dimanche 25 août 2019

Jersey recherche des commentaires sur sa nouvelle loi sur la sécurité des aliments


« Jersey recherche des commentaires sur sa nouvelle loi sur la sécurité des aliment», source Food Safety News.

Une période de consultation publique a été ouverte concernant la nouvelle loi de Jersey sur la sécurité des aliments.

La législation révisée vise à améliorer la santé et la sécurité sanitaire dans la préparation, le service et la distribution des aliments.

Le projet de loi sur la sécurité des aliments (Jersey) remplacera la loi de 1966 sur la sécurité des aliments (Jersey) et s'appliquera aux entreprises impliquées dans la préparation et la vente de produits alimentaires. La date de clôture de la période de commentaires est le 1er novembre.

Cela couvre l'importation et l'exportation de denrées alimentaires vers Jersey, la licence d'exploitation de produits alimentaires, les infractions et les pénalités, ainsi que les mesures à prendre par une entreprise pour retirer des aliments non sûrs du marché.

Jersey est la plus grande des îles anglo-normandes et se trouve dans la baie de Saint-Malo, près des côtes française et anglaise.

Protection publique supplémentaire
Les agents de santé environnementale continueront à contrôler les entreprises pour s’assurer qu’elles se conforment à la loi. Eat Safe continuera à informer le public sur les règles d’hygiène des aliments dans les entreprises.

Le nombre d'étoiles du programme Eat Safe est de 0, 2, 3, 4 ou 5 ; 0 étant le pire et 5 le meilleur, reflétant le statut en matière de sécurité des aliments et d'hygiène.

Toutes les entreprises sont tenues d’afficher publiquement leur classement par étoiles conformément à la loi. Les entreprises sont inspectées tous les six mois à trois ans, en fonction du niveau de risque et de la conformité.

« Jersey a déjà d'excellents taux de conformité aux meilleures pratiques en matière de santé et de sécurité des aliments et cette législation offrira une protection supplémentaire aux opérateurs qui s'engagent à respecter des normes de pratique élevées », a déclaré Caroline Maffia, directrice adjointe de la santé environnementale.

« Cette législation révisée protégera davantage le public contre les conséquences néfastes des mauvaises pratiques dans les différentes industries du transformation des aliments, et les consultations offriront à l’industrie une occasion de s’engager avec ces nouvelles mesures et de discuter des changements avec les agents de l’Environmental Health. »

Des réunions de consultation sont prévues les 9, 17 et 18 septembre pour permettre aux acteurs du secteur de comprendre l’impact de la loi sur le secteur.

L'adaptation chez les bovins peut être en train de conduire E. coli à développer des propriétés dangereuses


Image en micrographie électronique de E. coli isolés de bovin. (Crédit: Atsushi Iguchi, Université de Miyazaki)
« L'adaptation chez les bovins peut être en train de conduire E. coli à développer des propriétés dangereuses », source Phys.org à partir de données de la Kyushu University.

Une étude à grande échelle des différences et des similitudes génétiques entre les bactéries E. coli provenant de bovins et d’êtres humains indique que des caractéristiques provoquant une intoxication alimentaire chez l’homme pourraient continuellement apparaître chez les bactéries provenant de bovins afin de mieux s’adapter à leur environnement.

Si la bactérie E. coli est l'une des causes les plus connues d'intoxication alimentaire, il existe une grande variété de souches de E. coli, dont beaucoup sont des résidentes permanentes et inoffensives de notre intestin. Cependant, l'ingestion de souches dangereuses de E. coli dans des aliments contaminés peut entraîner une maladie grave, des vomissements et une diarrhée.

« Pour mettre au point des mesures préventives les plus efficaces, nous avons besoin d'une connaissance approfondie de la source et des conditions de vie de la bactérie », a dit Yoshitoshi Ogura, professeur associé au département de bactériologie de l'université de Kyushu, qui a dirigé la recherche.

« Bien que l'on pense depuis longtemps que les bovins sont l'une des principales sources de E. coli qui causent une intoxication alimentaire, les raisons pour lesquelles des formes dangereuses continueraient à apparaître chez les bovins n'ont pas été élucidées. »

Le groupe d’Ogura, en collaboration avec des chercheurs du Japon, de France, de Belgique et des États-Unis, a tenté de répondre à cette question en explorant la génétique des bactéries E. coli provenant de bovins et des humains dans 21 pays répartis sur six continents.

« À ce jour, les séquences du génome de E. coli provenant de bovins n'ont été signalées que de manière limitée. Nous avons donc dû combler cette lacune », commente Yoko Arimizu, premier auteur de l’étude parue dans Genome Research et annonçant de nouveaux résultats.

