Troisième semaine de février 2022: Un jour sans fin pour les rappels de produits alimentaires en France ?

On a fêté récemment au Canada, la Journée de la marmotte qui a été popularisée par un film, ‘Un jour sans fin’, et l’on peut dire, sans peine, que c’est ce que vivent les consommateurs français avec des rappels quotidiens permanents de produits alimentaires. 

Si l’on daigne jeter en coup d’oeil sur ce qui se passe chez nos voisins européens, on reste stupéfait de l’étendue des dégâts, c’est hélas, l’un des nombreux maux de la sécurité des aliments en France avec des contrôles et inspections en baisse, sans oublier une communication et une transparence que personne n’envie. Même l’Anses ne traite presque plus du sujet de la sécurité des aliments, c’est dire ...

41 rappels seulement en cette troisième semaine de février 2022 versus respectivement 86 et 88 pour la première et seconde semaine de février.

Du mieux donc ? Pas vraiment, car les rappels liés à la présence d’oxyde d’éthylène, vous savez ce feuilleton de l’incompétente Commission européenne qui dure depuis septembre 2020, sont dépassés désormais par la présence de pathogènes dans des produits alimentaires.

A-t’on réellement gagné au change ?

23 rappels sur 41 sont dus à la présence de Salmonella ou de Listeria monocytogenes !

Hélas, les produits laitiers se taillent la part du lion dans les rappels de cette semaine. Les fondamentaux ont-ils été oubliés ?

Six rappels seulement cette semaine sont liés à la présence d’oxyde d’éthylène.

Voici le détail par jour des rappels ci-dessous

14 février 2022

- oxyde d’éthylène: 4

- Salmonella: 2

- Listeria monocytogenes: 1

- cyanure d’hydrogène: 1

Coulisses des rappels

- Lire l’article du blog sur le rappel de légumineuses contaminées par Salmonella, les bienfaits de certaines plantes ?

- Le rappel d’amandes amères en raison d’une proportion importante de cyanure d’hydrogène a été publié sur twitter, mais attention sur le site Internet RappelConso, ce rappel est proposé seulement, si l’on recherche l’information, sur le moteur de recherche, c’est très pratique. Au final, information rétablie le lendemain soit le 15 février. A noter que ce rappel a eu lieu le 11 février en Suisse, le 10 février en Allemagne, le 9 février au Luxembourg et le 7 février en Autriche. Pourquoi ce retard ? Pas encore de notification au RASFF de l’UE, si, mais le 16 février 2022.

- Deux rappels liés à la présence de pathogènes sur 8 sont des produits laitiers.

15 février 2022

- Salmonella: 6

- Listeria monocytogenes: 5

- oxyde d’éthylène: 1

- migration d’emballage: 1

Coulisses des rappels

- Des pathogènes dans des produits laitiers sont à l’origine de 10 rappels du jour sur 13.

- Quatrième rappel depuis le début de l’année 2022 pour du saumon fumé et septième rappel en février pour du fromage Rocamadour.

- Notification au RASFF de l’UE par la France le 15 février de la présence de Salmonella dans du fromage de chèvre, Pouligny St Pierre.

- Un rappel au Luxembourg de bouillon aux herbes et avec de l'huile d'olive Puget de la marque Knorr en raison d’un défaut d'emballage pouvant entrainer la migration de contaminants. Pas encore de notification au RASFF de l’UE, comme quoi tout ne fait pas l’objet d’une notification au soit disant système d’alerte rapide ou RASFF.

16 février 2022

- Salmonella: 4

- oxyde d’éthylène: 2

- Listeria monocytogenes: 1

- résidu de pesticide: 1

Coulisses des rappels

- quatre rappels liés à des pathogènes dans des fromages: huitième rappel en deux jours de Pouligny St Pierre et huitième rappel de Rocamadour en février 2022.

