vendredi 7 février 2020

Séroprévalence du virus de l'hépatite E chez les donneurs de sang en Corse


Voici une étude sur la séroprévalence du virus de l'hépatite E chez les donneurs de sang en Corse

Référence
Capai Lisandru, Hozé Nathanaël, Chiaroni Jacques, Gross Sylvie, Djoudi Rachid, Charrel Rémi, Izopet Jacques, Bosseur Frédéric, Priet Stéphane, Cauchemez Simon, de Lamballerie Xavier, Falchi Alessandra, Gallian Pierre. Seroprevalence of hepatitis E virus among blood donors on Corsica, France, 2017Euro Surveill. 2020;25(5):pii=1900336. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.5.1900336

Contexte
Avec une population de 338000 habitants en 2018, la Corse est une grande île française (8680 km2) située en mer Méditerranée dans le sud-est de la France métropolitaine. Le but de l'étude était d'étudier la séroprévalence du virus de l'hépatite E (VHE) chez des donneurs de sang volontaires de Corse, une zone considérée comme une zone de forte prévalence et d'évaluer le niveau d'immunité de la population ainsi qu'une analyse fine de la prévalence dans les districts corses.

Discussion
En 2011 et 2012, une enquête nationale (utilisant le test Wantai) a identifié une hétérogénéité géographique dans la distribution du statut sérologique des IgG anti-VHE chez les donneurs de sang volontaires en France métropolitaine, et la Corse faisait partie des zones où la séroprévalence était la plus élevée enregistrée (62 %).

Figatelli
Le ficatellu, une saucisse locale de foie de porc, a été officiellement identifié comme une source de contamination d'origine alimentaire par le VHE, mais l'impact réel de la consommation de ficatellu sur l'épidémiologie du VHE est inconnu et d'autres sources potentielles de contamination restent à explorer. Ici, nous avons terminé l'étude susmentionnée en effectuant une analyse spécifique d'un nouvel échantillon plus important de donneurs de sang corse.

Entre septembre 2017 et janvier 2018 (période sans activité touristique importante), nous avons recruté 2 705 donneurs de sang résidant en Corse dont 1 518 (56,1%) testés positifs pour les IgG anti-VHE. Cela a confirmé la forte endémicité du VHE en Corse.

D'autres zones à forte prévalence ont été identifiées en Europe à l'aide du même test IgG anti-VHE, à savoir le centre de l'Italie (région des Abruzzes, 49%) [46] et le sud-ouest de la France (région Midi-Pyrénées, 52,5%).

L'analyse des données brutes indique que la séroprévalence du VHE est plus élevée chez l'homme, constat qui a été précédemment décrit dans l'analyse univariée mais non multivariée, et également plus élevé chez les individus nés en Corse. Il a été précédemment proposé que ces différences puissent s'expliquer par des facteurs sociologiques (profession spécifique, chasse, etc.), mais il n'existe à ce jour aucune explication factuelle qui tienne compte de la forte prévalence générale chez les hommes et les femmes et également de la différence entre les sexes.

L'association entre l'antigène des leucocytes humains (HLA) ou les antigènes des groupes sanguins et les maladies infectieuses a été documentée dans la littérature mais, à notre connaissance, n'a jamais été étudiée pour l'infection par le VHE. Ici, nous n'avons pas identifié un tel lien entre les groupes sanguins ABO, Rhésus et Kell et la présence d'anticorps anti-HEV.

Les titres d'anticorps sont généralement faibles, avec 77,2%, 81,6% et 85,9% des donneurs ayant des titres d'IgG anti-VHE inférieurs à 5, 7 et 10 UI/mL, respectivement. La séroprévalence augmente avec l'âge, sauf chez les personnes de plus de 60 ans environ. Dans nos modèles, ce dernier peut s'expliquer soit par une force infectieuse variable avec l'âge (mais cela n'est pas étayé à ce jour par des informations épidémiologiques ou sociologiques) ou par une perte d'anticorps spécifiques dans le temps. Des études antérieures ont montré que les taux d'anticorps diminuent avec le temps et chez certains sujets, les IgG anti-VHE peuvent disparaître après un suivi variant entre 1 et 22 ans. Une étude récente auprès de donneurs de sang du centre de l'Italie utilisant le test Wantai a rapporté un taux de séroconversion VHE de 2,1 pour 100 personnes-années, du même ordre de grandeur (1,3-4,6/100 personnes-années) que ceux estimés avec nos modèles.

Notamment, la séroprévalence dans le groupe le plus jeune des donneurs de sang (18-27 ans) était plus de 10% plus élevée chez les personnes nées en Corse (environ 51%) que chez celles nées à l'extérieur (environ 39%). Cela se traduit par une force d'infection de 4,3% (IC 95% : 3,5–5,6) par an chez les natifs contre 2,8% (IC 95% : 2,5–3,2) par an chez les non-natifs dans le 'modèle de séroréversion'. Cependant, en l'absence de données épidémiologiques détaillées pour les individus de moins de 18 ans, la forme exacte de la courbe de séroconversion chez l'enfant et l'adolescent reste à établir. De toute évidence, l'identification des déterminants de l'exposition dans la population corse de moins de 18 ans est essentielle pour comprendre l'épidémiologie du VHE localement. Une comparaison de la séroprévalence du VHE mesurée ici (56,1%) avec les sérums archivés de donneurs de sang collectés en 2000 dans les deux départements de la Corse (53,3%; n = 90) (données non présentées) suggère que l'exposition au VHE a été stable en la population corse depuis au moins deux décennies. De plus, nous n'avons pas identifié de variation significative de la prévalence selon le district administratif de résidence. Dans l'ensemble, les informations épidémiologiques semblent converger vers une exposition potentielle commune et omniprésente à l'infection par le VHE pour les personnes vivant en Corse.