Alors que le plus grand nombre d'échantillons provenait du Japon, les souches d'autres régions présentaient des caractéristiques bien réparties parmi celles du Japon, indiquant une bonne diversité des ensembles d'échantillons.

En se basant sur les caractéristiques génétiques de la bactérie, les chercheurs pouvaient généralement séparer les différentes souches de E. coli en deux groupes, l’un composé principalement de bactéries prélevées chez l’homme et l’autre groupe provenant de bovins.

Appliquant la même analyse à des E. coli obtenus cliniquement et connus pour causer des maladies, les chercheurs ont découvert que la plupart des souches causant des problèmes intestinaux appartenaient au groupe associé aux bovins.

En outre, de nombreux échantillons issus de bovins présentaient des caractéristiques similaires à celles provoquant une intoxication alimentaire, telles que la production de shigatoxines. Bien que ces caractéristiques ne semblent généralement pas causer de maladies chez les bovins, leur prévalence dans les échantillons analysés suggère que ces caractéristiques sont bénéfiques pour la vie dans l'intestin des bovins.

« Tant qu'il y aura une pression pour maintenir ou renforcer ces caractéristiques productrices de maladies afin de mieux s'adapter à la vie dans l'intestin des bovins, de nouveaux variants de E. coli causant des intoxications alimentaires continueront probablement à apparaître », dit Ogura.

Les chercheurs spéculent que ces caractéristiques pourraient aider E. coli à se protéger contre les organismes mangeurs de bactéries présents dans les intestins des bovins, mais des travaux supplémentaires sont nécessaires pour identifier la raison exacte.

Référence.
Large-scale genome analysis of bovine commensal Escherichia coli revealed that bovine-adapted E. coli lineages are serving as evolutionary sources of the emergence of human intestinal pathogenic strains, Genome Research (2019). DOI: 10.1101/gr.249268.119

Des pathogènes d'origine alimentaire protégés par des bactéries commensales qui favorisent la formation de biofilm


« Des pathogènes d'origine alimentaire protégés par des bactéries commensales qui favorisent la formation de biofilm », source Doug Powell du barfblog.

Selon des chercheurs de Penn State, des bactéries pathogènes qui se cachent obstinément dans certaines installations de conditionnement de pommes peuvent survivre et être protégées par des bactéries inoffensives qui sont connues pour leur capacité à former des biofilms. Cela pourrait conduire au développement de stratégies alternatives de contrôle des pathogènes d’origine alimentaire.

Telle était la principale constatation tirée d'une étude sur trois installations de conditionnement de fruits dans le Nord-Est des Etats-Unis, où la contamination par Listeria monocytogenes était un sujet de préoccupation. L’étude, réalisée en collaboration avec l’industrie de la pomme, visait à mieux comprendre l’écologie microbienne des installations de transformation des aliments. Le but ultime était d’identifier les moyens d’améliorer la maîtrise des agents pathogènes dans la chaîne d’approvisionnement des pommes afin d’éviter les épidémies de maladies d’origine alimentaire et le rappel de pommes et de produits à base de pommes.

« Ce travail fait partie des efforts de Penn State pour aider les producteurs à se conformer aux normes énoncées dans la loi fédérale sur la sécurité des produits alimentaires, souvent désignée sous le nom de FSMA (Food Safety Modernization Act) », a déclaré la chercheuse Jasna Kovac, professeure adjointe en sciences des aliments au College of Agricultural Sciences.

Dans cette étude, les chercheurs ont cherché à comprendre la composition du microbiote dans les environnements de conditionnement de pommes et son association avec l'apparition de l'agent pathogène d'origine alimentaire Listeria monocytogenes. Leurs essais ont révélé qu'une usine de conditionnement avec une présence significativement plus élevée de Listeria monocytogenes était uniquement dominée par la famille bactérienne Pseudomonadaceae et par la famille des moisissures, Dipodascaceae.

« Lors de nos recherches sur les propriétés de ces micro-organismes, nous avons appris qu'ils étaient connus pour être d'excellents formateurs de biofilms », a dit le chercheur principal Xiaoqing Tan (voir photo), étudiant récemment diplômé en maîtrise en sciences des aliments et membre du Penn State Microbiome Center, hébergé dans le Huck Institutes of Life Sciences.

« Sur la base de nos résultats, nous émettons l'hypothèse que ces micro-organismes inoffensifs soutiennent la persistance de Listeria monocytogenes car ils protègent les bactéries dangereuses en les enfermant dans des biofilms. Nous testons cette hypothèse dans une étude de suivi. »

Les résultats de la recherche, publiée (le 21 août) dans Microbiome, permettent de mieux comprendre le problème de la contamination par Listeria et pourraient amener les chercheurs et l'industrie de la pomme à se rapprocher de la résolution du problème, estime Kovac.