- Notification au RASFF de l’UE le 16 février par la France de la présence de Listeria monocytogenes dans du saumon fumé de France. A noter que l’analyse a été faite le 7 février, comme souvent, un timing bureaucratique !

17 février 2022

- résidu de pesticide: 5

- Listeria monocytogenes: 2

- oxyde d’éthylène: 1

Coulisses des rappels

- Encore un rappel de fromage pour cause de présence de Listeria monocytogenes.

18 février 2022

- résidu de pesticide: 1

- Listeria monocytogenes: 2

- patuline: 1

Coulisses des rappels

- 18 rappels de fromages et de produits laitiers en une semaine …

- Notification au RASFF de l’UE par la France le 18 février de filets de harengs à l’huile de Pologne pour cause de présence de Listeria monocytogenes; l’information rapporte un retrait en France (?).

- Oubli par RappelConso, rappel par Auchan le 18 février 2022 de bouchées jambon fumé ail et fines herbes 100 g pour cause de présence de Listeria monocytogenes.

- Encore un oubli de RappelConso, rappel par Lidl le 18 février 2022 d'un dessert de fruits pomme abricot pour cause de présence de patuline supérieure à la limite autorisée par la réglementation européenne.

Feuilleton des rappels liés à la présence d’oxyde d’éthylène en France

Cela dure depuis le 9 septembre 2020, mais le décompte en France n’a débuté que le 20 octobre 2020.

Ainsi, selon la DGCCRF (depuis le 20 octobre 2020), il y a eu au 18 février 2022, 16 573 rappels (références et lots) versus 16 566 rappels au 11 février 2022. Cela va-t’il traduire une réelle baisse de ce type de rappels, à suivre ...

Curiosité

L’article du blog, «Une réunion sur l'oxyde d'éthylène met en lumière des divergences au sein des Etats membres de l'UE, alors que les rappels se poursuivent», fait l’objet d’un intérêt croissant de la part des lecteurs du blog. En effet, c’est le black-out total de la part de nos autorités sanitaires. Ainsi sur le site de la DGCCRF, on peut lire en leitmotiv, depuis des mois (bientôt des années ?) cette phrase consternante de platitudes, «Des investigations sont actuellement en cours en lien avec la Commission européenne pour identifier l’origine de cette contamination.» Chacun appréciera le niveau de la communication et de la transparence ...

Le prochain article sur le sujet aura lieu fin février pour un petit bilan.

Aux lecteurs du blog

Comme le montre cette notice de la BNF, le blog Albert Amgar a été indexé sur le site de la revue PROCESS Alimentaire. 10 052 articles initialement publiés par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue sont aujourd’hui inacessibles. Disons le franchement, la revue ne veut pas payer 500 euros pour remettre le site à flots, alors qu’elle a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles.

Etats-Unis: De la relation entre le taux de TIAC dans les restaurants et les notes d'inspection en sécurité des aliments. Quid en france ?

En 2016, les auteurs du bilan des toxi-infection alimentaires collectives de France publié par Santé publique de France notaient en conclusion,

Depuis avril 2017, les consommateurs ont accès aux résultats des contrôles sanitaires réalisés depuis le 1er mars 2017 dans tous les établissements de la chaîne alimentaire (restaurants, cantines, abattoirs, etc.) sur le site www.alim-confiance.gouv.fr. Cette mesure a été prévue par la loi d’Avenir pour l’agriculture, l’alimentation et la forêt, du 13 octobre 2014. L’impact de cette mesure incitative à l'amélioration continue des établissements agroalimentaires pourra être évalué dans les années à venir.

Depuis, plus rien, aucun autre bilan n'a fait état de cette remarque, les années passent, et on ne voit rien venir, un jour peut-être ...

Pourtant, un article aux Etats-Unis qui examine précidément les «Taux d'éclosions d'origine alimentaire associés au classement et à l'affichage des inspections dans les restaurants: évaluation à l'aide des données nationales de surveillance des toxi-infections alimentaires», source Journal of Protection.

