« Une étude remet en question les recommandations d'antibiotiques pour les cultures », source article de Chris Dall paru le 25 juin 2020 dans CIDRAP News.
Une nouvelle étude réalisée par des chercheurs d'un groupe qui conseille les agriculteurs sur les maladies des plantes suggère que les antibiotiques peuvent être utilisés plus fréquemment sur les cultures et sur une plus grande variété de cultures que ce que l'on pensait auparavant.
Les résultats sont basés sur les données de Plantwise, un programme de développement agricole qui forme des vulgarisateurs à fournir une assistance et des conseils aux agriculteurs des pays d'Afrique, d'Asie et des Amériques. Une analyse de plus de 436 000 enregistrements de la base de données Plantwise contenant des recommandations fournies aux agriculteurs pour la gestion des problèmes de culture a révélé que les antibiotiques, y compris certains antibiotiques médicalement importants, sont recommandés pour une utilisation sur plus de 100 cultures, le plus souvent le riz.
Selon les dossiers, les antibiotiques sont recommandés non seulement pour des maladies bactériennes spécifiques, mais aussi pour des problèmes fongiques. Ils ont également été recommandés pour lutter contre les insectes et les acariens et les infections virales, contre lesquelles aucun antibiotique n'a d'activité contre.
Dans l'ensemble, la proportion d'enregistrements contenant une recommandation pour un antibiotique était inférieure à 1%, et les enregistrements n'indiquent pas si la recommandation a été suivie. De plus, les quantités d'antibiotiques utilisées, là où les recommandations ont été suivies, sont bien plus faibles que celles utilisées en médecine humaine et vétérinaire.
Mais les résultats sont remarquables car il y a très peu de documentation ou de surveillance de l'utilisation d'antibiotiques dans les cultures. Une récente enquête conjointe menée par l'Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO), l'Organisation mondiale de la santé (OMS) et l'Organisation mondiale de la santé animale (OIE) a révélé que seulement 3% des 158 pays évaluent régulièrement les types et les quantités d'antibiotiques utilisés sur les cultures. L'utilisation d'antibiotiques en médecine humaine et vétérinaire, considérée comme les principales voies de développement de la résistance aux antibiotiques, retient beaucoup plus l'attention.
L'auteur principal de l'étude, Phil Taylor, du CABI (Commonwealth Agricultural Bureau), un organisme à but non lucratif international qui se concentre sur les problèmes de l'agriculture et de l'environnement, en particulier les maladies des plantes et les ravageurs, a déclaré que bien qu'il soit difficile de dire à quel point les antibiotiques menacent la santé humaine dans les cultures, il en fournit un autre voie potentielle de propagation de la résistance aux antibiotiques.
« L'utilisation d'antibiotiques sur les cultures est certainement une autre façon dont les communautés bactériennes sont exposées à de faibles niveaux d'antibiotiques, ce qui va bien sûr amplifier les gènes de résistance », a dit Taylor. « Enrober la phyllosphère [surface foliaire] d'antibiotiques va certainement exposer un grand nombre de bactéries à des antibiotiques qu'elles n'auront jamais rencontrées auparavant. »
L'étude a été publiée dans CABI Agriculture and Bioscience, le journal officiel du CABI.
Préoccupations concernant les antibiotiques importants sur le plan médical
Dans leur analyse des données de Plantwise, qui est exploitée par CABI, Taylor et son collègue et coauteur de CABI, Robert Reeder, ont trouvé un total de 436 674 enregistrements provenant de 32 pays, mais la proportion contenant une recommandation d'antibiotiques ne représentait que 0,38%, et les recommandations d'antibiotiques ont été enregistrés dans seulement 17 des pays analysés. L'analyse finale comprenait des enregistrements de 11 pays représentant quatre régions de l'OMS, Asie du Sud-Est, Méditerranée orientale, Pacifique occidental et Amériques.
Les auteurs notent que les données ont été regroupées en régions plutôt que d'être présentées par pays en raison des sensibilités potentielles entourant la recommandation d'antibiotiques à utiliser sur les cultures. De plus, l'ensemble des données ne contient pas d'enregistrements de Chine, qui ne divulgue pas de données à CABI. Et aucun dossier en provenance d'Afrique ne contient de recommandations d'antibiotiques, pour des raisons qui ne sont pas claires, a déclaré Taylor. Il ne pense pas que cela soit dû au coût ou aux différences de cultures ou aux types d'agents pathogènes qui affectent les cultures.
« Les cultures sont similaires à travers le monde, tout comme les maladies », a-t-il dit. « Je pourrais imaginer que les chaînes d'approvisionnement n'ont pas encore atteint l'Afrique et si rien ne change, ce ne sera qu'une question de temps avant que les antibiotiques ne soient utilisés [là-bas]. »
L'analyse a révélé qu'un total de 11 antibiotiques appartenant à huit classes ont été recommandés pour une utilisation sur plus de 100 cultures différentes. Les types d'antibiotiques recommandés variaient selon la région, tout comme les quantités recommandées. Alors que six des antibiotiques sont utilisés principalement pour lutter contre les maladies des plantes, les six autres - amoxycilline, tétracycline, oxytétracycline, streptomycine, gentamicine et céfadroxil - sont considérés comme médicalement importants par l'OMS.
La streptomycine était l'antibiotique le plus fréquemment recommandé, suivie de la tétracycline et de la kasugamycine, un antibiotique développé spécifiquement pour le contrôle des maladies bactériennes dans le riz qui est utilisé sur une variété d'autres cultures.
Le riz était la culture dominante dans laquelle les antibiotiques étaient recommandés. En Asie du Sud-Est, 7,4% des recommandations pour le riz contenaient un antibiotique. Taylor et Reeder ont estimé que si le taux recommandé de plantomycine (un mélange de streptomycine et de tétracycline qui était le plus largement antibiotique recommandé par nom commercial dans l'ensemble de données) a été appliqué à 7,4% de la superficie rizicole d'Asie du Sud-Est, une seule application représenterait 63 tonnes de streptomycine et 7 tonnes de tétracycline.
Les autres cultures pour lesquelles des antibiotiques étaient recommandés étaient les tomates, les agrumes, les pommes de terre et le chou.
Taylor, qui était agriculteur pendant 16 ans avant de rejoindre CABI, a déclaré que de nombreuses personnes dans le monde pensent que les antibiotiques sont un moyen raisonnable de contrôler les maladies des plantes et que les antibiotiques utilisés strictement sur les cultures ne peuvent pas poser de problème pour la santé humaine. Pourtant, l'utilisation d'antibiotiques médicalement importants sur les cultures le préoccupe.
« Je pense qu'il est terrible que des antibiotiques médicalement importants soient utilisés de cette manière », a-t-il dit. « L'utilisation d'antibiotiques dans la production végétale renforce encore les arguments en faveur de l'inclusion de la santé des plantes sous la bannière », Une Seule Santé ou One Health.
Taylor et Reeder ont également noté que les antibiotiques utilisés sur les cultures sont régulièrement mélangés à d'autres produits agrochimiques, ce qui a suscité des inquiétudes quant aux interactions qui pourraient favoriser la résistance croisée ou la co-sélection pour la résistance aux antibiotiques.
« Il y a des preuves alarmantes que le mélange d'antibiotiques avec d'autres produits agrochimiques induit une résistance beaucoup plus rapidement que l'exposition aux antibiotiques isolément, et c'est un problème préoccupant, mais ce n'est pas quelque chose que nous avons étudié », a dit Taylor.
Utilisation d'antibiotiques sur les arbres fruitiers américains
Bien que l'Amérique du Nord ne figure pas parmi les régions couvertes par l'ensemble de données, à ce jour, l'utilisation d'antibiotiques sur les cultures est la plus largement documentée aux États-Unis, où la streptomycine et l'oxytétracycline sont utilisées depuis longtemps pour lutter contre le feu bactérien, une maladie bactérienne qui frappe la pomme et poiriers. Plus récemment, l'Environmental Protection Agency des États-Unis a autorisé une utilisation accrue de l'oxytétracycline sur environ 283 280 hectares de cultures d'agrumes en Floride et en Californie afin de prévenir la maladie du verdissement des agrumes et va examiner une demande d'utilisation accrue de la streptomycine.
Des groupes de défense de la santé publique et de l'environnement, ainsi que les Centers for Disease Control and Prevention et la Food and Drug Administration, se sont déclarés préoccupés par le fait que la pulvérisation de quantités massives de ces antibiotiques sur les agrumes pourrait menacer la santé humaine en sélectionnant des bactéries résistantes aux antibiotiques dans le sol, qui pourraient alors partager des gènes de résistance avec des agents pathogènes qui causent des maladies chez l'homme et les animaux.
Taylor et Reeder disent également qu'il existe des preuves suggérant que les cultures, en particulier si elles sont consommées crues, pourraient être un véhicule potentiel pour que des bactéries résistantes pénètrent dans l'intestin humain. Mais ils notent que ceux qui préconisent l'utilisation d'antibiotiques contre les maladies des plantes soulignent qu'il n'y a aucune preuve de propagation de bactéries résistantes des bactéries phytopathogènes aux agents pathogènes humains ou animaux, malgré plus de 50 ans d'utilisation continue.
Taylor a dit que Plantwise continuerait à collecter des données auprès d'agents de vulgarisation agricole formés dans le monde entier, et ses collègues et lui espèrent être en mesure au fil du temps de cataloguer les différents types d'antibiotiques utilisés sur les cultures et de surveiller leur utilisation.
Aucun commentaire:
Enregistrer un commentaire
Remarque : Seul un membre de ce blog est autorisé à enregistrer un commentaire.