De nouveaux tests détectent les sérotypes de Salmonella en quelques minutes

« De nouveaux tests détectent les sérotypes de Salmonella en quelques minutes », source communiqué de l’Universityof New South Wales (UNSW) du 28 avril 2020.

Des chercheurs de l'UNSW ont créé de nouveaux tests ADN pour accélérer la détection de Salmonella et, à l'avenir, identifier la source d'épidémies d'intoxication alimentaire.

Des chercheurs de l'UNSW Sydney ont développé une série de tests ADN précis et hautement sensibles qui peuvent identifier les cinq sérotypes de Salmonella les plus courants en Australie.

Salmonella est l'une des causes les plus fréquentes de maladies d'origine alimentaire dans le monde, y compris en Australie.

Ces nouveaux tests détectent rapidement l'ADN en huit minutes et fonctionnent à température constante, contrairement à d'autres méthodes qui nécessitent un équipement spécialisé pour le cycle de température.

En attendant d'autres recherches, les scientifiques affirment que leurs tests pourraient aider les laboratoires de santé publique et de l'industrie à freiner la propagation des épidémies à Salmonella à l'avenir.

L’étude, Highly Sensitive and Specific Detection and Serotyping of Five Prevalent Salmonella Serovars by Multiple Cross-Displacement Amplification, publiée dans The Journal of Molecular Diagnostics, surmonte la méthode de la culture bactérienne traditionnelle coûteuse et laborieuse et ouvre la voie à des tests accélérés directement à partir d'échantillons.

L'auteur principal, le professeur Ruiting Lan, de l'École de biotechnologie et des sciences biomoléculaires de l'UNSW, a dit que les nouveaux tests pourraient jouer un rôle essentiel dans le traçage rapide et précis de l'origine des futures infections à Salmonella.

« Il est essentiel pour les enquêteurs en santé publique d'avoir un moyen simple et rapide de rechercher l’origine des épidémies à Salmonella - ainsi, la capacité de tester différents sérotypes de Salmonella est importante », a déclaré le professeur Lan.

« Salmonella, que ce soit dans un échantillon clinique ou alimentaire - même dans des matières fécales - peut exister en quantités infimes et nécessite des méthodes très sensibles pour être détectées. »

« Notre méthode améliorée d'amplification par déplacements multiples croisés (MCDA pour Multiple Cross Displacement Amplification) peut détecter de minuscules quantités d'ADN rapidement et à température constante, ce qui en fait un excellent choix pour un test de détection bactérienne simple, rapide et sensible. »

« Il s'agit d'une nette amélioration par rapport au test MCDA existant pour Salmonella qui ne fait pas de distinction entre les différents sérotypes de Salmonella. »

Sérotypes courants de Salmonella

En 2017, plus de 16 000 cas d'intoxication à Salmonella ont été rapportés en Australie - une augmentation de 30% par rapport à la moyenne décennale précédente - alors que le taux est estimé à 185 cas pour 100 000 personnes, par an.

Cinq sous-types de Salmonella, appelés sérotypes, ont causé plus de 85% des infections en 2017.

Le premier auteur Xiaomei Zhang, en PhD à l'UNSW, a déclaré que la nouvelle méthode de détection peut identifier les cinq sérotypes les plus courants de Salmonella et sera cruciale pour aider à maîtriser la propagation de l'infection pendant les épidémies.

« Des milliers de sérotypes de Salmonella existent, mais nous avons développé et évalué sept tests MCDA pour la détection et la différenciation rapides des cinq sérotypes de Salmonella les plus courants en Australie: S. Typhimurium, S. Enteritidis, S. Virchow, S. Saintpaul et S. Infantis », A déclaré Zhang.

« Il est important de pouvoir détecter les différents sérotypes, car certains sont plus susceptibles d'être associés à des infections locales tandis que d'autres sont plus susceptibles d'être associés à des cas importés. »

« De plus, au moins deux de ces sérotypes - S. Typhimurium et S. Enteritidis - sont également les sérotypes de Salmonella les plus répandus dans le monde. Ainsi, nos recherches sont applicables à d'autres régions et pays. »

« Un autre avantage est le fait que nos tests ne nécessitent pas d'équipement de détection spécialisé, simplifiant ainsi une future application en milieu clinique ou industriel. »

Des tests à l'épreuve du temps

Le professeur Lan a déclaré que les nouveaux tests ADN développés dans l'étude étaient uniques car les marqueurs génétiques utilisés ont été sélectionnés à partir de l'analyse de milliers de génomes de Salmonella.

« Ces marqueurs sont spécifiques aux sérotypes donnés et donc à l'épreuve du temps de nos nouveaux tests, car le sérotypage traditionnel basé sur la culture est en voie d'élimination », a-t-il déclaré.

Le professeur Lan a déclaré que l'équipe était impatiente de poursuivre ses recherches par des essais sur le terrain.

« Les performances des tests MCDA justifient une validation supplémentaire - donc, il reste du travail à faire », a-t-il dit.

« Le test a été développé en utilisant des cultures pures. Il devra être validé à l'aide d'échantillons dans les milieux de la santé, de l'environnement et de l'industrie alimentaire. »

« Il est difficile de savoir quand nos tests deviendront disponibles, mais ils font partie de la tendance mondiale vers des tests de diagnostic indépendants de la culture qui peuvent identifier les bactéries causant une maladie d'origine alimentaire sans avoir besoin de cultiver les bactéries dans un laboratoire. »

« En fin de compte, nos tests pourraient être utilisés dans le diagnostic clinique pour déterminer les sérotypes courants qui causent la salmonellose, pour analyser les tendances des sérotypes pour la surveillance de la santé publique, et ils pourraient également avoir une application dans l'industrie alimentaire. »