Les équipements des usines de transformation des fruits, tels que les convoyeurs à brosses, ont une conception sanitaire médiocre qui les rend difficiles à nettoyer et à désinfecter, a-t-elle souligné. Elle et LaBorde prévoient de collaborer avec l'industrie de la pomme pour élaborer des stratégies de nettoyage et de désinfection plus efficaces.

Les chercheurs ont prélevé des échantillons dans des installations de conditionnement de pommes dans lesquelles Listeria monocytogenes était persistante. Ils ont découvert que des bactéries inoffensives peuvent héberger les agents pathogènes.

« Pour faire suite à ces découvertes, nous expérimentons certaines des souches de bactéries non pathogènes qui ne sont pas nocives pour les humains afin de voir si elles peuvent être utilisées en tant que biocontrôle », a-t-elle déclaré. « Une fois appliqués sur les surfaces des équipements dans ces environnements, elles peuvent être capables de surpasser et de supprimer Listeria, réduisant ainsi les risques liés à la sécurité des aliments et les éventuelles mesures réglementaires. Nous explorons toujours cette approche dans un environnement de laboratoire contrôlé. Si cela s'avère réalisable, nous aimerions tester cela dans des installations de conditionnement et de transformation de la pomme. »

Les chercheurs, dans la Penn State, soupçonnent que le microbiote hébergeant éventuellement Listeria monocytogenes ne se limite pas aux installations de transformation des fruits ou à la production de fruits. Ils commenceront bientôt à analyser les communautés microbiennes dans les installations de transformation des produits laitiers afin de déterminer la composition microbienne et l'écologie de ces environnements.

Les autorités sanitaires norvégiennes recommandent aux femmes enceintes d'éviter les compléments et les shots à base de gingembre

« Les autorités sanitaires norvégiennes recommandent aux femmes enceintes d'éviter les compléments au gingembre », source article de Doug Powell du barfblog.

L'Autorité norvégienne de sécurité des aliments met en garde les femmes enceintes et les femmes qui envisagent une grossesse d'éviter les compléments à base de gingembre et des shots contenant du gingembre.

Will Chu of Nutra rapporte que la recommandation intervient après que la Danish Veterinary and Food Administration aient effectué une nouvelle évaluation des risques qui a révélé un risque d'avortement plus élevé dans des études sur l’animal.

Dans le rapport, la DTU a déclaré que les résultats n'excluaient pas la possibilité que de grandes quantités de gingembre puissent également augmenter ce risque chez l'homme.

« Le DTU Food Institute conclut que dans de nombreux cas, l'ingestion de racine de gingembre à partir d'un seul shot de gingembre sera plus importante (jusqu'à 20-23 grammes (g) par jour) que la quantité fraîche ou séchée habituellement consommée dans l'alimentation. »

« Des expériences sur des rats indiquent que le gingembre peut affecter le développement normal du fœtus », indique le rapport du 21 décembre 2018.

« Les études menées jusqu'à présent chez l'homme n'ont pas cherché à savoir si le gingembre pouvait avoir un effet dangereux au début de la grossesse. Les études chez l'animal suggèrent qu'il pourrait s'agir d'une période particulièrement sensible. »

« Il existe une petite marge de sécurité entre la dose quotidienne liée aux effets néfastes pendant la grossesse chez la rate et la quantité de gingembre pouvant être consommée avec un seul shot de gingembre », poursuit le rapport.

L'Institut norvégien de la santé publique, de concert avec l'autorité norvégienne de la sécurité des aliments, a évalué le rapport danois, étayant ses conclusions et mettant en garde contre le shot au gingembre et les compléments contenant du gingembre.

Un ancien responsable de la santé publique a déclaré que de nombreux échecs du gouvernement étaient à l'origine de l'épidémie à Listeria dans les hôpitaux d’Angleterre


« Un ancien responsable de la santé publique a déclaré que de nombreux échecs du gouvernement étaient à l'origine de l'épidémie à Listeria dans les hôpitaux d’Angleterre », source article de Joe Whitworth paru le 24 août 2019 dans Food Safety News.

La mort de six personnes des suites de cas d’infections à Listeria liées à des aliments hospitaliers plus tôt cette année est le résultat de graves défaillances du système de santé publique britannique, selon un article publié dans le  Journal of the Royal Society of Medicine.

Le professeur John Ashton a déclaré dans l’article qu'il existait une image confuse de ce qui se passait lorsque les patients présentant une infection à Listeria ont été signalés pour la première fois en juin. Ashton est l'ancien directeur régional de la santé publique du nord-ouest de l'Angleterre. Il a critiqué la communication de Public Health England.