Résumé

Une enquête nationale menée précédemment sur les programmes d'inspection des restaurants a associé la pratique consistant à divulguer les résultats d'inspection aux consommateurs au point de vente (POS ou point of service) du restaurant avec moins de toxi-infections alimentaires collectives. Nous avons utilisé les données du système national de surveillance des épidémies d'origine alimentaire (FDOSS pour Foodborne Disease Outbreak Surveillance System) pour évaluer la reproductibilité des résultats de l'enquête. Les programmes qui ont participé à l'enquête représentaient environ 23% des éclosions de maladies d'origine alimentaire dans un seul État (le Minnesota) dans les restaurants signalées au FDOSS entre 2016 et 2018. Les organismes qui ont divulgué les résultats des inspections au point de vente ont signalé moins d'éclosions (moyenne = 0,29 éclosions pour 1 000 établissements) que ceux qui divulguaient leurs résultats en ligne (0,7) ou pas du tout (1,0). Le fait d'avoir une méthode de notes ou de scores pour les inspections était associé à moins d'éclosions signalées que de ne pas avoir de méthode de notes. Les agences qui utilisaient des notes alphabétiques avaient le plus faible nombre d'éclosions pour 1 000 établissements. Il y avait une association positive (coefficient de corrélation, r = 0,54) entre le nombre moyen de plaintes de maladies d'origine alimentaire pour 1 000 établissements, selon l'enquête, et le nombre moyen d'éclosions de restaurants signalées au FDOSS (R2 = 0,29). Cette association était plus forte pour des tqxi-infections alimentaires dues à des toxines bactériennes (R2 = 0,35) que pour les épidémies à norovirus (R2 = 0,10) ou à Salmonella (R2 = 0,01). Les résultats de notre étude transversale sont cohérents avec les observations précédentes qui liaient la pratique consistant à afficher les notes ou les scores des résultats d'inspection au point de vente avec une réduction de la fréquence des maladies d'origine alimentaire et des toxi-infections alimentaires associées aux restaurants. Le soutien aux programmes de surveillance des maladies d'origine alimentaire et aux activités de réglementation des aliments dans les agences de santé locales est fondamental pour les systèmes de sécurité des aliments coordonnés aux niveaux étatique et fédéral.

Comme vous l’avez vu, ça marche, alors qu’attend-on en France d’autant qu’en 2020, les foyers de toxi-infections alimentaires collectives dans la restauration commerciale n’ont que peu baissé …

Certes il y a eu -43% de toxi-infections alimentaires collectives par rapport à 2019, mais la part des TIAC déclarées suite à des repas dans des restaurants commerciaux est passée que de 40,8% à 36,5%. A suivre ...

Aux lecteurs du blog

Comme le montre cette notice de la BNF, le blog Albert Amgar a été indexé sur le site de la revue PROCESS Alimentaire. 10 052 articles initialement publiés par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue sont aujourd’hui inacessibles. Disons le franchement, la revue ne veut pas payer 500 euros pour remettre le site à flots, alors qu’elle a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles.

Un nouveau modèle pour la formation d'un biofilm endodontique

«Un nouveau modèle pour la formation d'un biofilm endodontique» par Elio et Roberto du blog Small Things Considered.

En ce moment même, les biofilms font fureur en microbiologie. Et pourquoi pas, étant donné que la plupart des bactéries dans la nature ne nagent pas librement mais sont attachées à une surface. Des systèmes modèles pour les biofilms sont donc indispensables. Des chercheurs de deux institutions à Bogotá, en Colombie, l'Universidad del Bosque et l'Universidad de los Andes (avec Diana M. Castillo comme auteur principal) ont combiné leurs forces pour développer un nouveau modèle de formation de biofilm par Enterococcus faecalis. Cet agent pathogène se développe à la fois dans l'intestin humain et à la surface des dents. On le trouve également dans les canaux radiculaires, où il peut provoquer de graves infections endodontiques.

