Public Health England enquête sur une augmentation des cas d’infection à E. coli O157

« Public Health England enquête sur une augmentation des cas d’infection à E. coli O157 », source article de Joe Whitworth paru le 23 août 2020 dans Food Safety News.

Public Health England enquête sur un pic dans les rapports des cas d’infections à E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) ce mois-ci.

Les sources potentielles de l'augmentation des cas à E. coli O157 ne sont pas encore claires, mais le temps chaud récent peut avoir joué un rôle.

Les dernières données disponibles montrent que lors de la semaine se terminant le 16 août, il y a eu 27 notifications à E. coli O157. Les quatre dernières semaines en avaient vu respectivement, 11, 13, 6 et 7.

Selon les statistiques de 2019 pour la semaine se terminant le 18 août, il y avait eu 13 notifications à E. coli O157. Les quatre semaines précédentes avaient trois semaines avec 12 et une avec 14.

Source encore inconnue

« Depuis le début du mois d'août, Public Health England a noté une augmentation générale des signalements d'infections à E. coli O157, en particulier dans les West et East Midlands », indique un communiqué de PHE envoyé à Food Safety News.

« Une augmentation de l'activité des E. coli à cette période de l'année n'est pas inhabituelle, surtout compte tenu des conditions climatiques récentes. Public Health England étudie activement cette situation. Une source possible de ces flambées reste incertaine à ce stade. »

Certains services de l'unité de référence des bactéries gastro-intestinales (GBRU), qui fait partie de la PHE, ont été suspendus en raison de la pandémie de coronavirus. Cependant, la détection des STEC à partir d'échantillons de selles et d'isolats par PCR et la confirmation de l'identité et du typage de Salmonella, Shigella, STEC et Listeria par séquençage du génome entier se poursuivent.

Précautions pour le public

Les symptômes de l'infection à E. coli comprennent des crampes abdominales et une diarrhée qui peuvent devenir sanglantes. De la fièvre et des vomissements peuvent également survenir. La période d'incubation peut aller de trois à huit jours et la plupart des patients se rétablissent dans les 10 jours.

Le SHU est une maladie grave qui peut entraîner une insuffisance rénale, des problèmes de santé permanents et même la mort. Il est le plus souvent déclenché par une infection à STEC, selon les Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis. Les premiers symptômes comprennent une diminution du débit urinaire, de la diarrhée et une sensation de lenteur et de fatigue. Le SHU se développe généralement une à deux semaines après les premiers symptômes de l'infection à E. coli.

La bactérie E. coli est principalement transmise à l'homme par la consommation d'aliments contaminés, comme la viande hachée crue ou insuffisamment cuite, le lait cru et les légumes crus et les graines germées.

« E. coli peut causer une infection grave chez les personnes dont le système immunitaire est affaibli ou les groupes vulnérables, y compris les bébés, les personnes âgées ou les femmes enceintes », selon la PHE.

« Certaines infections peuvent être graves et les personnes infectées peuvent développer des complications qui peuvent mettre leur vie en danger. Comme pour tous les cas de diarrhée et de vomissements, il est important que les gens restent hydratés et restent loin du travail ou de l'école aussi longtemps que les symptômes persistent. Si vous remarquez du sang dans vos selles, contactez immédiatement votre médecin généraliste. »

Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous

Choses lues sur les contrôles en sécurité sanitaire des aliments au mois d'août en France

Dans un tweet du 14 juin 2018, la chaîne LCP rapportait des propos du ministre de l’économie et des finances au sujet des contrôles,

Cela étant, selon France Inter du 19 août 2020, « Les contrôles de la répression des fraudes divisés par deux cet été ». Moralité, il y en avait déjà moins, il y en aura encore moins ...

10 000 contrôles, contre 20 000 l'an passé. Une décision assumée par le gouvernement, bien que le risque d'abus dans les hôtels, les restaurants ou sur les marchés soit plus élevé en pleine saison. Il s'agit de ne pas brusquer les professionnels du tourisme, fragilisés par la crise.

