A propos du diagnostic des STEC en Suisse

Cet article paru dans Eurosurveillance a pour titre, « Les modifications apportées au diagnostic des STEC induisent-elles une interprétation erronée des données de surveillance des maladies en Suisse? Tendances temporelles de la positivité, 2007 à 2016. »

Contexte

Les cas confirmés en laboratoire de Escherichia coli producteurs de shigatoxines (STEC) sont à déclarer au Système national de notification des maladies infectieuses en Suisse depuis 1999. Depuis 2015, une forte augmentation du nombre de cas a été observée. À peu près au même moment, la PCR multiplexe syndromique a commencé à remplacer d'autres méthodes de diagnostic dans la pratique de laboratoire standard pour les analyses de pathogènes gastro-intestinaux, ce qui suggère que l'augmentation des cas notifiés est due à un changement dans les pratiques et les nombres de tests.

Objectif

Cette étude a examiné l'impact des changements dans les méthodes de diagnostic, en particulier l'introduction de panels de PCR multiplexe, sur les données de surveillance de routine des STEC en Suisse.

Méthodes

Nous avons analysé les données de laboratoire de routine de 11 laboratoires, qui ont rapporté 61,9% de tous les cas de STEC de 2007 à 2016 pour calculer la positivité, c'est-à-dire le taux du nombre de tests STEC positifs divisé par le nombre total de tests effectués.

Résultats

L'introduction de la PCR multiplexe a eu un fort impact sur la fréquence des tests STEC et les cas identifiés, le nombre de tests effectués ayant été multiplié par sept entre 2007 et 2016. Pourtant, la positivité normalisée selon l'âge et le sexe est passée de 0,8% en 2007 à 1,7% en 2016.

Conclusion

Une positivité croissante suggère que l'augmentation des notifications de cas ne peut être attribuée à une seule augmentation du nombre de tests. Par conséquent, nous ne pouvons pas exclure une réelle tendance épidémiologique de l'augmentation observée. Moderniser le système de notification pour combler les lacunes actuelles en matière de disponibilité des informations, par exemple, des méthodes de diagnostic et une meilleure triangulation de la présentation clinique, des informations sur le diagnostic et le sérotype sont nécessaires pour faire face aux maladies émergentes et aux progrès technologiques.

Référence

Fischer Fabienne Beatrice, Saucy Apolline, Schmutz Claudia, Mäusezahl Daniel. Do changes in STEC diagnostics mislead interpretation of disease surveillance data in Switzerland? Time trends in positivity, 2007 to 2016. Euro Surveill. 2020;25(33):pii=1900584. 

https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.33.1900584

A noter la publication de cet article, Augmentation inattendue du nombre de déclarations d’infections à E. coli entéro-hémorragique ces derniers mois en Suisse : influence des nouvelles méthodes de PCR multiplexe employées pour le diagnostic primaire? (données : état au 5 novembre 2015). Bulletin de l’OFSP.

On peut y lire,

Toutefois, ces nouvelles techniques comportent également un inconvénient de taille qu’il importe de signaler ici. L’enquête épidémiologique relative à un foyer de toxi-infections repose sur l’isolation des agents pathogènes. Etant donné que les méthodes de PCR multiplexe n’ont pas besoin des cultures, le risque serait de ne plus pratiquer ces dernières et, ainsi, de ne plus confirmer le lien épidémiologique entre les cas et les denrées alimentaires. Par conséquent, si ces méthodes faisaient reculer les cultures, ne serait ce qu’en partie, l’exploration des flambées serait très limitée, voire impossible. Comme cette évolution doit absolument être évitée, il est important, surtout quand on suspecte l’existence d’une flambée, d’envoyer des échantillons au Centre national de référence (NENT) en vue de l’isolation des germes.

Mise à jour du 27 août 2020. On lira:

• E. coli productrices de shigatoxines (STEC) dans les denrées alimentaires : évaluation des risques microbiologiques, document d’aide à la décision pour l’évaluation de la présence de STEC dans les denrées alimentaires 18 juin 2020.
• Escherichia coli entérohémorragiques (EHEC). Maladies infectieuses à déclaration obligatoire Suisse et Principauté du Liechtenstein. État semaine 34/2020 (25.08.2020). La date de réception de la déclaration est déterminante pour l'axe temporel. Incidence mensuelle pour 100 000 habitants.

