des laboratoires microbiologiques de routine au LNR pour l'identification/la confirmation du sérotype de S. Bareilly.

L'épidémie a été reconnue en République tchèque en octobre 2017 après avoir identifié le pulsotype par PFGE de l'épidémie dans une sélection d'isolats de S. Bareilly provenant de la collection d'isolats du LNR tchèque. Ces tests ont été sous-traités à l'Institut de recherche vétérinaire (VRI), Brno, République tchèque, qui fournit des tests PFGE pour l'Administration vétérinaire d'État (SVA), la République tchèque et les secteurs de la santé publique tchèque et slovaque.

Discussion

La République tchèque et la Slovaquie signalent les nombres les plus élevés de cas de salmonellose dans l'UE/EEE, mais il n'y a pas de preuves des sources/vecteurs des épidémies d'origine alimentaire par rapport aux autres pays de l'UE/EEE. La République tchèque et la Slovaquie ont un système de contrôle de la santé publique à deux niveaux (un régional et un national) dans lequel le niveau national sert d'évaluateur des risques et doit être invité par l'autorité régionale de supervisation afin de soutenir une enquête sur une épidémie. L'épidémie signalée ici était dispersée dans les 14 régions tchèques et les huit régions slovaques, avec un faible nombre de cas par région. Par conséquent, l'épidémie n'était reconnaissable qu'au niveau national, ce qui a entraîné une reconnaissance tardive de l'épidémie. Une simple analyse épidémiologique descriptive de la liste de lignes incluant l'âge et le sexe était insuffisante dans la construction d'une hypothèse. Nous avons révélé des lacunes dans la stratégie d'interview actuellement utilisée qui s'est jusqu'à présent concentrée sur la consommation d'œufs et de viande de poulet pour identifier les sources d'épidémies d'origine alimentaire. Par conséquent, nous avons dû trouver et adopter la stratégie la plus efficace pour le dépistage et la confirmation des cas dans les conditions locales. Plus précisément, nous avons appliqué le questionnaire largement dans les deux pays touchés pour la première fois. Cependant, la limite de cette approche était l'application tardive du questionnaire pendant la période de l'épidémie, c'est-à-dire après le pic de l'épidémie lorsque le nombre de nouveaux cas était déjà faible. En conséquence, le nombre de répondants au questionnaire était faible, même si le taux de réponse était élevé (75%). Comme la cause probable de l'épidémie était présente en tant qu'ingrédient commun dans plusieurs types d'aliments, le questionnaire n'a pas fourni une indication claire concernant l'aliment contaminé. Cependant, le questionnaire nous a permis de comprendre que le véhicule était probablement largement distribué par les chaînes de magasins dans les deux pays et n'était pas lié à des produits alimentaires inhabituels ou importés. Nous ne pouvons pas exclure un biais de rappel en raison du délai entre l'apparition des symptômes et l'entrevue.

Nous avons décidé de ne pas mener d'étude analytique en raison du faible nombre de nouveaux cas et de l'hypothèse faible basée sur le questionnaire. Une sensibilisation accrue des autorités alimentaires et vétérinaires a conduit plus tard à l'identification de l'isolat de S. Bareilly étroitement apparenté à de l'œuf en poudre (mélange d'œufs séchés).

Après la reconnaissance de l'isolat génétiquement étroitement lié dans des œufs en poudre, les données du questionnaire ont été réévaluées et une exposition possible à des produits alimentaires contenant des ovoproduits en poudre a été retrouvée dans tous les cas.

La gamme des produits alimentaires suspects était très large (des tablettes de chocolat à la mayonnaise) et leurs marques sont restées non identifiées dans plus de la moitié des cas.

L'utilisation de méthodes de typage basées sur le WGS a conduit à de nombreux retraits réussis dans les épidémies multi-pays. Ces épidémies sont difficiles à détecter car il est difficile de confirmer s'il existe un lien épidémiologique entre les cas. Bien que le sérotypage de routine des isolats de Salmonella puisse être bénéfique dans la phase initiale de détection de l'épidémie, en particulier lorsque le sérotype est rare, des méthodes de typage plus précises sont nécessaires pour la confirmation de l'épidémie. La seule méthode de typage avancée disponible dans les deux pays était la PFGE. Les ressources allouées à de tels événements étant limitées, nous n'avons pas été en mesure de tester tous les isolats humains. Tous nos isolats humains séquencés provenaient de la République tchèque en 2017.