Le réservoir animal (principalement des porcs et des verrats) est consensuellement considéré comme une source majeure d'infection par le VHE chez l'homme [53,54]. Cependant, l'importance relative des voies de contamination directes (c'est-à-dire liées à la consommation de viande de porc et de sanglier) ou indirectes n'est pas claire. La contamination indirecte peut être liée à la transmission du virus par les mains ou des vecteurs passifs de transmission d'une maladie (fomites) mais également à l'eau potable contaminée. Des informations antérieures issues de l'étude nationale française ont identifié l'eau potable en bouteille comme facteur de protection contre l'infection, et dans la région rurale d'Auvergne (France métropolitaine centrale), l'eau du réseau public a été identifiée comme la source commune d'infection pour un groupe de sept cas humains, avec de l'ARN HEV détecté dans un puits privé qui a accidentellement contaminé le réseau public d'eau.

De plus, une étude récente en Suède a détecté des souches de génotype 3 du VHE dans l'eau du robinet et dans l'eau brute avant traitement. Par conséquent, à mesure que de nouvelles recherches sont mises en œuvre pour identifier les sources omniprésentes d'exposition au VHE en Corse, le rôle potentiel de l'eau potable dans la propagation de l'infection par le VHE devrait être étudié.

Conclusion
Notre étude confirme que la Corse est une zone d'endémie élevée pour l'infection par le VHE, avec une exposition homogène dans les différents quartiers géographiques. La séroprévalence augmente avec l'âge jusqu'à 60 ans et est plus élevée chez l'homme que chez la femme. Notre étude a identifié trois domaines prioritaires pour des investigations complémentaires sur la Corse.

Premièrement, l'épidémiologie dans le groupe d'âge plus jeune (moins de 18 ans) est essentiellement inconnue en l'absence de données biologiques et devrait être explorée plus avant.
Deuxièmement, les sources courantes de contamination, en particulier l'eau potable, méritent des études complémentaires car le VHE peut être trouvé dans les fèces et les eaux usées et la Corse est une région où l'infection des porcs et des verrats est fréquente. Le réservoir d'animaux, les eaux usées et la contamination potentielle du réseau public d'eau peuvent être étudiés.
Troisièmement, la forte proportion de donneurs ayant un faible titre d'anticorps anti-VHE soulève des questions sur la protection offerte par les anticorps IgG et sur la sensibilité à une infection secondaire par le VHE.

Saga Alim'confiance : Une fiction en France mais aussi en Guadeloupe


Le ministère de l'agriculture nous propose une fiction le 6 février 2020 « Comment est garantie la sécurité sanitaire en France ? Du contrôle à Alim'confiance, illustration du dispositif en Guadeloupe »
Le site Alim’confiance répertorie les résultats des contrôles sanitaires effectués par l’administration dans le secteur alimentaire. Annie-Claude Tabar, inspectrice en sécurité sanitaire des aliments à la Direction de l'Alimentation, de l'Agriculture et de la Forêt de Guadeloupe, présente sa mission en vidéo.

On apprend ainsi,
En métropole tout comme dans les Départements et régions d'outre-mer, de nombreux contrôles officiels ont lieu pour assurer la sécurité sanitaire. Ces contrôles se déroulent dans les établissements de la chaîne alimentaire (restaurants, commerces de bouche, restauration collective...) en deux temps :
  • un contrôle documentaire ;
  • un contrôle physique.
Lors de cette dernière phase, l'inspecteur vérifie notamment que le personnel de l'établissement suit les règles d'hygiène ainsi que les locaux.
Les résultats de l'inspection sont ensuite disponibles sur Alim'confiance. Lancé en mars 2017, ce site internet et cette application mobile permettent de les consulter librement.


Par ailleurs, sauf erreur de ma part, il n'y a aucune entreprise ou restaurant référencé en provenance de Guadeloupe sur le site Alim'confiance … à la date de l'écriture de cet article.

Rappelons qu'au bout d'un an, le nom des entreprises ou restaurants, etc. disparaît d'Alim'confiance … étrange système !

Malheureusement, à la date du 7 février 2020, ce ne sont pas « Plus de 40 000 résultats d'inspection ont été rendus public ... » que nous avons, mais seulement autour de 30 000 !

Vous pouvez vérifier en additionnant les données ci-dessous sur cette capture d'écran … et nous n'obtenons que 30 404 résultats très loin des plus de 40 000 résultats…, étonnant, non ?

États-Unis : Un nouveau virus bovin associé à des rhumes de cerveau et à des infections des sinus


« Aux États-Unis, un nouveau virus bovin associé à des rhumes de cerveau et à des infections des sinus », source article de Dan Flynnparu le 7 février 2020 dans Food Safety News.

Le kobuvirus bovin, un virus bovin découvert pour la première fois au Japon en 2003, est arrivé aux États-Unis.

L'arrivée est rapportée dans la revue médicale Emerging Infectious Diseases. Le kobuvirus bovin ou BKV appartient à la famille des virus qui provoquent des rhumes de cerveau et des infections des sinus chez l'homme.

Le BKV semble être la plus récente des zoonoses, c'est-à-dire celles causées par des infections qui peuvent se propager entre les animaux et les humains.

Des recherches de l'Université de l'Illinois (UI) sur la mort de deux veaux ont conduit à la découverte du BKV aux États-Unis. Les intestins de veaux ont été soumis à un échantillonnage et à un séquençage d'ADN microbien qui les ont liés au virus au Japon.

Depuis qu'ils ont été signalés pour la première fois au Japon par les Centers for Disease Control and Prevention il y a 17 ans, des rapports sur le BKV sont venus de Thaïlande, Hongrie, Pays-Bas, Corée, Italie, Brésil, Chine et Égypte.