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Envois non sollicités de semences en provenance de Chine ou d'Asie à des particuliers français

Le ministère de l’agriculture informe le 20 août 2020 à propos d’« Envois non sollicités de semences en provenance de Chine à des particuliers français ».

Fin juillet, aux États-Unis et au Canada, des sachets de semences en provenance de Chine, dans la plupart des cas, ont été reçus par des particuliers ne les ayant pas commandés. Des personnes vivant en France viennent de faire part de situations identiques. Le Royaume-Uni rencontre aussi un problème similaire, de même qu’Israël.

Effectivement, le 30 juillet, un article de Dan Flynn dans Food Safety News rapportait « Des envois mystérieux de semences en provenance de Chine laissent l'USDA sans indice ».

Des agents de vulgarisation des comtés aux commissaires d'État à l'agriculture en passant par l'USDA, le public est averti des expéditions de «semences mystérieuses et non sollicitées» en provenance de Chine qui pourraient apparaître dans leurs boîtes aux lettres. Les semences non sollicitées proviennent de Chine ou peut-être d'autres régions d'Asie.

Les paquets de semences - souvent étiquetés comme des bijoux ou des jouets - sont expédiés vers des boîtes postales à travers l'Amérique. Les consommateurs sont avertis de ne pas ouvrir ou planter les graines.

La crainte immédiate est que les graines pourraient propager une espèce envahissante qui pourrait «dévaster l’environnement, déplacer ou détruire des plantes et des insectes indigènes, endommager gravement les cultures et empoisonner le bétail», selon Louie Mendoza, commissaire à l’agriculture du comté de Butte, Californie. Le risque d'infestations d'espèces envahissantes est une menace pour l'agriculture nationale.

Le communiqué du ministère de l'agriculture indique: 

Ces semences d’origine inconnue peuvent être vectrices de maladies non présentes sur le territoire français ou s’avérer être des plantes invasives. C’est pourquoi il est essentiel de ne surtout pas les semer.

Par conséquent, si vous recevez des sachets de semences non sollicitées, il vous est demandé de les placer dans un sac plastique et de jeter ce sac hermétiquement clos dans votre poubelle d’ordures ménagères afin que les semences soient détruites.

Avant de les jeter, il est demandé, si possible, à des fins d’investigations, d’envoyer des photos des bordereaux d’envoi des emballages et des sachets contenant les graines à la Brigade nationale d’enquêtes vétérinaires et phytosanitaires du ministère de l’agriculture et de l’alimentation : bnevp.dgal@agriculture.gouv.fr 

En cas de contact avec les semences, il est également recommandé de bien se laver les mains et le cas échéant, de désinfecter tout objet ayant été en contact avec elles. 

Pour toute information complémentaire, vous pouvez contacter le Service régional de l’alimentation de votre DRAAF.

Mise à jour du 26 septembre 2020. Le ministère de l'agriculture reproduit le communiqué précité en début d'article le 25 septembre 2020, soit un peu plus d'un mois après le communiqué initial ...

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Royaume-Uni: Epilogue dans une affaire de chantage à la contamination de pots pour bébés

« Un agriculteur reconnu coupable d'avoir mis du métal dans des aliments pour bébés », source article de Joe Whitworth paru le 21 août 2020 dans Food Safety News.

Un homme qui a mis des éclats de métal dans des pots pour bébés au Royaume-Uni a été reconnu coupable de chantage et de produits contaminés.

Nigel Wright a commencé à menacer la chaîne de supermarchés Tesco au printemps 2018, écrivant à son magasin local dans le Lincolnshire et l’avertissant à moins qu'ils ne lui versent 750000 £ de bitcoin, une monnaie en ligne qui permettait à l'homme de 45 ans de rester anonyme, qu’il contaminerait les aliments dans les rayons.

Sous le pseudonyme de «Guy Brush», Wright, un agriculteur, a exigé de plus grosses sommes d’argent allant jusqu’à 1,5 million de livres en bitcoins, disant à Tesco qu’il contaminerait également des bocaux avec Salmonella, de la poudre blanche et des couteaux.

Il a été condamné fin septembre.

