255 cas à Salmonella résistant liés à de la viande bovine et du fromage à pâte molle au lait cru, selon le CDC

« 255 cas à Salmonella résistant aux antibiotiques liés à de la viande bovine et du fromage à pâte molle, selon le CDC », source CIDRAP News.

Le Centers for Disease Control and Prevention (CDC) a présenté en détail une épidémie inhabituelle de 255 cas d’infections à Salmonella Newport dans 32 États, liée à la fois à de la viande bovine et à du fromage à pâte molle et présentant une résistance à de multiples antibiotiques.

« Les cas d’infection ont été liées à de la viande bovine obtenue aux États-Unis et à du fromage à pâte molle du Mexique, ce qui suggère que cette souche pourrait être présente chez les bovins des deux pays », a dit le CDC dans un aperçu envoyé aux médecins dans le cadre de ses efforts de la Clinician Outreach and Communication Activity (COCA).

« Les tests de sensibilité aux antibiotiques ont montré que la souche avait une sensibilité réduite à l'azithromycine et une non-sensibilité à la ciprofloxacine deux antibiotiques oraux couramment prescrits », a ajouté l'agence. « Cela laisse la ceftriaxone, un antibiotique injectable, comme option de traitement recommandée. »

Ian Plumb, auteur principal d’une étude sur l’épidémie publiée dans Morbidity and Mortality Weekly Report (MMWR), a déclaré à CIDRAP News: « Nous continuons de voir des cas survenir chez des patients. Le schéma de résistance aux antibiotiques de cette souche est alarmant parce que les antibiotiques oraux primaires utilisés pour traiter les patients atteints de ce type d’infection à Salmonella pourraient ne pas fonctionner. "

Plumb est épidémiologiste à l’Enteric Disease Branch du CDC. Lui et ses collègues dans la mise à jour de MMWR ont déclaré que l'azithromycine par voie orale est également une option. Plumb a ajouté par courrier électronique: « La plupart des patients atteints d'infections à Salmonella n'ont pas besoin d'antibiotiques, mais certains patients oui, en cas de maladie grave ou si un clinicien identifie les facteurs de risque de maladie grave. »

Il a ajouté: « Le meilleur moyen pour les cliniciens de guider le traitement est de vérifier si une bactérie est résistante pour ce patient en particulier. » Plumb a également noté que l'Infectious Diseases Society of America s avait publié ici des lignes directrices sur la gestion des infections à Salmonella.

Soixante hospitalisés, 2 décès

Les cas liés à l'épidémie remontent de juin 2018 à mars 2019, et le CDC a identifié pour la première fois la souche de Salmonella multirésistants (MDR pour multidrug resistant) en septembre, selon l’article de MMWR. Sur 206 patients pour lesquels des informations étaient disponibles, 89 (43%) ont signalé un voyage récent au Mexique.

Soixante patients sur 209 (29%) ont été hospitalisés, dont 4 (6% de ceux pour lesquels des données sont disponibles) nécessitant des soins intensifs. Dix des 255 patients (4%) avaient une bactériémie à Salmonella (infection du sang) et deux patients sont décédés, a précisé le CDC.

Les patients étaient âgés de moins de 1 à 90 ans et l'âge médian était de 36 ans. Plus de la moitié (58%) étaient des femmes et 65%, des hispaniques.

La CDC a déclaré dans son courrier électronique à COCA. « Les infections résistantes peuvent être plus difficiles à traiter et les patients risquent davantage de développer des complications graves. »

Parmi les patients qui ont voyagé au Mexique et qui avaient des informations sur les aliments qu'ils ont mangés, 41 sur 47 (87%) ont déclaré avoir consommé de la viande bovine et 29 sur 46 (63%) ont déclaré avoir consommé du fromage à pâte molle, a noté l’article de MMWR. Parmi les 29 personnes qui ont mangé du fromage à pâte molle, 23 (79%) ont déclaré avoir obtenu ce fromage au Mexique, le plus souvent sous forme de queso fresco, un fromage au lait cru (non pasteurisé).

