samedi 22 janvier 2022

Surveillance et caractéristiques des épidémies d'origine alimentaire aux Pays-Bas, 2006 à 2019

Nombre d'épidémies d'origine alimentaire (n = 5 657) et de cas humains associés (n = 27 711) par an, Pays-Bas, 2006-2019

«Surveillance et caractéristiques des épidémies d'origine alimentaire aux Pays-Bas, 2006 à 2019», source Eurosurveillance.

Le but de cette étude est de décrire les caractéristiques des épidémies d'origine alimentaire enregistrées entre 2006 et 2019 aux Pays-Bas afin de fournir une meilleure compréhension des épidémies d'origine alimentaire et d'orienter les efforts pour contrôler, réduire et prévenir les futures maladies d'origine alimentaire.

Discussion
Douze années de données provenant de trois voies de surveillance ont été utilisées pour une analyse descriptive sur le long terme des épidémies d'origine alimentaire aux Pays-Bas. La majorité des foyers ont été enregistrés à la NVWA (Autorité de sécurité des aliments) par des citoyens. Un nombre beaucoup plus faible de foyers de cas ont été notifiés par le Public Health Service (PHS); cependant, puisque ceux qui ont signalé l'éclosion étaient des professionnels de la santé, comme des médecins et des microbiologistes, les chances de détecter un pathogène étaient beaucoup plus grandes. Une augmentation importante des épidémies signalées a été observée depuis 2015, lorsque les critères de déclaration ont été élargis pour inclure les épidémies enregistrées par la NVWA dans lesquelles aucun échantillon d'aliment n'a été prélevé. Bien que les critères aient été élargis pour réduire la sous-déclaration, les détails de ces foyers supplémentaires étaient limités, en particulier lorsque les sources n'étaient pas confirmées.

L'exploration des tendances par pathogène n'a pas été affectée par les modifications des critères de déclaration, bien que seul le nombre annuel d'épidémies causées par norovirus, Salmonella et Campylobacter ait été suffisamment élevé pour être analysé. L'accent mis sur l'enregistrement et les développements analytiques des épidémies de virus à partir de 2012 a conduit à une augmentation des rapports sur les épidémies à norovirus, en particulier celles avec des prélèvements positifs. La plus grande épidémie d'origine alimentaire enregistrée aux Pays-Bas s'est produite en 2012, causée par Salmonella Thompson dans le saumon fumé. Sur la base des 1 149 cas signalés, il a été calculé que plus de 21 000 personnes avaient été infectées, avec un coût total estimé de l'épidémie de 7,5 millions d'euros, dont 6,8 millions d'euros pour le coût de la maladie. Étonnamment, après cette grande épidémie, le nombre d'épidémies à Salmonella a chuté de manière significative sans raison évidente. Jusqu'en 2012, une diminution des cas a également été observée dans la surveillance du laboratoire sentinelle Salmonella, mais suivie d'une stabilisation par la suite. Pour Campylobacter, une diminution des cas dans la surveillance du laboratoire sentinelle a été observée depuis 2014, bien que cette diminution semble plus importante dans le nombre d'épidémies que dans le nombre total de cas.

Une grande partie des épidémies à norovirus ont été identifiées par des prélèvements environnementaux positifs, étayés par la présence de norovirus confirmé dans les cas ou des symptômes signalés indiquant la présence de norovirus. La présence de norovirus sur des ustensiles et des surfaces peut indiquer un manipulateur d'aliments infecté qui a contaminé les aliments pendant la préparation en raison de défauts dans les mesures d'hygiène. Néanmoins, la transmission de personne à personne ne peut être exclue dans ces cas. Dans les épidémies confirmées à norovirus à véhicule alimentaire, 21 des 27 épidémies étaient liées aux coquillages. Le point de contamination des coquillages par des virus se situe très probablement dans la zone d'élevage des produits de la mer en raison de l'arrivée d'eaux usées. Les six autres épidémies à norovirus avec un véhicule alimentaire confirmé étaient plus susceptibles d'avoir été causées par des manipulateurs d'aliments infectés. Les épidémies à Salmonella avec un véhicule alimentaire confirmé étaient très probablement liées à de la viande rouge, des œufs (tous S. Enteritidis), à de la viande de volaille et des produits laitiers, conformément aux principaux réservoirs de Salmonella et comme indiqué dans les aperçus des épidémies d'origine alimentaire dans d'autres pays du monde. Une différence notable entre Campylobacter par rapport à Salmonella et norovirus était le nombre de cas par épidémie, qui était beaucoup plus faible dans les épidémies à Campylobacter. Des différences similaires dans le nombre de cas par épidémie pour ces pathogènes ont été signalées en Nouvelle-Galles du Sud, en Australie et aux États-Unis, alors qu'au Royaume-Uni, le nombre moyen de cas par éclosion ne différait pas de manière significative pour Salmonella et Campylobacter. Une explication des épidémies plus petites pourrait être l'absence de croissance de Campylobacter dans les aliments, contrairement à Salmonella. Ce n'est que dans une petite partie des épidémies à Campylobacter qu'un produit alimentaire a pu être confirmé, dans lequel les produits laitiers (lait cru/fromage au lait cru) et la volaille étaient les plus importants. Une étude d'attribution a estimé que 66% des infections humaines à Campylobacter aux Pays-Bas provenaient de poulets, 21% de bovins, 3% de moutons et 0,3% de porcs. Aux États-Unis, Angleterre et Pays de Galles, où un plus grand nombre d'épidémies à Campylobacter ont été enregistrées, la volaille, les produits laitiers, l'eau et les aliments composés étaient les sources les plus pertinentes.