Rappel de pots pour bébés chez Heinz et Cow & Gate

À la mi-décembre 2019, une mère de Lockerbie a trouvé de petits fragments de couteau dans un pot pour bébés qu'elle s'apprêtait à donner à son enfant. Lorsqu'un rappel à l'échelle nationale a été émis ce mois-là, une famille de Rochdale a également contacté l'entreprise pour lui dire qu'elle avait jeté deux pots pour bébés contenant du métal.

Ce rappel impliquait que Heinz et Tesco avaient retiré de la vente toute la gamme d'aliments pour bébés Heinz By Nature de 7 mois et plus après la découverte qu'un pot avait été alors contaminé par deux fragments métalliques tranchants retrouvés dans le pot. Un mois plus tard, Cow & Gate et Tesco ont rappelé 15 variétés de pots pour bébés Cow & Gate de 7 mois et plus vendus au Royaume-Uni suite à des inquiétudes dont certains pots auraient pu être contaminés.

Wright aurait placé trois pots d’aliments pour bébés avec des éclats de métal dans deux magasins Tesco entre mai 2018 et février 2020.

Charles White, du Crown Prosecution Service, a déclaré: « Wright a exigé une somme d’argent extraordinaire, et était tellement déterminé à l’obtenir qu’il était prêt à contaminer des aliments pour enfants dans les rayons des supermarchés. C'est un témoignage de la vigilance des parents et des mesures rapides prises par le supermarché, la police et d'autres agences pour assurer la sécurité sanitaire du public.

Enquête et arrestation

Lors de son arrestation en février 2020, Wright a déclaré à la police qu'il avait été menacé d'extorsion par des personnes qui disaient qu'elles nuiraient à sa famille s'il ne le faisait pas.

L'enquête a été menée par l'Unité des crimes majeurs du Bedfordshire, du Cambridgeshire et du Hertfordshire, assistée par des partenaires tels que la National Crime Agency ainsi que Tesco, Heinz et Cow & Gate. L’enquête a été soutenue par la Food Standards Agency, Food Standards Scotland, Public Health England, Public Health Scotland et Police Scotland.

L'opération Hancock, qui était la plus grande enquête de chantage jamais menée au Royaume-Uni, était dirigée par le chef de police adjoint du Hertfordshire Bill Jephson.

« Tout au long de cette enquête, notre objectif principal était de protéger le public et d'identifier l'individu ou le groupe impliqué, car ils n'avaient manifestement aucune inquiétude quant à l'impact de leurs actions. J'espère que la condamnation de Nigel Wright aura un effet dissuasif sur quiconque pense que le chantage est une option criminelle viable. Les ressources dont disposent les forces de l'ordre pour répondre aux menaces de cette nature sont importantes car des crimes comme celui-ci ne seront tout simplement pas tolérés », a-t-il déclaré.

L’accusation a pu prouver qu’il n’y avait aucune preuve à l’appui des allégations de Wright. Au lieu de cela, la police du Hertfordshire a trouvé des éléments indiquant qu'il avait agi seul.

Preuves contre Wright

Un ordinateur portable a été découvert dans sa Toyota avec des brouillons des lettres d'extorsion et l'accès au compte de messagerie que «Guy Brush» avait utilisé pour communiquer avec Tesco.

Wright a recherché en ligne avec les termes «tesco trafiqué» et «autopsie de garçon» et avait lu un article sur le rappel d'aliments pour bébés.

La Cour pénale centrale d'Angleterre et du Pays de Galles, également connue sous le nom de Old Bailey, a vu des photos que Wright avait prises de pots contaminés, placés à côté de petits couteaux et avec de petites marques vertes sur la base du pot.

Alors que le chantage se poursuivait, un officier s'est fait passer pour un employé de Tesco et a donné à Wright un code d'accès pour la valeur de 100000 £ de bitcoin. Lorsque Wright a été arrêté, il avait une copie de ce code d'accès écrit sur un morceau de papier.

White a déclaré que les preuves comprenaient l'ordinateur portable, les images que Wright avait prises des aliments contaminés et le code d'accès Bitcoin.

« Il a créé un mensonge élaboré en disant qu'il était lui-même l'objet d'un chantage, mais il est clair que Wright était la seule personne responsable de mettre potentiellement la sécurité sanitaire du public en danger. »

Wright a été reconnu coupable de trois chefs de chantage et de deux chefs de marchandises contaminées après un procès de neuf jours. Il a été placé en détention provisoire et sera condamné fin septembre.

