La récurrence de la souche épidémique souligne l'importance d'enquêter sur les éclosions d'origine alimentaire et de tracer complètement les produits touchés. La possibilité d'un rappel en temps opportun de produits potentiellement contaminés lors d'épidémies internationales causées par des aliments avec des chaînes d'approvisionnement complexes doit être garantie. Sinon, la résurgence d'une épidémie peut se produire même des mois après son apparente atténuation. Ceci est particulièrement pertinent pour les produits alimentaires surgelés, qui ont généralement une durée de conservation de 2 ans ou plus. Les baies congelées sont un vecteur fréquent d'épidémies d'hépatite A et les conditions de production doivent faire l'objet d'une évaluation critique pour identifier et éliminer les sources potentielles de contamination. Les preuves produites par les enquêtes épidémiologiques, tout comme les preuves microbiologiques, devraient suffire pour lancer des recherches sur la traçabilité et les aliments, en particulier parce que des preuves épidémiologiques sont souvent disponibles avant que des preuves microbiologiques soient présentes, le cas échéant. Le typage moléculaire des isolats humains de VHA s'est à nouveau avéré indispensable pour la détection, l'investigation et la surveillance d'épidémies géographiquement dispersées ou prolongées.
«L'hygiène, avant la microbiologie, n'est hygiénique que dans ses intentions. C'est la science des apparences qui repose entre des mains d'aveugles : est sain ce qui est beau, bon, et ne sent pas mauvais.» Pierre Darmon, L'homme et les microbes, Fayard, 1999.
mercredi 23 septembre 2020
L'Allemagne fait partie de la résurgence d'une épidémie d'hépatite A
mardi 22 septembre 2020
Défendre la science et la raison par Marcel Kuntz
Je publie bien volontiers cet article coup de poing, Défendre la science et la raison par Marcel Kuntz.
- quelles qu’elles soient, sur des questions pour lesquelles des réponses scientifiques existent (non pas que la science sait tout, mais elle sait quand même un certain nombre de choses).
- d’où qu’elles viennent, y compris de journalistes-militants… notamment au service de l’écologie politique la plus radicalisée.
Rappel de produits alimentaire par la DGCCRF, pourquoi viens-tu si tard ?
| 🔴#RappelProduit #alimentation |
— DGCCRF (@dgccrf) September 21, 2020
Ne consommez pas ces pains et rapportez-les sur le point de vente pour remboursement!
👉https://t.co/zUR42HEEdm pic.twitter.com/3TCwtp8Slr
Pays-Bas: La recherche sur la sécurité des aliments vise à lutter contre Listeria
Identification rapide des bactéries avec MinION
Clarifier les itinéraires de distribution
Une étude néerlandaise évalue les agents pathogènes chez les poulets de chair
Deux agences aux Pays-Bas ont examiné la prévalence de certains agents pathogènes chez des poulets destinés à la production de viande.
L'étude a réaffirmé que Campylobacter, Salmonella et les bactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE) dans les élevages de poulets de chair peuvent être transmis aux humains par la consommation de viande et par contact direct ou indirect.
En 2018 et 2019, l'Institut national pour la santé publique et l'environnement (RIVM) et l'Autorité néerlandaise de sécurité des produits alimentaires et de consommation (NVWA) ont enquêté sur la fréquence à laquelle ces agents pathogènes sont apparus chez les poulets de chair. L'étude a impliqué des poulets de chair dans 198 des plus de 600 fermes du pays ainsi que 132 éleveurs, membres de la famille et employés de 81 entreprises.
La viande peut être contaminée dans l'abattoir si elle entre en contact direct avec les fientes. Les consommateurs peuvent prévenir l'infection en consommant du poulet bien cuit. Il est également important d'éviter que d'autres aliments entrent en contact avec la volaille et la viande crues, ont conseillé RIVM et NVWA.