Il a été rapporté que la PFGE de S. Bareilly présentait un faible niveau de discrimination, en particulier pour les souches originaires d'Asie du Sud. Cependant, dans l'épidémie rapportée ici, un pulsotype spécifique pour les isolats des épidémies tchèques et slovaques a été identifié. Différents pulsotypes ont été observés avant et également pendant la période d'épidémie.

Les ovoproduits en poudre sont considérés comme sûrs en raison de leur traitement microbicide (traitement thermique, faible activité de l'eau), mais les séchoirs par atomisation contaminés ont parfois été décrits comme des sources d'épidémie. Les ovoproduits en poudre (jaune d'œuf, blanc d'œuf ou un mélange des deux) servent d'ingrédients à plusieurs produits alimentaires et une inactivation thermique supplémentaire n'est pas nécessaire.

Le propriétaire du séchoir par atomisation pendant la période e ld'épidémie à l'emplacement A disposait d'un vaste réseau de distribution dans les deux pays comprenant des boulangeries, des producteurs de produits semi-finis et des producteurs de confiserie, ce qui est conforme à la répartition nationale des cas. Tous les lots ont été épuisés et consommés au moment où l'isolat étroitement lié dans les produits d'œufs en poudre a été détecté. Le propriétaire actuel du séchoir par atomisation à l'emplacement B a coopéré avec les autorités vétérinaires de l'État pour résoudre le problème de la contamination. L'installation a été fermée et une reconstruction complète de la technologie est en cours.

Conclusion

L'utilisation de méthodes de typage moléculaire nous a permis de relier les cas à S. Bareilly répartis dans deux pays sur une période prolongée. La PFGE a servi avec succès d'outil de première ligne dans l'identification de l'épidémie, et les méthodes basées sur le WGS ont joué un rôle crucial dans la confirmation de l'épidémie et dans l'identification de la source possible. Le questionnaire adopté a été partagé par les deux pays touchés et peut être utilisé en temps opportun dans de futures enquêtes sur des épidémies d'origine alimentaire présumées. Les séchoirs par atomisation contaminés doivent être considérés comme des sources potentielles de contamination croisée des ovoproduits en poudre par Salmonella.

Norvège : Investigation d'une épidémie à Salmonella Agbeni liée à des fruits secs exotiques

Une étude parue dans Eurosurveillance traite de fruits secs exotiques et Salmonella. Des fruits secs exotiques ont provoqué une épidémie à Salmonella Agbeni avec une tableau clinique grave en Norvège, de décembre 2018 à mars 2019.

La salmonellose non typhique est une infection gastro-intestinale caractérisée par de la diarrhée, des nausées et parfois des vomissements et de la fièvre. En 2017, 20 cas confirmés de salmonellose pour 100 000 habitants ont été signalés dans l'Union européenne (UE), ce qui en fait la deuxième infection d'origine alimentaire la plus fréquemment signalée. (c'est toujours le cas en 2019 -aa)

En Norvège, il est obligatoire de signaler tous les cas de salmonellose au Système norvégien de surveillance des maladies transmissibles (MSIS), et les laboratoires de microbiologie médicale soumettent les isolats de Salmonella au Laboratoire national de référence pour les bactéries entéropathogènes (LNR) de l'Institut norvégien de santé publique (NIPH) pour la confirmation et la surveillance épidémiologique moléculaire par séquençage du génome entier (WGS). Le taux d'incidence était de 18 pour 100 000 habitants en 2018.

La majorité des cas sont liés aux voyages, car la Norvège possède peu de réservoirs nationaux connus. Les sérotypes dominants détectés sont Salmonella Typhimurium et Salmonella Enteritidis. Des épidémies impliquant différents sérovars de Salmonella sont observées de manière irrégulière en Norvège, avec quatre foyers nationaux signalés en 2018.

Cas humains

Nous avons identifié la souche épidémique, Salmonella Agbeni, ST2009 et CT2489, parmi les 56 cas, avec ≤ 2 différences alléliques entre les isolats. Un cas avait une double infection à S. Agbeni et Salmonella Wagenia.