Les bactéries productrices de toxines, S. aureus, C. perfringens et, en particulier, B. cereus étaient d'autres pathogènes principaux dans les épidémies d'origine alimentaire confirmées. Ces bactéries ont été détectées dans tous les groupes d'aliments, sauf le poisson, mais avec une préférence pour les aliments composés et les céréales/pâtes/riz. B. cereus est omniprésent dans l'environnement et les produits alimentaires, S. aureus se trouve généralement sur la peau et dans le conduit nasal et C. Perfringens existe dans le sol, la flore intestinale et les animaux. Une gestion inadéquate de la température, comme un refroidissement lent ou inadéquat et le stockage des produits alimentaires à des températures élevées entre 10°C et 60°C, peut permettre la multiplication des bactéries et la production de toxines. Une mauvaise hygiène et un nettoyage inadéquat pourraient introduire une contamination des produits à n'importe quelle étape, de la production primaire jusqu'au service des aliments. Le nombre de cellules viables de B. cereus peut être réduit lorsqu'un produit a été réchauffé, éliminant ainsi les bactéries. Cependant, les toxines déjà présentes avant le réchauffage resteront et peuvent provoquer des maladies. Bien que la majorité des épidémies d'origine alimentaire causées par B. cereus présentent des concentrations supérieures à 100 000 ufc/g dans le produit contaminé, des épidémies avec des concentrations comprises entre 1 000 et 100 000 ufc/g ont également été signalées. Dans les présentes analyses, les épidémies dont le nombre est inférieur à 100 000 ufc/g pour B. cereus, C. perfringens ou S. aureus ont été classées comme ‘agent causal inconnu’. Cela aurait pu conduire à une sous-estimation des épidémies causées par ces bactéries productrices de toxines, car 55 autres épidémies se situaient entre 1 000 et 100 000 ufc/g; cela comprend 39 épidémies dans lesquelles B. cereus a été retrouvé dans un produit alimentaire, six épidémies avec C. perfringens, huit avec S. aureus et deux avec B. cereus et C. perfringens ou S. aureus (données non présentées). La maladie due à ces bactéries productrices de toxines, qui est symptomatiquement similaire, a été rarement confirmée dans les cas, car elle est généralement de courte durée et spontanément résolutive. Cela entraîne un déficit de diagnostic, car les cas recherchent rarement des soins médicaux et aucune analyse de laboratoire n'est effectuée.

La majorité des foyers ont été enregistrés par la NVWA et ont principalement pour cadre des restaurants, des épiceries fines et des cafétérias. Cela pourrait indiquer que, lors d'une inspection par l'autorité de sécurité des aliments, les inspecteurs devraient vérifier si les exigences pertinentes pour la manipulation et la préparation des aliments sont respectées. D'autre part, ces épidémies sont principalement signalées par des citoyens et n'ont souvent pas été confirmées par le pathogène. Dans les épidémies dans lesquelles l'agent pathogène a été confirmé dans les cas, nos données indiquent que le pourcentage global de lieux de restauration publics était plus faible et que les maisons privées étaient également un lieu d'épidémies. Une tendance à détecter ou à signaler une épidémie dans un lieu de restauration public plus fréquemment qu'à domicile ne peut donc pas être exclue.

La contamination des aliments peut se produire à tout moment, de la ferme à la table. Les épidémies avec écouvillons environnementaux positifs et celles causées par les trois bactéries productrices de toxines, principalement présentes dans les produits composés et les céréales/pâtes/riz, étaient très probablement le résultat d'une hygiène, d'une manipulation, d'un stockage et d'une préparation inadéquats dans la dernière étape avant la consommation. Les coquillages (norovirus, virus de l'hépatite A), la viande rouge (Salmonella, STEC), les œufs (Salmonella), les produits laitiers (Campylobacter, Salmonella) et les fruits et légumes (Salmonella, STEC, virus de l'hépatite A) sont les produits les plus susceptibles d'être contaminés pendant le processus de fabrication. Le risque d'infection des personnes survient lorsque ces produits sont consommés crus ou insuffisamment cuits, car un chauffage approfondi réduirait ou éliminerait les agents pathogènes. Des normes de production élevées, y compris des mesures de maîtrise, doivent être en place pour réduire le risque. Même lorsque certains aliments, par ex. de la viande rouge ou de la volaille, sont consommés après une cuisson à cœur, une mauvaise manipulation des aliments pendant la préparation pourrait entraîner une contamination croisée et donc des maladies. Cependant, dans notre étude, le moment de la contamination n'a pas pu être analysé avec les informations actuelles.

De plus, l'agent pathogène à l'origine de la maladie est resté inconnu dans la majorité des épidémies (88,2 %), conformément aux observations de la Nouvelle-Galles du Sud, Australie. Plusieurs facteurs contribuent à cet écart. Premièrement, la plupart des agents pathogènes ont une période d'incubation d'au moins plusieurs jours. Souvent, les restes des aliments en cause ne seront plus disponibles pour les analyses lorsque les symptômes de la maladie apparaissent et sont signalés. Ceci est amplifié lorsque la notification est effectuée après la détection de l'agent pathogène dans les cas, car l'analyse peut prendre plusieurs jours. La probabilité que le lot de l'aliment en cause ne soit plus disponible augmente avec l'augmentation de la fenêtre temporelle. De plus, la période d'incubation introduit un biais de rappel, qui pourrait conduire à la désignation incorrecte d'un certain aliment comme produit alimentaire potentiellement contaminé, en particulier dans les petites épidémies avec des cas, c'est-à-dire des membres d'un ménage, qui partagent plus d'un aliment commun. Cette situation est exacerbée par l'inclusion des épidémies signalées à la NVWA directement par les citoyens. Une autre possibilité est que l’aliment ait été supposée être la source de l'infection, mais qu'elle ait en réalité été causée par une propagation de personne à personne.

L’aliment est produit et transporté dans le monde entier. Lorsqu'un produit alimentaire est contaminé au début de la chaîne de production alimentaire, les cas peuvent se propager sur une vaste zone géographique. Un système national de surveillance y compris les données de séquence des isolats offre la possibilité de suivre les différentes souches observées dans le pays et de détecter même de petits cas groupés qui se propagent à l'échelle nationale. De tels systèmes de surveillance en laboratoire basés sur les agents pathogènes sont développés pour Salmonella, L. monocytogenes, STEC et le virus de l'hépatite A aux Pays-Bas, ce qui a conduit à l'identification de plusieurs épidémies nationales qui, autrement, n'auraient pas été vues du tout ou n'auraient pas été détectées avant longtemps à un stade ultérieur. Un système de surveillance basé sur les isolats est actuellement développé pour Campylobacter, qui montre une incidence élevée stable ainsi qu'une charge de morbidité, indiquant que les efforts visant à réduire ce pathogène lors de la production primaire ou pendant la phase de manipulation et de transformation ne sont pas efficaces. L'identification de ces cas gtoupés nationaux augmente les possibilités d'études cas-témoins et de recherche des sources grâce auxquelles les sources potentielles peuvent être identifiées et éventuellement éliminées, réduisant ainsi la charge de morbidité. De plus, le système national actuellement en place offre également la possibilité de communiquer avec d'autres pays voisins pour déterminer si une épidémie est observée à l'échelle internationale. Dans certains cas, cela peut même conduire à une enquête conjointe, comme cela s'est produit avec plusieurs épidémies dans notre aperçu, par ex. STEC dans la laitue avec l'Islande. Salmonella Newport dans les germes de soja avec l'Allemagne et Salmonella Enteritidis dans les œufs dans le cadre d'une enquête européenne conjointe.

Conclusion
L'utilisation de différentes voies pour surveiller les épidémies d'origine alimentaire aide à mieux comprendre la survenue de ces épidémies. PHS enregistre les épidémies locales, les systèmes nationaux de surveillance spécifiques à une maladie détectent les épidémies dispersées sur une zone plus vaste et les citoyens signalent les épidémies qui, autrement, auraient été manquées. L'analyse de 12 années d'épidémies d'origine alimentaire révèle la persistance de ces épidémies aux Pays-Bas. Une multiplicité d'agents pathogènes peut provoquer des maladies via une vaste gamme de produits alimentaires, ce qui complique le contrôle et l'élimination des maladies d'origine alimentaire. La contamination pendant le processus de production, la consommation de produits crus et une mauvaise hygiène, manipulation, stockage et préparation sont les principaux facteurs sous-jacents qui pourraient être traités pour réduire le nombre d'épidémies d'origine alimentaire. Dans l'ensemble, norovirus, Salmonella et Campylobacter semblaient être les agents pathogènes les plus répandus liés aux épidémies d'origine alimentaire. De plus, des liens spécifiques ont été observés entre les agents pathogènes et les denrées alimentaires. Ces résultats guideront les futures enquêtes sur les épidémies afin de concentrer la recherche sur la source dans la mesure du possible.

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