Pourtant du travail de contrôles, il existe des besoins. Ainsi cette information du Parisien selon laquelle « des caves insalubres servent de cuisines à deux restaurants du IXe arrondissement. »

Dans le IXe arrondissement de Paris, non loin des Grands Magasins, deux restaurateurs louent des caves et les utilisent comme cuisine ou réserve. Provoquant le ras-le-bol et l’inquiétude des habitants de l’immeuble qui dénoncent des conditions d’hygiène déplorables.

Une vidéo accompagne le reportage, mais je n’ai pas vu ou lu que l’inspecteur Denormandie soit intervenu, il a une excuse, il ne peut pas être partout ...

Autre aspect rapporté par Le Télégramme du 18 août 2020 avec « Une matinée avec les inspecteurs d’hygiène dans un restaurant de la région vannetaise ».

C'est une description d'un travail très professionnel des inspecteurs, rien à redire ...

Deux inspecteurs de la DDPP de Vannes ont réalisé un contrôle sanitaire dans un restaurant de région vannetaise, ce lundi 17 août. Nous les avons suivis lors de leur visite.

Garants de la sécurité des consommateurs, les inspecteurs d’hygiène alimentaire sont la hantise de certains restaurateurs. Au service de la Direction départementale de la protection des populations (DDPP), ils sont quinze à sillonner le département, sans jamais s’annoncer. L’agent X - qui tient à garder l’anonymat - est l’une d’entre eux. Dans le milieu depuis près de quarante ans, elle estime faire un métier « qui a du sens ». Ce lundi, elle visite un restaurant de la région vannetaise, accompagnée du chef de service sécurité sanitaire des aliments. Un employé à peine surpris les accueille, ses responsables sont en vacances.

Les deux inspecteurs enfilent blouse, charlotte et surchaussures bleues puis entament leurs inspections dès les vestiaires. Rien ne leur échappe. Ni la moisissure sur la porte, ni les traces de doigts sur l’interrupteur, ni « le gros bordel » dans une pièce qui servait autrefois de salle de bains. Son smartphone dans une main, un stylo dans l’autre, l’inspectrice photographie et note chaque anomalie.

Dans la cuisine, les questions fusent. « C’est une tenue correcte ça ? On a de l’eau chaude ? Des essuie-mains ? Et les poubelles ? Cette porte-là, elle reste ouverte ? » Le chef cuisinier, un colosse qui dépasse le mètre quatre-vingts, semble perplexe. L’inspecteur fait glisser son doigt sur la surface d’une grille d’aération, qui ressort noir de poussière. « Vous trouvez que c’est propre ? », l’interroge-t-il, mains sur les hanches. Devant un cuisinier penaud, sa consœur se veut rassurante : « on ne vous fait pas de reproches personnels, juste un constat ».

Muni d’un thermomètre, le chef de service vérifie la température de chaque produit laissé hors du réfrigérateur. « Ça devrait être au frais depuis une heure », assène-t-il. L’inspectrice photographie à tour de rôle l’intérieur encrassé d’un micro-ondes et des traces marron sur le carrelage. « C’est dommage toutes ses gamelles à même le sol », fait-elle remarquer. « Je ne sais pas quoi vous dire, j’essaie de faire au mieux et maintenant, je vais peut-être perdre mon boulot », souffle le cuisinier livide.

Dans un verre en plastique, le chef de service trouve une blatte. « Elle est en train de se repaître ! », s’exclame-t-il, mi-atterré mi-amusé. Le cuisinier, lui, se décompose à vue d’œil.

Dans les chambres froides, les agents relèvent les températures et s’assurent de la traçabilité de chaque produit. Des steaks hachés mal emballés, des desserts glacés et autres mets non étiquetés finiront à la poubelle.

Après deux heures d’inspection, le duo fait le point avec le cuisinier et le responsable adjoint. « C’est notre jour de bonté, entame le chef de service. En temps normal, c’est 1 500 euros d’amende en cas d’absence de déclaration d’activité et parce que l’hygiène laisse à désirer. Aujourd’hui, on vous en fait grâce, mais la prochaine fois, ce ne sera pas le cas ». La visite se solde par une mise en demeure : les gérants ont trois mois pour redresser la barre.