Six personnes sont décédées et neuf cas de listériose ont été enregistrés avec des liens vers des sandwichs au poulet fournis à des groupes hospitaliers en Angleterre par Good Food Chain. Tous les patients ont développé des infections à Listeria entre le 20 avril et le 2 juin.

Le fabricant de sandwichs, Good Food Chain, a été informé que la Food Standards Agency (FSA) pourrait reprendre ses activités, car il n’a pas été confirmé qu’il était la source de l’épidémie, mais l’entreprise devrait être liquidée.

La souche épidémique a été retrouvée dans de la viande produite par North Country Cooked Meats. La société et son distributeur North Country Quality Foods ont été liquidés fin juillet et les deux sociétés ont cessé leurs activités.

Leçons de l'histoire
Dans le Journal de la Royal Society of Medicine, Ashton a également cité des informations selon lesquelles 12 personnes recevant un traitement en ville pour des blessures dans le comté d’Essex seraient décédées des suites de la propagation du streptocoques du groupe ‘A’ et 20 autres auraient été infectées dans des maisons de retraite et leurs propres maisons.

Il a établi des comparaisons avec deux incidents ayant entraîné la mort de 41 personnes au milieu des années 80 et impliquant des épidémies à Salmonella et Legionella. Selon une enquête menée en 1988, le manque de contrôle efficace de l’environnement local et des maladies transmissibles était au cœur des deux événements.

En août 1984, une épidémie à Salmonella à l'hôpital psychiatrique Stanley Royds dans le Yorkshire a entraîné la mort de 19 patients âgés. En avril 1985, une épidémie de légionellose à l'hôpital général du district de Stafford affecta 68 patients, dont 22 sont décédés.

Ashton a déclaré que les leçons tirées de l'histoire montrent qu'une autre réorganisation n'est pas nécessaire, mais qu'il est nécessaire de renforcer ce qui est actuellement en place et de soutenir son évolution pour en faire un objectif adapté.

Réfléchir aux échecs du système de santé publique
« Il est maintenant temps de digérer ces dernières défaillances du système de santé publique mis en place il y a seulement six ans dans le cadre des changements structurels d'Andrew Lansley au NHS et pour la santé publique », a écrit Ashton.

« Le retour de la fonction santé publique vers les autorités locales en 2013 a entraîné le placement de nombreux directeurs de la santé dans des structures dans lesquelles ils sont gérés par des directeurs des services sociaux pour adultes, en limitant les possibilités d'action et de liberté d'expression. Il existe un schisme dans lequel la perspective clinique dans l'administration locale a disparu et les liens entre les autorités locales et le NHS sont devenus de plus en plus dysfonctionnels. »

Ashton a déclaré que depuis 2013, les établissements de santé publique des autorités locales ont été réduits et que les budgets ont été considérablement réduits.

« Pour ajouter à cette agonie, dix années d'austérité et de coupes massives dans les budgets des autorités locales ont entraîné une baisse des effectifs des départements de la santé environnementale qui ne sont plus en mesure de rester à l'avant-garde des menaces pour la santé humaine malgré tous leurs efforts. »

« Néanmoins, certaines équipes de santé publique locales ont obtenu des résultats remarquables, souvent à un prix personnel, avec une dégradation morale et un travail de partenariat anticipé coordonné, qui en a souffert. »

samedi 24 août 2019

255 cas à Salmonella résistant liés à de la viande bovine et du fromage à pâte molle au lait cru, selon le CDC

« 255 cas à Salmonella résistant aux antibiotiques liés à de la viande bovine et du fromage à pâte molle, selon le CDC », source CIDRAP News.

Le Centers for Disease Control and Prevention (CDC) a présenté en détail une épidémie inhabituelle de 255 cas d’infections à Salmonella Newport dans 32 États, liée à la fois à de la viande bovine et à du fromage à pâte molle et présentant une résistance à de multiples antibiotiques.

« Les cas d’infection ont été liées à de la viande bovine obtenue aux États-Unis et à du fromage à pâte molle du Mexique, ce qui suggère que cette souche pourrait être présente chez les bovins des deux pays », a dit le CDC dans un aperçu envoyé aux médecins dans le cadre de ses efforts de la Clinician Outreach and Communication Activity (COCA).