Prélèvements alimentaires

Des prélèvements d'aliments ont été collectés sur la base de produits suspects selon les entretiens. Les échantillons alimentaires ont été fournis par les cas, les supermarchés et le distributeur. Des prélèvements de raisins secs, d'arachides et d'épices différentes étaient tous négatifs pour Salmonella spp. En tout, neuf emballages ouverts de Mix A provenant de cas et deux emballages intacts de Mix A provenant de supermarchés ont été analysés. S. Agbeni a été détecté dans tous les sachets ouverts et dans un sachet intact. De plus, un autre sérovar de Salmonella, S. Gamaba, a été détecté dans deux emballages intacts de Mix A.

Le WGS a confirmé que les isolats de S. Agbeni étaient identiques à la souche épidémique avec ≤ 2 différences alléliques entre les isolats. Les isolats détectés de S. Gamaba à partir des deux sachets de Mix A étaient identiques: ST5862 et CT2581. De plus, un isolat de patient à S. Gamaba qui était identique aux isolats du mix A par WGS a été identifié dans la base de données du laboratoire au LNR. Nous avons interrogé le patient, qui a signalé l'apparition des symptômes début janvier 2019, et confirmé la consommation de Mix A.

Investigation

Il y avait quelques limites à cette enquête. Premièrement, le système de surveillance passive peut n'avoir détecté qu'une faible proportion de cas, et principalement ceux présentant les symptômes les plus graves. Les personnes atteintes de gastro-entérite simple ne recherchent souvent pas de soins de santé. Cela pourrait influencer les déterminants épidémiologiques de l'infection et le profil démographique des cas.

Deuxièmement, les entretiens rétrospectifs peuvent conduire à un biais de rappel, en particulier pour les participants qui ont signalé des symptômes au début de l'épidémie.

Pour surmonter le biais de rappel, nous avons recueilli les reçus des magasins et introduit les questionnaires électroniques qui comprenaient des photos d'aliments spécifiques. Cela a été très utile pour l'enquête sur l'épidémie, car certains cas ne se souvenaient pas qu'ils avaient consommé le mélange A, mais cela a été vérifié par des reçus et/ou le questionnaire électronique.

Troisièmement, les enquêtes épidémiologiques et microbiologiques ont été menées en parallèle et ont eu une influence l'une sur l'autre. Lorsque nous avons commencé l'étude cas-témoins appariés, il y avait déjà des communications médiatiques sur le véhicule probable de l'épidémie. Ainsi, nous avons dû arrêter le recrutement avant de recruter un nombre suffisant de couples appariés, et nous avons dû effectuer une analyse inégalée des enregistrements obtenus. Nous sommes convaincus que notre décision était correcte, même si l'analyse était basée sur peu de cas, car les résultats biaisés de l'analyse cas-témoins s'alignaient très bien avec toutes les autres enquêtes et confirmaient la source par une forte association épidémiologique.

La constatation a été vérifiée par la détection de la souche épidémique à la fois dans le produit alimentaire et dans les cas humains.

Les fruits secs, produit à risque ?

Cette épidémie a mis en évidence des fruits secs comme un produit à risque d'infections d'origine alimentaire, ce qui est particulièrement préoccupant pour les produits prêts à consommer. Les experts en santé publique, les cliniciens et les microbiologistes doivent être conscients de ce risque, en particulier en cas d'épidémies avec des sérotypes rares de Salmonella. La présente investigation souligne l'importance d'une enquête intersectorielle sur l'épidémie afin d'identifier le vecteur alimentaire responsable et permettre son rappel, ainsi que l'importance de la traçabilité de la chaîne alimentaire à l'échelle de l'UE. Des enquêtes supplémentaires sont nécessaires pour estimer le risque des produits de fruits secs pour les agents pathogènes d'origine alimentaire. Pour faire le suivi de cette question en Norvège, la NFSA a lancé un échantillonnage accru de ces produits dans le programme de surveillance de Salmonella pour 2019 et 2020, ce qui fournira plus d'informations sur le niveau de contamination de ces produits.

Le microbiome intestinal joue un rôle dans l'autisme, selon une étude

«Le microbiome intestinal joue un rôle dans l'autisme», source ASM News du 6 avril 2021.

Une nouvelle étude a démontré que le trouble du spectre autistique est lié à des changements dans le microbiome intestinal. Les résultats sont publiés cette semaine dans mSystems, une revue en accès libre de l'American Society for Microbiology.

«Sur le plan longitudinal, nous avons pu voir qu'au sein d'un individu, les changements du microbiome étaient associés à des changements de comportement», a déclaré la chercheuse principale de l'étude Catherine Lozupone, microbiologiste au Département de médecine, Université du Colorado, Campus médical d'Anschutz. Aurora, Colorado. «Si nous voulons comprendre le lien entre le microbiome intestinal et l'autisme, nous avons besoin de plus d'efforts de collaboration entre les différentes régions et centres pour obtenir des informations généralisables vraiment complètes sur cette relation.»

Dans la nouvelle étude, les chercheurs ont comparé la composition du microbiome intestinal entre des personnes atteintes d'un trouble du spectre autistique et des témoins neurotypiques (neurotypique est un mot créé par des personnes autistes pour qualifier les gens qui ne le sont pas.) en Arizona et au Colorado à l'aide de méthodes standardisées d'extraction et de séquençage d'ADN. Les chercheurs ont découvert que la composition du microbiome intestinal différait entre les individus de l'Arizona et ceux du Colorado et que les symptômes gastro-intestinaux étaient significativement plus élevés chez les personnes autistes que chez les personnes sans autisme en Arizona mais pas au Colorado. La composition du microbiome intestinal était significativement associée à l'autisme lors du contrôle de l'emplacement du site d'étude, mais pas lors du contrôle des symptômes gastro-intestinaux.

Les chercheurs ont également évalué longitudinalement la relation entre le microbiome intestinal et la gravité du comportement de l'autisme, le régime alimentaire et les symptômes gastro-intestinaux chez les individus du Colorado. «Nous avons contacté les participants à l'étude tous les trois mois environ et leur avons demandé de remplir un certain nombre de cheklistes, l'une étant la liste de contrôle du comportement aberrant qui examine les comportements associés comme un discours inapproprié et des mouvements répétitifs», a déclaré le Dr Lozupone. «Un questionnaire sur la fréquence des aliments a demandé aux participants ce qu'ils avaient mangé la semaine dernière. Nous avons également demandé quels types de symptômes gastro-intestinaux ressentaient les participants. Nous avons obtenu des échantillons fécaux pour examiner le microbiome. Nous avons collecté toutes ces données pour voir comment elles étaient liées les unes aux autres.»

Dans l'analyse longitudinale, les chercheurs ont constaté que la différence des niveaux de léthargie/retrait social mesurés chez les individus à différents moments était en corrélation avec le degré de changement de la composition du microbiome intestinal et qu'une aggravation du discours inapproprié entre les points dans le temps était associée à une diminution du microbiome intestinal. la diversité.

«Nous avons besoin de plus d'études, mais nos travaux montrent que le microbiome intestinal joue un rôle dans la provocation des symptômes chez les enfants atteints de troubles du spectre autistique», a dit le Dr Lozupone.

«Cela confirme davantage le fait que le microbiome intestinal pourrait être une cible thérapeutique précieuse pour les enfants atteints de troubles du spectre autistique. Je sais que certains laboratoires ont exploré des choses comme la greffe de microbiome fécal chez ces enfants et ont obtenu des résultats prometteurs.»

Des travaux supplémentaires visant à démêler les mécanismes en jeu pourraient conduire à de nouvelles thérapies pour les enfants autistes.

Mise à jour du 12 avril 2021. On lira ce tweet de Mme Emmanuelle Ducros, à propos d'une émission sur la chaîne Arte ...

Je refais pour qu'on se rende compte de la manipulation.

@ARTEfr affirme dans un reportage que l'autisme provient du glyphosate, en superposant deux courbes, comme ça.

On peut manipuler de la même façon en affirmant que l'autisme vient de la consommation bio.

Honteux non? pic.twitter.com/t2DjirmFWx

— Emmanuelle Ducros (@emma_ducros) April 12, 2021