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Pêches et Salmonella aux Etats-Unis

« Target rappelle des pêches après avoir été liées à une épidémie à Salmonella », source Food Safety News.

Target rappelle des pêches en raison d'une possible contamination par Salmonella.

Les responsables de la santé et de la sécurité des aliments de l'État du Minnesota avertissent les consommateurs du Minnesota de ne pas consommer de pêches fraîches et entières fournies par Wawona Packing Company et achetées dans des points de vente au détail, notamment chez Aldi et Target, après avoir lié à des cas d’infections à Salmonella.

Le Minnesota Department of Health (MDH) et le Minnesota Department of Agriculture (MDA), ainsi que les Centers for Disease Control and Prevention (CDC), la Food and Drug Administration (FDA) enquêtent sur une épidémie à Salmonella Enteritidis dans plusieurs États liée à la consommation de pêches fournies par Wawona Packing Company.

Selon le MDH, des personnes malades ont déclaré avoir acheté des pêches chez Aldi, Target et peut-être dans d'autres magasins. Le 19 août, Aldi a annoncé un rappel de pêches de la Wawona Packing Company, y compris des pêches en vrac et en sac.

Target est en train de retirer les pêches de ses magasins.

« ALDI rappelle des pêches alors que le CDC enquête sur une épidémie à Salmonella dans plusieurs Etats », source Food Safety News.

ALDI a rappelé des pêches assorties reçues de son fournisseur, Wawona Packing Company, en raison d'une possible contamination par Salmonella et d'un lien avec une épidémie d'intoxication alimentaire.

Jusqu'à présent, 68 cas à Salmonella Enteritidis ont été signalés, entraînant 14 hospitalisations dans 9 États, Connecticut, Illinois, Iowa, Kentucky, Massachusetts, Michigan, Minnesota, New Hampshire, New York, Dakota du Nord, Ohio, Rhode Island, Dakota du Sud, Vermont, Virginie-Occidentale et Wisconsin. Le rapport complet du CDC peut être lu ici.

Vingt-trois résidents du Minnesota ont été identifiés comme faisant partie de l'épidémie. Les malades ont entre 3 et 92 ans, avec un âge médian de 28 ans. Six patients ont été hospitalisés mais se sont tous rétablis. Les patients sont tombés malades entre le 12 juillet et le 3 août.

Mise à jour du 22 août 2020. Une troisième entreprise rappelle des pêches, Wawona recalls peaches linked to multi-state Salmonella outbreak, source Food Safety News.

Mise à jour du 28 août 2020. Mise à jour du 27 août sur l’éclosion à Salmonella liée aux pêches, d'autres rappels

Dans un suivi de l'épidémie de maladies à Salmonella liée aux pêches, les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) indiquent qu'au 27 août, un total de 78 personnes infectées par la souche épidémique de Salmonella Enteritidis ont été rapportées dans 12 États.

23 hospitalisations ont été signalées. Aucun décès n'a été signalé.

Le 23 août, l’Agence de la santé publique du Canada rapporte, une éclosion d'infections à Salmonella liée aux pêches importées des États-Unis.

Mise à jour du 30 août 2020. Où l'on apprend par Food Safety News que l'épidémie se propage ...

« Des informations reçues par la FDA indiquent que les pêches Wawona rappelées ont été expédiées à des pays étrangers, Australie, Canada, Chine, Costa Rica, Équateur, Salvador, Guatemala, Honduras, Mexique, Panama, Philippines, Singapour, Taïwan et Émirats Arabes Unis. », selon la mise à jour.

« La FDA partage les informations de distribution directement avec les autorités étrangères de sécurité des aliments dans ces juridictions. »

Au moins deux pays ont émis des avis de rappel pour les pêches - la Nouvelle-Zélande et Singapour.

Les éclosions aux États-Unis et au Canada ont rendu malades 111 personnes, 78 aux États-Unis et 33 au Canada.

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Mouvement marginal sur les infections à STEC en Écosse

« Mouvement marginal sur les infections à STEC en Écosse », source Food Safety News.

