mercredi 15 juillet 2020

A propos de consommation de poulet cuit et la listériose humaine, selon une étude au Royaume-Uni


De la présence de « Listeria monocytogenes dans du poulet cuit: détection d'une éclosion au Royaume-Uni (2016-2017) et analyse de L. monocytogenes à partir d'une surveillance indépendante des aliments (2013-2017) », source J. Food Prot (2020).

Résumé
En Angleterre et au Pays de Galles, Public Health England (PHE) utile le séquençage du génome entier (WGS pour whole genome sequencing) aux cultures de Listeria monocytogenes issues de cas humains de listériose, d'aliments et d'environnements de production alimentaire.

Suite à l'inspection de routine d'un petit distributeur en février et mars 2016, deux sachets de poulet cuit non ouverts produits par le même fabricant ont été contaminés par L. monocytogenes à des niveaux de 340 et 20 UFC/g.

Un rappel public de ce produit a été émis en mars 2016. Au début de 2017, un cluster de lignée unique de < 5 PSN (polymorphisme d’un seul nucléotidique) a été détecté entre L. monocytogenes des deux produits de poulet cuits et des cultures de cinq cas de listériose humaine chez Angleterre et Écosse avec début de maladie entre mars 2016 et février 2017.

Les données épidémiologiques ont fourni des preuves supplémentaires que ce cluster faisait partie d’une éclosion liée à un fabricant de poulets cuits, dont les produits ont été fournis au petit distributeur, ce qui a lancé l'investigation sur l'épidémie.

Sans lien avec cette éclosion, 34 L. monocytogenes récupérés grâce à la surveillance alimentaire de routine de 2 007 échantillons de poulets cuits entre 2013 et 2017 ont été analysés par WGS.

Des clusters de lignées uniques < 5 SNP précédemment non détectés ont été identifiés parmi les cultures de poulets cuits et avec celles de deux clusters et de deux cas sporadiques de listériose humaine qui étaient compatibles avec la transmission d'origine alimentaire.

Cette analyse a identifié plus facilement le lien des clusters à L. monocytogenes dans des chaînes alimentaires spécifiques que le traçabilité manuelle traditionnelle. Le couplage des données associées aux cultures de L. monocytogenes provenant de cas de listériose avec celles provenant d’analyses alimentaires non liées est une source unique d'informations pour l'évaluation des risques de maladies transmissibles, les études épidémiologiques, la prévention et le contrôle des maladies.

Cet article fournit des preuves supplémentaires qui devraient servir de rappel de l'association entre la consommation de poulet cuit et la listériose humaine.

Estimation du nombre de décès pour cause de maladie d'origine alimentaire au Royaume-Uni pour 11 agents pathogènes clés


Dans une précédente article du blog il avait été question en « Angleterre et Pays de Galles : Le nombre de cas attribués aux aliments contaminés par Listeria augmente mais reste faible ».

« Une étude a estimé à 180 décès par an pour cause de maladies d'origine alimentaire au Royaume-Uni. », source article de Joe Whitworth paru le 15 juillet 2020 dans Food Safety News. L’étude est disponible en intégralité.

Des chercheurs ont estimé qu'il y avait 180 décès par an au Royaume-Uni causés par des maladies d'origine alimentaire en liaison  avec 11 agents pathogènes.

La Food Standards Agency (FSA) estime qu'environ 2,4 millions de cas de maladies d'origine alimentaire se produisent chaque année au Royaume-Uni.
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Les norovirus d'origine alimentaire devraient causer 56 décès par an, Salmonella 33 décès, Listeria monocytogenes 26, Clostridium perfringens 25 et Campylobacter 21. La plupart des décès surviennent chez les personnes âgées de 75 ans et plus.

Les décès d'origine alimentaire dus à Shigella, Cryptosporidium, Giardia, adénovirus, astrovirus et rotavirus sont rares, selon l'étude publiée dans la revue BMJ Open Gastroenterology.

Les cinq principaux coupables
Campylobacter, Clostridium perfringens, Listeria monocytogenes, Salmonella et norovirus sont responsables de 98 pour cent des 180 décès, mais il n'est pas possible de classer les cinq agents pathogènes. Le nombre total de décès pourrait être aussi faible que 113 ou aussi élevé que 359.

Le Royaume-Uni a enregistré 57 décès dus à Salmonella en 2017 et 2018, selon les données compilées par le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC).

Les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis ont estimé en 2011 qu'il y avait 2 612 décès pour 31 agents pathogènes communément transmis par les aliments. Le nombre total de décès pourrait être aussi faible que 1 723 ou aussi élevé que 3 819.

