Lorsqu'ils sont préparés pour le transport, les pommes et autres fruits sont souvent traités avec un fongicide pour éviter l’altérioration et prolonger la durée de conservation. La pratique préserve la fraîcheur, mais c'est peut-être une arme à double tranchant: cela peut aider à sélectionner et à favoriser la transmission de levures pathogènes multirésistantes.
Une étude publiée cette semaine dans mBio, une revue en accès libre de l'American Society for Microbiology, offre de nouvelles preuves de cette idée.
«Des études antérieures ont examiné l'effet des fongicides sur le pathogène humain Aspergillus fumigatus», a dit la mycologue Anuradha Chowdhary de l'Université de Delhi, mais de nouveaux travaux se concentrent sur des souches résistantes aux antibiotiques de Candida auris, une levure pathogène qui se propage rapidement dans les hôpitaux. et a été isolé de la nature. «Les fongicides utilisés en agriculture peuvent sélectionner par inadvertance des champignons résistants aux antibiotiques», a dit Chowdhary.
Elle et ses collaborateurs ont passé au crible les surfaces de 84 fruits, représentant 9 types de fruits d'arbres différents, à la recherche de C. auris pathogènes et d'autres levures. Les fruits ont été récoltés en 2020 et 2021 dans des régions du nord de l'Inde et comprenaient 62 pommes, 20 cueillies dans des vergers et 42 achetées sur un marché de Delhi. Chaque espèce de fruit hébergeait au moins 1 type de levure.
Les scientifiques se sont concentrés sur les pommes. Ils ont trouvé des souches résistantes aux antibiotiques de C. auris sur un total de 8 pommes (13%) et ont utilisé le séquençage du génome entier pour identifier 16 colonies distinctes. Les pommes comprenaient 5 variétés ‘Red Delicious’ et 3 variétés ‘Royal Gala’. Ces 8 pommes avaient toutes été entreposées avant l'achat et aucune des pommes fraîchement cueillies n'hébergeait C. auris>«Le groupe a trouvé d'autres souches de Candida sur les pommes conditionnées», a dit le microbiologiste Jianping Xu de l'Université McMaster à Hamilton, Ontario. Xu a codirigé l'étude avec Chowdhary.
C. auris est résistant à de nombreux antibiotiques. Il a été identifié pour la première fois en 2009 au Japon, et depuis lors, il a émergé ou s'est propagé à tous les continents habités. Les chercheurs ont étudié l'origine et la propagation du pathogène. «Nous ne comprenons toujours pas vraiment les forces qui conduisent à l'émergence simultanée de plusieurs groupes génétiques distincts de C. auris», a dit Xu. Une étude menée par Chowdhary et Xu publiée l'année dernière dans mBio a été la première à isoler C. auris d'un environnement naturel, les marais et les plages de sable d'un écosystème côtier naturel des îles Andaman, Inde.
Les nouvelles découvertes suggèrent que les pommes pourraient être une force sélective du pathogène et l'aider à se propager. Bien que l'étude se soit concentrée sur des fruits récoltés dans le nord de l'Inde, Xu a souligné que la propagation de C. auris n'est pas un phénomène spécifique à l'Inde. C'est une menace mondiale: en 2019, le Centers for Disease Control and Prevention ont identifié C. auris comme l'un des 5 pathogènes qui constituent une menace urgente pour la santé publique dans le monde. Pour comprendre comment répondre à la menace du pathogène pour l'homme, les chercheurs doivent savoir comment il se déplace à travers d'autres systèmes naturels.
«Lorsque nous examinons les pathogènes humains, nous avons tendance à regarder ce qui nous est immédiat», a dit Xu. «Mais nous devons voir cela plus largement. Tout est connecté à tout le système. Les fruits ne sont qu'un exemple.»
Les champignons sont une partie importante de l'environnement, et Chowdhary a dit que la nouvelle étude montre comment l'environnement, les animaux et les humains sont tous connectés, le principe central du concept de One Health (Une seule santé) «Le concept One Health justifie des efforts continus et notre attention pour prévenir la transmission des infections», a-t-elle dit.