Les niveaux d'infections à E. coli signalés en Écosse ont légèrement baissé en 2019, selon les chiffres publiés par Health Protection Scotland.

L'année dernière, il y a eu 150 cas à E. coli O157 et 108 de STEC non-O157, ce qui représente une légère diminution sur les 156 cas à E. coli O157 et 110 patients STEC non-O157 en 2018.

Quatre foyers ont été signalés. C'était moins que les six en 2018 et la moyenne de 2014 à 2018 de cinq flambées avec une fourchette de trois à neuf par an. En 2019, les flambées ont impliqué trois sérogroupes différents; deux à E. coli O157, un à O26 et un à O125. Dans les quatre cas, le principal mode de transmission était considéré comme des aliments.

Les données proviennent d'une publication de Health Protection Scotland (HPS), qui fait partie de Public Health Scotland (PHS), sur E. coli producteur de shigatoxines O157 et d'autres infections à STEC pour 2019.

Taux d'infection élevés

La surveillance renforcée de E. coli O157 et d'autres STEC est effectuée avec le Scottish E. coli O157/STEC Reference Laboratory (SERL) et les équipes du conseil du NHS de la protection de la santé. Les données sont également intégrées à d'autres sources, comme ObSurv, le système de surveillance de toutes les flambées générales de maladies intestinales infectieuses.

Les taux d'infection à E. coli O157 en Écosse ont augmenté au milieu des années 90 et restent élevés par rapport à d'autres pays du Royaume-Uni et d'Europe. Plus de 40 pour cent des personnes sont admises à l'hôpital à la suite d'une infection.

La répartition par âge de 149 cas à E. coli O157 variait de moins d'un an à plus de 90 ans. Au total, 56 pour cent des cas étaient des femmes. Les enfants de moins de 16 ans représentaient 33% des cas et 13% avaient plus de 65 ans. Comme on l'a vu les années précédentes, les enfants de moins de 5 ans avaient le taux d'infection le plus élevé. Les cas ont culminé pendant les mois d'été avec la plupart des infections au cours des deuxième et troisième trimestres de l'année, avec 65 pour cent des cas au cours de cette période.

Comme les années précédentes, les phages types (PT) 21/28 et PT8 restent les deux plus fréquemment rapportés sur la base des 135 isolats disponibles avec respectivement 33 et 32. Sur les 149 signalements à E. coli O157 en 2019, 29 n'avaient aucun gène de shigatoxine identifiable. Il s'agissait d'une légère diminution sur les 33 cas négatifs à la shigatoxine en 2018 et les 31 en 2017.

Non-O157 en Écosse

Les données de laboratoire et de surveillance sont également capturées sur les infections à STEC non-O157 qui représentent 42 pour cent de tous les rapports de STEC en Écosse. Une personne avait deux sérotypes différents de STEC non-O157, donc au total, 109 rapports de laboratoire de STEC non-O157 ont été identifiés, contre 110 en 2018 et 83 en 2017.

Vingt-quatre sérogroupes STEC non-O157 différents ont été retrouvés en 2019, plus deux sérogroupes non identifiables, dont 13 n'ont été signalés qu'une seule fois. STEC O26 était le plus fréquent avec 34 tandis que le seul autre sérogroupe à double chiffre était STEC O125 et neuf cas étaient STEC O145.

La répartition par âge des 108 cas variait de moins d'un an à plus de 80, tandis que 49 pour cent étaient des femmes. Les enfants de moins de 16 ans représentaient 29 pour cent des cas et 12 pour cent avaient plus de 65 ans. Comme les années précédentes, les enfants de moins de 5 ans avaient le taux d'infection le plus élevé.

La plupart des infections sont survenues au cours des deuxième et troisième trimestres de l'année, avec 69% des cas au cours de cette période. Le pic des semaines 41 à 44 était associé à une éclosion à E. coli O26.

Des informations sur 233 cas à E. coli ont été signalées au HPS à la suite d'entretiens avec l'équipe locale de protection de la santé; 133 à E. coli O157 et 100 de STEC non-O157. Au total, 38% des cas pour lesquels des informations étaient connues ont été admis à l'hôpital pendant au moins une nuit en raison d'une maladie. Pour E. coli O157, ce chiffre était de 45 pour cent et pour les STEC non-O157, il était de 28 pour cent.

