Des scientifiques évaluent une méthode de détection plus rapide de Listeria

Eva Wagner est de train pipeter des échantillons d'ADN avec l'aide d'un séquenceur de MinION. Eva est post-doc dans le projet de recherche Path Seq. Photo Jon-Are Berg-Jacobsen, Nofima

«Des scientifiques évaluent une méthode de détection plus rapide de Listeria», source Food Safety News et complété par mes soins.

Des chercheurs norvégiens ont établi et évalué une méthode plus rapide pour détecter Listeria monocytogenes.

Des scientifiques de Nofima ont découvert qu'il était possible de détecter Listeria dans un échantillon après seulement quatre heures d'enrichissement à l'aide d'un appareil de séquençage portable appelé MinION d'Oxford Nanopore Technologies. C'est 20 heures plus rapide que la méthode d'enrichissement traditionnelle pour rechercher le pathogène.

Cependant, l'analyse n'est pas quantitative et ne permet pas de discriminer entre les bactéries vivantes et mortes.

D'autres micro-organismes de l'environnement de transformation peuvent être détectés en même temps lors de l'utilisation de l'approche de séquençage. C'est rentable et cela fournit des informations sur l'image microbiologique plus large dans une usine de production alimentaire, ont dit les chercheurs.

Les scientifiques ont utilisé sept types différents de séquences de Listeria monocytogenes isolés d'environnements de transformation de la viande avec et sans microbiote de fond tels que d'autres espèces de Listeria et des souches non-Listeria, selon l'étude publiée dans la revue de l’ASM, Applied and Environmental Microbiology. L’article est disponible en intégralité.

Résultat rapide nécessaire

Eva Wagner, de Nofima, a déclaré que l'équipe avait étudié et comparé différentes technologies de séquençage pour obtenir des résultats plus rapides sur la présence ou l'absence de Listeria dans un échantillon.

«Nous voulions également savoir si la méthode de séquençage est capable de différencier des types distincts de Listeria. Un résultat indiquant si Listeria était ou non présent dans un échantillon devrait idéalement être fourni avant le début de la journée de travail suivante afin que des contre-mesures soient mises en œuvre. Il est particulièrement important que les équipements et les surfaces, sur lesquels Listeria a été détectée, aient été soigneusement nettoyés et désinfectés», a-t-elle dit.

La méthode traditionnelle d'enrichissement pour détecter Listeria monocytogenes consiste à cultiver un échantillon prélevé dans l'environnement de transformation ou un produit alimentaire dans un milieu sélectif qui favorise la croissance de la bactérie.

Ce processus peut prendre de 24 heures à plusieurs jours pendant que la production se poursuit. Cela signifie que les produits alimentaires peuvent être contaminés et que les personnes peuvent être infectées par Listeria pendant le processus de l’analyse.

La chercheuse de Nofima, Birgitte Moen, a dit que la prochaine étape consiste à collecter des prélèvements de l'industrie et de tester la méthode avec eux.

Fournir plus de détails

Les producteurs de denrées alimentaires peuvent recevoir des résultats indiquant si Listeria a été détectée ou non dans l'échantillon, mais la méthode actuelle n'est pas toujours en mesure de faire la distinction entre des souches de Listeria similaires.

L'utilisation du séquençage Illumina MiSeq a permis aux scientifiques de prédire la présence de souches coexistantes de Listeria monocytogenes.

L'application systématique de l'approche pourrait conduire à des actions de l'industrie qui préviennent la contamination et les rappels ultérieurs et la destruction d'aliments, les pertes économiques et de réputation et les cas de listériose.

«De nouvelles technologies de séquençage sont utilisées pour déterminer le code génétique (ADN) et ainsi identifier les micro-organismes. Cela rendra les opérations de contrôle étendues d'aujourd'hui dans l'industrie alimentaire plus rapides, plus précises et plus rentables», a déclaré Annette Fagerlund.

Fagerlund est chercheur à Nofima et dirige PathoSeq, un projet de trois ans qui se déroule jusqu'en mars 2023. L'objectif est d'aider les producteurs alimentaires norvégiens à établir des contrôles de routine plus rapides, plus rentables et ciblées pour les pathogènes d'origine alimentaire.

Un autre projet Nofima, appelé Future Food Control, étudie la sécurité des aliments, la réduction du gaspillage alimentaire et l'utilisation d'emballages en plastique.

Il court jusqu'à la fin de 2024 et implique le suivi de la source des pathogènes, des bactéries et des moisissures d’altération dans les installations de production et des mesures correctives efficaces en mettant l'accent sur le poulet cru et les aliments périssables à base de plantes.

Les systèmes d'emballage et les conditions de stockage seront évalués à l'aide de matériaux d'emballage recyclés ou renouvelables sans compromettre la sécurité, la durée de conservation ou avoir un impact négatif sur les déchets alimentaires.

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