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«Des isolats de Listeria monocytogenes associés aux ruminants appartiennent préférentiellement à des clones hypervirulents qui sont associés aux produits laitiers: une étude longitudinale dans 19 élevages», source article publié dans Environmental microbiology du 4 décembre 2021. L’article est disponible en intégralité.
Les objectifs de la présente étude étaient: (i) déterminer la prévalence de Listeria spp. Chez des ruminants laitiers individuels et l'environnement de l'exploitation dans des exploitations laitières espagnoles selon une étude longitudinale; (ii) caractériser la diversité génétique et la structure des populations de L. monocytogenes dans les exploitations laitières en utilisant le séquençage du génome entier; et (iii) pour comprendre la transmission de L. monocytogenes au niveau de l’exploitation laitière et les facteurs de risque [saison, hygiène de production, nombre de lactation et les jours de lactation actuelle] qui l'influencent.
Dans cette étude, la prévalence de L. monocytogenes détectée dans les exploitations laitières (3,8% dans des échantillons de matières fécales et 2,5% dans des échantillons de l'environnement de l’exploitation laitière) était inférieure à celle précédemment signalée dans les exploitations laitières sans cas clinique de listériose (prévalence de l'échantillon fécal de 0% à 60% chez les bovins et 14,2% chez les ovins) dans des exploitations laitères des États-Unis et d'Europe. Les différences de climat et de gestion de l'exploitation (par exemple, les aliments utilisés) entre les différentes régions géographiques peuvent expliquer la faible prévalence de L. monocytogenes dans notre étude par rapport aux études précédentes réalisées dans les pays du Nord.
L. monocytogenes a été détecté plus fréquemment chez des élevages bovins que dans des élevages de petits ruminants, en accord avec des études antérieures concernant l'épidémiologie de la listériose chez les ruminants Fait intéressant, l'espèce pathogène, L. ivanovii, souvent signalée chez les petits ruminants n'a été détectée dans aucune de nos exploitations laitières, ce qui pourrait être dû à sa prévalence relativement faible ou à d'éventuels biais des protocoles d'isolement qui ont généralement été optimisés pour la récupération de L. monocytogenes. Nos résultats sont en accord avec d'autres rapports utilisant des approches basées sur la culture montrant que l'incidence de L. innocua dans les fèces des ruminants est plus élevée (9,7% à 22,7%) que celle de L. monocytogenes (1,8% à 9,3%), bien qu'il ait été démontré que L. innocua peut devenir plus important que L. monocytogenes au cours des protocoles d'enrichissement masquant sa détection.
Bien que la consommation d'ensilage contaminé soit considérée comme la principale source d'infection pour les ruminants, jusqu'à un tiers des cas de listériose animale n'ont pas de lien évident entre la listériose et l'alimentation en ensilage. Dans cette étude, dans 50% des exploitations laitières où des excrétions fécales ont été détectées, aucune souche de L . monocytogenes pourrait être détecté dans les aliments pour animaux, les mangeoires ou les abreuvoirs. Il a été suggéré que la faune, le personnel de l’exploitation laitière ou les visiteurs, l'acquisition de nouveaux animaux et/ou de matériel agricole pourraient également véhiculer L. monocytogenes dans les exploitations.
La majorité des isolats récupérés ici appartenaient à la lignée I (en particulier à SL1/CC1, SL219/CC4 et SL87/CC87) qui est significativement associée à une origine clinique à la fois chez l'homme et l'animal. Il a été démontré que CC1 et CC4 sont fortement associés aux produits laitiers, étant plus invasifs (hypervirulents) et colonisant mieux la lumière intestinale et une cause de plusieurs épidémies de listériose humaine. CC87 a déjà été signalé comme prédominant dans les isolats d'origine alimentaire et cliniques en Chine et lié à deux épidémies dans le nord de l'Espagne.