Sur les 233 cas pour lesquels des informations étaient disponibles, 27% de tous les cas à E. coli ont contracté leur infection en dehors du Royaume-Uni. Pour à E. coli O157, 29% ont déclaré avoir voyagé en dehors du Royaume-Uni et pour les cas de STEC non-O157, le chiffre était de 24%.

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Les niveaux d'anticorps COVID-19 varient considérablement chez des patients rétablis

« Les niveaux d'anticorps COVID-19 varient considérablement chez des patients rétablis », source article de Mary Van Beusekom paru le 19 août 2020 dans CIDRAP News.

Une étude publiée dans JAMA Internal Medicine de 175 patients qui se sont rétablis d'un COVID-19 léger révèle une large variation des niveaux d'anticorps contre le nouveau coronavirus, allant de niveaux très élevés chez 2 patients à des niveaux indétectables chez 10, mais aucune différence significative dans durée de la maladie.

Des chercheurs de l'Université Fudan de Shanghai, Chine, ont mesuré les niveaux d'anticorps chez des patients COVID-19 libérés du centre de santé publique de Shanghai après avoir été hospitalisés du 24 janvier au 26 février.

Sur les 175 patients, 165 (94%) avaient des niveaux significativement plus élevés d'anticorps COVID-19 que 13 témoins non infectés dans la phase de convalescence de l'infection. Les niveaux d'anticorps étaient moyens-faibles chez 29 patients (17%), moyens-élevés chez 69 patients (39%) et élevés chez 25 patients (14%).

Âge, sexe, réponse inflammatoire

Les chercheurs ont détecté des anticorps neutralisants chez les patients 4 à 6 jours après l'apparition des symptômes, et les taux ont culminé 4 à 11 jours plus tard. Les niveaux d'anticorps étaient significativement plus élevés chez les 56 sujets plus âgés (60 à 85 ans) et 63 sujets d'âge moyen (40 à 59 ans) que chez 56 patients plus jeunes (15 à 39 ans). Les 10 patients avec des anticorps indétectables étaient plus jeunes (âge médian, 34 ans), et 8 d'entre eux étaient des femmes.

À la sortie de l'hôpital, des taux d'anticorps significativement plus élevés ont été retrouvés chez 82 hommes (47%) que chez 93 femmes (53%).

Parmi les 117 patients avec des données de suivi à 2 semaines, le niveau médian d'anticorps était nettement inférieur au niveau médian à la sortie de l'hôpital, et les 56 hommes (48%) avaient encore des niveaux d'anticorps significativement élevés par rapport aux 61 femmes (52% ). Les niveaux d'anticorps chez les patients avec des niveaux d'anticorps indétectables à la sortie de l'hôpital sont restés indétectables au suivi.

À l'admission à l'hôpital, les taux d'anticorps étaient corrélés avec ceux de la protéine C-réactive (indiquant une réponse inflammatoire) mais pas avec le nombre de lymphocytes (indiquant une réponse immunitaire à l'infection). De faibles niveaux de lymphocytes et des niveaux élevés de protéine C-réactive ont été associés à de mauvais résultats pour le COVID-19.

Par rapport aux sujets plus jeunes, les patients plus âgés et d'âge moyen avaient un nombre de lymphocytes significativement plus bas et des taux de protéine C-réactive plus élevés à l'hospitalisation, indiquant une réponse immunitaire plus faible et une réponse inflammatoire plus forte au coronavirus.

Rôle du plasma de convalescents

Bien que les anticorps neutralisants soient considérés comme importants pour la guérison des maladies infectieuses et la protection contre une infection future, on ne sait pas s'ils confèrent une immunité contre une future infection au COVID-19 et combien de temps cette immunité pourrait durer.

L'utilisation de plasma de convalescents, ou le transfert de plasma sanguin de patients atteints de coronavirus rétablis à des patients non infectés pour conférer une immunité, repose sur l'hypothèse que les anticorps COVID-19 peuvent fournir une protection contre l'infection, mais sa durabilité est inconnue.

Les auteurs ont dit que la variabilité des niveaux d'anticorps neutralisants chez les patients atteints de COVID-19 rétablis met en évidence la nécessité d'évaluer et d'ajuster les niveaux d'anticorps dans le plasma de convalescents avant l'administration, si cela s'avère efficace.