Le CDC dit que la prévalence du BKV aux États-Unis « reste inconnue », et la découverte de l'Université de l'Illinois signifie qu'il y a un besoin de « surveillance continue ». Le besoin est maintenant de déterminer le taux et la distribution du BKV en Amérique du Nord.

On ne sait pas si le BKV est strictement une zoonose ou s'il pourrait se propager à l'homme. La forme de kobuvirus chez l'homme est appelée « virus d'Aichi » et elle provoque une « gastro-entérite aiguë ». Les kobuvirus peuvent être transmis par voie fécale-orale ou par la consommation d'aliments contaminés.

Leyi Wang de l'UI, professeur de médecine clinique vétérinaire, a dirigé la recherche sur le kobuvirus bovin sur le sol américain.

Les maladies zoonotiques concernent à la fois le CDC et le Service d'inspection zoosanitaire et phytosanitaire (APHIS) de l'USDA. L'unité USDA a été principalement à l'affût de la maladie virale hautement contagieuse et mortelle appelée peste porcine africaine (PPA).

Depuis son émergence en Afrique dans les années 1920, la PPA est devenue courante dans certaines parties de l'Asie et de l'Europe, mais l'Amérique du Nord est exempte de PPA.

Et la propagation en Chine du nouveau coronavirus (2019-ncoV) a des origines zoonotiques. « Les connaissances actuelles sont largement basées sur ce que l'on sait sur les coronavirus similaires », explique le CDC.

« Les coronavirus sont une grande famille de virus communs à de nombreuses espèces animales, notamment les chameaux, les bovins, les chats et les chauves-souris. Rarement, les coronavirus animaux peuvent infecter des personnes, puis se propager entre des personnes comme le MERS, le SRAS et maintenant avec le 2019-nCoV. »

Bis repetita, 50 nouveaux cas dans une flambée à Salmonella liée à des œufs de Pologne affectant 18 pays de l'UE



Même cause, même conséquence voici « 250 nouveaux cas dans une flambée à Salmonella liée à des œufs affectant 18 pays », source article de Joe Whitworth paru le 7 février 2020 dans Food Safety News.

Près de 250 nouvelles infections ont été enregistrées dans une épidémie à Salmonella dans plusieurs pays liée à des œufs de Pologne.

Le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) et l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) ont signalé qu'en janvier de cette année, 18 pays avaient signalé 656 cas confirmés et 202 cas probables depuis février 2017.

Il y a 385 cas confirmés historiquement et 413 cas probables historiques remontant à 2012, ce qui en fait la plus grande éclosion européenne à Salmonella Enteritidis jamais enregistrée. Cependant, les responsables de l'ECDC ont déclaré que l'ampleur réelle de l'épidémie était probablement sous-estimée.

Depuis la dernière mise à jour en novembre 2018, 248 nouveaux cas ont été signalés, dont 124 ont été confirmés, 36 probables, 42 infections confirmées et 46 probables.

Plus de 1600 personnes malades depuis 2012
La Belgique, Croatie, République tchèque, Danemark, Finlande, France, Grèce, Hongrie, Irlande, Italie, Luxembourg, Pays-Bas, Norvège, Pologne, Roumanie, Slovénie, Suède et le Royaume-Uni ont enregistré 1 656 cas d'infection depuis 2012. Le Royaume-Uni en a eu le plus avec 688 cas confirmés et probables, les Pays-Bas en ont eu 280, la Belgique 202 et la République tchèque 111.

Des informations sur l'hospitalisation sont disponibles pour 427 patients dans 12 pays et 136 ont nécessité un traitement hospitalier parmi les cas confirmés et confirmés historiquement. Deux cas historiques ont le décès confirmé, un enfant et un patient âgé, ont également été signalés.

Chaque année de 2016 à 2018, les cas épidémiques ont atteint un sommet en septembre, avec de grandes vagues signalées entre la fin du printemps et le début de l'automne. Une telle augmentation saisonnière n'a pas été observée en 2019.

Des investigations épidémiologiques, microbiologiques et de traçabilité des aliments ont lié des cas avant 2018 à des œufs provenant de fermes de poules pondeuses d'un consortium polonais.

Malgré les mesures de contrôle en 2016 et 2017, les fermes du consortium polonais étaient positives en 2018 et 2019 avec des souches épidémiques, suggérant une contamination persistante, selon les responsables. Les investigations sur la production de poules pondeuses et les chaînes d'approvisionnement en aliments pour animaux n'ont pas trouvé l'origine possible de la contamination.

L'une des souches épidémiques a été retrouvée de 2017 à 2019 dans la production primaire en Allemagne. Cette souche épidémique représente les deux tiers des cas confirmés.

Investigations au Royaume-Uni
En septembre 2018, un groupe de neuf cas confirmés a été associé à la consommation d'une boisson à base de blanc d'œuf liquide cru distribuée par le Dr Zak. Les échantillons positifs à Salmonella d'œufs blancs liquides prêts à consommer provenant de deux lots correspondaient à ceux de ces cas groupés épidémiques.

Les deux lots ont été produits par une société française. L'un a été produit avec des matières premières telles que du œuf blanc pasteurisé d'une entreprise espagnole. L'autre a utilisé des matières premières provenant de 13 fermes de poules pondeuses allemandes et de 11 fermes de poules pondeuses néerlandaises. Une investigation sur cette flambée a montré que des lots positifs ont été produits avec des œufs d'Espagne, des Pays-Bas et d'Allemagne, qui ont tous fourni des œufs exempts Salmonella à la société française.

Le même jour que la production de l'un des lots contaminés, un autre lot d'œufs liquides a été produit dans l'entreprise française avec des œufs fournis par un centre d'emballage polonais à partir d'une ferme de ponte polonaise appartenant au consortium polonais. Cependant, la possibilité de contamination croisée a été exclue en raison de la chaîne de production différente utilisée avec différents équipements: cuves, machine de remplissage et en raison du traitement thermique des produits conditionnés.

Des investigations au Royaume-Uni ont identifié 14 cas pouvant faire partie de l'épidémie se rendant à Chypre et séjournant au même endroit entre fin mai et fin juin 2018. Ce site a reçu des œufs d'une ferme de ponte polonaise via le centre d'emballage polonais et un grossiste néerlandais.

Action polonaise
Les mesures prises en 2016 et 2017, notamment le dépeuplement des troupeaux positifs, n'ont pas été suffisantes pour éliminer la contamination dans le consortium polonais. Ainsi, les élevages de poules pondeuses de ce groupe étaient toujours positifs pour les souches épidémiques en 2018 et 2019.

Entre août 2018 et décembre 2019, sept des 13 élevages de poules pondeuses polonaises échantillonnées appartenant au consortium polonais ont été testés positifs pour Salmonella Enteritidis. De novembre 2019 à janvier 2020, tous les troupeaux appartenant au groupe polonais ont été testés conformément au règlement 2160/2003 mais Salmonella n'a pas été détectée.

Les autorités polonaises ont signalé que tous les troupeaux positifs à Salmonella Enteritidis appartenant au consortium polonais étaient dépeuplés, y compris les troupeaux trouvés positifs en mai 2019. De 2015 à 2019, 16 élevages de poules pondeuses, dont 13 appartenaient au consortium polonais, étaient positifs pour au moins un des quatre adresses PSN (polymorphisme d'un seul nucléotide) provoquant des infections humaines. Quatre élevages appartenant à la société polonaise étaient positifs pour Salmonella Enteritidis entre janvier 2017 et juillet 2019.

Les responsables de l'ECDC ont déclaré que l'épidémie était toujours en cours et que davantage d'infections étaient attendues.

« Puisqu'aucune preuve n'a été fournie que la source de contamination a été éliminée, il est prévu que de nouvelles infections se produiront et que de nouveaux cas seront signalés dans les prochains mois. Des investigations supplémentaires sont nécessaires pour identifier la source de contamination. »

Rendez-vous l'année prochaine ou dans deux ans ... et il faut de nouveau saluer la transparence de l'information des autorités sanitaires en France ... on nous cache tout, on nous dit rien ?

Mise à jour du 13 février 2020. Au Luxembourg, on est informé comme le montre cet article du 13 février des autorités de sécurité des aliments de ce pays
Episode de toxi-infections alimentaires de Salmonella enteritidis liés aux œufs impliquant plusieurs pays. Évaluation rapide conjointe de l’ECDC et de l’EFSA.

Un épisode de cas de toxi-infections alimentaires, liés à des œufs, de Salmonella Enteritidis du même génome se poursuit déjà depuis plusieurs années dans de nombreux pays de l’Europe. En effet, entre 1 février 2017 et le 14 janvier 2020, 15 pays européens (EU/EEA) ont notifié 656 cas confirmés et 202 cas probables. Cet épisode de cas de toxi-infections alimentaires est également à relier à 385 cas confirmés identifié avant février 2017, impliquant en tout 18 pays européens. Le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) et l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) ont publié un rapport sur l’évaluation rapide conjoint de cet épisode .

Le Luxembourg est concerné par 8 cas de maladie identifiés dans le Laboratoire national de Santé. Vue que les œufs ou produits d’œufs contaminés ne se trouvaient pas sur le marché luxembourgeois, les autorités supposent que les infections sont liées à un séjour à l’étranger.

Les investigations épidémiologiques et microbiologiques ainsi que le traçage des aliments ont identifié la consommation d’œufs originaires d’une ferme en Pologne comme source. Mais même après l’implémentation de mesures correctives en 2016-2017, les fermes restent positives aux souches de Salmonelles concernées. Les investigations ciblées sur les productions de poules pondeuses et leurs aliments n’ont pas permis d’identifier la source de la contamination.

Cet épisode de cas de toxi-infections n’est pas encore terminé et vu qu’il n’y a pas encore confirmation de l’élimination de la source de contamination, le rapport conclut que les cas d’infections liées à la consommation d’œufs contaminés vont probablement encore se produire. 

NB : On serez en droit d'attendre une information en France ...

Culture de la sécurité des aliments dans la restauration commerciale aux Brésil


Voici un article paru dans Food Control qui va intéresser les adeptes de la culture de la sécurité des alimenst, et en particulier au Brésil, « Food safety culture in food services with different degrees of risk for foodborne diseases in Brazil » (Culture de la sécurité des aliments dans la restauration commerciale avec différents degrés de risque de maladies d'origine alimentaire au Brésil).

Faits saillants
  • Tous les éléments de la culture de la sécurité sanitaire des aliments présentaient une cohérence interne raisonnable
  • La culture de la sécurité des aliments a été améliorée dans les restaurants à faible risque de maladies d'origine alimentaire
  • L'engagement organisationnel était mieux perçu dans les restaurants à faible risque
  • Tous les manipulateurs d'aliments étaient optimistes quant au risque de maladie d'origine alimentaire
Résumé
La culture de la sécurité des aliments peut créer un environnement propice à une manipulation et un management adéquats des aliments, réduisant ainsi les non-conformités à la réglementation en matière de sécurité des aliments, en particulier celles liées aux flambées de maladies d'origine alimentaire.

Cette étude visait à évaluer les différences entre les éléments de la culture de la sécurité des aliments dans la restauration commerciale à risque faible ou élevé de maladies d'origine alimentaire.

Cette étude a été menée auprès de 63 managers et 333 manipulateurs d'aliments dans 32 restaurants commerciaux situés dans la région métropolitaine de Campinas, État de São Paulo, Brésil.

Les éléments suivants de la culture de la sécurité des aliments (en considérant des voies techniques, managériales et humaines) ont été évalués: système de management, style et processus; leadership ; engagement organisationnel; climat de sécurité des aliments (communication ; engagement personnel; soutien du management et des collègues; soutien de l'environnement ; jugement à propos des risques ; croyances normatives et pression au travail) ; et la perception des risques.

Sur le sujet du management technique, les restaurants ont été classés comme restaurants à risque alimentaire faible ou élevé. Pour l'évaluation du système de management de la sécurité des aliments, une checklist validée a été utilisée.

Sur le plan humain, une analyse du climat de la sécurité des aliments a été réalisée en évaluant cinq éléments appliqués exclusivement aux manipulateurs d'aliments.

Les restaurants à risque élevé ont présenté un pourcentage plus élevé de non-conformités dans la plupart des aspects liés à la réglementation en matière de sécurité des aliments et à la structure physique.

Le leadership et la connaissance des managers de restaurants à faible risque présentaient un niveau supérieur par rapport aux managers de restaurants à haut risque, montrant que dans le premier groupe, les managers agissaient comme médiateurs de pratiques sûres.

Les manipulateurs d'aliments des restaurants à faible risque ont présenté des scores plus élevés en matière de connaissances sur la sécurité des aliments, d'engagement organisationnel et de climat lié à la sécurité des aliments par rapport aux manipulateurs d'aliments des restaurants à haut risque.

Dans les restaurants à faible risque de maladies d'origine alimentaire, les éléments de la culture de la sécurité des aliments ont été mieux évalués, indiquant moins de non-conformités de la réglementation liées à la sécurité des aliments.

Dans ces restaurants, un climat cohérent de sécurité des aliments a été perçu par la composante technico-managériale. Ce résultat montre que moins de non-conformités à la législation sur la sécurité des aliments, en particulier celles impliquant des maladies d'origine alimentaire à haut risque, ont été le résultat positif d'une amélioration de la culture de la sécurité des aliments. En ce sens, il est possible d'améliorer la sécurité des aliments en appliquant, en faisant évoluer et en mûrissant les concepts de la culture de la sécurité des aliments dans les restaurants du Brésil.

jeudi 6 février 2020

L’Anses alerte sur un nouveau virus émergent qui menace la culture des tomates, piments et poivrons. Premiers cas dans des serres en Andalousie


« L’Anses met en garde contre un virus émergent qui affecte les plantes potagères », source communiqué du 3 février de l'Anses.
L’Anses alerte sur un nouveau virus émergent qui menace la culture des tomates, piments et poivrons en France. Le Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) est particulièrement dangereux pour les plantes qui y sont sensibles. Ce virus peut en effet se transmettre par les semences, les plants et les fruits infectés, ainsi que par simple contact, survivre longtemps sans perdre son pouvoir infectieux, et aucun traitement ou aucune variété résistante n’existe aujourd’hui contre ce virus.
Identifié pour la 1ère fois au Moyen-Orient en 2014, les signalements se multiplient depuis 2018 au Mexique, aux États-Unis, puis en Europe et en Asie. Suite à son expertise, l’Anses confirme un risque élevé d’introduction et de dissémination du virus en France avec un impact potentiel conséquent sur les cultures, tant pour les filières professionnelles que pour les productions familiales qui représentent des volumes significatifs. 
L’Agence rappelle l’importance du respect de la réglementation européenne sur les importations de semences et les plants, avec des exigences particulières pour les importations de fruits. Elle recommande de mettre en place un plan de surveillance adapté, de signaler rapidement la présence du virus sur une aire de production et de viser l’éradication du virus dans ces structures. Enfin, il est nécessaire d’informer les particuliers et les professionnels sur le risque posé par le ToBRFV et les mesures de prévention à mettre en œuvre.

Par ailleurs
L’Agence estime que le risque de transfert du virus des fruits importés vers les cultures est plus probable dans les productions familiales que dans le cadre du monde professionnel, en raison de la proximité entre les activités culinaires et celles de la production ainsi que de la circulation des manipulateurs sur le site de production par rapport aux exploitations professionnelles dont les activités sont plus structurées. S’ajoute à cela le risque d’entrée via le marché des semences achetées par les particuliers sur internet. Ainsi, l’Anses recommande d’informer les particuliers sur ce nouveau risque.

Mais les productions familiales peuvent être aussi professionnelles comme Espagne,
Symptomatologie significative dans un plant de tomates en serre.
Ainsi, Le ministère a déclaré le 24 janvier « officiellement » l'existence de « l'organisme nuisible appelé virus de la tomate rugueuse brune (ToBRFV) au sein de la Communauté autonome d'Andalousie ».

Au total, six serres à Vícar et à El Ejido, dans la province d'Almería, se sont révélées être victimes du virus de la tomate brune (ToBRFV), connu sous le nom de virus de la tomate robuste, un nouvel organisme nuisible dont il n'y avait aucune trace de sa présence en Espagne, et que depuis le 24 janvier est « officiellement » en Andalousie, et plus précisément dans ces exploitations, selon le rapport connu de Noticias de Almería, bien que dans deux d'entre elles il semble que le problème soit déjà passé.

En raison de l'importance des cultures de tomates et de poivrons sous abri pour l'Andalousie, ce virus peut devenir une menace sérieuse pour l'agriculture andalouse, principalement dans les provinces d'Almería et de Grenade.

Cet article espagnol de juillet 2019 rapportait déjà une Alerte au sujet d'un nouveau virus qui affecte les tomates et les poivrons.
Le virus de la tomate rugueuse n'affecte pas la santé des personnes, mais il peut causer de graves dommages aux exploitations agricoles.