« Les tests de sensibilité aux antibiotiques ont montré que la souche avait une sensibilité réduite à l'azithromycine et une non-sensibilité à la ciprofloxacine deux antibiotiques oraux couramment prescrits », a ajouté l'agence. « Cela laisse la ceftriaxone, un antibiotique injectable, comme option de traitement recommandée. »

Ian Plumb, auteur principal d’une étude sur l’épidémie publiée dans Morbidity and Mortality Weekly Report (MMWR), a déclaré à CIDRAP News: « Nous continuons de voir des cas survenir chez des patients. Le schéma de résistance aux antibiotiques de cette souche est alarmant parce que les antibiotiques oraux primaires utilisés pour traiter les patients atteints de ce type d’infection à Salmonella pourraient ne pas fonctionner. "

Plumb est épidémiologiste à l’Enteric Disease Branch du CDC. Lui et ses collègues dans la mise à jour de MMWR ont déclaré que l'azithromycine par voie orale est également une option. Plumb a ajouté par courrier électronique: « La plupart des patients atteints d'infections à Salmonella n'ont pas besoin d'antibiotiques, mais certains patients oui, en cas de maladie grave ou si un clinicien identifie les facteurs de risque de maladie grave. »

Il a ajouté: « Le meilleur moyen pour les cliniciens de guider le traitement est de vérifier si une bactérie est résistante pour ce patient en particulier. » Plumb a également noté que l'Infectious Diseases Society of America s avait publié ici des lignes directrices sur la gestion des infections à Salmonella.

Soixante hospitalisés, 2 décès
Les cas liés à l'épidémie remontent de juin 2018 à mars 2019, et le CDC a identifié pour la première fois la souche de Salmonella multirésistants (MDR pour multidrug resistant) en septembre, selon l’article de MMWR. Sur 206 patients pour lesquels des informations étaient disponibles, 89 (43%) ont signalé un voyage récent au Mexique.

Soixante patients sur 209 (29%) ont été hospitalisés, dont 4 (6% de ceux pour lesquels des données sont disponibles) nécessitant des soins intensifs. Dix des 255 patients (4%) avaient une bactériémie à Salmonella (infection du sang) et deux patients sont décédés, a précisé le CDC.

Les patients étaient âgés de moins de 1 à 90 ans et l'âge médian était de 36 ans. Plus de la moitié (58%) étaient des femmes et 65%, des hispaniques.

La CDC a déclaré dans son courrier électronique à COCA. « Les infections résistantes peuvent être plus difficiles à traiter et les patients risquent davantage de développer des complications graves. »

Parmi les patients qui ont voyagé au Mexique et qui avaient des informations sur les aliments qu'ils ont mangés, 41 sur 47 (87%) ont déclaré avoir consommé de la viande bovine et 29 sur 46 (63%) ont déclaré avoir consommé du fromage à pâte molle, a noté l’article de MMWR. Parmi les 29 personnes qui ont mangé du fromage à pâte molle, 23 (79%) ont déclaré avoir obtenu ce fromage au Mexique, le plus souvent sous forme de queso fresco, un fromage au lait cru (non pasteurisé).

Parmi les patients qui n'ont pas voyagé au Mexique, 20 sur 70 (29%) ont déclaré avoir consommé du fromage à pâte molle de style mexicain et 68 sur 73 (93%) ont déclaré avoir consommé de la viande bovine. Les inspecteurs ont détecté la souche épidémique dans des échantillons de viande bovine prélevés en novembre 2018 et en mars 2019 dans deux installations d'abattage et de transformation au Texas, a indiqué le CDC dans l’article de MMWR. Il a toutefois et ajouté que « l’examen des données des patients n’a pas permis d’identifier de fournisseur commun de viande ou de fromage contaminé. »

Quand on a demandé pourquoi le CDC annonçait cette épidémie via MMWR et non avec une annonce typique, Plumb a déclaré que l’article résumait une investigation complexe et ajoutait: « Les décisions d'avertir le public lors d'une investigation sont basées sur un certain nombre de facteurs, notamment: la source des infections a été identifiée et s’il existe de nouvelles recommandations à l’intention des consommateurs. »

« Cette enquête n'a pas identifié de produit contaminé spécifique, et les cas n'étaient pas liés géographiquement. Nos résultats corroborent les recommandations existantes du CDC visant à préparer la viande bovine en toute sécurité et de ne consommer que du fromage à pâte molle fabriqué avec du lait pasteurisé. »

Les vaches laitières, source possible
Les isolats du fromage mexicain, du caecum de bovins et des échantillons de bœuf ont été étroitement comparés par séquençage du génome complet.

« Dans cette épidémie MDR, la consommation de fromage et de bœuf étaient toutes deux associées à la maladie, ce qui indique que des vaches laitières étaient une source probable de ces infections », ont indiqué les auteurs dans MMWR. « La découverte de la souche épidémique dans du fromage acheté au Mexique et le pourcentage élevé de voyageurs au Mexique ayant déclaré avoir consommé du fromage à pâte molle de style mexicain suggèrent que le fromage à pâte molle en provenance du Mexique était une source d'infection.