Ils ont également souligné que leur découverte selon laquelle les patients plus âgés COVID-19 ont tendance à avoir des niveaux d'anticorps plus élevés, mais des résultats pires les amène à remettre en question l'hypothèse selon laquelle les anticorps protègent contre une future infection à coronavirus. « Les implications cliniques potentielles de ces découvertes pour le développement de vaccins et la protection future contre l'infection sont inconnues », ont-ils écrit.

Dans une note de l’éditeur du même journal, Mitchell Katz de NYC Health + Hospitals, a noté que les patients plus âgés, les hommes et ceux qui ont des réponses inflammatoires plus fortes, qui ont généralement eu de mauvais résultats pour le COVID-19, avaient des niveaux d'anticorps plus élevés que les autres sujets de l'étude, « suggérant que les titres plus élevés d'anticorps ne conduisent pas nécessairement à un taux de récupération plus élevé. »

Katz a appelé à des recherches pour savoir si certains groupes de personnes ont besoin de niveaux d'anticorps plus élevés pour se rétablir et si des niveaux plus élevés d'anticorps se traduisent par une meilleure protection contre le virus en termes de vaccin.

« Dans cette étude, 10 des 175 patients avaient des niveaux d'anticorps indétectables malgré une infection documentée », a-t-il écrit. « Ces patients sont-ils sensibles à une infection future, ou ont-ils une protection basée sur leur infection, sensibilisant les lymphocytes T cytotoxiques ou killer ou les lymphocytes B à mémoires? Les réponses à ces questions pointues peuvent conduire à une meilleure protection face à cet adversaire encore largement méconnu. »

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Nouveau plan quinquennal : La FDA et ses partenaires souhaitent étendre les efforts sur la résistance aux antibiotiques

« La FDA et ses partenaires souhaitent étendre les efforts sur la résistance aux antibiotiques », source article de Chris Dall du 19 août 2020 dans CIDRAP News.

La Food and Drug Administration des États-Unis et ses partenaires d'autres agences fédérales ont présenté des plans visant à étendre leurs efforts pour suivre la résistance aux antibiotiques des agents pathogènes d'origine alimentaire.

Dans le cadre d'un nouveau plan stratégique quinquennal, la FDA, en coopération avec les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) et l’US Department of Agriculture's Food Safety and Inspection Service (USDA-FSIS), vise à élargir la portée du National Antimicrobial Surveillance Monitoring System (NARMS) pour inclure plus d'agents pathogènes bactériens, plus d'espèces animales et de bactéries résistantes retrouvées dans l'environnement.

Les agences affirment que le plan stratégique met l'accent sur un modèle de surveillance ‘One Health’ qui reconnaît les interconnexions entre les personnes, les animaux, les plantes et leur environnement commun.

Surveillance élargie pour inclure les eaux de surface

Le NARMS a été créé en 1996 par la FDA, le CDC, l'USDA et les services de santé des États et locaux pour surveiller la résistance des bactéries entériques chez les humains, les viandes vendues au détail et les animaux destinés à l'alimentation au moment de l'abattage.

Le rapport annuel du NARMS fournit des données de surveillance sur les niveaux de résistance aux antibiotiques retrouvés chez Salmonella non typhoïdes, Campylobacter, Escherichia coli, Enterococci et Shigella, les espèces bactériennes les plus communément transmises aux humains par les aliments. Les données du NARMS sont également utilisées pour investiguer dans les épidémies de maladies d'origine alimentaire.

La surveillance de la résistance aux antibiotiques chez Salmonella et Campylobacter est essentielle du point de vue de la santé publique, car chaque année, ces deux agents pathogènes causent à eux seuls plus de 2,5 millions de cas de maladie aux États-Unis et des centaines de décès. Bien que les infections à Salmonella et à Campylobacter d'origine alimentaire ne nécessitent pas toujours des antibiotiques, la résistance aux antibiotiques couramment utilisés peut provoquer des infections plus graves et entraver le traitement.

D'autres fonctions du NARMS comprennent la conduite d'enquêtes épidémiologiques et microbiologiques pour examiner les sources et les facteurs de risque de bactéries résistantes, les mécanismes génétiques de résistance et les résultats cliniques des infections d'origine alimentaire causées par des agents pathogènes présentant des profils de résistance spécifiques.