Le modèle en question consiste à faire pousser Enterococcus faecalis à la surface des racines des dents, des morceaux de dentine (la couche médiane de la dent, entre l'émail et la pulpe), découpés dans des dents humaines saines fraîchement extraites (à des fins orthodontiques) et surface stérilisée avant d'être inoculée avec des cultures de E. faecalis. Les échantillons ont été incubés jusqu'à un mois pour simuler les conditions d'une vraie dent infectée. Les bactéries présentes à la surface de la racine dentinaire ont été dénombrées et examinées à l'aide de deux approches: la microscopie électronique à balayage à émission de champ et la microscopie confocale à balayage laser. Après 14 jours, les surfaces radiculaires sont devenues colonisées de manière homogène et la plupart des cellules étaient viables, comme en témoigne la coloration au SYTO 9 et à l’iodure de propidium pour les cellules vivantes/mortes. Au bout de 30 jours, plus de la moitié des cellules étaient mortes. Pour paraphraser les propos des auteurs, «ce nouveau modèle endodontique in vitro de formation de biofilm de E. faecalis présente un biovolume approprié et une structure tridimensionnelle stable. Il est compatible avec un biofilm mature dans des conditions de restriction nutritionnelle, comme cela se produit habituellement chez les environnement endodontique. Il devrait permettre une évaluation future de l'efficacité des substances antimicrobiennes avec une approche plus clinique.» On dirait qu'ils sont prêts à y aller.

NB: Acte fréquemment réalisé par votre dentiste, le traitement endodontique (aussi appelé traitement de racine, de canal ou dévitalisation) consiste à soigner la partie interne de la dent, la pulpe, lorsque celle-ci est atteinte (carie, fracture, nécrose...).

From @STCmicrobeblog: biofilms are all the rage in micro­biology. And why not, being that most bac­teria in nature are not free-swimming but are at­tached to some surface... https://t.co/cPm3UYbzeN

— ASM (@ASMicrobiology) February 16, 2022

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Etats-Unis: Quatre bébés infectés par Salmonella et Cronobacter liés à du lait maternisé

«Quatre bébés infectés par Salmonella et Cronobacter liés à du lait maternisé», source CIDRAP News.

Au moins quatre bébés ont été infectés par Salmonella Newport ou Cronobacter sakazakii et un bébé est décédé après avoir bu du lait maternisé fabriqué à partir d'une poudre produite dans les installations d'Abbott Nutrition à Sturgis, Michigan, a déclaré la Food and Drug Administration (FDA) dans un communiqué de presse du 17 février 2022 et une mise à jour de l’éclosion le 18 février 2022.

Trois bébés ont été testés positifs pour une infection à C. sakazakii et un pour Salmonella, et tous ont été hospitalisés. La FDA a dit: «Cronobacter peut avoir contribué à un décès dans un cas.»

La formule dinfantile e l'établissement Abbott à Sturgis a été achetée du 6 septembre au 18 décembre 2021, ont rapporté les familles des bébés. La FDA conseille aux personnes de ne pas utiliser les préparations en poudre pour nourrissons Similac, Alimentum ou EleCare si les deux premiers chiffres du code du produit vont de 22 à 37 et que le code sur le contenant contient K8, SH ou Z2 et que la date de péremption est le 1er avril 2022 ou ultérieur.

On lira le communiqué de rappel volontaire d’Abbot ici.

Des scientifiques de la FDA et du CDC s'associent à un responsable local pour investiguer sur l'éclosion. «Il s'agit d'une enquête en cours, et la société travaille avec la FDA pour lancer un rappel volontaire du produit potentiellement concerné», a dit la FDA. «La FDA continue d'enquêter et mettra à jour cet avis si des informations supplémentaires sur la sécurité sanitaire des consommateurs deviennent disponibles.»