« Le fromage à pâte molle de style mexicain a déjà été identifié comme une source d'autres épidémies à Salmonella. La consommation déclarée de queso fresco, des voyages dans diverses régions du Mexique et la détection de souches de Newport indiscernables que la contamination du fromage à pâte molle est le résultat du portage par le bétail plutôt qu’une mauvaise hygiène lors de la production du fromage. »

« Les vaches laitières sont souvent utilisées comme source de viande bovine hachée et ont été impliquées dans de précédentes épidémies de MDR avec Salmonella Newport. »

Plumb a déclaré: « Toute utilisation d'antibiotiques chez l'homme ou chez l'animal peut augmenter le risque de propagation de bactéries résistantes. Il est donc important de n'utiliser des antibiotiques que lorsque cela est nécessaire. Éviter un usage non nécessaire des antibiotiques dans le bétail qui sont utilisés chez l’homme pourrait prévenir la propagation des bactéries et peuvent réduire le risque de souches résistantes chez les animaux conduisant à une maladie chez l'homme. »

Émergence récente de la résistance aux antibiotiques
Parmi les 252 isolats testés pour la résistance aux antibiotiques, 226 (90%) avaient des gènes de résistance au triméthoprime-sulfaméthoxazole, à la tétracycline et au chloramphénicol, et à une sensibilité réduite à l'azithromycine, ont indiqué les experts du CDC dans leur article. Et 143 isolats (57%) ont démontré une résistance supplémentaire à l'ampicilline et à la streptomycine, ainsi qu'une non-susceptibilité à la ciprofloxacine. Tous les gènes de résistance étaient situés sur un plasmide IncR.

« La présence de gènes de résistance sur un plasmide est préoccupante en raison du risque de propagation à d'autres bactéries », ont déclaré les auteurs dans MMWR. Les plasmides peuvent transférer du matériel génétique non seulement entre bactéries de la même espèce, mais également entre espèces de pathogènes.

« La souche épidémique semble être apparue récemment parce que Newport présentant une sensibilité réduite à l'azithromycine n'a pas été détecté dans des isolats d'animaux, de viande au détail ou chez l'homme lors de la surveillance du ARMS [National Antimicrobial Resistance Monitoring System] avant 2016 », ont indiqué les auteurs.

Les auteurs concluent que « le séquençage du génome complet était utile pour lier les infections humaines à des sources alimentaires, distinguant la souche épidémique MDR d’une souche sensible aux antibiotiques provoquant une épidémie simultanée et prédisant la résistance aux antibiotiques. Dans cette épidémie, un patient sur trois a reçu des antibiotiques susceptibles d'avoir été inefficaces. »

Contrôles des produits importés, le compte n'y est pas!


Selon La France Agricole du 22 août 2019, « Attendant des « annonces concrètes », la Coordination rurale n’a pas été convaincue par la réponse du ministre de l’Agriculture sur les contrôles des denrées alimentaires importés. »