Dans le cadre du plan stratégique, le NARMS maintiendra et améliorera cette surveillance de routine de la résistance en ajoutant davantage de micro-organismes provenant d'animaux de compagnie et d'animaux de compagnie, d'autres types de résistance aux antibiotiques et des données sur les tests environnementaux. L'effort comprendra des collaborations avec l'Environmental Protection Agency pour surveiller les eaux de surface à la recherche d'agents pathogènes résistants aux antibiotiques, la création d'un programme de test des bactéries résistantes dans les aliments pour animaux et les aliments pour animaux de compagnie, et l'ajout de tests de surveillance de routine sur les produits de la mer et les aliments importés.

D'autres objectifs incluent l'utilisation d'outils bioinformatiques pour mieux comprendre les mécanismes, les sources et la propagation de la résistance aux antibiotiques et le développement d'approches métagénomiques pour relier les gènes de résistance à leur source microbienne; un partage accru des données NARMS avec d'autres agences américaines et mondiales pour encourager une approche de santé publique plus opportune face aux flambées; et plus de recherches sur la source d'agents pathogènes d'origine alimentaire résistants aux antibiotiques, l'impact des infections causées par ces agents pathogènes et les stratégies visant à réduire la propagation d'organismes résistants.

« Limiter la résistance aux antimicrobiens est une priorité pour la santé publique », ont déclaré les agences. « L'adoption d'une approche One Health ou une seule santé, encourage de nouvelles collaborations interinstitutions pour relever le défi de la résistance dans les domaines humain, animal et environnemental. »

La FDA accepte les commentaires sur le plan et tiendra une réunion publique virtuelle pour discuter du plan les 13 et 14 octobre.

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Il était une fois les mille et une poubelles géantes de Madame Hidalgo à Paris

Le titre est inspiré de l'excellent article de Christine Celrc dans Le Figaro.fr du 20 août 2020, «Les mille et une poubelles géantes d’Anne Hidalgo à Paris».

Les rues de la capitale vont encore enlaidir: la municipalité parisienne prévoit d’installer dans toute la ville des «containers de collecte de proximité» de 2 mètres cubes. »

Ça s’est fait en douce, entre élection municipale et crise du coronavirus. Profitant de l’exil de milliers de Parisiens vers des lieux de séjour plus respirables, la maire du 14e, Carine Petit, une socialiste écolo, a fait installer à deux pas de la prestigieuse Fondation Cartier quatre poubelles géantes de 2 mètres cubes couvrant deux emplacements de parking, en face d’appartements en rez-de-chaussée. C’est le premier geste spectaculaire d’une opération lancée discrètement il y a dix-huit mois par Anne Hidalgo: la mise en place, en pleines rues, de mille et une poubelles géantes.

 L'explication de ce système est fourni par l'Ademe, qui selon Christine clerc, serait un plagiat de Molière quand on lit la prose:

L'enjeu de l'expérimentation trilib' n'est pas que local et régional : plus largement il s'agit de montrer qu'il est possible de créer des "stations de tri en libre-service", avec un design qualitatif et bien insérées dans le paysage urbain. C'est aussi une réflexion sur le meilleur compromis à trouver en ville dense entre volume utile, ergonomie d'usage et acceptabilité par les riverains directs. Enfin c'est un mobilier hybride pour le devenir des déchets ressources collectés avec une ouverture sur le réemploi et l'économie sociale et solidaire. Ceci recoupe des enjeux nationaux :  l'accès au service de tri pour les adresses non ou mal desservies et la libération d'espace dans les parties communes pour d'autres flux ou usages.

Comme le rapporte Christien Clerc, il ne s'agit pas d'écologie mais d'économies. Aux dépens de la propreté des rues. Et de la santé des habitants. 

A Paris, dit Christine clerc, tout est une question de présentation, 

C'est une question de couleurs: sur les plans, les rues sont peintes en vert, les carrefours aussi, où pousseront quelques mauvaises herbes.

Je n'ai pas encore vu ce genre de curiosité dans mon quartier, mais si cela se produit, ce sera sans moi ... 

PS: Le site de Trilib' de la Ville de Paris se trouve ici.

Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous