Réunion virtuelle européenne One Health, partie 2

« Réunion en ligne pour un projet européen de sécurité alimentaire », source article de Joe Whitworth paru le 4 juin 2020 dans Food Safety News.

Note de l'éditeur: cet article, partie 2 sur 2, résume les présentations orales et par affiches de la réunion de trois jours du programme conjoint européen One Health.

Un projet européen contribuant à promouvoir le progrès scientifique sur les zoonoses d'origine alimentaire a tenu sa réunion annuelle virtuellement à cause de l'épidémie liée au coronavirus.

La deuxième réunion scientifique annuelle du programme commun européen One Health (OHEJP pour One Health European Joint Program) sur les zoonoses d'origine alimentaire, la résistance aux antimicrobiens et les menaces émergentes était prévue à Prague en République tchèque, la semaine dernière, mais avec la pandémie de COVID-19 la réunion physique a été annulée et remplacée par une réunion virtuelle.

Les organisateurs ont décidé d'accueillir la réunion en ligne avec des présentations orales et par affiches. Voir la première partie decet article résumant ces présentations de l'événement de trois jours.

Présentations orales

Gina M. Duggan, de Teagasc, a étudié la dynamique de l'excrétion de E. coli producteurs de shigatoxines (STEC).

L'Irlande a le taux le plus élevé de cas humains de STEC dans l'UE. L'étude a évalué l'excrétion de STEC chez des moutons irlandais et a examiné les facteurs de risque potentiels sous-jacents à la dynamique de l'excrétion, ainsi que les STEC de sérogroupes O157 et O26. Les résultats ont révélé de faibles niveaux de super-excréteurs O157 et O26 chez les moutons destinés à l'abattage, mais un niveau élevé de portage des STEC dans l'ensemble.

Gianni Lo Iacono, de l'Université du Surrey, a présenté des informations sur l'impact du climat sur la campylobactériose, car la saisonnalité est mal comprise.

À l'aide de données provenant de l'Angleterre et du Pays de Galles, une forte augmentation de l'incidence au début de l'été et des variations interannuelles étaient associées à la température, à l'humidité relative et à la durée du jour. Le risque était le plus élevé pour une humidité relative entre 75 à 80 pour cent et une température maximale de 14 à 16°C.

Marieke Opsteegh du RIVM a parlé d'une revue de la littérature pour résumer les études européennes sur l'attribution des sources de Toxoplasma gondii.

L'élicitation d'experts a indiqué que les aliments étaient une source plus importante que le sol et l'eau. Les évaluations quantitatives des risques ne portaient que sur la transmission par la viande. Dans les rapports des patients, les sources présumées étaient de l'eau de puits, des contacts avec des chats, du lait de chèvre non pasteurisé et différents types de viande insuffisamment cuite, mais les preuves solides de la source la plus probable faisaient généralement défaut.

Le projet «TOXOSOURCES» effectuera une évaluation quantitative des risques dans plusieurs pays, y compris l'exposition de la viande et de l'environnement à Toxoplasma gondii.

Présentations par affiches

Anna Czubkowska, de l’Institut national de recherche vétérinaire de Pologne, a évalué la présence de pathogènes bactériens d'origine alimentaire dans le lait cru de vache dans le pays.

Un total de 100 échantillons de lait cru de vache en vrac provenant de différentes fermes laitières a été collecté en 2019. Yersinia enterocolitica a été retrouvé dans 24 pour cent des échantillons testés. Listeria monocytogenes a été détecté dans 14% des analyses. Campylobacter jejuni à 4 pour cent et un isolat de E. coli O157 ont également été identifiés.

Kathrin Hauser, de l'Agence autrichienne pour la santé et la sécurité alimentaire, a étudié la colonisation par Klebsiella pneumoniae de six personnes en bonne santé pendant un an en analysant un échantillon de selles par semaine. Au total, 80 isolats de Klebsiella pneumoniae provenant de cinq participants ont été obtenus.

Deux individus ont partagé plusieurs sous-types identiques de Klebsiella pneumoniae. Cela met en évidence le rôle potentiel de la nourriture en tant que réservoir pour les humains, car des repas partagés pourraient être identifiés entre les deux participants dans le délai correspondant.

Violeta Di Marzio, d'IZSAM en Italie, a examiné Klebsiella pneumoniae multirésistants dans des cuisses de poulet, des salades prêtes à consommer (PAC) et des carottes.

Un total de 60 échantillons de cuisses de poulet, de salades PAC et de carottes achetées chez différents distributeurs ont été examinés. Dix souches de Klebsiella pneumoniae ont été isolées dans des salades PAC, 54 souches ont été détectées dans des cuisses de poulet et quatre dans des carottes. Le pourcentage de souches multirésistantes dans des cuisses de poulet était significativement plus élevé que les autres types d'échantillons.

L'échange de signaux d'événements zoonotiques en Europe a fait l'objet d'une affiche de Maria Nöremark, de l'Institut national vétérinaire de Suède.

Le partage précoce des signaux d'événements zoonotiques peut être essentiel pour comprendre que des cas distincts font partie d'une épidémie et garantir la participation de secteurs tels que la santé publique, la sécurité sanitaire des aliments et la santé animale aux niveaux local, régional, central ou international.

La déclaration de maladies à déclaration obligatoire est réglementée, mais pour certains pathogènes et événements endémiques ou émergents, d'autres facteurs peuvent déclencher un signal, comme une augmentation inattendue des cas.

Dans six pays, des entretiens ont eu lieu avec des professionnels qui reçoivent et partagent des signaux d'événements zoonotiques potentiels. Les résultats préliminaires montrent que les contacts informels étaient très importants et le fait de connaître quelqu'un en personne facilite la signalisation. Une crainte d'une réaction excessive des autres secteurs a été décrite lorsque les signaux ont été partagés de manière anonyme. Des systèmes informatisés fonctionnant bien et non conviviaux ont été décrits, tout comme les obstacles juridiques au partage des données.

Une affiche de Thomas Haverkamp, de l'institut vétérinaire norvégien, a expliqué detection de Campylobacter dans la production de poulets à l'aide d'une analyse métagénomique de prélèvements d'air. Les résultats ont montré que la détection de Campylobacter était possible en utilisant la métagénomique shotgun de prélèvements de filtres à air.

Laura C. Gonzalez Villeta, de l'Université du Surrey, avait une affiche sur la compréhension de l'association entre les paramètres météorologiques les plus influents - à l'exception de la température - et l'incidence de la salmonellose.

Comprendre pourquoi l'incidence de Salmonella est conditionnée à certaines variables météorologiques aurait des applications pratiques en santé publique. Les chercheurs utiliseront des modèles et développeront un outil pour prédire la probabilité d'infection en fonction des variations météorologiques connues avant qu'une infection ne se produise.

Pikka Jokelainen, du SSI au Danemark, fait partie du projet TOXOSOURCES sur le parasite Toxoplasma gondii qui se poursuivra jusqu'en 2022. Le consortium examinera les contributions de différentes sources, telles que la viande et les produits réfrigérés prêts à consommer dans l'infection à Toxoplasma gondii afin d'obtenir les estimations les plus fiables possibles pour informer les gestionnaires de risques et les décideurs.

Une affiche de Beata Lachtara, de l'Institut national de recherche vétérinaire, a donné un aperçu de la présence de Listeria monocytogenes isolé d'aliments et de l'environnement associé à la production en Pologne.

Les 138 souches de Listeria analysées ont été collectées de 2013 à 2019 dans des environnements alimentaires, de viande crue et de production d'aliments prêts à consommer en Pologne. Les résultats ont montré que la structure de la population de Listeria était diverse. Sept types de séquences différents ont été identifiés parmi les souches testées qui ont été regroupées en trois complexes clonaux.