Une analyse de l'OCDE présente les avantages et les inconvénients des audits à distance

«Une analyse de l'OCDE présente les avantages et les inconvénients des audits à distance», source article de Joe Whitworth paru le 14juillet 2023 dans Food Safety News.

Selon un rapport de l'Organisation de coopération et de développement économiques (OCDE) de 71 pages, «Costs, benefits and effectiveness of remote audits for international food safety», les audits à distance ont leur place pour garantir la sécurité sanitaire des aliments, mais ne doivent pas remplacer les visites sur site.

Sur la base d'études de cas et d'une enquête de l'OCDE, le rapport examine le coût, les avantages et l'efficacité des audits à distance. Pour les études de cas, les entretiens ont eu lieu entre mai et novembre 2022 avec les autorités de 10 pays et cinq autres parties prenantes, dont Critereon, Tesco et Red Tractor. L'enquête a reçu 163 réponses entre la mi-octobre et le début décembre 2022.

L'analyse révèle que les principaux avantages sont la réduction des frais de déplacement, la réduction des empreintes d'émissions, l'utilisation flexible du temps et les possibilités de former et d'impliquer davantage de personnel.

Les inconvénients comprennent les limites de collecte des preuves d'audit, le fardeau supplémentaire du temps de préparation, les problèmes de connectivité Internet et le manque d'engagement personnel. Dans un cas, une surface de peinture inégale a été perçue à tort comme de la condensation au plafond. Le représentant sur place devait démontrer que la surface scellée était sèche et montrer sa nature inégale.

Différents points de vue

Avant le COVID-19, l'audit à distance n'était utilisé que pour les cas spécialisés à petite échelle. La pandémie a connu une augmentation significative, bien que l'utilisation ait varié selon les pays et les secteurs. Il est relativement facile pour les pays importateurs de demander un audit à distance, même à court terme, mais pour les audités, chaque réponse peut impliquer un travail considérable.

Une gamme de technologies a été utilisée dans les audits à distance, mais le plein potentiel n'a pas été réalisé. Dans quelques cas, en particulier dans le secteur privé, des outils tels que des technologies portables et des plates-formes exclusives ont été utilisés.

Les coûts, les avantages, l'efficacité et les opinions perçus sur l'utilisation continue des audits à distance variaient selon le rôle du répondant dans le système de sécurité sanitaire des aliments, qu'il s'agisse d'une autorité, d'une entreprise alimentaire, d'un auditeur ou d'un audité, d'un exportateur ou d'un importateur, d'une petite ou d'une grande entreprise, d'une entreprise développée ou en développement économique.

Le rapport a révélé que les pays émergents et en développement sont susceptibles d'être moins en mesure d'utiliser l'audit à distance en raison des lacunes de l'infrastructure numérique, de l'accès et des capacités. Cela risque d'exclure ces pays des marchés d'exportation, ou du moins de créer un désavantage concurrentiel.

La plupart des parties prenantes ont trouvé que les audits entièrement à distance étaient moins efficaces que les visites sur site, mais les audits partiellement à distance, également appelés hybrides ou mixtes, étaient les bienvenus. Beaucoup considéraient qu'ils pourraient être un «outil dans la boîte à outils», mais qu'ils devraient être limités par certains critères.

Le rapport a souligné la nécessité d'harmoniser la terminologie et d'élaborer des directives pratiques sur la manière et le moment de mener des audits à distance.

Les audits à distance trouvent leur place

L'expérience d'audit de Critereon a montré qu'il y avait toujours moins de non-conformités dans les audits à distance. Cela semblait peu probable en raison des améliorations de la conformité réelle en matière de sécurité des aliments, d'autant plus que de nombreux établissements souffraient également d'absences du personnel et d'autres perturbations et indiquaient un problème d'audit à distance.

Les audits à distance se sont concentrés sur les domaines présentant des risques relativement élevés en matière de sécurité sanitaire des aliments, notamment le secteur de l'élevage et le secteur du poisson et des fruits de mer, qui représentaient ensemble 75% des audits dans l'enquête.

Plus de 70% des auditeurs considéraient les audits à distance comme moins ou beaucoup moins efficaces que les audits sur site, tandis que plus de la moitié des audités ont déclaré qu'ils étaient aussi efficaces que les contrôles sur site.

Des questions ont été soulevées quant à la fiabilité des éléments probants d'audit à distance, y compris le risque de fausse déclaration ou de fabrication d'éléments probants, ainsi que des éléments probants de mauvaise qualité pouvant entraîner des malentendus ou des omissions.

De nombreux répondants ont déclaré que les audits à distance pourraient être utilisés pour des examens basés sur des documents, mais qu'ils étaient problématiques en remplacement de l'audit physique des établissements.

Les situations dans lesquelles les audits à distance fonctionnent comprennent les cas où le risque de sécurité sanitaire des aliments est faible ; il existe une relation établie; il y a un objectif simple comme traiter une non-conformité particulière ou pour des endroits géographiquement éloignés ou à haut risque. Ils peuvent ne pas être appropriés pour les audits des systèmes réglementaires ou pour les produits présentant des risques élevés en matière de sécurité sanitaire des aliments.

Les résultats de l'enquête ont indiqué que 33% seraient favorables à l'utilisation continue d'audits partiellement à distance et près de la moitié à une utilisation dans des circonstances spécifiques, telles que des situations d'urgence ou des scénarios à faible risque.

Résistance accélérée dans les infections bactériennes à souches multiples, selon une étude

«Résistance accélérée dans les infections bactériennes à souches multiples, selon une étude», source article de Chris Dall paru le 13 juillet 2023 dans CIDRAP News.

Une étude menée par des chercheurs de l'Université d'Oxford fournit de nouvelles informations sur l'évolution de la résistance aux antimicrobiens chez les patients atteints d'infections bactériennes.

L'étude, publiée cette semaine dans Nature Communications, a révélé que chez les patients colonisés par Pseudomonas aeruginosa, la résistance évoluait plus rapidement en réponse au traitement antibiotique chez ceux présentant plusieurs souches de l'agent pathogène, par rapport à ceux présentant une seule souche.

Les auteurs de l'étude disent que les résultats démontrent le lien entre la diversité intra-hôte et la résistance et suggèrent que la mesure de la diversité des populations d'agents pathogènes bactériens pourrait permettre de prédire plus facilement quels patients échoueront le traitement antibiotique.

Les populations avec un mélange de souches développent plus rapidement une résistance

Pour l'étude, les chercheurs ont analysé des isolats de P. aeruginosa provenant de patients inscrits à l'étude ASPIRE-ICU, une étude de cohorte épidémiologique européenne multicentrique visant à identifier l'incidence et les prédicteurs des infections à P. aeruginosa et à Staphylococcus aureus dans les unités de soins intensifs. Pseudomonas est un agent pathogène opportuniste qui peut provoquer des infections graves chez les patients hospitalisés gravement malades et immunodéprimés et développe une résistance aux antibiotiques à un taux très élevé.

Bien que les facteurs de résistance intra-hôte soient mal compris, notent les chercheurs, la théorie prédominante est que les patients sont généralement infectés par une seule souche d'un pathogène bactérien et que la résistance émerge par la sélection naturelle d'isolats qui ont développé ou acquis des mutations de résistance au cours leur infection.

L'objectif de leur analyse était de tester l'hypothèse selon laquelle la résistance aux antimicrobiens chez P. aeruginosa et d'autres agents pathogènes peut évoluer plus rapidement lorsque les patients sont infectés par plusieurs souches, car une plus grande diversité génétique accélère la réponse évolutive au traitement antibiotique.

Pour caractériser la diversité de P. aeruginosa chez les patients, les chercheurs ont séquencé les génomes de 441 isolats provenant d'échantillons des voies respiratoires inférieures de 35 patients en soins intensifs dans 12 hôpitaux. Ils ont ensuite mesuré la résistance des isolats à un panel de six antibiotiques (ciprofloxacine, méropénème, gentamicine, aztréonam, ceftazidime et pipéracilline-tazobactam) et calculé l'évolution de la proportion d'isolats résistants à chaque antibiotique au fil du temps pour chaque combinaison de patient et antibiotique.

Près des deux tiers des patients (23 sur 35) ont été colonisés par une seule souche de P. aeruginosa, mais les autres ont été colonisés par plusieurs souches. L'analyse de la réponse aux antibiotiques a montré que si la résistance se développait chez les patients colonisés par des souches uniques en réponse à un traitement antibiotique, les augmentations de résistance au fil du temps étaient 20% plus importantes chez les patients colonisés par plusieurs souches.

Une enquête plus approfondie sur les populations avec un mélange de souches chez cinq patients a révélé que les isolats associés à des souches multirésistantes (MDR pour multidrug-resistant) de P. aeruginosa ont remplacé à plusieurs reprises les isolats associés à des souches non-MDR chez quatre de ces patients en réponse à un traitement antibiotique. De plus, chez trois des cinq patients colonisés par plusieurs souches de P. aeruginosa, les souches MDR ont été détectées avant le traitement antibiotique. Lorsqu'elles étaient exposées à des antibiotiques, ces souches MDR préexistantes avaient un avantage concurrentiel sur les souches non-MDR.

Sur la base de ces résultats, les auteurs de l'étude estiment que plus de 90% de l'augmentation de la résistance aux antimicrobiens chez les patients présentant des populations avec un mélange de souches est due à la sélection de souches résistantes préexistantes.

«Ce résultat très clair suggère que la diversité des agents pathogènes est associée à l'émergence rapide de la résistance, car diverses populations d'agents pathogènes sont plus susceptibles de contenir des souches résistantes préexistantes, et non parce que la diversité en soi accélère l'émergence de la résistance au sein des souches», ont-ils écrit.

Il y avait cependant un compromis évolutif associé aux populations avec un mélange de souches. Lorsque les chercheurs ont mesuré le taux de croissance des isolats de tous les patients dans un milieu sans antibiotique, les isolats MDR se sont développés plus lentement et ce compromis était plus fort dans les populations avec un mélange de souches.

Prévention des infections, meilleur diagnostic

L'auteur principal de l'étude dit que les résultats soulignent l'importance des mesures de prévention et de contrôle des infections qui réduisent le risque de colonisation par des agents pathogènes opportunistes comme P. aeruginosa. Il suggère également que de meilleures méthodes de diagnostic sont nécessaires pour identifier les patients atteints d'infections à plusieurs souches et évaluer leur potentiel de résistance aux antimicrobiens.

«Les méthodes de diagnostic que nous utilisons pour étudier la résistance aux antibiotiques dans les échantillons de patients ont changé très lentement au fil du temps, et nos résultats soulignent l'importance de développer de nouvelles méthodes de diagnostic qui faciliteront l'évaluation de la diversité des populations d'agents pathogènes dans les prélèvements de patients», a dit Craig. Maclean, professeur d'évolution et de microbiologie à Oxford, dans un communiqué de presse de l’université.

NB : L'image est du CDC/Jennifer Oosthuizen

Vision mondiale des déterminants des résistances aux antibiotiques

«Vision mondiale des déterminants des résistances aux antibiotiques», source communiqué de l’Institut Pasteur du 11 juillet 2023.

Résumé

Pour comprendre les principaux déterminants de la dynamique mondiale de la résistance aux antibiotiques, des scientifiques de l’Institut Pasteur, de l’Inserm et des universités de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines et de Paris-Saclay ont développé un modèle statistique grâce à une analyse spatio-temporelle de grande ampleur. En utilisant la base de données de suivi de l’antibiorésistance ATLAS, ce modèle a mis en évidence des différences importantes de tendances et de facteurs associés en fonction des espèces de bactéries et des résistances à certains antibiotiques. Par exemple, la bonne qualité du système de santé d’un pays est associée à de faibles niveaux d’antibiorésistance chez toutes les bactéries à Gram négatif* étudiées ; des températures élevées sont à l’inverse associées à des forts niveaux d’antibiorésistance chez les Entérobactéries. De façon inattendue, la consommation d’antibiotique nationale n’est pas corrélée à la résistance chez la majorité des bactéries testées. Ces résultats suggèrent que les mesures de contrôle de l’antibiorésistance doivent s’adapter au contexte local et aux combinaisons bactéries-antibiotiques ciblées. Les résultats de cette étude ont été publiés dans la revue The Lancet Planetary Health le 10 juillet 2023.

La résistance aux antibiotiques ou l’antibiorésistance constitue aujourd’hui l’une des plus graves menaces pesant sur la santé mondiale. Ce phénomène est naturel mais le mauvais usage des antibiotiques y contribue en sélectionnant les résistances et complexifie la lutte contre les infections bactériennes. Une surveillance mondiale de l’antibiorésistance est en place, notamment sous l’égide de l’OMS, et de nombreuses bases de données ont été créées pour répertorier chaque apparition d’antibiorésistance dans le monde, et pouvoir à terme bien comprendre ce phénomène pour mieux lutter contre. Il n’existe pas une résistance aux antibiotiques mais plusieurs, très dépendantes des espèces bactériennes. Une étude récente a estimé qu’en 2019, 1,27 millions de décès dans le monde résultaient de la résistance aux antibiotiques et 4,95 millions y étaient associés.

Pour définir les principaux facteurs associés à la dynamique de l’antibiorésistance au niveau mondial, une équipe de recherche pluridisciplinaire à l’Institut Pasteur a développé un modèle statistique et analysé les données d’antibiorésistance de la base ATLAS, données collectées  depuis 2004 dans plus de 60 pays sur les cinq continents. Les scientifiques ont analysé les données en testant un grand nombre de déterminants afin de faire émerger les principaux facteurs de l’antibiorésistance et de comprendre leur association avec les dynamiques observées au niveau mondial. «Des équipes de recherche étudient comment l’antibiorésistance émerge au sein d’une bactérie dans une boite de Petri ou encore chez un individu… mais il manque aujourd’hui cette vue d’ensemble au niveau populationnel et mondial afin de pouvoir étudier les liens, en fonction des espèces de bactéries pathogènes, entre la résistance et certains facteurs comme la qualité d’un système de santé national. Pour comprendre la dynamique de l’antibiorésistance, il est nécessaire d’étudier toutes les échelles. C’est ce que cette étude propose», explique Eve Rahbe, chercheuse doctorante au sein de l’unité Epidémiologie et modélisation de la résistance aux antimicrobiens à l’Institut Pasteur et première auteure de l’étude.

L’étude a consisté dans un premier temps à sélectionner des facteurs pertinents pouvant influer sur les dynamiques d’antibiorésistance. «Si certains facteurs biologiques sont connus, il était important pour nous d’évaluer également des hypothèses associées à des facteurs socio-économiques et climatiques», continue la chercheuse. Au total, 11 facteurs ont été retenus, notamment la qualité du système de soins (indice GHS), la consommation d’antibiotiques et la richesse du pays (indice PIB), ainsi que des données sur les voyages et des variables climatiques. Puis, des modèles statistiques ont été élaborés pour étudier les associations potentielles entre les données ATLAS et les facteurs retenus.

L’analyse des données au niveau mondial sur la période 2006-2019 a d’abord mis en évidence une augmentation de la résistance aux carbapénèmes chez plusieurs espèces, alors que les tendances restent stables mondialement pour les autres résistances. De plus, cette étude a démontré que les dynamiques et les facteurs associés à l’antibiorésistance sont dépendants des combinaisons bactéries-antibiotiques. Cependant, de façon surprenante, la consommation nationale d’antibiotiques n’est pas associée significativement à la résistance chez la majorité des bactéries testées (sauf pour la consommation de quinolones pour les Escherichia coli et Pseudomonas aeruginosa résistantes aux quinolones ou encore la consommation de carbapénèmes chez Acinetobacter baumannii résistantes aux carbapénèmes).

A contrario la bonne qualité du système de santé d’un pays est associée à de faibles niveaux d’antibiorésistance chez toutes les bactéries à Gram négatif* testées. Les températures élevées sont, elles, associées à des forts niveaux d’antibiorésistance mais chez les Entérobactéries uniquement (Escherichia coli et Klebsiella pneumoniae).

« Cette étude met en évidence la diversité des déterminants conduisant à l’antibiorésistance de différentes bactéries pathogènes au niveau mondial, et la nécessité d’adapter les approches de contrôle de la résistance au contexte local (pays, contexte de transmission) et à la combinaison bactérie-antibiotique en question», conclut Philippe Glaser, responsable de l'unité Écologie et évolution de la résistance aux antibiotiques à l'Institut Pasteur et co-principal auteur de l’étude.

«Notre modèle statistique pourra être appliqué à d’autres bases de données, comme celle de l’OMS notamment. Une meilleure connaissance des déterminants de résistance, différents entre les pays, et probablement entre des régions d’un même pays, est essentielle et permettra d’adapter les actions de santé publique», conclut Lulla Opatowski, Professeur à l’université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines et chercheuse au sein de l’unité d’Epidémiologie et modélisation de la résistance aux antimicrobiens, co-principale auteure de l’étude.

*Les bactéries à Gram négatif sont des bactéries à deux membranes qui posent plus de problème de résistance aux antibiotiques, du fait de la perméabilité réduite de la membrane externe.

NB : L'image est du CDC.

Mise à jour du 25 juillet 2023

On lira l'artcile paru dans Le Figaro du 25 juillet 2023, «Les causes des résistances aux antibiotiques dans le monde mieux connues», par Vincent Bordenave.

La consommation globale d’antibiotiques n’est pas la cause première de résistance chez la majorité des bactéries testées. 

Deux probiotiques améliorent le lupus érythémateux disséminé, peut-être en régulant les réponses immunitaires et en remodelant le microbiote intestinal

Akkermansia muciniphila et Lactobacillus plantarum améliorent le lupus érythémateux disséminé, peut-être en régulant les réponses immunitaires et en remodelant le microbiote intestinal. En savoir plus dans une étude parue dans mSphere, «Akkermansia muciniphila and Lactobacillus plantarum ameliorate systemic lupus erythematosus by possibly regulating immune response and remodeling gut microbiota».

Résumé

Le lupus érythémateux disséminé (LES), caractérisé par une inflammation persistante, est une maladie auto-immune complexe qui affecte tous les organes et qui rend difficile le traitement clinique. La dysbiose du microbiote intestinal favorise les maladies auto-immunes qui endommagent les organes extra-intestinaux. La modulation du microbiome intestinal est proposée comme une approche prometteuse pour les parties fines du système immunitaire, soulageant l'inflammation systématique dans de multiples maladies. Cette étude a démontré que l'administration de Akkermansia muciniphila et de Lactobacillus plantarum contribuait à un environnement anti-inflammatoire en diminuant l'interleukine (IL)-6 et l'IL-17 et en augmentant les niveaux d'IL-10 dans la circulation. Le traitement par  A. muciniphila et L. plantarum a restauré l'intégrité de la barrière intestinale d’une façon différente. De plus, les deux souches ont réduit le dépôt d'IgG dans le rein et amélioré la fonction rénale de manière significative. D'autres études ont révélé des rôles de remodelage distincts de l'administration de A. muciniphila et de L. plantarum sur le microbiome intestinal. Ce travail a démontré les mécanismes essentiels de la façon dont A. muciniphila et L. plantarum remodèlent le microbiote intestinal et régulent les réponses immunitaires dans un modèle chez la souris atteinte de LES.

Importance

Plusieurs recherches ont démontré que certaines souches probiotiques contribuent à réguler l'inflammation excessive et à restaurer les tolérances dans le modèle animal du LES. D'autres essais sur des animaux combinés à des études cliniques sont nécessaires de toute urgence pour élucider davantage les mécanismes de l'effet de bactéries probiotiques spécifiques dans la prévention des symptômes du LES et le développement de nouvelles cibles thérapeutiques. Dans cette étude, nous avons exploré le rôle de A. muciniphila et L. plantarum dans l'amélioration de l'activité de la maladie du LES. Le traitement par A. muciniphila et L. plantarum a soulagé l'inflammation systémique et amélioré la fonction rénale dans le modèle murin de LES. Nous avons démontré que A. muciniphila et L. plantarum contribuaient à un environnement anti-inflammatoire en régulant les niveaux de cytokines dans la circulation, en restaurant l'intégrité de la barrière intestinale et en remodelant le microbiome intestinal, mais dans une mesure différente.

Qualité des huiles d'olive, le temps passe, rien ne change pour le consommateur !

Selon une étude de Que Choisir publiée le 26/06/2023 sur les huiles d’olive, plus de la moitié sont non conformes ! 

Sur les 14 huiles d’olive officiellement «vierges extra» que nous avons analysées, 8 ne répondaient pas aux exigences de cette appellation, et auraient dû être vendues comme «vierges» uniquement. Une pratique bien trop fréquente. 

Toujours aucune amélioration en vue au rayon des huiles d’olive. Alors que les alertes se sont multipliées, ces dernières années, concernant les fausses promesses des références vierges extra, notre nouveau test d’huiles d’olive confirme que le problème perdure. Le terme « extra » engage en effet ‒ en théorie ‒ à l’absence de défaut gustatif (le moindre petit goût de rance ou de fermenté, par exemple, est exclu) et physicochimique (aucune trace d’oxydation de l’huile n’est permise), durant toute la période de commercialisation du produit. Or, 8 des 14 références que nous avons analysées cette année présentaient ce type de défauts. Soit un taux de déclassement équivalent à celui constaté lors de notre précédent test, en 2021, et plus élevé encore que celui retrouvé en 2019 (à l’époque, 20 % des huiles testées s’étaient avérées non extra).

Le blog vous avait proposé un article en août 2021, 48% des huiles d’olive prélevées sont non conformes, selon des contrôles de 2020 de la DGCCRF, as usual.

Les principaux résultats d’une enquête de 2020 de la DGCCRF, sobrement intitulée, «Des fraudes récurrentes relevées sur les huiles d’olive».

Les services de la DGCCRF ont également effectué 97 prélèvements (122 en 2019 et 126 en 2018 -aa) pour vérifier les allégations concernant la qualité des produits. 48% des huiles d’olive prélevées ont été déclarés non conformes au terme des analyses effectuées, en raison de caractéristiques organoleptiques (caractéristiques, qualités ou propriétés perçues par les sens lors de la dégustation, comme la couleur, l'odeur ou le goût) insuffisantes car ne répondant pas aux critères de leurs catégories tels que définis par la réglementation. Ces anomalies étaient parfois associées à des problématiques d’étiquetage. Des mesures de police administratives ont été prononcées pour permettre le déclassement d’huiles d’olives impropres à la consommation et leur réemploi dans l’industrie non alimentaire.

Il n’y a pas que l’association Que Choisir qui fait des tests sur l’huile d’olive, le blog a publié le 26 mai 2023 un article, Huiles d'olive sous le prisme de la revue 60 millions de consommateurs. Rien de bien neuf, hélas !

S’agissant des huiles d'olive appellation «vierge extra»: la moitié d'un panel de 24 échantillons, déclassée en «vierge».

A l’évidence, tous ces résultats vont dans le même sens, le temps passe rien ne change et personne n'a la réponse ...

Etats-Unis : Le nombre de patients dans l'épidémie au parasite Cyclospora a augmenté pour atteindre 581 personnes

A la suite de cet article récent sur le sujet publié sur le blog, voici que «Le nombre de patients dans l'épidémie au parasite Cyclospora a augmenté pour atteindre 581 personnes», source article de Coral Beach paru le 15 juillet 2023 dans Food Safety News.

Le nombre de patients dans une grande épidémie d'infections par le parasite Cyclospora a considérablement augmenté, le nombre approchant les 600 personnes.

Le Centers for Disease Control and Prevention suit l'épidémie depuis le 1er avril. Depuis cette semaine, il y a 581 patients confirmés en laboratoire. La précédente mise à jour de l'agence du 22 juin comptait 317 patients répertoriés.

«Aucun aliment spécifique n'a été identifié commesource de la plupart de ces maladies. Les responsables de la santé publique des États et locaux interrogent les personnes atteintes de cyclosporose pour savoir quels aliments ils ont mangés avant de tomber malade», selon la mise à jour de l'épidémie du CDC.

Le CDC a enregistré des patients de 32 juridictions, dont 31 États et la ville de New York.

Les personnes malades sont âgées de 3 à 96 ans, avec un âge médian de 49 ans et 61% de femmes. Les dates d'apparition de la maladie vont du 1er avril au 2 juillet.

Il y a probablement plus de patients en raison du temps qu'il faut pour que l'infection se développe et du temps requis pour les tests, les tests de confirmation et les rapports. Des analyses spécifiques sont nécessaires pour déterminer les cas d’infection, qui peuvent imiter d'autres maladies. Les symptômes peuvent s'atténuer puis réapparaître.

Le CDC, la FDA et des partenaires étatiques et locaux ont enquêté sur une épidémie de cas de cyclosporose en Géorgie et en Alabama liée au brocoli cru importé qui comprenait 20 cas de maladie. Des personnes ont dit avoir mangé du brocoli dans les 14 jours précédant leur maladie. La FDA et les partenaires étatiques et locaux ont mené des enquêtes de traçabilité et ont déterminé que le brocoli avait été importé. Cependant, les investigateurs de la FDA n'ont pas été en mesure de confirmer le type ou le producteur spécifique du brocoli importé comme source de l'épidémie. Cette éclosion semble être terminée et rien n'indique à l'heure actuelle que le brocoli continue d'être une source de maladie pour d'autres cas de cyclosporose signalés aux États-Unis.

Sur 569 personnes pour lesquelles des informations sont disponibles, 55 ont été hospitalisées. Aucun décès n'a été signalé.

Le nombre total de cas confirmés en laboratoire signalés depuis le 1er avril comprend 20 cas en Géorgie et en Alabama liés à une éclosion associée à du brocoli cru importé.

«Plusieurs éclosions de cyclosporose causées par différents aliments peuvent être signalées au cours de la même année. Les précédentes épidémies de cyclosporose aux États-Unis ont été liées à divers types de produits frais, notamment du basilic, de la coriandre, de la laitue mesclun, des framboises et des pois mange-tout», selon le CDC.

Pendant les épidémies, les responsables de la santé publique utilisent des questionnaires pour interroger les personnes malades afin de déterminer ce qu'elles ont mangé au cours de la période de 14 jours avant de tomber malade.

Principaux faits

- Nombre de cas : 581

- Hospitalisations : 55

- Décès : 0

- États signalant des cas : 31

- Statut de l'enquête : Actif (première publication le 25 mai 2023)

Images : les personnes infectées excrètent des oocystes de Cyclospora cayetanensis non sporulés (non infectieux ; immatures) dans leurs selles ; les oocystes immatures ont généralement besoin d'au moins 1 à 2 semaines dans des conditions de laboratoire favorables pour sporuler et devenir infectieux. Un oocyste non sporulé, avec un cytoplasme indifférencié, est montré (extrême gauche), à côté d'un oocyste sporulant qui contient deux sporocystes immatures (A). Un oocyste rompu mécaniquement a libéré l'un de ses deux sporocystes (B). Un sporocyste libre est représenté ainsi que deux sporozoïtes libres, le stade infectieux du parasite (C). Les oocystes (D) sont auto-fluorescents lorsqu'ils sont observés au microscope ultraviolet (E). (Crédit : CDC/DPDx)

Les dangers de manger de la pâte crue

Il s’agit ci-après du dernier communiqué relatif à une éclosion à Salmonella liée à de la pâte crue à biscuits aux Etats-Unis. Le blog profite de ce communiqué pour y adjoindre à la suite d’autres élements sur les dangers de manger de la pâte crue.

Un communiqué de la FDA du 13 juillet rapporte que l’investigation sur une éclosion à Salmonella liée à de la pâte à biscuits crue (mai 2023)

L'investigation de la FDA est terminée. Le CDC déclare l'épidémie terminée.

La FDA et le CDC, en collaboration avec des partenaires étatiques et locaux, ont enquêté sur une épidémie d'infections à Salmonella Enteritidis liées à de la pâte pour Chocolate Chip Cookie et S’mores Bars vendues dans les magasins franchisés de Papa Murphy's et achetées avant le 23 mai 2023.

La FDA a mené une enquête de traçabilité et identifié deux fournisseurs d'intérêt. La FDA et plusieurs partenaires étatiques ont collecté des prélèvements chez les deux fournisseurs, et les partenaires étatiques ont également collecté des prélèvements dans plusieurs magasins Papa Murphy's.

Tous les prélèvements collectés ont été signalés comme négatifs pour la contamination par Salmonella. Le 13 juillet 2023, le CDC a annoncé que l'épidémie était terminée. Le CDC signale un total de 26 cas de personnes malades dans six États. La dernière apparition de la maladie remonte au 22 mai 2023. L'investigation de la FDA est terminée.

En réponse à cette investigation, Papa Murphy's a informé les propriétaires franchisés à l'échelle nationale et a cessé de vendre toute pâte à Chocolate Chip Cookie et S’mores Bars dans tous les magasins et a cessé d'utiliser des mélanges de pâte à biscuits secs non préparés datant d'avril 2023 pour s'assurer que des ingrédients potentiellement contaminés ne soient pas utilisés. Au 13 juillet 2023, Papa Murphy's n'a pas relancé les ventes de pâte à biscuits. De plus, l'entreprise revoit les articles et les étiquettes de son menu de desserts pour améliorer encore les instructions aux consommateurs afin de souligner que leurs produits ne sont pas destinés à être consommés crus.

Nombre de cas

- Nombre total de cas : 26

- Hospitalisations : 4

- Décès : 0

- Début de la dernière maladie : 22 mai 2023

- États avec cas : Cafifornie, Idaho, Montana, Oregon, Washington, Utah.

- Distribution des produits : à l'échelle nationale.

 Selon le CDC,

«Le nombre réel de personnes malades dans cette épidémie était probablement beaucoup plus élevé que le nombre signalé, et l'épidémie n'a peut-être pas été limitée aux États où les maladies sont connues. En effet, de nombreuses personnes se rétablissent sans soins médicaux et ne sont pas testées pour Salmonella.»

Des tests spécifiques sont nécessaires pour diagnostiquer une infection à Salmonella, qui imite d'autres maladies.

Les cas de maladie ont commencé à des dates allant du 24 février au 28 mai, selon le CDC. Le 23 mai, Papa Murphy’s a temporairement cessé de vendre sa pâte crue à biscuits Chocolate Chip Cookie et S’mores Bars en réponse à cette épidémie.

Les enquêteurs de la santé publique ont utilisé le système PulseNet pour identifier les cas de maladie qui faisaient partie de cette éclosion. PulseNet du CDC gère une base de données nationale d'empreintes ADN de bactéries qui causent des maladies d'origine alimentaire. L'empreinte ADN est réalisée sur des bactéries à l'aide d'une méthode appelée séquençage du génome entier (WGS). Le WGS a montré que les bactéries provenant de prélèvements de personnes malades sont étroitement liées génétiquement. Cela suggère que les personnes concernées par cette épidémie sont tombées malades à cause du même aliment.

Les responsables de la santé publique conseillent toujours aux personnes de ne pas manger de pâte ou de pâte crue, car elle contient des ingrédients crus tels que la farine, qui peuvent héberger des bactéries telles que Salmonella et E. coli.

Le CDC propose les conseils suivants pour une utilisation sécuritaire de la pâte crue, de la pâte à frire et de la farine :

- Ne manger jamais de pâte crue censée être cuite au four.
- Se laver toujours les mains et nettoyer et désinfecter soigneusement les surfaces de travail et les ustensiles après tout contact avec de la pâte crue ou de la pâte à frire.
- Conserver les aliments crus ou la pâte à l'écart des autres aliments lors de leur préparation pour éviter toute contamination possible de se propager.

«Les dangers de manger de la pâte crue», source Society of Risk Analysis, décembre 2022.

De nouvelles études montrent que de nombreux consommateurs ne savent peut-être pas que la farine non cuite provoque des maladies d'origine alimentaire

Au cours de la dernière décennie, la farine crue ou non cuite a été identifiée comme une source émergente d'intoxication alimentaire. L'un des problèmes peut être le suivant : dans une enquête récente, jusqu'à deux tiers des participants ont admis avoir mangé de la pâte à biscuits crue. De nouvelles études montrent que les consommateurs ne savent peut-être pas que, comme les œufs, la farine est un aliment cru qui peut être contaminé par des bactéries comme Salmonella et E. coli.

Deux nouvelles études sur les coûts et les dangers de la consommation de farine non cuite ont été présentées lors d'un symposium sur les risques pour la sécurité des aliments lors de la réunion annuelle de la Society for Risk Analysis, du 4 au 8 décembre 2022 à Tampa, Floride. Dans sa présentation, «Ne pas manger de pâte crue - Une étude de cas sur la communication des risques de sécurité des aliments avec les consommateurs» (Do Not Eat Raw Dough – A Case Study of Communicating Food Safety Risks with Consumers), Betty Feng de l'Université Purdue décrit ses recherches sur la sensibilisation des consommateurs aux risques liés à la manipulation de farine crue. Dans une deuxième étude, Rubait Rahman de la Michigan State University identifie les épidémies associées à la farine et aux produits à base de farine de 2001 à 2021 et estime le fardeau économique des maladies d'origine alimentaire associées à ces produits.

Le Centers for Disease Control (CDC) estime qu'un Américain sur six contracte une maladie d'origine alimentaire chaque année et Salmonella et E. coli font partie des cinq principaux agents pathogènes qui envoient des personnes à l'hôpital. Ces deux bactéries ont récemment été identifiées comme la cause de maladies liées à la farine. (En 2021, une épidémie à E. coli dans 12 États était liée à un mélange à gâteau.)

L'année dernière, Feng et ses collègues ont rapporté que 85% des consommateurs interrogés n'étaient pas au courant des rappels de farine ou des épidémies, et seulement 17% de ceux qui utilisent de la farine pour cuisiner pensaient qu'ils seraient affectés. Malgré le fait que le CDC et la FDA ont récemment publié des fiches d'information sur les dangers de manger de la pâte crue, 66% des consommateurs interrogés ont déclaré qu'ils mangeaient de la pâte à biscuits ou de la pâte crue.

Feng a présenté les résultats d'une récente étude de suivi oculaire dans laquelle seuls deux participants sur 47 ont trouvé les messages de sécurité sanitaire de la farine sur les 10 emballages de mélange à pâte ou de farine disponibles dans le commerce.

«Nos recherches ont montré que les messages de sécurité saniatire de la farine sur les emballages actuels ne sont pas efficaces pour transmettre des informations et modifier le comportement des consommateurs», a déclaré Feng.

Dans une étude distincte, «Foodborne Illness Outbreaks in Flour and Flour-Based Food Products from Microbial Pathogens in the US and Their Economic Burden from 2001-2021», Rahman et ses collègues constatent que neuf éclosions de maladies d'origine alimentaire associées à la farine et aux aliments à base de farine produits sont apparus aux États-Unis au cours des 20 dernières années (2001-2021). Ces flambées ont entraîné 752 cas de maladie signalés, dont 30% ont nécessité une hospitalisation. La plupart de ces cas signalés, causées par des infections à Salmonella et E. coli, impliquaient la consommation de farine crue ou la manipulation non sécuritaire d'un produit à base de farine.

Mais les recherches de l'équipe indiquaient que plus de 19 000 cas de maladies d'origine alimentaire associés à ces produits peuvent survenir chaque année aux États-Unis, soit plus de 500 fois le nombre de cas signalés. Leur analyse tient compte de facteurs tels que la sous-déclaration et le sous-diagnostic, ce qui entraîne un fardeau pour la santé publique dépassant de loin les statistiques officiellement publiées.

Sur la base de leur estimation du nombre de cas de 2001 à 2021, Rahman et ses collègues constatent que le coût économique moyen d'une intoxication alimentaire à la farine peut atteindre 258 millions de dollars par an. Cela comprend les coûts associés aux soins médicaux directs, les pertes de productivité, la mortalité prématurée et comprend des mesures de la douleur et de la souffrance résultant de ces maladies.

«Beaucoup de ces coûts peuvent être évités en sensibilisant davantage le public aux risques liés à la consommation de farine crue et de produits à base de farine», déclare Rahman.

Royaume-Uni : Détection de la grippe aviaire H5N1 chez 2 personnes supplémentaires alors qu'en Finlande, davantage d'élevages d'animaux à fourrure sont touchés

«Royaume-Uni : Détection de la grippe aviaire H5N1 chez 2 personnes supplémentaires alors qu'en Finlande davantage d'élevages d'animaux à fourrure sont touchés», source article de Lisa Schnirring paru le 14 juillet 2023 dans CIDRAP News.

La UK Health Security Agency (UKHSA) a rapporté le 14 juillet deux autres détections asymptomatiques de grippe aviaire H5N1 chez des personnes ayant été en contact avec des volailles malades, portant à quatre le total du pays grâce à son programme de surveillance en cours.

Dans d'autres développements, les responsables de la santé animale en Finlande ont signalé le 14 juillet quatre autres détections de H5N1 dans des élevages d'animaux à fourrure, ce qui fait suite à l'annonce faite le 13 juillet d'une épidémie chez des renards bleus dans un élevage d'animaux à fourrure.

Tests positifs sur les personnes de deux élevages

Dans un communiqué, la UKHSA a dit que la recherche des contacts n'avait révélé aucun cas d’infection lié à la grippe aviaire humaine.

Meera Chand, directrice des infections cliniques et émergentes de la UKHSA, a déclaré que les preuves actuelles suggèrent toujours que le virus ne se propage pas facilement des oiseaux aux humains.

«Ces détections peuvent faire suite à une contamination du nez et de la gorge due à l'inhalation de matières provenant de l'environnement, ou peuvent être dues à une infection», a-t-elle déclaré. «Il peut être difficile de les distinguer chez les personnes qui ne présentent aucun symptôme. Suite à toute détection, nous déclencherons immédiatement la réponse de santé publique appropriée.»

Les responsables de la santé ont déclaré que les épidémies dans les élevages de volailles se sont poursuivies à un faible niveau au cours de l'été, mais que la transmission du virus chez les oiseaux sauvages reste élevée au Royaume-Uni, en particulier chez les goélands et les sternes. Les deux dernières personnes testées positives ont été exposées dans différentes fermes.

Les scientifiques ont obtenu une séquence virale partielle d'une personne et une séquence complète de l'autre. Les deux virus appartiennent au clade 2.3.4.4b H5N1 et appartiennent au génotype UK AIV48.

Plus tôt cette semaine, des agences mondiales de la santé ont mis en garde contre une menace continue du H5N1 pour les humains, sur la base d'épidémies continues chez les oiseaux et de détections croissantes chez des mammifères non humains. Bien que les cas humains, désormais au nombre de 10, restent sporadiques, certains ont été graves ou mortels, tandis que d'autres seraient le résultat d'une contamination environnementale des voies respiratoires. Toutes concernaient des personnes ayant été en contact avec des oiseaux malades.

Les scientifiques continuent de surveiller de près tout changement dans le virus qui lui donne la capacité d'infecter plus facilement les humains. Les chercheurs ont déjà documenté des changements dans le gène PB2 qui sont liés à une réplication accrue dans les cellules de mammifères. Et bien que certains des changements donnent au virus la capacité de se lier à des récepteurs de type humain, il n'y a aucun signe de changement de préférence des récepteurs des voies respiratoires aviaires aux récepteurs humains.

H5N1 confirmé dans 4 autres élevages d’animaux à fourrure en Finlande

Dans des développements connexes, l'Autorité alimentaire finlandaise (FFA) a déclaré le 14 juillet que des tests ont confirmé laprésence du virus H5N1 dans quatre autres élevages, portant le total à cinq.

Les responsables ont déclaré que le virus est le même que celui retrouvé dans l'établissement signalé le 13 juillet. Parmi les nouvelles détections, deux se trouvent à Kauhava, une à Kausti et une à Halsua. Les élevages sont situées dans la partie centre-ouest du pays.

Dans l'une des d'éclosions dans un nouvel élevage, le virus a été trouvé chez des renards bleus et des visons. En octobre dernier, l'Espagne a signalé une épidémie de H5N1 chez des visons. Les responsables de la santé suivent de près les détections croissantes chez les mammifères pour évaluer les changements de virus et parce que les visons ont été suggérés comme un possible récipient de mélange pour les virus respiratoires.

Les nouvelles détections surviennent juste un jour après que le pays a signalé sa première épidémie dans un élevage d’animaux à fourrure, qui a rendu malades des renards bleus. L’élevage abritait également des chiens viverrins.

