Première épidémie à Escherichia coli entéroinvasifs au Danemark liée à des oignons nouveaux d'Egypte

Le blog vous en avait parlé le 29 décembre 2021 dans Des oignons nouveaux d'Egypte à l'origine d'une épidémie à E. coli au Danemark.

Il n’y a donc que les Etats-Unis qui ont des soucis de sécurité sanitaire des aliments avec des oignons, le Danemark et l’UE aussi …

Voici donc  «Imported spring onions related to the first recorded outbreak of enteroinvasive Escherichia coli in Denmark, November to December 2021» (Oignons nouveaux importés liés à la première épidémie enregistrée à Escherichia coli entéroinvasifs (ECEI) au Danemark, de novembre à décembre 2021). Source Eurosurveillance.

Les souches de ECEI ont des caractères biochimiques, génétiques et pathogéniques très proches des espèces du genre Shigella.

Message clé de santé publique

Que vouliez-vous aborder dans cette étude ?

Nous voulions contrôler une importante épidémie nationale au Danemark causée par Escherichia coli entéroinvasif (ECEI), un pathogène bactérien d'origine alimentaire provoquant des maladies diarrhéiques.

Pour connaître l'étendue de l'épidémie, nous avons d'abord voulu identifier les cas liés à l’épidémie, c'est-à-dire les individus partageant la souche ECEI particulière impliquée dans l'épidémie. Cela permettait d'interroger les cas pour découvrir comment ils ont été infectés, ce qui pourrait nous aider à découvrir l’origine de l'épidémie afin de l’arrêter.

Qu'avons-nous appris de cette étude ?

Sur la base des méthodes de diagnostic par PCR, 88 personnes étaient des cas potentiels de l’épidémie. Comme les PCR utilisées ne distinguaient pas ECEI de Shigella, un autre agent pathogène donnant des symptômes similaires, confirmant les cas possibles car les cas liés à l’épidémie nécessitaient une culture bactérienne, puis un typage O ou un séquençage du génome.

Trente-quatre cas ont été confirmés. Pour cela, le typage O était plus rapide que le séquençage du génome. Des entretiens et des investigation de traçabilité ont révélé que les oignons nouveaux importés d’Egypte dans des salades prêtes à l'emploi étaient la source de l'épidémie.

Quelles sont les implications de vos découvertes pour la santé publique ?

Les méthodes de typage rapide sont importantes pour confirmer les cas pendant une épidémie. Lors d'une épidémie d'origine alimentaire, la surveillance doit être rapidement adaptée, et ici une collaboration étroite entre les laboratoires de microbiologie clinique, l'institut de santé publique et l'administration vétérinaire et alimentaire a été très précieuse. L'épidémie souligne que des règles d'hygiène élevées pour les légumes frais importés doivent être maintenues lorsqu'elles doivent être utilisées dans des produits prêts à consommer.

Conclusion

L'étude actuelle met l'accent sur la pertinence de la rapidité dans la détection des épidémies de Shigella et/ou ECEI, la notification des cas et le typage des isolats disponibles. Cela augmente la possibilité d'élucider la cause par des entretiens avec les cas. Cet article souligne également l'importance d'une bonne collaboration au niveau des pays entre les différentes instances de surveillance, en l'occurrence les laboratoires de microbiologie clinique, le Statens Serum Institut et la Danish Veterinary and Food Administration. La communication des procédures de diagnostic et des signaux identifiés localement au niveau national et international est également importante.

Complément

Le Statens Serum Institut (SSI) fait le point au 9 mai 2022 sur l’épidémie à Escherichia coli entéro-invasif au Danemark, point 2.

Du 23 novembre au 4 février 2022, 88 personnes ont été infectées par Escherichia coli entéroinvasif (ECEI) ont été enregistrées au Statens Serum Institut. L'enquête a montré que la source d'infection était des oignons nouveaux découpés d’Egypte dans une salade de chou prête à consommer.

Une notification au RASFF de l’UE a eu lieu le 25 décembre 2022 dans le but d’informer les Etats membres de l’UE. On y a appris que les oignons nouveaux venaient d’Egypte via les Pays-Bas.

Référence

Torpdahl Mia, White Emily Dibba, Schjørring Susanne, Søby Malene, Engberg Jørgen, Engsbro Anne Line, Holt Hanne M, Lemming Lars, Lützen Lisbeth, Olesen Bente, Coia John E, Kjelsø Charlotte, Müller Luise. Imported spring onions related to the first recorded outbreak of enteroinvasive Escherichia coli in Denmark, November to December 2021. Euro Surveill. 2023;28(15):pii=2200572. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2023.28.15.2200572

Commentaire

Je veux bien que l’on ait «des règles d'hygiène élevées pour les légumes frais importés doivent être maintenues lorsqu'elles doivent être utilisées dans des produits prêts à consommer.», mais aller chercher des oignons nouveaux si loin, alors qu’il y a ce qu'il faut au sein de l'UE ... ça m'échappe, l'UE n'est-elle pas ce grand marché mondial ?

Mise à jour du 22 avril 2023

On lira aussi l'étude récente paru dans Journal of Food Protection, Royaume-Uni : Epidémie d'origine alimentaire Shigella sonnei producteurs de bêta-lactamase à spectre étendu associée à des oignons nouveaux contaminés.

Mise à jour du 1er mai 2023

On lira l'article de Joe Whitworth dans Food Safety News, UK Shigella outbreak linked to spring onions from Egypt (Royaume-Uni : Epidémie à Shigella liée à des oignons nouveaux d'Egypte).

Même origine des produits, même conséquence ...