Il est intéressant de noter que 21% des CTs (cgMLST types -aa) détectés ici n'étaient pas uniques à cette étude et comprenaient des génotypes précédemment détectés dans le contexte de la surveillance de la listériose en Europe et en Océanie. Ces résultats soulignent l'importance des programmes de surveillance chez les animaux des exploitations laitières, même en l'absence de signes de maladie, pour prévenir la transmission de pathogènes à l'homme à travers la chaîne alimentaire. Cela serait également particulièrement important chez les vaches lors de leur deuxième lactation et pendant les périodes hivernales, lorsque la prévalence de L. monocytogenes était significativement plus élevée. Des études antérieures ont également montré que la prévalence de L. monocytogenes dans les élevages bovins était plus élevée pendant l'hiver et qu'une transition inadéquate de la première à la deuxième lactation pouvait altérer le système immunitaire et prédisposent à la colonisation de L. monocytogenes. Nos résultats soulignent également l'importance de la gestion des antibiotiques en médecine vétérinaire, puisque la résistance à la tétracycline a été détectée plus fréquemment dans les isolats de L. innocua provenant des exploitations laitières utilisant cet antibiotique.
ici, les mêmes génotypes ont été retrouvés chez plusieurs animaux et surfaces au sein des mêmes exploitations laitières, bien que la majorité d'entre eux (72%) étaient sporadiques. De plus, à l'exception d'un mouton, des génotypes identiques n'ont pas pu être détectés chez le même animal au cours de différentes saisons, ce qui suggère que la période d'excrétion fécale est plus courte que le laps de temps entre nos dates d'échantillonnage (14 à 135 jours). En effet, le transport fécal de L. monocytogenes chez les humains adultes en bonne santé est également signalé comme transitoire et des études expérimentales antérieures chez des moutons inoculés par voie orale avec une dose élevée de L. monocytogenes (1010unités formant colonies) ont montré que l'excrétion fécale n'a duré que 10 jours. Des études chez les ruminants sauvages et domestiques suggèrent que les animaux peuvent héberger silencieusement L. monocytogenes dans les amygdales même sans rejet fécal, ce qui pourrait expliquer pourquoi L. monocytogenes n'a pas été détecté dans le excréments d'un troupeau de moutons où s'est déclarée une épidémie de listériose.
En résumé, nos données montrent que (i) L. innocua et L. monocytogenes étaient les Listeria spp. dans les fèces des ruminants laitiers et les environnements associés aux exploitations laitière; (ii) les ruminants isolés peuvent héberger L. monocytogenes seul ou avec L. innocua sans signes cliniques d'infection; (iii) L. monocytogenes a pu être isolé dans la moitié des exploitations laitières échantillonnées; (iv) les clones hypervirulents de L. monocytogenes CC1 et CC4, qui sont parmi les CC les plus courants de L. monocytogenes responsables de l'infection humaine, représentaient 30% des isolats de L. monocytogenes récupérés dans cette étude et ont été principalement obtenus à partir d'échantillons associés à l'hôte (fèces); (v) la prévalence globale de L. monocytogenes était plus élevée en hiver qu'en automne dans les élevages de bovins et plus élevée en hiver et au printemps qu'en automne dans les élevages ovins; et (vi) l'excrétion fécale de L. monocytogenes était intermittente et les vaches étaient plus susceptibles d'excréter L. monocytogenes lors de leur deuxième lactation.
Nos données sont cohérentes avec l'hypothèse selon laquelle des exploitations laitières peuvent favoriser la sélection de clones invasifs de L. monocytogenes, qui sont excrétés dans les fèces plus efficacement que les clones hypovirulents, et constituent un réservoir de souches hypervirulentes qui peuvent coloniser les produits laitiers. Cette étude améliore la compréhension de Listeria spp. la prévalence et l'écologie dans l'environnement des ruminants laitiers et peuvent contribuer à l'élaboration de stratégies efficaces de surveillance et de contrôle des maladies pour réduire à la fois le nombre de cas humains et animaux de listériose.
*Analyses cgMLST (core genome MLST): cgMLST (core genome MLST): Les séquences d’une série de gènes du 'génome de base' sont obtenues par ‘Whole genome sequencing’ et comparées à une base de données en ligne (Institut Pasteur, Paris).
Merci à Joe Whitworth de Food safety News d'avoir communiqué cette information.
