Rapport épidémiologique annuel 2017 de l'ECDC sur les STEC

Dans le cadre des rapports de surveillance, l’ECDC publie « Infection par Escherichia coli producteurs de shigatoxines ou de vérotoxines (STEC/VTEC). Rapport épidémiologique annuel 2017 ».

Points clés.

• En 2017, 6 457 cas confirmés d'infections à Escherichia coli producteurs de shigatoxines ou de vérotoxines (STEC/VTEC) ont été rapportés dans l'UE/EEE.
• Le taux de notification UE/EEE était de 1,8 cas pour 100 000 habitants.
• Le taux le plus élevé de cas confirmés a été observé chez les enfants âgés de 0 à 4 ans (8,9 cas pour 100 000 habitants).
• Le taux de notification UE / EEE est resté stable de 2013 à 2017.
• Les taux de notification les plus élevés ont été signalés au Danemark, Irlande, Norvège et Suède. 

La notification des infections à STEC/VTEC est obligatoire dans la plupart des pays de l'UE/EEE, à l'exception de cinq États membres où la notification est volontaire (France, Luxembourg et Espagne) ou fondée sur un autre type de système (Italie et Royaume-Uni).

Les systèmes de surveillance des infections à STEC / VTEC ont une couverture nationale dans tous les pays de l'UE/EEE, à l'exception de trois pays, la France, l'Italie et l'Espagne. La majorité des pays de l'UE/EEE (25 sur 30) disposent d'un système de surveillance passive et dans 21 d'entre eux, des cas ont été rapportés à la fois par des laboratoires et des médecins et/ou des hôpitaux. Cinq pays ont seulement des rapports de laboratoire.

En France, la surveillance des STEC/VTEC est basée sur la surveillance du syndrome hémolytique et urémique (SHU) chez l'enfant et en Italie, elle repose principalement sur le registre national des SHU. Vingt-neuf pays de l'UE/EEE ont communiqué des données fondées sur des cas et un a présenté des données agrégées.

Épidémiologie

Pour 2017, 6 647 cas d'infections à STEC/VTEC ont été rapportés par 30 pays de l'UE/EEE. Parmi ces cas, 6 457 (97%) ont été confirmés. Vingt-sept pays ont signalé au moins un cas confirmé et trois pays n’ont signalé aucun cas. Le taux de notification UE/EEE était de 1,8 cas pour 100 000 habitants, le même niveau que lors des quatre années précédentes.

Le nombre le plus élevé de cas confirmés a été rapporté par l’Allemagne et le Royaume-Uni, les deux représentant 47,4% de tous les cas signalés dans l’UE/EEE. Comme les années précédentes, les plus hauts taux de notification par pays ont été observés en Irlande, Norvège, Suède et Danemark, avec respectivement de 16,6, 7,2, 5,0 et 4,6 cas pour 100 000 habitants. Dix pays du sud et de l'est de l'UE/EEE ont signalé ≤ 0,1 cas pour 100 000 habitants.

En moyenne, 37,5% des cas de STEC/VTEC ayant des informations connues ont été hospitalisés. Vingt cas sont décédés, entraînant une létalité de 0,5%.

La majorité (83,5%) des cas de STEC/VTEC contenant des informations sur le pays d'infection étaient des infections acquises nationalement.

Une tendance nette saisonnière du nombre de cas confirmés de STEC/VTEC a été observée dans l'UE/EEE entre 2013-2017, avec davantage de cas signalés pendant les mois d'été, de juin à septembre.

Discussion

En 2017, les STEC/VTEC a été la quatrième zoonose la plus fréquemment signalée dans l'UE. En 2013-2017, l'ensemble des cas signalés est resté stable, mais à un niveau nettement plus élevé qu'au début de l'étude de la surveillance en 2007 des STEC/VTEC et plus élevée qu’avant une épidémie importante en 2011.

Une partie de l’augmentation peut s’expliquer par l’amélioration de la sensibilisation clinique à l’infection par STEC/VTEC après l’épidémie de 2011. D'autres facteurs contributifs pourraient être soit le nombre croissant de laboratoires qui effectuaient des analyses pour les sérogroupes autres que O157 et un changement dans les méthodes avec des méthodes de diagnostic sans culture, la PCR étant plus communément utilisée.

Le sérogroupe O157 a été le plus souvent signalé, mais la proportion a continué de diminuer, tandis que la proportion de sérogroupes de STEC/VTEC non-O157 qui a augmenté en 2017. Les six principaux sérogroupes non-O157 étaient O26, O103, O91, O145, O146 et O111 qui ont régulièrement augmenté dans l’UE depuis 2007 (dans des échantillons humains et alimentaires). Les non-O157 représentait une proportion plus élevée de cas de SHU que celle signalée pour le sérogroupe O157, ce qui met en évidence un risque émergent d’infections et la possibilité d'épidémies importantes.

La surveillance des infections à STEC/VTEC est obligatoire et couvre l'ensemble de la population dans la plupart des pays de l'UE/EEE.

Cependant, la surveillance ne couvre que les cas de SHU dans deux pays qui touchent principalement les enfants en bas âge et sont caractérisée par une insuffisance rénale aiguë nécessitant des soins hospitaliers. 

En 2017, la proportion moyenne de cas hospitalisés liés à STEC/VTEC était relativement élevée (38%) et avaient augmenté par rapport aux années précédentes. Des taux plus élevés de cas hospitalisés ont été signalées dans des pays ne signalant que des cas de SHU et présentant les taux de notification/cas les plus faibles, indiquant que leurs systèmes de surveillance ne se concentrent que sur les cas les plus graves.

Le groupe d’âge le plus touché par les STEC/VTEC étaient les nourrissons et les enfants de moins de 4 ans, qui représentaient près d’un tiers de tous les cas confirmés en 2017. Cela a également été observé dans les cas de SHU, où deux tiers des cas ont été rapportés chez des patients âgés de 0 à 4 ans.

La plupart des cas humains à STEC/VTEC sont sporadiques. La dernière revue systématique a révélé que la viande hachée bovine ou d’autres viandes est un facteur de risque important d’infection sporadique par STEC et a indiqué que les infections par des viandes contaminées sont le plus souvent causées par le sérogroupe O157.

Le récent foyer du sérotype O103:H2 met en évidence un risque d'infection associé au lait cru.

En 2017, 48 foyers à STEC ont été signalés à l’Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) impliquant 260 cas dans 11 pays et représentant 0,9% de tous les foyers d'origine alimentaire ou hydrique au niveau de l'UE. Ces épidémies étaient relativement petites (nombre moyen de cas: 5,4 cas par foyer). Neuf des 37 éclosions d'origine alimentaire ont été signalés avec un véhicule alimentaire connu. Quatre épidémies ont été causées par de la viande bovine et ses produits (STEC O157), un par de la viande et des produits à base de viande (STEC non spécifié), trois par du lait (STEC O157 et STEC non spécifié) et un par du fromage (STEC O111). En Irlande, où est signalé le taux de notification par pays le plus élevé de l’UE, les STEC représentaient l’agent causal le plus souvent responsable des foyers et a été identifié dans 50% des foyers en 2017, dont 11 d'origine hydrique.

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Rappelons, comme indiqué dans le texte de l’ECDC, les modalités de la surveillance sont les suivantes :

En France, la recherche des E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) dans les selles n’étant pas effectuée en routine dans les laboratoires d’analyses médicales, la surveillance de ces infections est basée sur la surveillance du syndrome hémolytique et urémique (SHU). Les objectifs de cette surveillance sont de suivre les tendances spatio-temporelles du SHU chez les enfants âgés de moins de 15 ans, de connaître les caractéristiques épidémiologiques des cas et de détecter des phénomènes épidémiques.

Par ailleurs, selon un article de l’InVS à propos d’une épidémie survenue entre février et mai 2018,

En France, la surveillance du syndrome hémolytique et urémique et des infections à Escherichia coli producteurs de shigatoxines repose sur plusieurs systèmes de surveillance qui permettent d’identifier la grande majorité des cas :

• la surveillance du SHU chez l’enfant de moins de 15 ans : depuis 1996, un réseau de services de néphrologie pédiatrique volontaires notifient les cas à Santé publique  France ;
• le Centre National de Référence pour les E. coli ;
• la déclaration obligatoire des toxi-infections alimentaires collectives. 

A suivre ...