L’article 44 de la loi EGA permet à la France d’interdire les importations de denrées alimentaires qui ne correspondent pas aux normes de production européennes concernant les produits phytopharmaceutiques et vétérinaires et les exigences d’identification et de traçabilité.
Pour s’assurer que ce texte soit bien appliqué, la Coordination Rurale a adressé un courrier au ministre de l’Agriculture ainsi qu’aux députés et sénateurs afin que ces derniers puissent questionner le Gouvernement sur les modalités de sa mise en application. Anne Renouard, agricultrice et présidente de la CR22, avait également interpellé sur ce sujet Didier Guillaume lors d’une table ronde organisée le 14 juin dernier à Plerin. Suite au courrier de la CR, le député des Côtes-d’Armor Eric Bothorel a posé une question écrite au Ministre et a obtenu une réponse que vous pouvez retrouver en intégralité ici.
Voici le texte de la réponse du ministère de l’agriculture :
Les services du ministère de l'agriculture et de l'alimentation sont mobilisés pour que puissent s'appliquer rapidement, dans un cadre réglementaire sécurisé, les dispositions prévues par la loi.
Le service d'inspection vétérinaire et phytosanitaire aux frontières déploie d'ores et déjà un plan de surveillance des produits d'origine animale importés sur le territoire français. La recherche de résidus de produits chimiques et de substances interdites est notamment ciblée dans le cadre de ce plan. Ce dispositif aux frontières sera renforcé en 2020, en augmentant le nombre d'échantillonnages des lots importés et en élargissant la liste des substances recherchées.
De plus, des mesures de contrôle orientés ou renforcés peuvent être prises sur certains couples produits/origines, en fonction des alertes sanitaires en cours dans les pays tiers. Les produits d'origine végétale sont également concernés par des contrôles mis en œuvre par la direction générale de la consommation, de la concurrence et de la répression des fraudes (DGCCRF).
Le suivi de l'application de l'article 44 de la loi EGALIM doit s'inscrire dans une réflexion globale sur les conditions d'importation. L'opportunité de la création d'un comité de suivi réunissant la DGCCRF, la direction générale de l'alimentation, l'agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail et les organisations agricoles est en cours d'évaluation par le Gouvernement.
Par ailleurs, les autorités françaises continuent de porter le projet de création d'un observatoire européen des risques sanitaires, afin que toutes les données des États membres soient rassemblées dans une même base permettant de déclencher des alertes et/ou d'orienter les contrôles au niveau de l'Union européenne sur les produits importés.
Enfin, dans le cadre des négociations en cours, le Gouvernement a appelé la Commission européenne à mettre rapidement en œuvre l'article 118 du règlement (UE) 2019/6 sur les médicaments vétérinaires. Cette disposition établit l'interdiction d'utilisation de certains antimicrobiens ou de certains usages (promoteurs de croissance) pour les produits animaux ou animaux exportés depuis les pays tiers. Son application permettra de concourir à la garantie de l'équité des conditions de concurrence entre les producteurs de l'Union européenne et ceux des pays tiers.
Selon la Confédération rurale,
L’augmentation du nombre d’échantillonnages n’est que de la poudre aux yeux quand on sait qu’aujourd’hui seuls 6 containers importés sur 5000 sont contrôlés.
La France n’a pas les ressources nécessaires pour contrôler toutes ses importations et ne peut donc en aucun cas garantir le respect de ces dernières à nos normes sanitaires.
On lira aussi sans trop être convaincu les articles de la page Internet du ministère de l’agriculture sur .Sécurité sanitaire des aliments : comprendre le dispositif de contrôle et de veille.

vendredi 23 août 2019

Eclosions saisonnières liées à Salmonella Typhimurium chez des passereaux, des chats domestiques et des humains en Suède


Un passereau
Vient de paraître dans Eurosurveillance, un article sur « Eclosions saisonnières liées à Salmonella Typhimurium chez des passereaux, des chats domestiques et des humains en Suède ».

Je vous propose la traduction de la discussion.

La plupart des cas de salmonellose en Suède sont liés à des voyages à l'étranger ou à des aliments contaminés, mais la survenue de cas associés à des chats dans les premiers mois de l'année est connue de manière anecdotique depuis de nombreuses années.

Nous avons utilisé des données nationales provenant de sources multiples couvrant la période 2009-2016 pour montrer que des épidémies multi-espèces de S. enterica subsp. Enterica serovar Typhimurium (STm) associées aux passereaux se produisaient chez les passereaux, les chats domestiques et les humains au cours des premiers mois de certaines années, possiblement provoquées par les fluctuations de la population de passereaux et les événements de migration de masse.

Les données de Birdwatcher confirment que les passereaux en Suède recherchent des habitations humaines pour se nourrir en grand nombre certaines années, ce qui entraîne des niveaux d’exposition variables à STm associée aux passereaux d’une année sur l’autre, tant pour les chats domestiques que pour les humains.

Les facteurs sous-jacents de ce phénomène sont probablement complexes. De nombreuses espèces d'arbres produisent de grandes cultures de semences par intermittence, avec une production faible ou nulle pendant les années intermédiaires ; ces cycles peuvent être synchrones sur de grandes zones géographiques, affectant ainsi l'écologie des espèces animales qui se nourrissent des graines de l'arbre.

Par exemple, on sait que la production de graines d'épicéa et de bouleau influe sur la taille de la population et les mouvements hivernaux des chenilles rouges et des tarins des aulnes d'Europe, avec des années d'irruptions provoquant de faibles semis et une mortalité accrue.

D'autres facteurs, tels que la culture de semences de l'année précédente, les conditions météorologiques et la disponibilité de sources de nourriture alternatives (telles que les semences de plantes annuelles) ont également été pensés pour déclencher une migration irrégulière parmi les passereaux.

La prédation sur des oiseaux affaiblis avec une septicémie possible, par ex. autour des mangeoires pour oiseaux, est la voie d’infection la plus probable pour les chats, exposant probablement le chat à une dose infectieuse élevée.

L'incidence humaine de STm associée aux passereaux était significativement plus élevée dans les régions boréales du nord et du centre de la Suède.

Bien que cela puisse être un artefact du nombre limité d'observations et d'années d'échantillonnage, ainsi que d'autres incertitudes liées à la sous-déclaration de salmonellose chez l'homme, il est biologiquement plausible, que la Suède, du centre au nord étant plus riche en habitats forestiers d'épicéas et de bouleaux, a par conséquent des populations plus importantes d’espèces de passereaux.