BLSE et Campylobacter principalement retrouvés
Des échantillons de fumier ont été prélevés dans toutes les élevages et analysés pour Campylobacter, E. coli producteurs de BLSE, Listeria monocytogenes et E. coli producteurs de shigatoxines (STEC). Des échantillons de poussière ont été examinés pour détecter Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM). Les résultats pour Salmonella proviennent de la surveillance régulière des troupeaux échantillonnés. Des échantillons fécaux de personnes ont été testés pour Campylobacter, E. coli producteurs de BLSE et Salmonella, tandis que des écouvillons nasaux ont été examinés pour le SARM.
Des bactéries productrices de BLSE ont été retrouvées dans des poulets de chair dans 36 pour cent des élevages. Pour les éleveurs et les membres de la famille, ces bactéries ont été retrouvées chez 7 pour cent des participants. Ceci est comparable au pourcentage de la population néerlandaise en général.
Campylobacter a été retrouvé dans près d'un tiers des élevages de poulets de chair. Ceci est comparable aux chiffres de la surveillance entre 1999 et 2002. Il a également été retrouvé chez deux participants humains.
Malgré des mesures d'hygiène telles que l'utilisation de surchaussures ou de vêtements de travail d'entreprise, la douche avant d'entrer dans les poulaillers et le nettoyage et la désinfection, la prévalence de Campylobacter chez les volailles vivantes semble difficile à réduire, selon le rapport.
L'approche modèle utilisée a montré neuf variables significativement associées à l'occurrence de Campylobacter, y compris la saison, l'âge des poulets de chair au moment de l'échantillonnage, le nombre de logements dans l’élevage et la densité de peuplement.
Résultats pour Salmonella, STEC et Listeria
La surveillance de Salmonella est effectuée dans tous les élevages de poulets de chair conformément à la législation européenne. Il a été rapporté la présence chez des poulets de chair dans 11 pour cent des élevages. Salmonella a également été retrouvé chez une personne.
La prévalence de Salmonella semble être supérieure à la moyenne européenne de 2018. Le sérotype émergent Salmonella Infantis a été retrouvé dans près de la moitié des cas, mais Typhimurium et Enteritidis n'ont pas été détectés. Le variant Java de Salmonella Paratyphi B était un autre sérotype courant.
Six facteurs de risque importants ont été relevés pour la présence de Salmonella, notamment le lavage des mains après être entré dans le poulailler, l'absence de contact avec d'autres volailles au cours des 12 dernières heures et les animaux de compagnie présents sur l’élevage. Cela montre la nécessité de suivre des mesures de biosécurité strictes pour contrôler Salmonella, selon le rapport.
Les STEC et Listeria ont été retrouvés dans très peu d'élevages de poulets de chair, ce qui signifie que les sites sont probablement moins importants dans la propagation de la Listeria et des STEC et présentent un risque limité. Ils ont été détectés sur 1 pour cent pour Listeria, ou moins pour les STEC, des élevages étudiés.
Des STEC ont été isolés de deux échantillons de fientes dans l'une des logements échantillonnés. L'isolat retrouvé dans les deux échantillons était le sérotype O24:H18, positif pour le gène de virulence stx2 mais négatif pour le gène eae.
Lors de la surveillance, Listeria monocytogenes a été retrouvé dans deux élevages. La prévalence de Listeria chez les poulets de chair aux Pays-Bas n'avait pas été étudiée auparavant.
Le SARM n'a été retrouvé dans aucune des 190 fermes de poulets de chair étudiées, mais des inquiétudes ont été soulevées quant au fait que la méthode n'était pas assez sensible. Il a été détecté dans l'écouvillon nasal de quatre personnes.
lundi 21 septembre 2020
Comment CHROMagar™ a révolutionné l'identification des microbes ?
« Comment CHROMagar™ a révolutionné l'identification des microbes », source ASM News.
Il y a 40 ans, le Dr Alain Rambach a inventé les milieux chromogènes, qui peuvent être la méthode microbiologique la plus largement utilisée et la plus percutante pour l'identification d'une large section transversale de microbes invisibles, y compris ceux importants pour le monde médical. Comme beaucoup de scientifiques, Rambach a pris une idée, une petite graine d'intuition, et l'a nourrie à travers diverses épreuves et tribulations jusqu'à ce que son rêve se réalise. Sa gélose chromogène originale a été développée en une ligne complète de produits CHROMagar™ et a engendré une industrie de concurrents. Grâce à une série de conversations avec Rambach, nous avons appris comment sa carrière en sciences biologiques a évolué et comment il a développé sa gélose chromogène, qui a eu un grand impact sur le domaine de la microbiologie clinique au cours des 25 dernières années.