La Chine rapporte le plus grand bond de cas liés au 2019-nCoV. L'OMS dévoile son plan de réponse


« La Chine indique le plus grand bond de cas liés au 2019-nCoV. L'OMS dévoile son plan de réponse », source article de Lise Schnirring paru dans CIDRAP News du 5 février.

Image liée au 'Grand Bond en avant' pendant la période
1958 à 1960
La Chine a annoncé le 5 février son plus grand bond en nombre de nouveaux cas de coronavirus (2019-nCoV), signalant 3 887 nouveaux cas de maladies, et l'Organisation mondiale de la santé (OMS) a publié une stratégie de réponse de 675 millions de dollars pour soutenir les activités au cours des 3 prochains mois.

Dans d'autres faits nouveaux, certains donateurs ont déjà annoncé leur soutien à la réponse et les pays hors de Chine continuent de signaler davantage de cas, dont 10 sur un bateau de croisière au Japon.

L'OMS expose sa stratégie de réponse
Lors d'une conférence de presse le 5 février, le directeur général de l'OMS, Tedros Adhanom Ghebreyesus, a déclaré que 675 millions de dollars, c'est beaucoup d'argent, mais un gros investissement dans la préparation peut maintenant conduire à des économies encore plus importantes. Il a ajouté que bien que l'objectif principal soit d'aider la Chine, une autre préoccupation majeure est l'impact potentiel sur les pays dont les systèmes de santé sont plus faibles.

Les objectifs du plan de 28 pages sont de limiter la transmission interhumaine; identifier, isoler et soigner les patients ; communiquer des informations critiques ; minimiser l'impact social et économique ; réduire la propagation à partir de sources animales et aborder d'autres inconnues.

Trois principaux domaines d'intervention sont l'intensification rapide de la coordination internationale, l'intensification de la préparation et de la réponse, et l'accélération de la recherche et d'autres innovations. L'OMS a déclaré qu'elle avait déjà débloqué 9 millions de dollars de son fonds de réserve. Sur le montant de 675 millions de dollars, environ 60 millions de dollars serviront à soutenir les opérations de l'OMS, le reste étant destiné aux pays à risque.

Mike Ryan, qui dirige le programme de l'OMS sur les urgences sanitaires, a déclaré: « C'est pourquoi nous recherchons des ressources pour protéger les pays les plus vulnérables afin de protéger les populations du nouveau coronavirus avant qu'il n'arrive sur le pas de la porte. »

Pendant ce temps, certains groupes ont déjà fait des promesses importantes. La Fondation Bill et Melinda Gates a annoncé le 5 février jusqu'à 100 millions de dollars pour protéger les populations à risque en Afrique et en Afrique du Sud et accélérer le développement de vaccins, de médicaments et de diagnostics. Selon un communiqué de presse de la fondation, jusqu'à 20 millions de dollars sont destinés à la Chine et aux groupes multinationaux pour accélérer la détection et le traitement ; 20 millions de dollars supplémentaires sont destinés à aider les pays à risque à renforcer leurs centres d'opérations d'urgence, leurs systèmes de surveillance et leurs capacités de traitement; et jusqu'à 60 millions de dollars pour accélérer le développement de vaccins, de traitements et de tests diagnostiques.

Dans un développement connexe, la Guinée équatoriale a annoncé 5 février un soutien de 2 millions de dollars à la réponse de la Chine au 2019-nCoV, selon un communiqué de presse de l'African Energy Chamber, un groupe commercial pour l'industrie énergétique africaine.

Dans d'autres événements liés à l'épidémie, Tedros a déclaré que l'OMS a organisé 5 février une réunion du groupe consultatif stratégique et technique sur les risques infectieux pour examiner ce qui est connu sur 2019-nCoV et fournir des conseils, et la semaine prochaine, elle convoquera des experts à Genève pour discuter et prioriser la recherche sur les vaccins , médicaments et outils de diagnostic.

Lors de la conférence de presse d'5 février, Sylvie Briand, directrice des maladies épidémiques et pandémiques de l'OMS, a déclaré qu'elle avait eu en téléconférence par deux fois des sociétés de voyages et de tourisme pour discuter de leurs préoccupations et défis en matière de risques, en vue de maintenir le dialogue sur les questions de réglementation.

Plusieurs sociétés de voyages ont suspendu leurs vols vers la Chine, certains en raison de problèmes d'infection et d'autres en raison d'une baisse de la demande. Dans ses recommandations d'urgence sanitaire temporaire, l'OMS a déconseillé les restrictions de voyage et de commerce.

Dans d'autres événements mondiaux, l'Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO), le Fonds international de développement agricole (FIDA) et le Programme alimentaire mondial (PAM) ont annoncé conjointement 5 février leur solidarité avec la Chine et offert leur soutien pour la riposte à l'épidémie. La FAO a déclaré qu'elle travaillait en étroite collaboration avec d'autres groupes mondiaux pour aider à identifier d'éventuels hôtes animaux, l'IFAS a déclaré qu'elle tirerait parti de son travail en Chine pour aider les communautés rurales touchées, et le PAM a déclaré qu'il était prêt à apporter son aide si nécessaire.

Le total de la Chine dépasse 24 000
Au moment d'écrire ces lignes, selon le SCMPl'estimation est de 29 000 cas (28 399) et 566 décès.

Les près de 4 000 nouveaux cas annoncés par la Chine 5 février portent le total de ses épidémies à 24 324, selon la dernière mise à jour de la Commission nationale de la santé (NHC) de Chine. Les décès ont augmenté de 65, tous des patients de la province du Hubei, ce qui porte le nombre de décès à 490. Concernant les cas graves, le pays en a signalé 431 de plus, portant le total à 3 219.

Lors de la conférence de presse d'5 février, Ryan a déclaré que la Chine avait clairement un retard dans les tests de 2019-nCoV, et bien qu'ils aient suffisamment de réactifs et de matériel, ils n'ont pas assez de personnel de laboratoire pour répondre à la demande massive.