Un petit mais à cette inspection, tout de même, c’était le « jour de bonté » du contrôle car peut-être s’agissait-il de « ne pas brusquer les professionnels du tourisme, fragilisés par la crise » ?

Je me demande si laisser ouvert un tel restaurant pendant trois mois ne fait prendre des risques aux futurs convives, c’est juste une question, étant donné l'étendue de ce qui a été constaté ...

Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous

Vers une définition du terme ‘synbiotique’

«Un groupe de scientifiques internationaux s'accordent sur une définition de ‘synbiotique’.»

Une nouvelle définition fournit une base pour les allégations scientifiques sur les bienfaits des synbiotiques pour la santé, source International Scientific Association for Probiotics and Prebiotics (ISAPP) avec le communiqué repris par EurekAlert!.

Le terme ‘symbiotique' apparaît sur un nombre croissant de produits alimentaires et de compléments alimentaires, avec des ingrédients synbiotiques prometteurs pour moduler la communauté des microbes vivant dans l'intestin humain, tout en procurant un bénéfice pour la santé. Les synbiotiques sont généralement considérés comme une combinaison d'un probiotique et d'un prébiotique - mais les experts ont jugé cette description trop limitative pour l'innovation dans ce domaine et trop ambiguë pour permettre une compréhension claire des bénéfices pour la santé des synbiotiques.

Pour résoudre l'ambiguïté scientifique autour des synbiotiques, un groupe de 11 scientifiques internationaux de premier plan a formé un groupe d'experts pour créer une définition consensuelle et clarifier les preuves requises pour montrer que les synbiotiques sont sûrs et efficaces.

Dans un article publié dans Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, les auteurs avancent une nouvelle définition des synbiotiques, qui est définie par les derniers développements scientifiques dans le domaine: « un mélange comprenant des micro-organismes vivants et un ou des substrats sélectivement utilisés par les micro-organismes hôtes qui confère un avantage pour la santé de l'hôte ».

Les experts du panel soulignent que la définition est conçue pour être inclusive - de nombreuses combinaisons différentes de micro-organismes vivants et de substrats utilisés de manière sélective pourraient être qualifiées de synbiotiques, à condition qu'une étude humaine démontre les bénéfices pour la santé d'une combinaison particulière. De plus, les synbiotiques n'ont pas besoin d'être limités à l'intestin; ils pourraient potentiellement cibler toute partie du corps humain qui héberge une communauté de micro-organismes.

« Nous espérons que la publication de cette définition marquera un changement dans la compréhension des synbiotiques », a dit le premier auteur, Kelly Swanson, professeur au Département des sciences animales et à la Division des sciences de la nutrition de l'Université de l'Illinois à Urbana-Champaign. « Nous pouvons commencer à discuter des synbiotiques d'une manière plus précise scientifiquement, en donnant à chacun un vocabulaire commun pour comprendre ce qu'ils font, comment ils fonctionnent et quelles preuves sont nécessaires pour répondre à la définition. »

Dans la publication, le groupe fait également une distinction entre ‘les synbiotiques complémentaires, dans lesquels un probiotique et un prébiotique sont combinés mais fonctionnent séparément, et les ‘synbiotiques synergiques’, dans lesquelles le substrat sélectivement utilisé nourrit spécifiquement les micro-organismes qui l'accompagnent.

Le groupe d'experts a été réuni par l’InternationalScientific Association for Probiotics and Prebiotics (ISAPP), une organisation à but non lucratif qui dirigeait auparavant les définitions scientifiques consensuelles des probiotiques et des prébiotiques.

« Créer une définition de synbiotique est une première étape », a dit Mary Ellen Sanders, directrice scientifique de l'ISAPP. « À partir de là, la communauté scientifique peut se concentrer sur la conception et la réalisation d'études pour tester les effets sur la santé de ces produits. »

Les enquêtes indiquent que les consommateurs recherchent de plus en plus des preuves que les produits sur le marché offrent les bénéfices qu'ils prétendent offrir. Sanders a dit: « Nous nous attendons à ce que les données scientifiques sur les bienfaits pour la santé des synbiotiques augmentent au fil du temps, parallèlement à une augmentation de la sensibilisation générale aux synbiotiques. »

Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous

Bonne nouvelle, la France compte un inspecteur en sécurité sanitaire et bien-être animal de plus !