En 2019, FoodNet a identifié 122 décès confirmés. Le réseau de surveillance active des maladies d'origine alimentaire (FoodNet) surveille l'incidence des infections diagnostiquées en laboratoire causées par huit agents pathogènes transmis couramment par les aliments dans 10 sites américains.

Portée due à la modélisation
Dans l'étude britannique, quatre modèles différents ont été développés à partir de données provenant de sources, notamment une surveillance renforcée, des épidémies, des certificats de décès et des données statistiques sur les épisodes hospitaliers. Les estimations pour E. coli O157 n'étaient possibles que pour deux modèles car il n'est pas toujours décomposé en souches spécifiques. Listeria monocytogenes était le seul pathogène pour lequel les quatre estimations étaient possibles.

Ces approches de modélisation signifient une estimation des décès par norovirus d'origine alimentaire de 32 à 92, des décès par Salmonella de 7 à 159, Listeria monocytogenes de 24 à 28, Clostridium perfringens de 1 à 163 et Campylobacter de 8 à 47. Pour E. coli O157, il était prévu il y a chaque année entre 1 et 39 décès d'origine alimentaire.

Les sources comprenaient des données sur les éclosions de Public Health England entre janvier 2001 et décembre 2016. Pour E. coli O157 et Listeria, Public Health England, Public Health Wales, Health Protection Scotland et la Public Health Agency en Irlande du Nord ont renforcé la surveillance. Les données sur les cas, les hospitalisations et les décès par pathogène ont été extraites de ces ensembles de données. Les données des certificats de décès en Angleterre et au Pays de Galles sont collectées par l'Office for National Statistics (ONS) et chaque décès est codé.

Pour le norovirus, 89% des personnes décédées avaient plus de 74 ans. Pour Campylobacter, Listeria monocytogenes et Salmonella, les proportions étaient respectivement de 68%, 54% et 55%. Ceci est basé sur des données où l'agent pathogène a été indiqué comme la cause sous-jacente sur le certificat de décès. Cela peut suggérer des conditions sous-jacentes ou une fragilité plus générale, ce qui signifie que l'individu peut être plus gravement touché par la maladie, selon l'étude.

Ceux qui sont adeptes de comparaison avec la France pourront aller voir cet article paru en janvier 2018 dans le BEH et intitulé, Estimation de la morbidité et de la mortalité liées aux infections d'origine alimentaire en France métropolitaine, 2008-2013. Un des principales différence est « d’estimer le nombre annuel de cas symptomatiques, de cas hospitalisés et de cas décédés pour 21 agents pathogènes (10 bactéries, 3 virus, 8 parasites) transmis à l’homme par l’alimentation, en France métropolitaine ».

mardi 14 juillet 2020

E. coli dans une salade cause une intoxication alimentaire chez plus de 3 400 élèves dans des écoles de l'est du Japon


Exemple de salade Wakamé
Selon The Mainnichi, « E. coli dans une salade cause une intoxication alimentaire chez plus de 3 400 élèves dans des écoles de l'est du Japon ».

La cause d'une épidémie d'intoxication alimentaire qui a touché au total 3 453 élèves et autres dans 15 écoles publiques de la ville de Yashio, dans la préfecture de Saitama, dans l'est du Japon, a été identifiée à une salade d'algues contenant des bactéries E. coli, selon le conseil scolaire de la ville le 13 juillet.

Les élèves avaient développé des symptômes, notamment des douleurs à l'estomac et de la diarrhée après avoir consommé de la salade fournie à l'école. Des analyses des selles effectués par le centre de santé publique de la ville préfectorale de Soka, ainsi que d'autres enquêtes ailleurs, ont montré que le plat incriminé était de la salade de produits de la mer servie le 26 juin. La cause de l'intoxication alimentaire était l'algue Wakamé et un mélange d’ingrédients dans la salade d'algues qui n'ont pas été chauffés pour détruire les bactéries après avoir été trempés dans l'eau.

Les déjeuners scolaires restent suspendus dans les écoles de la ville, et les élèves devraient apporter leurs propres paniers-repas jusqu'au 4 août.

Selon ce site, Escherichia coli pathogène O7 a été détecté à la fois dans les échantillons des selles des enfants et dans la salade d'algues fournie lors du déjeuner scolaire le mois dernier.

Une étude révèle des données sur les infections à Vibrio entrant au Royaume-Uni


« Une étude révèle des données sur les infections à Vibrio entrant au Royaume-Uni », source Food Safety News.

Des chercheurs ont fourni des informations sur les infections à Vibrio parahaemolyticus au Royaume-Uni, trouvant la majorité chez les personnes revenant d'Asie du Sud-Est.