Le Dr Alain Rambach |
Vous serez peut-être surpris d'apprendre qu'à sa sortie de l'École polytechnique de France en 1965, Alain Rambach était titulaire d'un diplôme en mathématiques et non de biologie. En fait, Rambach lui-même vous dira qu'il avait peu de connaissances en biologie, ne sachant que ce qu'il avait lu dans les manuels d'auteurs comme Joël de Rosnay et James Watson. Le destin l'a voulu, Rambach a rejoint l'Institut Pasteur en 1967 et a commencé à travailler sur son doctorat en génétique bactérienne aux côtés du scientifique lauréat du prix Nobel, François Jacob.
Les travaux de Rambach se sont concentrés sur le bactériophage lambda de Escherichia coli, qui allait devenir un élément essentiel de son travail au cours des 50 prochaines années. Après la soutenance de sa thèse, Rambach raconte qu'au début de 1973, il expliqua ses futurs objectifs de recherche à son équipe de parrainage en dessinant l'ADN sur un tableau noir à l'aide de 2 couleurs de craie: craie bleue pour la structure existante et craie orange pour l'insertion hypothétique du nouvel ADN. Cette vision de la manipulation génétique, selon Rambach, était un concept nouveau et quelque peu controversé à l'époque.
Réunion des esprits
Après avoir passé un an (1973-1974) à travailler sur la modification génétique du bactériophage lambda de E. coli pour en faire un vecteur de clonage de l'ADN, Rambach a terminé un stage de postdoc en biochimie à l'Université de Stanford et est retourné à l'Institut Pasteur en 1978. Il a été nommé à l'unité de génie génétique, où il s'est concentré sur le diagnostic médical des infections bactériennes, en particulier les infections causées par des organismes appartenant à l'ordre des Enterobacterales.
C'est dans l'unité de génie génétique que Rambach a rencontré le Dr Jean Buissière, un médecin militaire qui terminait 2 ans de formation en diagnostic des maladies infectieuses à côté de lui. Les travaux de Buissiere se sont concentrés sur la manière dont les chromophores, la partie d’une molécule responsable de la couleur que nous voyons, pourraient être utilisés pour identifier les bactéries. Dans une courte autobiographie, Rambach se souvient de Buissière en lui apprenant l'idée fondamentale qu'en « caractérisant l'équipement enzymatique des bactéries, il était possible d'obtenir une identification bactérienne ». En 1976, par exemple, Kilian et Bulow ont découvert que l'enzyme bêta-glucuronidase est fortement associée à Escherichia coli, et en fait confinée à Escherichia coli. Étant donné qu'environ 95% des souches de E. coli démontrent cette activité enzymatique, la détection de la présence ou de l'absence indique si E. coli lui-même est présent. Une façon de tester facilement l'activité bêta-glucuronidase est de rechercher la production d'un chromophore jaune hydrolysé à partir d'un substrat synthétique.
Alors que la plupart de ce type de recherche était effectué dans des tubes de bouillon liquide avec des cultures pures de bactéries, Rambach a pensé qu'il serait avantageux de mettre le procédé dans des milieux solides. Il a émis l'hypothèse que s'il utilisait un chromophore tel que l'indoxyl, qui ne se diffuse pas facilement comme les substances qui étaient utilisées dans la culture en bouillon à l'époque, il serait possible d'identifier divers types de bactéries par la couleur de leurs colonies, même lors de l'analyse de cultures complexes provenant de sources telles que des échantillons cliniques ou des aliments. La science derrière l'idée fonctionne comme ceci:
1. Le milieu contient des molécules appelées chromogènes. Une molécule de chromogène se compose d'un substrat (la ‘clé’ d'un ‘verrou’ enzymatique spécifique), ainsi que d'un chromophore. Le chromogène est incolore car le chromophore n'absorbe pas la lumière visible lorsqu'il est conjugué au substrat.