A défaut d'avoir suffisamment d'inspections en France, on attend des actions d'éclats d'un groupe aux visées obscures pour réagir ... la profession du foie gras méritait mieux ...

Voici les dernières actions de ce nouvel inspecteur, décidément sur tous les fronts en ce mois d'août, ...

Par contrôles complémentaires à ma demande, ce n’est pas 1 mais 3 sites du même exploitant qui sont fermés à Lichos & dans les Landes.

Je le dis : cet exploitant ne représente en rien l’élevage français. Des bâtiments n’étaient pas déclarés. Une procédure judiciaire est ouverte. pic.twitter.com/aTt9k8pcaa

— Julien Denormandie (@J_Denormandie) August 21, 2020

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La Suède enquête sur une augmentation du nombre de cas à Campylobacter

« La Suède enquête sur une augmentation du nombre de cas à Campylobacter », source article de Joe Whitworth paru le 22 août 2020 dans Food Safety News.

Les responsables de la santé publique en Suède ont noté une augmentation du nombre de personnes souffrant d'infections à Campylobacter ce mois-ci.

L'augmentation coïncide avec une augmentation de Campylobacter dans les troupeaux de poulets de chair depuis la fin juillet, selon Folkhalsomyndigheten (Agence de santé publique de Suède).

Cette agence, les unités régionales de contrôle des infections, l'Institut national vétérinaire (SVA), Livsmedelsverket (Agence nationale des aliments), le Conseil suédois de l'agriculture et l'Autorité suédoise de l'environnement de travail enquêtent sur les causes de l'augmentation et tentent de réduire le nombre de cas.

Au cours des quatre semaines précédant l'augmentation, le nombre de cas signalés d'infections domestiques ou pour lesquels des informations sur le pays d'infection manquaient était de 88 cas à la semaine 28 début de juillet, 77 pour la semaine 29, 88 pour la semaine 30 et 94 pour la semaine 31. À la semaine 32, début août, les infections sont passées à 149 et à 161 pour la semaine 33.

Enquêter sur l'augmentation soudaine des cas d’infection

La hausse a touché différentes régions du pays mais un comté, Sörmland, a eu 12 cas en juillet et il y en a déjà eu 19 en août.

Rikard Dryselius, microbiologiste à Folkhalsomyndigheten, a dit que l'augmentation générale est observée dans la plupart des comtés de Suède, en particulier dans ceux dont la population est suffisamment nombreuse.

« Nous ne savons pas encore s'il s'agit d'une épidémie ou non. Les informations dont nous disposons sont une augmentation soudaine du nombre de cas humains qui, selon l'Institut national vétérinaire suédois, fait suite à une augmentation soudaine parmi les grands troupeaux de poulets de chair. La saisie est en cours et des comparaisons seront effectuées », a-t-il déclaré à Food Safety News.

Le SVA publie chaque semaine des informations sur la proportion de troupeaux positifs à Campylobacter. Cela montre une augmentation pour les semaines 29, 30 et 31.

L'infection à Campylobacter est plus fréquente en été, mais l'augmentation survient après une période où l'incidence a été exceptionnellement faible. La prévalence de Campylobacter dans les troupeaux de poulets de chair a été très faible pendant la première moitié de l'année.

« La pandémie de COVID-19 est une explication plausible des faibles chiffres, car des tendances similaires ont également été observées pour d'autres maladies, que nous avons l'intention d'étudier plus en détail. Une explication supplémentaire pourrait également être le faible niveau de troupeaux de poulets de chair positifs à Campylobacter, comme vous pouvez le voir dans les statistiques de SVA », a dit Dryselius.

S'attaquer au problème de Campylobacter

Au cours des trois dernières années, Folkhalsomyndigheten et Livsmedelsverket ont comparé Campylobacter dans des poulets réfrigérés acheté dans les magasins pendant l'été avec Campylobacter isolés de cas humains pendant la période correspondante.