Les scientifiques ont analysé les souches archivées de Vibrio parahaemolyticus isolées des infections domestiques et des voyageurs au Royaume-Uni de 2008 à 2018 et qui avaient soumis des échantillons cliniques du Gastrointestinal Bacteria Reference Unit (GBRU) de Public Health England (PHE). Au total, 48 souches ont été récupérées de la collection de souches de PHE, ce qui montre qu'il est rare au Royaume-Uni.

Le GBRU est le laboratoire national de référence pour les pathogènes gastro-intestinaux et fournit des analyses d'échantillons cliniques pour les bactéries gastro-intestinales associées.

Comme de nombreuses infections associées aux voyages sont signalées à la GBRU, cela représente un mécanisme de surveillance passive utile pour détecter les infections associées aux voyages circulant dans le monde et qui sont ensuite importées au Royaume-Uni, selon l'étude publiée dans la revue Food Control.

Principalement de l’Asie du Sud-Est
La plupart des infections signalées entrant au Royaume-Uni provenaient de voyageurs revenant d'Asie du Sud-Est, mais des cas pourraient également provenir des États-Unis, de Cuba, de l'Inde, de la Turquie, des Caraïbes, de la France, de la Slovénie et du Royaume-Uni, ce qui met en évidence une large répartition géographique.

À l'échelle mondiale, Vibrio parahaemolyticus est la bactérie responsable d'intoxication alimentaire la plus répandue associée à la consommation des produits de la mer, mais l'épidémiologie de ces infections au Royaume-Uni n'était pas bien connue. La plupart des infections à Vibrio, à l'exception des cas de choléra, ne sont pas à déclaration obligatoire en Europe.

Des travaux antérieurs ont montré qu'il est de plus en plus préoccupant que le réchauffement climatique puisse augmenter le risque clinique de ce pathogène dans des zones traditionnellement non endémiques telles que l'Europe. Les infections sont généralement rares et sporadiques, mais des éclosions ont été signalées.

Les données épidémiologiques ont indiqué qu'environ 50% des infections signalées provenaient d'Asie du Sud-Est. Les cas à Vibrio parahaemolyticus confirmés cliniquement sont rarement signalés chaque année au Royaume-Uni. Il y a environ 22 cas d’infection signalées à PHE chaque année, principalement à cause des voyages associés à l'étranger.

Surveillance passive
Une grande diversité génétique des souches de Vibrio parahaemolyticus a été observée, la séquence de type 3 (ST3) étant la plus courante avec près de la moitié des 48 souches analysées.

Les scientifiques ont identifié 15 types de séquences différents parmi les souches cliniques isolées au cours de la dernière décennie, cinq souches analysées représentant de nouveaux types de séquences. Aucune souche du Pacifique Nord-Ouest, apparue aux États-Unis et propagée en Europe ces dernières années, n'a été identifiée.

Des études supplémentaires sont nécessaires pour explorer les facteurs de risque épidémiologiques associés aux infections en Europe ainsi que le potentiel d'émergence de ces agents pathogènes au niveau national.

Les chercheurs ont dit que l'une des principales limites était que de nombreuses souches cliniques manquaient de données de suivi des déplacements jusqu'à leur source probable.

« Nous démontrons que le séquençage du génome entier peut être efficace pour typer certains agents pathogènes humains entrant dans un pays non endémique traditionnellement considéré et cela a été capturé via des systèmes de surveillance épidémiologique passive. De telles approches peuvent potentiellement fournir un instantané utile de la diversité d'un groupe d'agents pathogènes donné circulant dans le monde », selon l'étude.

Rappel de graines de courgette en Angleterre. Elles peuvent donner des courgettes au goût amère


« Attention aux courges amères ! ». L’Anses nous avait prévenu le 31 octobre 2019 à ce propos.
A l’approche d’Halloween et en pleine saison des citrouilles, potirons, potimarrons, pâtissons et autres cucurbitacées qui égaient les recettes d’automne, il est important de rappeler que toutes les « courges » ne sont pas comestibles. Certaines courges amères peuvent être à l’origine d’intoxication alimentaire parfois grave.
Oui mais voilà il n’y a pas que les courges qui peuvent être amères, il y a aussi les courgettes …