Jusqu'à présent, les enquêteurs ont signalé plusieurs détections de C. sakazakii dans des échantillons environnementaux prélevés à l'usine de Sturgis. Un examen des dossiers de l'entreprise indique également une contamination de l'environnement par le pathogène et la destruction du produit par l'entreprise en raison de la contamination par Cronobacter.

«Comme il s'agit d'un produit utilisé comme seule source de nutrition pour de nombreux nouveau-nés et nourrissons de notre pays, la FDA est profondément préoccupée par ces rapports d'infections bactériennes», a déclaré Frank Yiannas, commissaire adjoint de la FDA pour la politique alimentaire et la réponse, dans un communiqué de presse.

«Nous voulons rassurer le public sur le fait que nous travaillons avec diligence avec nos partenaires pour enquêter sur les plaintes liées à ces produits.»

Avis de rappel au Canada de certaines préparations en poudre pour nourrissons de marque Abbott en raison des bactéries Cronobacter sakazakii et Salmonella.

Un article de Food Safety News du 19 février 2022 rapporte que «De nombreux pays ont reçu des préparations pour nourrissons rappelées liées à l'éclosion.»

Mise à jour du 21 février 2022. 

- Avis de rappel par la FSA du Royaume-Uni le 20 février 2021: Abbott recalls two infant formula powders because of the possible presence of Salmonella.

- Rappel le 21 février 2022 en Irlande de lots spécifiques de EleCare, Similac et Alimentum Similac en raison de la possible présence de Salmonella et de Cronobacter sakazakii.

Mise à jour du 22 février 2022. 

- Rappel en Australie le 19 février 2022  de EleCare, Similac et Alimentum Similac en raison d'une possible contamination microbienne..

- Réveil le 22 février 2022 de la Commission européenne avec cette notification au RASFF de l'UE qui concerne une intoxication alimentaire suspectée d'être causée par des préparations infantiles des Etats-Unis.

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Cas de gastro à norovirus en Italie avec des huîtres de France. Quid en France ?

Ce tweet du 19 février de Joe Whitworth interpelle, y a-t'il des cas de maladies liées aux coquillages non rapportées en France depuis le début de l'année ?

Ah bah voila ! I thought we were doing well, as not heard of any illnesses linked to French shellfish so far this year. 5 sick in Italy https://t.co/MzeLZHe1yL

— joewhitworth (@joewhitworth) February 19, 2022

Voici la notification au RASFF de l'UE par l'Itale le 18 février 2022 qui rapporte la présence de norovirus dans des huîtres de France, cinq personnes malades en Italie. à suivre ...

Dans ce contexte, on lira la récente mise à jour au 17 février 2022 par Santé publique de France des gastro-entérites aiguës.

Mise à jour du 22 février 2022. Cette information dans ce contexte peut être utile. Selon Le Télégramme du 21 février, La pêche de coquillages est interdite dans la Baie de Morlaix aval. Le préfet du Finistère vient de prendre un arrêté interdisant la pêche de coquillages dans la Baie de Morlaix aval à cause de la présence de norovirus.

Mise à jour du 23 février 2022. Notification au RASFF de l'UE par la France le 23 février 2022 de la présence de norovirus dans des huîtres de France. Il était temps ..

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Choses lues sur la sécurité des aliments, selon le Seismo Info de février 2022

Seismo Info, le célèbre couteau suisse de la sécurité des aliments de l’OSAV, vous propose le Seismo de février 2022 (02/2022). J’ai extrait les aspects liés liés strictement à la sécurité des aliments.

Certains de ces sujets ont été traités par le blog, mais un rappel et une mise à jour ne font que du bien ...

Foyers inhabituels de maladie d’origine alimentaire

Hydroponie: Aux États-Unis, une enquête a été menée sur une épidémie à Salmonella Typhimurium liée à des légumes verts pré-emballés issus d’une exploitation hydroponique intérieure. FDA, 8 pages. (14.01.2022).