Ce travail a révélé qu'environ un tiers des cas pourraient être liés à la viande de poulet et la majorité au poulet suédois élevé de manière conventionnelle.

Selon Folkhalsomyndigheten, des preuves à ce jour suggèrent que l'augmentation des cas d’infection et la fréquence plus élevée dans les troupeaux de poulets de chair sont également liées à cette occasion.

Dans le cadre de l'enquête, Folkhalsomyndigheten et l'Institut national vétérinaire analyseront des échantillons de Campylobacter provenant de patients et de troupeaux de poulets de chair.

Au total, 8 132 cas de campylobactériose ont été rapports en 2018, contre 10 608 en 2017. La plupart sont considérés comme sporadiques, mais au cours des dernières années, plusieurs éclosions importantes liées au poulet produit dans le pays se sont produites. En 2016 et 2017, le pays a connu une importante épidémie causée par le poulet suédois avec environ 5 000 cas de plus signalés entre août 2016 et mai 2017 que la normale.

Les personnes infectées ont généralement une diarrhée souvent sanglante, de la fièvre et des crampes d'estomac. Des nausées et des vomissements peuvent survenir. Les symptômes commencent généralement deux à cinq jours après l'ingestion de Campylobacter et durent environ une semaine.

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Approche pratique d'un plan de maîtrise de Listeria monocytogenes dans l'environnement de fabrication

Voici un article en accès libre paru dans Comprehensive Reviews in Food Science and Food Safety et intitulé, Listeria monocytogenes environmental sampling program in ready‐to‐eat processing facilities: A practical approach (Programme de prélèvements de Listeria monocytogenes dans l’environnement des ateliers de transformation d’aliments prêts à consommer: une approche pratique).

Résumé

Listeria monocytogenes est un pathogène d'origine alimentaire que l'on retrouve fréquemment dans l'environnement. Il peut facilement pénétrer dans les environnements de transformation des aliments et contaminer les aliments, causant potentiellement des problèmes de santé publique.

Les opérateurs alimentaire (OAs) sont responsables de la maîtrise de L. monocytogenes dans l'environnement de transformation des aliments, en particulier dans les installations produisant des aliments prêts à consommer.

La conception et la mise en œuvre d'un programme efficace de surveillance environnementale (PSE) pour L. monocytogenes fait partie intégrante de la lutte contre L. monocytogenes. Un PSE efficace, incluant tous les aspects de l'échantillonnage, à l'analyse, à l'interprétation des données, à la mise en œuvre de mesures correctives (y compris l'élimination des aliments), est un outil qui aidera à l'identification et à la maîtrise de la contamination par L. monocytogenes. Il doit être utilisé en conjonction avec les analyses du produit fini, et non comme un remplacement. Un PSE doit être spécifiquement conçu pour une installation particulière selon une approche fondée sur les risques au cas par cas, par une équipe de sécurité des aliments au sein de l'entreprise. Il doit être revu régulièrement (au moins tous les 6 mois) et vérifié pour son efficacité. La maîtrise de L. monocytogenes dans l'industrie alimentaire implique l'engagement total de la direction et de tout le personnel impliqué dans la sécurité des aliments mis sur le marché, réduisant ainsi le risque de listériose pour les consommateurs. Plusieurs documents réglementaires et d'orientation fournissent des recommandations pour la conception des aspects d'un PSE efficace pour L. monocytogenes. Cependant, un examen complet des éléments clés d'un PSE dans un seul document fait défaut. L'objectif de la présente revue est de fournir aux OAs un guide pratique pour la conception, la mise en œuvre et la vérification d'un PSE adapté par l'équipe de sécurité des aliments pour chaque entreprise alimentaire.