En Angleterre, il vient d’y avoir un rappel de graines de courgette … et voici l’explication qui est donnée lors du rappel :
Ce rappel s'applique à tout paquet de cette variété avec le code de lot I au dos du sachet.
Il a été porté à notre attention qu'un lot de nos ‘Courgettes Zucchini’ pouvait contenir un petit nombre de graines pouvant produire des fruits au goût amer. Cela pourrait être dû à des niveaux inhabituellement élevés de cucurbitacines, un composé naturel présent dans toutes les courgettes, concombres et courges.
L'incidence de ce problème est extrêmement rare, mais pas inconnue. Ce n'est pas un problème répertorié par la Horticultural Trades Association, dont nous suivons volontairement et rigoureusement les directives d'étiquetage de mise en garde. Cela peut provenir d’un problème de pollinisation croisée dans le cycle de production des semences et c’est introuvable avant la récolte. Nous avons suivi le problème d’un lot particulier de semences provenant d'un producteur ayant les routines de culture et d'élevage les plus méticuleuses.
Normalement, les cucurbitacines existent en très petites quantités mais des problèmes génétiques dans le cycle de production livrent très occasionnellement de plus grandes quantités dans la graine qui provoquent la saveur amère. Il est impossible de tester la graine elle-même et nous n'avons jamais eu un lot de graines comme celui-ci dans nos 40 ans d'histoire.
Nous recommandons que si vous avez cultivé cette variété à partir d'un paquet avec le code de lot I, n'ingérez pas les fruits sans tester le goût de l'amertume. Un test de goût est une chose sûre à faire pour détecter si vous avez une plante affectée qui sera extrêmement amère. L'ingestion de fruits en quantité peut provoquer des crampes d'estomac, de la diarrhée ou des nausées, veuillez donc jeter la plante.
Ce site suisse, Betty Bossi, ne dit pas autre chose, « Pourquoi les courgettes sont-elles amères? »
Les courgettes (comme les concombres et les melons) appartiennent à la famille des cucurbitacées (Cucurbita). Lorsque des courgettes sont amères, c’est signe qu’elles contiennent de la cucurbitacine, une substance toxique, dont la teneur a tendance à augmenter avec la maturité du légume et sa durée de stockage.
Voici comment elle peut se retrouver dans les cucurbitacées: les coloquintes (courges d’ornement) contiennent de la cucurbitacine. Dans les courges comestibles, cette toxine a été éliminée grâce à des processus de sélection.
Mais lorsqu’on fait pousser des coloquintes (ou d’autres variétés sauvages) à proximité de courges comestibles, elles peuvent se croiser et former à nouveau des fruits contenant de la cucurbitacine. La pollinisation par les abeilles sur de longues distances serait à l’origine de ces croisements.
Ne mangez jamais de cucurbitacées amères car leur consommation en grande quantité peut entraîner de graves intoxications.
Le bon conseil, goutez avant ....

Une défense secrète contre les adénovirus


Une étude montre que le trioxyde d'arsenic renforce les défenses de l'organisme contre les virus. S’agit-il d’une Défense secrète contre les adénovirus ? Source Technical University of Munich (TUM)

Une infection à adénovirus peut être potentiellement mortelle, en particulier pour les enfants après une greffe de cellules souches. Des virologues de l'Université technique de Munich et du Centre allemand de recherche pour la santé environnementale Helmholtz Zentrum München ont montré avec succès qu'un médicament précédemment approuvé utilisé dans le traitement du cancer pouvait aider à inhiber cette infection virale. En raison de son mécanisme d'action spécial, le virus ne peut pas développer de stratégies de défense.

Les adénovirus humains provoquent entre autre une conjonctivite, des maladies gastro-intestinales et une pneumonie. Dans la plupart des cas, cependant, une infection ne présente aucun symptôme ou seulement des symptômes bénins chez des adultes en bonne santé. « De manière générale, chaque adulte a probablement déjà eu plusieurs infections à adénovirus », explique le Dr Sabrina Schreiner. Elle travaille à l'Institut de virologie du TUM et au Centre allemand de recherche pour la santé environnementale Helmholtz Zentrum. Dans le passé, les virus humains, dont plus de 85 variants différents sont actuellement connus, n'étaient pas considérés comme particulièrement dangereux.

Aucun médicament ou vaccin disponible pour le moment
Cependant, pour les personnes souffrant de déficits du système immunitaire, l'évolution de l'infection peut avoir des effets graves, voire mortels. Une infection est particulièrement dangereuse pour les enfants après une greffe de cellules souches. Dans ce cas, le taux de mortalité des patients infectés peut atteindre 80%.

« Nous savons que les infections à adénovirus chez des patients en bonne santé peuvent également provoquer une pneumonie sévère se terminant par la mort depuis 2006 », explique Schreiner. Cependant, il n'existe pas encore de médicament spécifiquement efficace contre les adénovirus, et il n'y a pas non plus de vaccin pour la population générale.

Complexes protéiques à effets antiviraux
Schreiner et son équipe étudient la façon dont le virus se reproduit dans la cellule. Ils ont observé des changements marqués dans ce qu'on appelle des corps nucléaires PML (promyelocytic leukemia), constitués de plusieurs protéines au sein de la cellule, en cas d'infection à adénovirus.

Ces structures, qui sont par ailleurs rondes, se dissolvent et forment des fibrilles allongées. « Nous supposons que les corps PML ont un effet antiviral, explique Schreiner. « Les virus détruisent les structures rondes des complexes protéiques puis utilisent cette manipulation cellulaire pour leur propre reproduction. »

Renforcement des défenses de l'organisme
Les scientifiques ont remarqué chez les patients cancéreux que les structures des corps PML étaient également dissoutes. Mais lorsque les patients ont été traités avec du trioxyde d'arsenic (As2O3), les structures rondes se sont reformées. « Le trioxyde d'arsenic est un ingrédient actif connu qui a déjà été approuvé et est actuellement utilisé en clinique pour les patients atteints de leucémie », explique Schreiner.

Les chercheurs ont testé l'efficacité du trioxyde d’arsenic dans des cultures cellulaires infectées par des adénovirus. Ici aussi, les corps PML se sont à nouveau reformés en structures rondes et la concentration de virus a chuté. « Nous pouvons donc réellement restaurer les usines antivirales endogènes qui combattent ensuite le virus », explique Schreiner.

Pas d'attaque directe
Après les tests de laboratoire, dans la prochaine étape, le médicament sera utilisé sur les patients atteints d'infections à adénovirus. Les virologues sont en contact étroit avec les pédiatres des hôpitaux de Munich. Étant donné que le médicament a déjà été approuvé, il peut être utilisé immédiatement en traitement. « Ce composé contient de l'arsenic, mais il n'y a pas d'effets secondaires cytotoxiques dans les concentrations dans lesquelles il est utilisé et pour lesquels il a déjà été approuvé », explique Schreiner.

La particularité de ce médicament est qu'il affecte les propres structures de la cellule au lieu d'attaquer directement le virus. « Les virus deviennent souvent résistants aux médicaments qui les attaquent directement », explique Schreiner. « Par exemple, ils peuvent muter de telle manière qu'ils ne sont plus reconnus par le médicament. Mais dans ce cas, puisque le virus n'a pas d'interaction directe avec l'ingrédient actif, il ne peut développer aucun mécanisme de défense. »

Système d'imagerie intelligent alimenté par l'IA pour la détection précoce et la classification des bactéries vivantes dans les prélèvements d'eau


« L'apprentissage en profondeur permet une détection précoce et une classification des bactéries vivantes à l'aide de l'holographie », source Light Publishing Center, Changchun Institute of Optics, Fine Mechanics and Physics, Chinese Academy.

 Les maladies d'origine hydrique affectent plus de 2 milliards de personnes dans le monde, ce qui entraîne un lourd fardeau économique.

Par exemple, le traitement des maladies d'origine hydrique coûte plus de 2 milliards de dollars par an aux États-Unis seulement, avec 90 millions de cas enregistrés par an. Parmi les problèmes liés aux agents pathogènes d'origine hydrique, l'un des problèmes de santé publique les plus courants est la présence de bactéries coliformes totales et de Escherichia coli (E. coli) dans l'eau potable, ce qui indique une contamination fécale.

Les méthodes traditionnelles de détection des bactéries basées sur la culture prennent souvent 24 à 48 heures, suivies d'une inspection visuelle et d'un comptage des colonies par un expert, selon les directives de l'Agence américaine de protection de l'environnement (EPA).

Alternativement, des méthodes de détection moléculaire basées, par exemple, sur l'amplification des acides nucléiques, peuvent réduire le temps de détection à quelques heures, mais elles manquent généralement de sensibilité pour détecter les bactéries à de très faibles concentrations, et ne sont pas capables de faire la différence entre les vivants et les micro-organismes morts.

De plus, il n'existe pas de méthode à base d'acides nucléiques approuvée par l'EPA pour détecter les bactéries coliformes dans les prélèvements d'eau.

Par conséquent, il existe un besoin urgent d'une méthode automatisée qui puisse atteindre une détection rapide et à haut débit des colonies bactériennes avec une sensibilité élevée afin de fournir une alternative puissante aux méthodes standard actuellement approuvées par l'EPA qui prennent au moins 24 heures et nécessitent une expert pour le dénombrement des colonies.

Dans un nouvel article publié dans Light: Science & Applications, une équipe de scientifiques, dirigée par le professeur Aydogan Ozcan du Département de génie électrique et informatique de l'Université de Californie, Los Angeles (UCLA), États-Unis, et des collègues ont développé un Système d'imagerie intelligent alimenté par l'Intelligence artificielle (IA) pour la détection précoce et la classification des bactéries vivantes dans les prélèvements d'eau. Sur la base de l'holographie, ils ont conçu un système d'imagerie très sensible et à haut débit, qui capture en continu des images microscopiques d'une boîte de culture, où des bactéries se développent, pour détecter rapidement la croissance des colonies en analysant ces images en accéléré avec un réseau neuronal profond. Après la détection de la croissance de chaque colonie, un deuxième réseau neuronal est utilisé pour classer le type de bactérie.

L'efficacité de cette plate-forme unique a été démontrée en effectuant une détection précoce et une classification de trois types de bactéries, à savoir E. coli, Klebsiella aerogenes (K. aerogenes) et Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae), et les chercheurs de l'UCLA ont atteint une limite -de-détection de 1 bactérie formant colonie pour 1 litre d'eau en 9 heures de temps pour l’analyse, démontrant un gain de temps de plus de 12 heures pour la détection des bactéries par rapport aux méthodes EPA standard. Ces résultats mettent en évidence le potentiel transformateur de cette plateforme d'imagerie holographique alimentée par l'IA, qui permet non seulement une détection très sensible, rapide et rentable des bactéries vivantes, mais fournit également un outil puissant et polyvalent pour la recherche en microbiologie.

Légende.
a, schéma de l'appareil. b, Image d’une boîte de colonies de E. coli et K. aerogenes. c, Exemples d'images des colonies bactériennes en croissance individuelles détectées par un réseau neuronal profond formé. Les points temporels de détection et de classification des colonies en croissance sont annotés par des flèches bleues. La barre d'échelle est de 0,1 mm. Cette recherche a reçu un financement de l'US ARO.
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Crédit de Hongda Wang, Hatice Ceylan Koydemir, Yunzhe Qiu, Bijie Bai, Yibo Zhang, Yiyin Jin, Sabiha Tok, Enis Cagatay Yilmaz, Esin Gumustekin, Yilin Luo, Yair Rivenson, Aydogan Ozcan.

NB : L'article est disponible intégralement et gratuitement.

Le COVID-19, les eaux usées, les coquillages et l'Ifremer


Selon France info du 10 juillet 2029, Covid-19 : « Nous n'avons observé aucune trace du génome du coronavirus, ni dans les eaux marines ni dans les coquillages », annonce l'Ifremer.
L'institut français de recherche pour l'exploitation de la mer réalisera des tests régulièrement, indique son président directeur général. François Houllier se réjouit, par ailleurs, de l'amélioration générale de la qualité des eaux du littoral.
Vous lirez l’article qui n’apporte pas grand-chose à mon sens, mais voyons plutôt ce que disent les deux communiqués de l’Ifremer à propos de cette annonce …

« Aucune trace de SARS-CoV-2 dans les premiers échantillons d’eau de mer et de coquillages analysés », selon le communiqué de l’Ifremer du 18 mai 2020.
Deux échantillons de moules et 19 échantillons d'huîtres creuses ont ainsi été prélevés entre le 22 et le 27 avril 2020.
Parmi les 21 échantillons de coquillages analysés : 6 ont présenté des traces de norovirus signant une contamination par des rejets humains.
Aucun échantillon de coquillages n’a présenté de trace de SARS-CoV-2.
Autre type de résultat, sur de l’eau de mer
Quatre échantillons d’un litre d’eau marine potentiellement soumise à des rejets humains ont été prélevés dans des zones identifiées grâce au réseau d'observatoires pour la recherche en microbiologie environnementale intégrée (ROME).
Aucun échantillon d’eau de mer n’a présenté de traces de SARS-CoV-2.
Nouveau communiqué de l’Ifremer du 28 mai 2020, « De nouvelles analyses confirment l’absence du SARS-CoV-2 dans les coquillages alors qu’elles le détectent dans des eaux usées du Grand Ouest ».
Du génome de SARS-CoV-2 a été détecté dans 9 des 13 échantillons d'eaux usées prélevés.
« Nos analyses échelonnées dans le temps suggèrent que le virus circule moins qu’au début de l’épidémie, explique Soizick Le Guyader, virologiste et responsable du laboratoire nantais ‘Santé environnement et microbiologie’ de l’Ifremer.
« Les 7 échantillons d’eaux usées prélevés avant le 24 avril sont tous positifs au SARS-CoV-2. A partir du 24 avril, sur les 6 échantillons analysés, 4 se sont révélés négatifs ».
Sous la loupe des équipes de l’Ifremer : un échantillon de palourdes, deux de moules et 16 d'huîtres creuses prélevés entre le 4 et le 11 mai 2020 sur la côte normande, les côtes bretonnes et les façades atlantique et méditerranéenne. Parmi ces 19 échantillons analysés :
Aucun échantillon de coquillages n’a présenté de trace de SARS-CoV-2.
« L’un de ces échantillons de coquillage a été prélevé juste à proximité des rejets d’une station d’épuration dans laquelle nous avions détecté des traces de SARS-CoV-2 avant traitement. Le fait qu’aucune trace de SARS-CoV-2 n’y ait été détectée laisse à penser que les traitements des eaux usées sont de nature à diminuer le risque de propagation du virus dans le milieu marin », constate Soizick Le Guyader.
Commentaire. Sans être un expert, le nombre d’échantillons ne me semble pas très significatif. Souhaitions qu'il y ait très régulièrement ce type de prélèvements pour confirmer ces résultats. Par ailleurs, comme attendu, certains échantillons prélevés de coquillages sont contaminés par norovirus, principal agent responsable des gastro-entérites aiguës … le sujet norovirus est récurrent dans les coquillages ...

L'UE appelle à agir contre le commerce illégal de mollusques bivalves


« L'UE appelle à agir contre le commerce illégal de mollusques bivalves », source article de Joe Whitworth paru le 14 juillet 2020 dans Food Safety News.

La Commission européenne a demandé aux États membres d'étudier le commerce illicite présumé de mollusques bivalves qui a provoqué des épidémies d'origine alimentaire.

Lors d'une réunion du réseau de lutte contre la fraude alimentaire en mai, la Commission a dit qu'elle était au courant d'irrégularités dans la circulation des mollusques bivalves et a appelé les pays concernés à enquêter.

Une enquête sur le trafic de palourdes en décembre 2019 l'a liée à l'intoxication alimentaire d'au moins 27 personnes en Espagne qui en avaient consommé certaines soupçonnées d'avoir été collectées dans des zones de récolte non autorisées au Portugal. Des personnes sont tombées malades dans différents restaurants de Cantabrie et des Asturies.

Des soupçons similaires à ceux du Portugal et de l'Espagne
L'opération TXUSPAS, coordonnée par Europol, a entraîné 43 arrestations, 39 en Espagne et 4 au Portugal, et la saisie de 38,5 tonnes de palourdes d'une valeur de 350 000 euros et 80 000 euros en espèces. Six perquisitions et sept inspections ont donné lieu à une enquête dans 11 sociétés.

Cela impliquait l’autorité économique et de sécurité alimentaire portugaise (ASAE), le réseau de lutte contre la fraude alimentaire de la DG SANTÉ et était dirigé par la SEPRONA espagnole (division nature et environnement de la Guardia Civil). Les enquêtes ont révélé la pêche illégale au Portugal et deux voies d'entrée en Espagne avec des destinations finales dont Huelva et Cantabria.

Le réseau a été actif pendant au moins un an, gagnant jusqu'à 9 millions d'euros avec plus de 1 000 tonnes de palourdes capturées illégalement. Des palourdes ont été récoltées au Portugal et déplacées en Espagne pour la lucrative saison estivale et les fêtes de fin d'année. Après un nettoyage, ils ont été vendus dans les marchés et les restaurants. Le lavage a aidé à éliminer les bactéries telles que E. coli mais n'a pas éliminé les virus comme les génovroupes I et II de norovirus et de l'hépatite A.


Les participants à la réunion du Food Fraud Network de mai ont appris qu'un examen de la base de données de l'UE avait permis d'identifier des cas de commerce avec des soupçons similaires. Certains États membres ont informé la DG SANTÉ des infractions à la législation de l'UE sur les règles d'hygiène dans le commerce des mollusques bivalves.

Falsification de documents et manque de traçabilité
La DG SANTÉ a proposé que les pays renforcent la législation de l'UE pour améliorer la traçabilité dans le secteur et la numérisation des informations pour lutter contre la contrefaçon de documents.

Les irrégularités concernent des écarts de documentation et une mauvaise traçabilité visant à masquer le fonctionnement des opérateurs non enregistrés tels que les récolteurs, les centres de purification et d'expédition, la récolte des mollusques dans les zones non autorisées, les mauvaises conditions sanitaires de stockage et de transport et le mélange des récoltes illégales avec des dispositions légales.

Ces écarts comprennent la date de récolte, les zones, les espèces, les quantités et l'état de santé mal déclarés, l'absence d'informations sur le récolteur, des détails de transport manquants ou incorrects et la falsification des dates de livraison dans les centres de purification.

Ils sont qualifiés de fraude potentielle car, pour des raisons économiques, ils enfreignent intentionnellement la législation de l'UE sur les règles d'hygiène applicables aux aliments d'origine animale et conduisent à la tromperie des clients avec un risque accru pour la santé des consommateurs et une concurrence déloyale avec les entreprises honnêtes.

La FDA publie un ‘plan directeur’ pour ‘une nouvelle ère de la sécurité des aliments’, mais les détails sont insuffisants


« La FDA publie un ‘plan directeur’ pour ‘une nouvelle ère de la sécurité des aliments’, mais les détails sont insuffisants », source article de Coral Beach paru le 14 juillet 2020 dans Food Safety News.

Invoquant des images d'une comptine pour enfants et d'un classique de John Lennon, les dirigeants de la FDA ont dévoilé ce qu'ils appellent un plan pour une «Nouvelle ère d’une sécurité des aliments plus intelligente» de l'agence.

Plan directeur de la FDA
Comme la comptine Jack Be Nimble (Jack est agile), les «approches agiles» sont présentes parmi les promesses du plan directeur publié par la Food and Drug Administration (FDA).

Et, comme la chanson très connue de Lennon, la conclusion du plan directeur a exhorté, «imaginez», ou comment la vie serait si le système alimentaire pouvait être suffisamment agile pour tracer efficacement les aliments pendant les épidémies et les rappels. «Imaginez donc que ces aspirations deviennent la norme … » dit ainsi la conclusion du plan directeur.

Le plan directeur, qui devait être publié ce printemps, a été bloqué tandis que l'agence a réduit ses opérations pendant le confinement du COVID-19. Lorsque la «nouvelle ère de la sécurité des alimentaire» a été annoncée par le sous-commissaire de la FDA pour la politique et la réponse alimentaire, Frank Yiannas, au début de 2019, le contenu a été promis pour le début de 2020.

Maintenant que le plan directeur est sorti, il est clair que certaines parties du projet ne sont pas encore claires.

Jusqu'à présent, les informations sur la «nouvelle ère» comprenaient de nombreuses expressions telles que de nouvelles approches, des changements planifiés, des approches modernes et plus d'efficacité. Avec le déploiement du plan directeur, la FDA continue de s'appuyer sur ces phrases ainsi que sur des concepts tels que la «technologie de levier» et l'évolution de l'industrie alimentaire.

Il y a peu de détails dans le plan en termes de ce qu'est spécifiquement le dénouement et comment spécifiquement y arriver. Mais ce n'est pas ce que le plan est censé faire.

« Le plan n'est pas un plan d'action détaillé », a dit Yiannas aux journalistes lors d'une téléconférence de presse lundi après-midi. « L’objectif est de décrire une décennie de travail. »

Avant que l'un des détails de ce travail puisse être déterminé, le plan directeur de la FDA indique que le gouvernement devra recueillir des informations auprès des parties prenantes, y compris les entreprises, les gouvernements, les universités et le public.

Yiannas a dit aux journalistes que pendant que le plan était en cours d'exécution, la pression d'une industrie à l'autre entraînerait la réalisation de certains des objectifs ultimes de la «nouvelle ère» (New Era) avant que le gouvernement ne puisse rechercher, proposer, réviser et publier des directives ou des règles de l'industrie.

Les distributeurs exigent de plus en plus de traçabilité pour certains aliments, a dit Yiannas. À mesure que cette pratique se développera, les entités du système alimentaire qui approvisionnent les distributeurs et les restaurants devront mettre en œuvre une technologie de traçabilité moderne pour rester viables sur le marché.

La traçabilité n'est qu'un aspect du plan directeur publié par la FDA. Il comporte quatre éléments clés.

« Ce sont les piliers fondamentaux de la nouvelle ère de la sécurité des aliments plus intelligente, couvrant une gamme de technologies, d'analyses, de modèles commerciaux, de modernisation et de valeurs qui en sont les éléments constitutifs », selon le plan directeur.

« Il y a beaucoup de synergie; une idée dans un élément peut être pertinente pour un ou plusieurs autres. Par exemple, l'analyse se transforme en traçabilité et en nouveaux modèles commerciaux. Les thèmes de la confiance mutuelle entre les partenaires fédéraux et étatiques et l'importance de la culture de la sécurité des aliments sont tissés partout. Il existe des besoins communs en termes de mesures et d'audits tierce partie fiables. Ces éléments, en travaillant ensemble, nous feront entrer dans la nouvelle ère de la sécurité des aliments plus intelligente. »