Nous notons également une faible incidence dans la région de la capitale, le comté de Stockholm. Moins de ménages dans le comté de Stockholm que dans tout le pays ont un ou plusieurs chats (10% contre 17%) et plus de ménages vivent dans des immeubles à appartements (59% contre 41%). Ainsi, il est probable qu'une proportion plus faible de la population du comté de Stockholm interagisse avec un mangeur d'oiseaux de jardin ou un chat d'extérieur, par rapport aux autres comtés de la zone boreo-némorale, ce qui entraînerait probablement une exposition moindre à STm associée aux passereaux.

En Suède, STm associés aux passereaux chez les humains semblent toucher plus souvent les jeunes enfants et les personnes âgées. Il est possible que ces groupes soient davantage exposés aux chats d'extérieur, aux mangeoires d'oiseaux et aux environnements de jardin.

En outre, STm associée aux passereaux semble biaisée par l'hôte et ne possède pas de plasmide de virulence retrouvé dans de nombreuses autres souches de STm, caractéristique associée à un risque plus faible d'infection grave chez l'homme. Les adultes en bonne santé peuvent donc être hypothétiquement moins vulnérables à l’infection par ce variant de STm qu’avec d’autres variants.

Nous avons observé que STm associée aux passereaux était fortement saisonniers chez les passereaux, les chats et les humains. Les trois types d'hôtes ont connu un pic au début de l'année, en particulier en mars, des cas humains continuant de se produire au début de l'été, lorsque le nombre de cas chez les chats et les oiseaux a diminué.

Il est concevable que des oiseaux asymptomatiques ou une contamination persistante de l'environnement continuent de causer ces infections humaines plus tard dans la saison. Le pic de cette variante de STm contraste avec les autres infections domestiques à STm et la salmonellose en général en Suède, qui culmine à la fin de l'été.

La MLVA ainsi que le séquençage du génome complet ont confirmé le lien entre les différents hôtes de l'agent pathogène, bien que, comme prévu, les données de séquençage se soient révélées plus informatives.

L'épidémie de 2016 n'était pas clonale, ce qui correspond à une épidémie causée par des déclencheurs environnementaux agissant simultanément sur plusieurs sources d'infection - dans ce cas, des populations de passereaux dans différentes régions, par opposition aux souches hautement clonales fréquemment rencontrées chez une source unique, par exemple, des éclosions d'origine alimentaire.

Les données présentées doivent être interprétées avec prudence, car elles reposent largement sur une surveillance clinique passive. Une observation continue sur des périodes plus longues est donc justifiée. Cependant, bien que nous soyons loin de comprendre ce phénomène complexe, nous proposons que l'observation d'un nombre élevé de passereaux tels que le tarin des aulnes et le sizerin commun eurasiens en hiver puisse être utilisée comme un avertissement précoce d'un risque accru d'épidémies de salmonellose chez les chats et les humains.

Les sizerins flammés et les tarins des aulnes d'Eurasie sont des résidents dans la majeure partie du nord de l'Eurasie et plus au sud, par exemple. en Europe centrale et dans les Alpes, et sont aussi présents de manière saisonnière dans la plupart des pays d'Europe continentale.

Le bouvreuil eurasien réside dans la plupart des pays d’Europe. Comme mentionné précédemment, des épidémies de salmonellose chez ces oiseaux ont été signalées dans plusieurs pays européens.

En Amérique du Nord, le sizerin flammé commun est co-présent avec le tarin des pins (Spinus pinus), un proche parent du sizerin eurasien, les deux espèces connaissant des foyers périodiques de salmonellose.

Nos résultats sont donc susceptibles d'avoir des conséquences pour la santé publique et animale en dehors de notre zone d'étude en Suède. Les méthodologies de typage telles que MLVA et le séquençage du génome complet ont facilité l'échange de données entre les secteurs vétérinaire et de la santé publique, ainsi que la découverte de lignées distinctes d'agents pathogènes, améliorant ainsi la capacité de suivre la propagation zoonotique de bactéries.

L'utilisation continue de ces méthodes, ainsi que l'analyse rétrospective des isolats historiques et le partage international de données, devraient révéler davantage de lignées de STm adaptées à l'hôte et de liens épidémiologiques entre animaux et humains dans les années à venir.

Référence. 
Söderlund RobertJernberg CeciliaTrönnberg LindaPääjärvi AnnaÅgren ErikLahti Elina. Linked seasonal outbreaks of Salmonella Typhimurium among passerine birds, domestic cats and humans, Sweden, 2009 to 2016. 
Eurosurveill. 2019;24(34):pii=1900074. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2019.24.34.1900074