Dans d'autres développements, un enfant de Wuhan a été testé positif pour le virus 30 heures après sa naissance, ce qui soulève la possibilité d'une infection congénitale, a rapporté 5 février le South China Morning Post (SCMP).

Pendant ce temps, le gouvernement chinois semble restreindre la couverture médiatique de l'épidémie et la discussion sur les réseaux sociaux, a rapporté 5 février le New York Times. Il a déclaré que le pays a fait peu pour censurer la frustration du public dans les premières semaines de l'épidémie, mais maintenant que les citoyens sont focalisés sur les critiques des plus hautes autorités du pays, les médias d'État et d'autres médias se sont concentrées sur des articles positifs, selon une source anonyme du Times.

Cas en dehors de la Chine, certains avec transmission locale
Plusieurs pays ont signalé le 5 février plus de cas importés et locaux, le Japon signalant 10 cas de maladie chez 31 personnes qui ont été testées sur un navire de croisière qui est arrivé au port de Yokohama le 3 février. Le patient a été transporté à l'hôpital de la préfecture de Kanagawa. Environ 3 700 passagers et membres d'équipage sont sous quarantaine de 14 jours à la suite d'une maladie détectée sur un passager de Hong Kong.

Séparément, le Japon a signalé deux autres cas, portant son total de cas à 2019-nCov à 21. L'un est un homme de la préfecture de Chiba qui est un résident de Wuhan et dont la femme avait été testée positive plus tôt au Japon. L'autre, qui semble être un autre exemple de transmission locale, est un homme d'une vingtaine d'années de la préfecture de Kyoto qui assiste environ 300 touristes chinois chaque jour dans son travail.

Hong Kong a signalé le 5 février trois autres cas, ce qui porte son total à 21. Deux sont l'épouse et la fille d'un cas récemment confirmé, et aucun n'avait d'antécédents de voyage pendant la période d'incubation, faisant allusion à une transmission locale, selon un communiqué publié le 5 février par le Centre de protection de la santé (CHP). Le troisième est un homme tombé malade le 30 janvier. Ses antécédents de voyage incluent le travail à Shenzhen, en Chine, où il s'est rendu pour la dernière fois le 21 janvier. Il a également visité Tokyo du 28 janvier au 1er février.

Dans d'autres développements à Hong Kong, des responsables de la santé ont déclaré qu'une enquête et des tests étaient en cours sur les passagers et l'équipage d'un navire de croisière, après que des cas d'infection ont été confirmés chez huit voyageurs en provenance de Chine continentale, a déclaré le CHP dans un communiqué distinct. Plus tôt dans la journée, le gouvernement de Hong Kong a annoncé qu'en raison de l'aggravation de la situation et de la détection des premiers cas locaux, les visiteurs du continent seront soumis à une quarantaine obligatoire de 14 jours.

Ailleurs, d'autres pays qui ont signalé des cas antérieurs en ont signalé davantage, notamment :
  • L'Australie, qui a signalé un autre cas dans l'État du Queensland, ce qui porte le nombre dans le pays à 14. Le patient est un homme de 37 ans de Wuhan qui fait partie d'un groupe de voyage en provenance de Chine dans lequel trois autres cas ont été signalés plus tôt, a signalé ABC News d'Australie.
  • Le Canada a signalé un autre cas présumé positif, le deuxième de la Colombie-Britannique. Selon un communiqué du gouvernement provincial, la patiente est une femme dans la cinquantaine qui vit dans la région de Vancouver et qui a été en contact étroit avec des visiteurs de la famille de Wuhan.
  • La Malaisie a signalé le 5 février deux autres cas impliquant des évacués, a rapporté 5 février le ministère de la santé, portant le total du pays à 12.
  • Les autorités sanitaires philippines ont annoncé le 5 février le troisième cas du pays, une Chinoise de 60 ans qui est arrivée dans le pays via Hong Kong le 20 janvier. Elle a demandé des soins médicaux aux Philippines le 22 janvier pour de la fièvre et des maux de gorge, et un échantillon a été prélevé le 24 janvier, le test a initialement été négatif, et la femme a récupéré et a été autorisée à retourner en Chine le 31 janvier. Le 3 février, l'un des laboratoires qui ont testé l'un des échantillons précédents de la femme a déclaré que le résultat était positif pour le 2019-nCoV.

L'OMS a déclaré le 5 février dans son dernier rapport quotidien sur la situation qu'elle avait reçu 32 nouveaux cas signalés hors de Chine, portant le total à 191, dont un mortel, en provenance de 24 pays.

Risques des pesticides pour la santé humaine et la biodiversité. Un plaidoyer pour l'Anses !

Première séance à l'Assemblée Nationale du mardi 04 février 2020 avec des questions orales au gouvernement, la question posée concerne les risques de pesticides  pour la santé humaine et la biodiversité.

Mme la présidente. La parole est à Mme Delphine Batho, pour exposer sa question, no 954, relative aux risques des pesticides pour la santé humaine et la biodiversité.

Mme Delphine Batho. Le ministre de l’agriculture et de l’alimentation n’est pas là. Mais j’espère tout de même obtenir une vraie réponse du Gouvernement.

La Cour des comptes a rendu public ce matin son référé en date du 27 novembre 2019, constatant l’échec total de la politique des plans Écophyto, c’est-à-dire de la politique menée par ce gouvernement comme les précédents pour réguler l’usage des pesticides. Malgré 400 millions injectés dans ces plans, l’utilisation de pesticides est en augmentation de 24 % pour la seule année 2019. S’agissant du glyphosate, le Gouvernement a enterré sa propre promesse de l’interdire ; s’agissant des fongicides SDHI – inhibiteurs de la succinate déshydrogénase –, au sujet desquels 450 scientifiques demandent l’application du principe de précaution, il fait la sourde oreille. Et il renonce à protéger les riverains victimes des épandages. En plus, comble du comble, alors que l’Assemblée nationale a voté, par l’article 83 de la loi du 30 octobre 2018, l’interdiction de la fabrication en France de certains pesticides, le sommet de l’État apporte son soutien au lobby des pesticides pour remettre en cause l’application de cette disposition.