Mise à jour du 14 septembre 2023

Doit-on dire influenza aviaire ou grippe aviaire ? Source Anses.

Quand la maladie se manifeste chez les oiseaux, on parle d’influenza aviaire.

Quand un humain est touché par des virus influenza A d’origine aviaire, on parle alors de grippe aviaire.

Une épidémie dans un zoo met en évidence le risque de la COVID-19 entre l'homme et l'animal

«Une épidémie dans un zoo met en évidence le risque de la COVID-19 entre l'homme et l'animal», source article de Stéphanie Soucheray paru le 14 juillet 2023 paru dans CIDRAP News.

Dans un nouvel article publié dans la revue Eurosurveillance, des investigateurs néerlandais décrivent une épidémie de la COVID-19 chez des gorilles et des lions au zoo de Rotterdam fin 2021, malgré l'utilisation d'équipements de protection individuelle (EPI) par leurs soigneurs.

Le SRAS-CoV-2 a été détecté chez plusieurs animaux de zoo, probablement causé par une transmission interhumaine. Une telle transmission a également été documentée chez les animaux domestiques et sauvages. La dynamique de transmission doit être comprise, ont dit les auteurs de l'étude, pour évaluer le risque de propagation et protéger les animaux du SRAS-CoV-2 dans une perspective One Health.

L'épidémie de Rotterdam s'est produite au cours d'une période de 6 jours en novembre 2021, lorsque plusieurs gorilles des plaines occidentales et lions asiatiques ont souffert de fièvre, de toux et de léthargie. Les gardiens de zoo portaient des EPI depuis 2020, lorsque la pandémie de la COVID-19 a commencé, et les visiteurs du zoo devaient présenter une preuve de vaccination ou un résultat de test COVID négatif pour être admis.

Propagation d'animal à animal également probable

Des tests approfondis sur les animaux et 19 membres du personnel considérés comme des contacts directs et 21 membres du personnel considérés comme des contacts indirects ont suggéré une transmission interhumaine. Les données génomiques de deux gardiens de zoo et des lions et gorilles regroupés, ce qui peut indiquer une transmission entre les animaux et leurs gardiens de zoo, ont dit les auteurs.

«Nous avons considéré un ou plusieurs gardiens de zoo infectieux asymptomatiques, qui peuvent avoir été en contact les uns avec les autres dans des lieux privés ou dans les vestiaires, comme la source la plus probable de l'épidémie», ont dit les auteurs. «La transmission ultérieure d'animal à animal est probablement due au taux d'attaque élevé parmi les animaux et à l'utilisation constante d'EPI par les gardiens de zoo.»

Des mesures strictes doivent être prises dans les zoos pour se protéger contre les événements de débordement du SRAS-CoV-2, concluent les auteurs. «Il est crucial d'adopter des stratégies strictes de prévention et de contrôle pour éviter l'introduction d'agents pathogènes respiratoires dans les populations animales», écrivent-ils.

7500 pommiers saccagés aux vergers de Fontorbe à Lavaur (Tarn) : des collectifs pour l'environnement pointés du doigt par le propriétaire

Plus de 15 000 greffons arrachés sur plus de 7 500 arbres. Dans la nuit de jeudi à vendredi, des individus se sont introduits dans le Domaine de Fontorbe à Lavaur (Tarn) et ont saccagé 3 hectares de plantation de pommiers. Source La Dépêche du 14 juillet 2023.

7500 pommiers et 3 mois de travail saccagés en une nuit. Au delà d’une condamnation de ces actes odieux ⁦@MFesneau⁩ ⁦@GDarmanin⁩ , il est temps de faire payer à ces activistes écologistes chaque euro du préjudice subi. https://t.co/r1nNbXLl4s

— CSFL (@csfldefrance) July 14, 2023

Dans la nuit du 13 au 14 juillet, des vandales se sont introduits chez cet agriculteur, dans le Tarn, et on arraché 15 000 greffons de pommiers. Trois mois de travail saccagés.
Aucune revendication. Il y a 15 jours, des militants "écolos" ont organisé une marche dans le secteur,… https://t.co/EHiN2TuXrd

— Géraldine Woessner (@GeWoessner) July 15, 2023

Complément
On en apprend un peu plus sur cet article de France bleu.

Mise à jour du 17 juillet 2023

Nouveau rebondissement dans l'affaire des 7 500 pommiers détruits dans la nuit du jeudi 13 au vendredi 14 juillet près de Lavaur, dans le Tarn.

Ce lundi 17 juillet, un collectif inconnu, baptisé «Le chardon», a produit un communiqué de presse intitulé «L'avenir se noircit», pour revendiquer l'action perpétrée sur le domaine de Fontorbe. Source La Dépêche.

«Nous, habitant.e.s des campagnes ou des villes, descendant.e.s des paysan.ne.s qui ont nourri les humains de ce monde pendant des millénaires sans le détruire, nous ne pouvons plus croire des menteurs avérés. Une promesse de bio qui repasse directement en conventionnel n'est qu'un exemple de ce à quoi fait face une population entière : une agression actuelle, injustifiée, réelle, conduisant inévitablement à une défense nécessaire, simultanée et proportionnée» détaille le document reçu par La Dépêche du Midi. «Vous avez créé un peuple en état de légitime défense. Et ce peuple va se défendre, et sauver ses enfants de vos poisons» poursuit le communiqué. 

Mise à jour du 18 juillet 2023

Tarn : c’était donc bien des activistes écolos qui ont détruit les 7500 pommiers.. https://t.co/tWxtPVUQOt

— François Momboisse (@fmomboisse) July 18, 2023

Pour justifier le sacage de 7 500 pommiers dans le Tarn, le collectif auteur des destructions invoque la déconversion de la parcelle par l'agriculteur. Cultiver des pommes en France, de façon conventionnelle, en "verger écoresponsable", est perçu comme (citation) : "une agression…

— Géraldine Woessner (@GeWoessner) July 18, 2023