Conclusion

Listeria monocytogenes est omniprésent dans l'environnement et si des mesures de maîtrise ne sont pas en place, il pénètre dans l'environnement de transformation des aliments et peut par la suite contaminer les aliments en cours de transformation, provoquant potentiellement des éclosions de listériose. Dans l'environnement de la transformation des aliments, des mesures de contrôle sont également nécessaires, en particulier dans le secteur des aliments à haut risque, les aliments prêts à consommer. Les Bonnes Pratiques d’Hygiène, les Bonnes Pratiques de Fabrication, emaîtrise, mais afin de vérifier que les mesures de maîtrise soient efficientes et efficaces, un PSE robuste, conçu sur une approche basée sur les risques spécifiquement pour chaque installation, est nécessaire. Il existe de nombreuses lignes directrices publiées par différents groupes et autorités, mais la plupart se concentrent sur un seul aspect d'un PSE, la conception ou l'échantillonnage ou la mise en œuvre d'actions correctives.

Dans toutes les installations de transformation des aliments, la fonction de l'équipe de sécurité des aliments doit inclure la conception et la mise en œuvre d'un PSE, le suivi des résultats du PSE, la mise en place de plans d'action corrective et la mise en œuvre des plans d'action corrective, si nécessaire.

L'objectif du PSE n'est pas d'évaluer l'acceptation du produit, mais plutôt de détecter, en temps opportun, une contamination microbiologique inacceptable dans l'environnement de transformation des aliments, afin que des mesures correctives puissent être prises. Des résultats négatifs peuvent être obtenus par un programme d'échantillonnage inapproprié incapable de détecter la contamination, ce qui conduit à un faux sentiment de sécurité sanitaire.

À l'inverse, un résultat positif ne doit pas être interprété comme un échec, mais comme une identification réussie des gîtes de contamination. Une mise en œuvre correcte du PSE facilite la cartographie de la contamination au sein de l'installation de transformation, en particulier, la détermination de la présence de Listeria ou de la présence de contamination persistante, en traçant l'origine et les voies de contamination dans l'environnement de transformation des aliments.

À son tour, la détermination de la conception hygiénique et du flux de trafic dans toute l'usine peut être évaluée. Elle permet également de vérifier l'efficacité des procédures de nettoyage et de désinfection et de déterminer leur fréquence requise.

Le présent guide pratique vise principalement à aider les entreprises alimentaires dans la conception et le développement d'un PSE Listeria dans les installations de transformation d’aliments prêts à consommer. Cependant, comme les réglementations dans tous les pays ne sont pas les mêmes, les OAs doivent être au courant des réglementations de leur propre pays.

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Le steak barbare ou la viande artificielle nous menace-t-elle ?

«La «viande» artificielle est une très mauvaise nouvelle», est le titre d'une tribune de Gilles Luneau dans Le Figaro du 21 août 2020.

L’essayiste Gilles Luneau critique la production de «viande» de synthèse. Selon lui, cette prouesse technique ne répond pas à l’urgence écologique et va distendre encore davantage le lien entre l’homme et la nature.

Il vient de publier Steak Barbare (Éditions de L’Aube, 2020). 

Cliquez sur l'image pour l'agrandir

Résumé

Ce livre est la première enquête indépendante et approfondie sur l’agriculture dite « cellulaire ». Ce terme tient de la novlangue en ce qu’il annonce comme relevant de l’agriculture la production d’aliments – plus particulièrement des produits animaux – à partir de cellules souches cultivées en laboratoire ou de substituts végétaux assemblés avec des protéines de synthèse.

Viandes, œufs, laitages, poissons, fruits de mer, gélatines, cuirs, soies… sont (ou seront bientôt) fabriqués industriellement… sans passer par la ferme ! L’enquête, menée aux États-Unis et en Europe, s’attache aux start-up de cette nourriture artificielle, aux financeurs, aux fondations qui les portent et aux mouvements que ces fondations - soutiennent, notamment le mouvement végan. On ne met pas trois cent vingt-cinq mille dollars dans un « steak » sans idées derrière la tête… 

Ce livre-document lève le voile sur ces pratiques et l’idéologie qui les anime. Il alerte sur la rupture de civilisation qui est à l’œuvre. Il était temps !