On est aujourd’hui dans une urgence de santé publique, et dans une urgence totale pour la biodiversité et l’ensemble du vivant. Mes questions vont donc être extrêmement simples.

Oui ou non, le glyphosate va-t-il être interdit à la fin de cette année comme le Président de la République s’y était engagé ?

Oui ou non, le Gouvernement, qui en a le pouvoir, va-t-il suspendre l’autorisation de mise sur le marché des SDHI ?

Oui ou non, le Gouvernement va-t-il tirer les conséquences de l’échec complet des plans Écophyto en appliquant, enfin, l’article L. 253-7 du code rural qui permet à l’État de suspendre immédiatement l’utilisation de toute substance dangereuse ?

Mme la présidente. La parole est à M. le secrétaire d’État auprès du ministre de l’intérieur.

M. Laurent Nunezsecrétaire d’État auprès du ministre de l’intérieur. Madame la députée, je vous prie d’excuser le ministre de l’agriculture et de l’alimentation, que je représente en l’occurrence pour répondre à vos questions sur le sujet crucial qu’est celui de la réduction des produits phytosanitaires.
Je tiens à rappeler que la politique du Gouvernement est claire : les enjeux de santé publique sont non négociables ; dès qu’un produit présente un risque pour l’homme, il est retiré du marché – nous avons ainsi décidé unilatéralement, en 2018 et en 2019, d’interdire le métam-sodium, l’époxiconazole, les néonicotinoïdes et les substances apparentées alors même que nos voisins européens continuent à les utiliser ; notre objectif est de réduire de 50 % les quantités de produits phytosanitaires en 2025 et de sortir du glyphosate pour une majorité d’usages d’ici la fin 2020.
Deux principes guident notre action : celui du respect de la science et celui de la transparence.

En ce qui concerne la science, je tiens à dire dans cet hémicycle qu’il est hautement regrettable que des parlementaires s’en prennent à l’ANSES, l’Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail, alors que son expertise et son niveau d’indépendance ne sont plus à prouver. Si les parlementaires ne font plus confiance à la science, ne savent plus distinguer les notions de risque et de danger, où allons-nous ?

Quant à la transparence, le Gouvernement s’est engagé à communiquer les données de vente pour 2019 dès le printemps 2020.

Pour ce qui est spécifiquement de vos questions, je vous informe que l’ANSES rendra prochainement, à la demande du Gouvernement, un avis concernant les substances les plus préoccupantes, et il sera évidemment étudié avec attention. S’agissant du glyphosate, les ministres Élisabeth Borne et Didier Guillaume sont mobilisés, aux côtés de l’ANSES et de l’INRAE – l’Institut national de recherche en agriculture, alimentation et environnement – pour procéder à une évaluation comparative, objectivée et robuste. L’ANSES précisera sur ce fondement, d’ici fin juin, les usages pour lesquels le glyphosate pourrait être interdit, en veillant à ne pas mettre les agriculteurs dans l’impasse, ni techniquement ni économiquement.

En conclusion, je sais que, pour certains, tous les moyens sont bons pour interdire tous les produits phytosanitaires – c’est le cas lorsque des maires imposent des zones de non-traitement de 150 mètres autour des habitations, mais aussi s’agissant du SDHI ou du glyphosate. Il ne s’agit pas d’aller du jour au lendemain vers le zéro pesticide : faut-il rappeler que près de 25 % de la quantité totale de substances actives est constituée de produits dits naturels, utilisables en agriculture biologique ? Le Président de la République a dit que notre agriculture était une agriculture d’excellence, qui doit certes bouger, mais également être défendue haut et fort.

Mme la présidente. La parole est à Mme Delphine Batho.

Mme Delphine Batho. Les agriculteurs sont eux aussi victimes de ces produits, qui affectent leur santé. À écouter votre réponse, on peut se dire que, malheureusement, le lobby des pesticides a de beaux jours devant lui ! Vous direz au ministre de l’agriculture de réviser ses fiches puisque, par exemple, en ce qui concerne les néonicotinoïdes, ce n’est pas ce gouvernement qui les a interdits mais le Parlement, à l’encontre d’un exécutif qui ne voulait rien faire. Il en est de même s’agissant de la science : je rappelle que le Centre international de recherche sur le cancer, dépendant de l’Organisation mondiale de la santé, a classé le glyphosate comme cancérogène probable, et qu’il n’appartient ni au gouvernement français ni à l’ANSES de s’asseoir sur une décision du CIRC et de l’OMS. En tout cas, hélas, chacun aura compris le sens de votre réponse : tout continue comme avant et la santé publique demeure secondaire. (Applaudissements sur les bancs du groupe FI.)

M. Laurent Nunezsecrétaire d’État. Mais non !

NB : Une partie du texte est soulignée en gras par mes soins.

Selon La France Agricole du 5 février,
Invité à s’exprimer dans le cadre du bilan du contrat de solutions, Didier Guillaume a annoncé qu’il était favorable à l’utilisation du glyphosate, faute de mieux, pour maintenir l’agriculture de conservation.
Le vent serait-il en train de tourner ? Lors du premier bilan du « contrat de solutions », ce 4 février, le ministre de l’Agriculture Didier Guillaume a plaidé en faveur d’un retour au pragmatisme et à la science, face « à la société civile qui en demande toujours plus sans savoir et qui, au lieu de se baser sur la science, s’informe sur les réseaux sociaux ».