Salmonella Blockley: Un type rare de salmonelle, S. Blockley, a infecté 16 personnes en Norvège; la majorité a dû être hospitalisée. La source de l'infection est inconnue. Food Safety News, 2 pages. (15.01.2022).

Sécurité alimentaire

Poissons et fruits de mer: Une étude a étudié la présence d’hydrocarbures aromatiques polycycliques (PAHs) et de PAH halogénés (XPAHs) dans des snacks à base de fruits de mer. Les résultats suggèrent un risque cancérigène potentiel pour les amateurs de ces produits. Food Control, 10 pages. (06 2022).

Cannabinoides: Les chimistes cantonaux de Suisse ont contrôlé des denrées alimentaires contenant du cannabis ou des extraits de cannabis ou portant la mention CBD. Sur 100 produits analysés, 85 ont été jugés non conformes. ACCS, 2 pages. (01.02.2021). Une publication se penche sur la présence de mycotoxines dans les plantes de cannabis et les aliments et boissons à base de cannabis. Affidia, 3 pages. (18.01.2022).

Succédanés de lait: En Allemagne entre 2019 et 2021, des boissons végétales ont été analysées sur le plan sensoriel et nutritionnel. Les échantillons ont inclus des boissons à base d'avoine, de soja, de riz, d'amandes, de noix de cajou, de protéines de pois, ou de noix de coco. LAVES, 3 pages. (2022).

Farine: Deux études récentes publiées sur la farine indiquent que les consommateurs américains doivent être mieux informés sur la manière d'utiliser la farine en toute sécurité. Food Safety News, 3 pages. (12.01.2022). Publications originales: Journal of Food Protection, Journal of Food Protection.

Parasites: Cyclospora, Toxoplasma et Cryptosporidium ont été détectés dans des baies vendues en Norvège. Cependant, seul de l'ADN a été détecté - il n'y a ainsi aucune certitude que les stades infectieux des parasites étaient présents, et il n'y a aucune information sur la viabilité. Food Safety News, 3 pages. (21.01.2022). Publication originale: Food Microbiology.

Risques chimiques: Une analyse réalisée en Finlande a estimé que l'arsenic et certaines mycotoxines constituaient les plus grands risques d'effets graves sur la santé liés aux contaminants présents dans les aliments. Food Safety News, 2 pages. (02.02.2022).

Allergènes: En Italie, certains supermarchés apposent des panneaux pour avertir les clients du risque d'acheter des pâtes, du pain et des produits de boulangerie préparés avec des farines contaminées par des graines de moutarde. Affidia, 1 page. (14.01.2022). Plus d’informations: MDSalute. Voir aussi: SeismoInfo 09 2021.

Contaminants et grossesse: Des scientifiques américains ont montré que, chez des souris, la transmission directe du bisphénol A (BPA) d'une mère à son enfant en développement via le placenta aurait un impact négatif sur le développement du cerveau du fœtus. EurekAlert!, 4 pages. (12.01.2022). Publication originale: Epigenomics. Selon une nouvelle étude, l'exposition aux phtalates pourrait perturber une hormone importante nécessaire au bon déroulement de la grossesse. ScienceDaily, 2 pages. (12.01.2022). Publication originale: Environnement International.

Glycosides cyanogènes: Une entreprise canadienne procède au rappel de « smoothie » en raison de la présence de baies de sureau crues, qui renferment des glycosides cyanogènes (toxines naturelles). Le produit visé par le rappel a été vendu en ligne. Gouvernement du Canada, 1 page. (21.01.2022).

Alcaloïdes: En Hollande, les autorités ont mis en garde contre deux préparations à base de plantes, vendues sur internet, dont les ingrédients pourraient présenter un risque pour la santé. Les préparations contiennent les alcaloïdes bêta-carboline harmine, harmaline et tétrahydroharmine. Food Safety News, 3 pages. (25.01.2022).

Staphylococcus argenteus: Au Japon, une étude a examiné la prévalence de S. argenteus, une nouvelle espèce du complexe Staphylococcus aureus, dans des aliments frais et dans les abattoirs de volaille. S. argenteus a été isolé dans 21 des 151 échantillons de poulet. International Journal of Food Microbiology, 8 pages. (16.02.2022).

Transport: Au Danemark, une campagne de contrôle officiels en 2021 a porté sur le transport des denrées alimentaires au niveau du commerce de détail. Un quart des entreprises ne respectaient pas les règles lors de la collecte ou de la livraison des aliments. Food Safety News, 2 pages. (23.01.2022).

Aux lecteurs du blog

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La raison structurelle surprenante pour laquelle votre éponge de cuisine est dégoûtante

Des chercheurs ont découvert que la structure d'une éponge imite celle du sol pour produire un environnement plus propice à la diversité microbienne que la plupart des équipements de laboratoire.

«La raison structurelle surprenante pour laquelle votre éponge de cuisine est dégoûtante», source communiqué de Duke University.

La structure environnementale affecte les interactions entre les espèces microbiennes, faisant de l'éponge de cuisine commune un meilleur incubateur pour la diversité bactérienne qu'une boîte de Petri de laboratoire.

Des chercheurs de l'Université Duke ont découvert un fait basique mais surprenant: votre éponge de cuisine est un meilleur incubateur pour diverses communautés bactériennes qu'une boîte de Petri de laboratoire. Mais ce ne sont pas seulement les restes piégés qui rendent la corne d'abondance de microbes si heureuse et productive, c'est la structure de l'éponge elle-même.

Dans une série d'expériences, des scientifiques montrent comment diverses espèces microbiennes peuvent affecter la dynamique des populations les unes des autres en fonction de facteurs de leur environnement structurel tels que la complexité et la taille. Certaines bactéries se développent dans une communauté diversifiée tandis que d'autres préfèrent une existence solitaire. Et un environnement physique qui permet aux deux espèces de vivre leur meilleure vie conduit aux niveaux de biodiversité les plus élevés.

Le sol fournit ce type d'environnement de logement mixte optimal, tout comme votre éponge de cuisine.

Les ingénieurs biomédicaux de Duke affirment que leurs résultats suggèrent que les environnements structurels devraient être pris en compte par les industries qui utilisent des bactéries pour accomplir des tâches telles que le nettoyage de la pollution ou la production de produits commerciaux.

Les résultats ont été publiés en ligne le 9 février dans la revue Nature Chemical Biology.

«Les bactéries sont comme les personnes qui vivent la pandémie, certaines ont du mal à s'isoler tandis que d'autres prospèrent», a dit Lingchong You, professeur de génie biomédical à Duke. «Nous avons démontré que dans une communauté complexe qui a des interactions positives et négatives entre les espèces, il existe une quantité intermédiaire d'intégration qui maximisera sa coexistence globale.»

Les communautés microbiennes se mélangent à des degrés divers dans la nature. Le sol offre de nombreux coins et recoins permettant à différentes populations de se développer sans trop d'interaction de la part de leurs voisins. La même chose peut être dite pour les gouttelettes d'eau individuelles sur le dessus des feuilles.

Mais lorsque les humains mélangent de nombreuses espèces bactériennes dans un bouillon (goop) sans structure pour produire des produits comme l'alcool, des biocarburants et des médicaments, c'est généralement dans une assiette ou même dans une grande cuve. Dans leurs expériences, You et son laboratoire montrent pourquoi ces efforts industriels peuvent être judicieux pour commencer à adopter une approche structurelle de leurs efforts de fabrication.

Les chercheurs ont utilisé un code barres pour environ 80 souches différentes de E. coli afin de pouvoir suivre la croissance de leur population. Ensuite, ils ont mélangé les bactéries dans diverses combinaisons sur des boîtes de culture de laboratoire avec une grande variété d'espaces de vie potentiels allant de six grands puits à 1 536 petits puits. Les grands puits se rapprochaient des environnements dans lesquels les espèces microbiennes peuvent se mélanger librement, tandis que les petits puits imitaient des espaces où les espèces pouvaient rester entre elles.

Quelle que soit la taille de l'habitat, les résultats étaient les mêmes. Les petits puits qui ont commencé avec une poignée d'espèces ont fini par évoluer vers une communauté avec seulement une ou deux souches survivantes. De même, les grands puits qui ont commencé avec une large gamme de biodiversité ont également mis fin à l'expérience avec seulement une ou deux espèces restantes.

«Les petites portions nuisent vraiment aux espèces qui dépendent des interactions avec d'autres espèces pour survivre, tandis que les grandes portions éliminent les membres qui souffrent de ces interactions (les solitaires)», a dit You. «Mais le portionnement intermédiaire a permis une diversité maximale de survivants de la communauté microbienne.»

Les résultats, dit You, créent un cadre pour les chercheurs travaillant avec diverses communautés bactériennes pour commencer à tester quels environnements structurels pourraient fonctionner le mieux pour leurs activités. Ils expliquent également pourquoi une éponge de cuisine est un habitat si utile pour les microbes. Il imite les différents degrés de séparation trouvés dans un sol sain, offrant différentes couches de séparation combinées à différentes tailles d'espaces communs.

Pour prouver ce point, les chercheurs ont également mené leur expérience avec une bande d'éponge domestique ordinaire. Les résultats ont montré qu'il s'agit d'un incubateur de diversité microbienne encore meilleur que n'importe lequel des équipements de laboratoire testés.

«Il s'avère qu'une éponge est un moyen très simple de mettre en œuvre un portionnement à plusieurs niveaux pour améliorer l'ensemble de la communauté microbienne», a déclaré You. «C'est peut-être pour ça que c'est une chose vraiment sale, la structure d'une éponge fait juste une maison parfaite pour les microbes.»

Aux lecteurs du blog

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Choses lues sur le bio

Les agriculteurs « dindons de la farce » d’une filière #bio qui ne fait plus recette. Analyse d’une situation de crise que certains candidats aux #présidentielles2022 promouvant le #bio à outrance feignent d’ignorer... pic.twitter.com/6up9INkPnK

— GRW (@AEGRW) February 17, 2022

Pour la première fois, le marché se replie dans les supermarchés. Pourquoi ?

Après avoir beaucoup grandi, le marché du bio entame sa crise d'adolescence https://t.co/LO2VVPRdhQ via @lopinion_fr

— Emmanuelle Ducros (@emma_ducros) February 17, 2022

Mise à jour du 12 mai 2022. On lira sur le blog d’André Heitz, «Bjørn Lomborg dans le Wall Street Journal: «La crise en Ukraine révèle la folie de l'agriculture biologique».

«La crise de l'énergie causée par la guerre en Ukraine a détrompé de nombreux politiciens de l'idée que le monde pourrait faire une transition rapide vers une énergie verte alimentée par le solaire, le vent et les vœux pieux. Alors que les prix des denrées alimentaires montent en flèche et que le conflit menace de provoquer une crise alimentaire mondiale, nous devons faire face à une autre réalité impopulaire: l'agriculture biologique est inefficace, gourmande en terres et très coûteuse, et elle laisserait des milliards de personnes affamées si elle était adoptée dans le monde entier.»

Aux lecteurs du blog

Comme le montre cette notice de la BNF, le blog Albert Amgar a été indexé sur le site de la revue PROCESS Alimentaire. 10 052 articles initialement publiés par mes soins de 2009 à 2017 sur le blog de la revue sont aujourd’hui inacessibles. Disons le franchement, la revue ne veut pas payer 500 euros pour remettre le site à flots, alors qu’elle a bénéficié de la manne de la publicité faite lors de la diffusion de ces articles.