2. Lorsqu'un organisme bactérien ayant une activité enzymatique spécifique entre en contact avec la molécule de chromogène, cette enzyme clive la molécule de chromogène, libérant le chromophore.
3. Lorsque le chromophore n'est pas conjugué, sa couleur devient visible. En utilisant un chromophore qui ne se diffuse pas facilement dans le milieu environnant, la couleur reste concentrée dans la zone où la colonie bactérienne avec l'activité enzymatique cible s'est développée. Ainsi, la colonie prend elle-même la couleur du chromophore.
Encouragé par Buissière, Rambach a décidé de créer lui-même ce milieu.
A suivre cette passionnante aventure qui se poursuit en lisant la suite de cet article ...
dimanche 20 septembre 2020
Peste porcine africaine: aucun risque pour le consommateur, selon le BfR
« Peste porcine africaine: aucun risque pour les consommateurs », source BfR 29/2020, 11 septembre 2020.
L'agent pathogène ne peut pas être transféré aux humains
La peste porcine africaine (PPA), détectée pour la première fois en Allemagne chez un sanglier le 10 septembre 2020, ne présente pas de risque pour la santé humaine. « L'agent pathogène de la PPA ne peut pas être transféré à l'homme », explique le professeur Andreas Hensel, président de l'Institut fédéral allemand pour l'évaluation des risques (BfR). « Aucun risque pour la santé n'est posé par le contact direct avec des animaux malades ou par la consommation d'aliments fabriqués à partir de porcs domestiques ou de sangliers infectés. »
L'agent pathogène de la PPA est un virus qui infecte les porcs domestiques et les sangliers et qui conduit à une maladie grave, souvent mortelle, chez ces animaux. Il est transféré par contact direct ou avec des excrétions d'animaux infectés, ou par des tiques. Le virus de la PPA est endémique chez des animaux sauvages infectés en Afrique, mais il y a également eu à plusieurs reprises des foyers dans le sud de l'Europe. L'agent pathogène se propage vers le nord-ouest depuis 2007 de la Géorgie à l'Arménie, l'Azerbaïdjan et la Russie. Des cas de PPA ont été enregistrés chez des sangliers ainsi que des foyers chez des porcs domestiques dans les États baltes depuis 2014. Le virus a également été détecté en Roumanie, en Hongrie, en Pologne et en République tchèque. En septembre 2018, le pathogène a également été trouvé chez des sangliers en Belgique et donc pour la première fois en Europe occidentale. Le 10 septembre 2020, le virus de la PPA a été détecté pour la première fois en Allemagne chez un sanglier du Brandebourg.
L'agent pathogène est très stable et peut rester infectieux dans les aliments pendant plusieurs mois. Si des aliments non chauffés ou des restes d’aliments provenant d'animaux infectés sont donnés à des animaux non infectés, le virus peut donc se propager dans des régions auparavant indemnes de PPA, infectant ainsi des troupeaux de porcs domestiques.
Bien que le virus de la PPA ne présente pas de danger, ni de risque pour l'homme, la viande de porcs domestiques et de sangliers doit toujours être préparée dans des conditions d'hygiène, comme toutes les autres viandes crues, car elle peut également contenir d'autres agents pathogènes, conseille le BfR. Elle doit être conservée au réfrigérateur et préparé séparément des autres aliments avant la cuisson. Lors du chauffage, une température à cœur de 70°C ou plus doit être atteinte dans la viande pendant au moins deux minutes, recommande le BfR.
Le BfR a compilé quelques questions fréquemment posées sur la PPA pour plus d'informations. Ils peuvent être téléchargés sur le site du BfR ici.
A propos des mécanismes d'inactivation par l'acide peracétique du rotavirus et du virus de la tulane dans des conditions pertinentes pour l'hygiène des légumes
Un sondage identifie les principales préoccupations des consommateurs en matière de sécurité alimentaire
Loin, très loin de cet eldorado de la sécurité des aliments, voici un article, sans transition, qui rapporte qu’un sondage identifie les principales préoccupations des consommateurs en matière de sécurité alimentaire, source Food Safety News.
Selon un sondage, six personnes sur dix ont déclaré qu'elles n'iraient plus jamais dans un restaurant si elles contractaient une maladie d'origine alimentaire en y mangeant.
Les consommateurs interrogés ont déclaré que leurs principales préoccupations en matière de sécurité des aliments comprenaient l'hygiène de la cuisine et du personnel, les éclosions d'origine alimentaire, les maladies causées par des aliments contaminés et les rappels.
Les résultats proviennent de l'étude de Zebra Technologies, une société d’assistance et de visibilité sur la sécurité des aliments. Elle détaille les points de vue des consommateurs et des entreprises agroalimentaires sur la sécurité sanitaire, la traçabilité et la transparence.
Un peu plus de 80% des consommateurs ont déclaré que les entreprises avaient un rôle important à jouer dans la sécurité des aliments et une responsabilité éthique pour garantir une manipulation sûre des aliments. Soixante-dix pour cent des consommateurs ont déclaré qu'il était important de savoir comment leurs aliments et leurs ingrédients sont fabriqués, préparés et manipulés.
Moins d'un quart des consommateurs ont déclaré avoir une confiance totale dans la sécurité sanitaire de leurs aliments, sur la base des informations dont ils disposent actuellement. En moyenne, 20% des consommateurs font totalement confiance aux entreprises et aux marques pour garantir la sécurité des aliments, contre 37% des représentants de l'industrie, qui seraient plus informés.
Faits saillants en Amérique du Nord
Le sondage a porté sur 4 957 consommateurs et 462 entreprises agroalimentaires de 15 pays sur les marchés de la fabrication, du transport et de la logistique, de la vente au détail et de la distribution en gros en Amérique du Nord, en Amérique latine, en Asie-Pacifique et en Europe. Ils ont été interviewés en janvier 2020 par Azure Knowledge Corporation.
En Amérique du Nord, près des deux tiers des consommateurs ont cité la peur des maladies d'origine alimentaire comme la principale raison pour laquelle ils voulaient plus d'informations sur l’origine des aliments. Le niveau de confiance moyen dans les entreprises et les marques pour garantir la sécurité des aliments et des boissons est plus élevé chez les décideurs du secteur (45%) que chez les consommateurs (18%).
Près de sept représentants de l'industrie sur dix ont déclaré que le secteur était prêt à gérer la traçabilité et la transparence des aliments, mais seuls 35% des consommateurs sont d'accord. Seuls 13 pour cent du public estimaient que l'industrie était extrêmement préparée aujourd'hui à gérer la traçabilité et à être transparente sur la façon dont les aliments passent dans la chaîne d'approvisionnement, tandis que 27 pour cent des décideurs ont déclaré avoir cette opinion. La moitié des décideurs interrogés ont déclaré que répondre aux attentes des consommateurs restera un défi au cours des cinq prochaines années.
« Les résultats de notre étude montrent que si l'industrie prend des mesures pour garantir une chaîne d'approvisionnement plus transparente, il reste du travail à faire pour accroître la confiance des consommateurs et améliorer la traçabilité des aliments. Les entreprises ont naturellement plus d’informations à leur disposition, mais peuvent améliorer la confiance des consommateurs dans leurs sources de nourriture en leur donnant accès aux mêmes informations », a dit Mark Wheeler, directeur des solutions de la chaîne d’approvisionnement chez Zebra Technologies.
Réactions dans d’autres régions
Les entreprises d'Amérique latine prennent plus au sérieux la sécurité des aliments et la transparence, tandis que les attitudes concernant la valeur de la technologie pour la sécurité des aliments sont plus détendues en Europe.
Soixante-dix-neuf pour cent des consommateurs d'Amérique latine ont déclaré qu'il était important d'avoir accès à des informations précises sur la provenance de leurs aliments. Près de neuf personnes sur dix ont cité l'hygiène du personnel, des cuisines des restaurants comme leur principale préoccupation pour les problèmes liés à l'alimentation.
En Europe, seuls 15% des consommateurs interrogés font totalement confiance aux distributeurs de produits alimentaires et de boissons pour s'assurer que les produits sont sans danger pour la consommation. Plus de six personnes sur dix ont indiqué qu'une épidémie d'origine alimentaire était leur principale préoccupation pour les problèmes liés aux aliments.
Près des trois quarts des consommateurs d'Asie-Pacifique ont indiqué que les maladies et les décès causés par la contamination étaient leur principale préoccupation concernant les risques posés par la chaîne d'approvisionnement alimentaire.
samedi 19 septembre 2020
Face aux risques, un livre sur la sécurité sanitaire
Ecrit en 2010, cet article du blog était déjà là pour dire, « Ah, et c’est quoi l’AFSSA ? » …
La scène se passe le 19 avril 2001 au Palais de l’Elysée, et l’abbé Pierre est là, entouré de quelques amis, pour être fait grand officier de la Légion d’honneur. Après les discours, viennent les moments de détentes et en voici un court extrait.
Puis le chef de l’Etat s’adresse à Martin Hirsch :
- « Et comment ça se passe pour vous l’hiver ?
Pas trop mal, puisque je suis haut fonctionnaire. Je suis bénévole chez Emmaüs.
- Bénévole, c’est bien aussi. Et sinon, vous faites quoi ?
Je suis directeur général de l’Agence française de sécurité sanitaire des aliments…
- Ah, et c’est quoi ? »
Peut-être qu’aujourd’hui le directeur général de l’Anses pourrait demander quelques explications sur la signature par la ministre de l’environnement d’une pétition sur la fin des pesticides ? Qui sait ? Sortir un ouvrage, c'est bien, marquer son territoire, c'est mieux !
Revenons à l’Anses qui a inspiré un livre d’histoire de la sécurité sanitaire, « Face aux, risques ».
Que de chemin parcouru depuis l’Afssa… puis-je dire, pour ma part, je n’ai toujours pas ‘digéré’ le fait d’ajouter des pans entiers comme ceux sur l’environnement et le travail à la sécurité sanitaire des aliments, mais c’est ainsi, car il me semble que la sécurité sanitaire des aliments est, à elle-seule, un sujet majeur de préoccupation …
Pour écrire ce livre, l’Anses a fait appel à l’éditeur Le Cherche Midi et à trois historiens qui ont croisé leurs regards et leurs plumes sur l’évolution de la sécurité sanitaire en France. Du siècle des Lumières à nos jours, « Face aux risques » évoque en 208 pages richement illustrées les avancées liées au progrès scientifique et médical, l’impact des grandes crises sanitaires, l’évolution des préoccupations sociétales et du système de santé publique.
A mesure des prises de conscience et de l’évolution de la science, dans une société de plus en plus sensible aux enjeux de santé et à l’environnement, ce livre montre combien les responsabilités de la puissance publique, le rôle des experts et des instances d’expertise scientifiques, le statut même du savoir sont soumis à des questionnements constamment renouvelés.
Avec la pandémie actuelle, « Face aux risques » trouve une résonance nouvelle et donne à chacun matière à réfléchir, au regard des enseignements du passé, aux différentes façons de mobiliser la science pour éclairer la décision publique.
Je ne ferais pas donc la critique de ce livre, mais en revanche, je recommanderai l’ouvrage de Madeleine Ferrières, Histoire des peurs alimentaires. Du Moyen-Âge à l’aube du XXe siècle, édité au Seuil, 2002.
Complément du 22 septembre 2020. On écoutera ce tweet de l'Anses à propos de ce livre ...
📗 A lire ! Le livre « Face aux risques, une histoire de la sûreté alimentaire à la santé environnementale » est disponible en librairie !
— Anses (@Anses_fr) September 17, 2020
🎧 Ecoutez Pascal Griset, co-auteur du livre, le présenter en quelques mots !
👉 La suite sur notre site : https://t.co/oOnmDZos76 pic.twitter.com/1G8oRdrioS