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A propos du diagnostic des STEC en Suisse

Cet article paru dans Eurosurveillance a pour titre, « Les modifications apportées au diagnostic des STEC induisent-elles une interprétation erronée des données de surveillance des maladies en Suisse? Tendances temporelles de la positivité, 2007 à 2016. »

Contexte

Les cas confirmés en laboratoire de Escherichia coli producteurs de shigatoxines (STEC) sont à déclarer au Système national de notification des maladies infectieuses en Suisse depuis 1999. Depuis 2015, une forte augmentation du nombre de cas a été observée. À peu près au même moment, la PCR multiplexe syndromique a commencé à remplacer d'autres méthodes de diagnostic dans la pratique de laboratoire standard pour les analyses de pathogènes gastro-intestinaux, ce qui suggère que l'augmentation des cas notifiés est due à un changement dans les pratiques et les nombres de tests.

Objectif

Cette étude a examiné l'impact des changements dans les méthodes de diagnostic, en particulier l'introduction de panels de PCR multiplexe, sur les données de surveillance de routine des STEC en Suisse.

Méthodes

Nous avons analysé les données de laboratoire de routine de 11 laboratoires, qui ont rapporté 61,9% de tous les cas de STEC de 2007 à 2016 pour calculer la positivité, c'est-à-dire le taux du nombre de tests STEC positifs divisé par le nombre total de tests effectués.

Résultats

L'introduction de la PCR multiplexe a eu un fort impact sur la fréquence des tests STEC et les cas identifiés, le nombre de tests effectués ayant été multiplié par sept entre 2007 et 2016. Pourtant, la positivité normalisée selon l'âge et le sexe est passée de 0,8% en 2007 à 1,7% en 2016.

Conclusion

Une positivité croissante suggère que l'augmentation des notifications de cas ne peut être attribuée à une seule augmentation du nombre de tests. Par conséquent, nous ne pouvons pas exclure une réelle tendance épidémiologique de l'augmentation observée. Moderniser le système de notification pour combler les lacunes actuelles en matière de disponibilité des informations, par exemple, des méthodes de diagnostic et une meilleure triangulation de la présentation clinique, des informations sur le diagnostic et le sérotype sont nécessaires pour faire face aux maladies émergentes et aux progrès technologiques.

Référence

Fischer Fabienne Beatrice, Saucy Apolline, Schmutz Claudia, Mäusezahl Daniel. Do changes in STEC diagnostics mislead interpretation of disease surveillance data in Switzerland? Time trends in positivity, 2007 to 2016. Euro Surveill. 2020;25(33):pii=1900584. 

https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.33.1900584

A noter la publication de cet article, Augmentation inattendue du nombre de déclarations d’infections à E. coli entéro-hémorragique ces derniers mois en Suisse : influence des nouvelles méthodes de PCR multiplexe employées pour le diagnostic primaire? (données : état au 5 novembre 2015). Bulletin de l’OFSP.

On peut y lire,

Toutefois, ces nouvelles techniques comportent également un inconvénient de taille qu’il importe de signaler ici. L’enquête épidémiologique relative à un foyer de toxi-infections repose sur l’isolation des agents pathogènes. Etant donné que les méthodes de PCR multiplexe n’ont pas besoin des cultures, le risque serait de ne plus pratiquer ces dernières et, ainsi, de ne plus confirmer le lien épidémiologique entre les cas et les denrées alimentaires. Par conséquent, si ces méthodes faisaient reculer les cultures, ne serait ce qu’en partie, l’exploration des flambées serait très limitée, voire impossible. Comme cette évolution doit absolument être évitée, il est important, surtout quand on suspecte l’existence d’une flambée, d’envoyer des échantillons au Centre national de référence (NENT) en vue de l’isolation des germes.

Mise à jour du 27 août 2020. On lira:

• E. coli productrices de shigatoxines (STEC) dans les denrées alimentaires : évaluation des risques microbiologiques, document d’aide à la décision pour l’évaluation de la présence de STEC dans les denrées alimentaires 18 juin 2020.
• Escherichia coli entérohémorragiques (EHEC). Maladies infectieuses à déclaration obligatoire Suisse et Principauté du Liechtenstein. État semaine 34/2020 (25.08.2020). La date de réception de la déclaration est déterminante pour l'axe temporel. Incidence mensuelle pour 100 000 habitants.

Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous