Norvège : Investigation d'une épidémie à Salmonella Agbeni liée à des fruits secs exotiques

Une étude parue dans Eurosurveillance traite de fruits secs exotiques et Salmonella. Des fruits secs exotiques ont provoqué une épidémie à Salmonella Agbeni avec une tableau clinique grave en Norvège, de décembre 2018 à mars 2019.

La salmonellose non typhique est une infection gastro-intestinale caractérisée par de la diarrhée, des nausées et parfois des vomissements et de la fièvre. En 2017, 20 cas confirmés de salmonellose pour 100 000 habitants ont été signalés dans l'Union européenne (UE), ce qui en fait la deuxième infection d'origine alimentaire la plus fréquemment signalée. (c'est toujours le cas en 2019 -aa)

En Norvège, il est obligatoire de signaler tous les cas de salmonellose au Système norvégien de surveillance des maladies transmissibles (MSIS), et les laboratoires de microbiologie médicale soumettent les isolats de Salmonella au Laboratoire national de référence pour les bactéries entéropathogènes (LNR) de l'Institut norvégien de santé publique (NIPH) pour la confirmation et la surveillance épidémiologique moléculaire par séquençage du génome entier (WGS). Le taux d'incidence était de 18 pour 100 000 habitants en 2018.

La majorité des cas sont liés aux voyages, car la Norvège possède peu de réservoirs nationaux connus. Les sérotypes dominants détectés sont Salmonella Typhimurium et Salmonella Enteritidis. Des épidémies impliquant différents sérovars de Salmonella sont observées de manière irrégulière en Norvège, avec quatre foyers nationaux signalés en 2018.

Cas humains

Nous avons identifié la souche épidémique, Salmonella Agbeni, ST2009 et CT2489, parmi les 56 cas, avec ≤ 2 différences alléliques entre les isolats. Un cas avait une double infection à S. Agbeni et Salmonella Wagenia.

Prélèvements alimentaires

Des prélèvements d'aliments ont été collectés sur la base de produits suspects selon les entretiens. Les échantillons alimentaires ont été fournis par les cas, les supermarchés et le distributeur. Des prélèvements de raisins secs, d'arachides et d'épices différentes étaient tous négatifs pour Salmonella spp. En tout, neuf emballages ouverts de Mix A provenant de cas et deux emballages intacts de Mix A provenant de supermarchés ont été analysés. S. Agbeni a été détecté dans tous les sachets ouverts et dans un sachet intact. De plus, un autre sérovar de Salmonella, S. Gamaba, a été détecté dans deux emballages intacts de Mix A.

Le WGS a confirmé que les isolats de S. Agbeni étaient identiques à la souche épidémique avec ≤ 2 différences alléliques entre les isolats. Les isolats détectés de S. Gamaba à partir des deux sachets de Mix A étaient identiques: ST5862 et CT2581. De plus, un isolat de patient à S. Gamaba qui était identique aux isolats du mix A par WGS a été identifié dans la base de données du laboratoire au LNR. Nous avons interrogé le patient, qui a signalé l'apparition des symptômes début janvier 2019, et confirmé la consommation de Mix A.

Investigation

Il y avait quelques limites à cette enquête. Premièrement, le système de surveillance passive peut n'avoir détecté qu'une faible proportion de cas, et principalement ceux présentant les symptômes les plus graves. Les personnes atteintes de gastro-entérite simple ne recherchent souvent pas de soins de santé. Cela pourrait influencer les déterminants épidémiologiques de l'infection et le profil démographique des cas.

Deuxièmement, les entretiens rétrospectifs peuvent conduire à un biais de rappel, en particulier pour les participants qui ont signalé des symptômes au début de l'épidémie.

Pour surmonter le biais de rappel, nous avons recueilli les reçus des magasins et introduit les questionnaires électroniques qui comprenaient des photos d'aliments spécifiques. Cela a été très utile pour l'enquête sur l'épidémie, car certains cas ne se souvenaient pas qu'ils avaient consommé le mélange A, mais cela a été vérifié par des reçus et/ou le questionnaire électronique.

Troisièmement, les enquêtes épidémiologiques et microbiologiques ont été menées en parallèle et ont eu une influence l'une sur l'autre. Lorsque nous avons commencé l'étude cas-témoins appariés, il y avait déjà des communications médiatiques sur le véhicule probable de l'épidémie. Ainsi, nous avons dû arrêter le recrutement avant de recruter un nombre suffisant de couples appariés, et nous avons dû effectuer une analyse inégalée des enregistrements obtenus. Nous sommes convaincus que notre décision était correcte, même si l'analyse était basée sur peu de cas, car les résultats biaisés de l'analyse cas-témoins s'alignaient très bien avec toutes les autres enquêtes et confirmaient la source par une forte association épidémiologique.

La constatation a été vérifiée par la détection de la souche épidémique à la fois dans le produit alimentaire et dans les cas humains.

Les fruits secs, produit à risque ?

Cette épidémie a mis en évidence des fruits secs comme un produit à risque d'infections d'origine alimentaire, ce qui est particulièrement préoccupant pour les produits prêts à consommer. Les experts en santé publique, les cliniciens et les microbiologistes doivent être conscients de ce risque, en particulier en cas d'épidémies avec des sérotypes rares de Salmonella. La présente investigation souligne l'importance d'une enquête intersectorielle sur l'épidémie afin d'identifier le vecteur alimentaire responsable et permettre son rappel, ainsi que l'importance de la traçabilité de la chaîne alimentaire à l'échelle de l'UE. Des enquêtes supplémentaires sont nécessaires pour estimer le risque des produits de fruits secs pour les agents pathogènes d'origine alimentaire. Pour faire le suivi de cette question en Norvège, la NFSA a lancé un échantillonnage accru de ces produits dans le programme de surveillance de Salmonella pour 2019 et 2020, ce qui fournira plus d'informations sur le niveau de contamination de ces produits.