Parmi les patients qui n'ont pas voyagé au Mexique, 20 sur 70 (29%) ont déclaré avoir consommé du fromage à pâte molle de style mexicain et 68 sur 73 (93%) ont déclaré avoir consommé de la viande bovine. Les inspecteurs ont détecté la souche épidémique dans des échantillons de viande bovine prélevés en novembre 2018 et en mars 2019 dans deux installations d'abattage et de transformation au Texas, a indiqué le CDC dans l’article de MMWR. Il a toutefois et ajouté que « l’examen des données des patients n’a pas permis d’identifier de fournisseur commun de viande ou de fromage contaminé. »

Quand on a demandé pourquoi le CDC annonçait cette épidémie via MMWR et non avec une annonce typique, Plumb a déclaré que l’article résumait une investigation complexe et ajoutait: « Les décisions d'avertir le public lors d'une investigation sont basées sur un certain nombre de facteurs, notamment: la source des infections a été identifiée et s’il existe de nouvelles recommandations à l’intention des consommateurs. »

« Cette enquête n'a pas identifié de produit contaminé spécifique, et les cas n'étaient pas liés géographiquement. Nos résultats corroborent les recommandations existantes du CDC visant à préparer la viande bovine en toute sécurité et de ne consommer que du fromage à pâte molle fabriqué avec du lait pasteurisé. »

Les vaches laitières, source possible

Les isolats du fromage mexicain, du caecum de bovins et des échantillons de bœuf ont été étroitement comparés par séquençage du génome complet.

« Dans cette épidémie MDR, la consommation de fromage et de bœuf étaient toutes deux associées à la maladie, ce qui indique que des vaches laitières étaient une source probable de ces infections », ont indiqué les auteurs dans MMWR. « La découverte de la souche épidémique dans du fromage acheté au Mexique et le pourcentage élevé de voyageurs au Mexique ayant déclaré avoir consommé du fromage à pâte molle de style mexicain suggèrent que le fromage à pâte molle en provenance du Mexique était une source d'infection.

« Le fromage à pâte molle de style mexicain a déjà été identifié comme une source d'autres épidémies à Salmonella. La consommation déclarée de queso fresco, des voyages dans diverses régions du Mexique et la détection de souches de Newport indiscernables que la contamination du fromage à pâte molle est le résultat du portage par le bétail plutôt qu’une mauvaise hygiène lors de la production du fromage. »

« Les vaches laitières sont souvent utilisées comme source de viande bovine hachée et ont été impliquées dans de précédentes épidémies de MDR avec Salmonella Newport. »

Plumb a déclaré: « Toute utilisation d'antibiotiques chez l'homme ou chez l'animal peut augmenter le risque de propagation de bactéries résistantes. Il est donc important de n'utiliser des antibiotiques que lorsque cela est nécessaire. Éviter un usage non nécessaire des antibiotiques dans le bétail qui sont utilisés chez l’homme pourrait prévenir la propagation des bactéries et peuvent réduire le risque de souches résistantes chez les animaux conduisant à une maladie chez l'homme. »

Émergence récente de la résistance aux antibiotiques

Parmi les 252 isolats testés pour la résistance aux antibiotiques, 226 (90%) avaient des gènes de résistance au triméthoprime-sulfaméthoxazole, à la tétracycline et au chloramphénicol, et à une sensibilité réduite à l'azithromycine, ont indiqué les experts du CDC dans leur article. Et 143 isolats (57%) ont démontré une résistance supplémentaire à l'ampicilline et à la streptomycine, ainsi qu'une non-susceptibilité à la ciprofloxacine. Tous les gènes de résistance étaient situés sur un plasmide IncR.

« La présence de gènes de résistance sur un plasmide est préoccupante en raison du risque de propagation à d'autres bactéries », ont déclaré les auteurs dans MMWR. Les plasmides peuvent transférer du matériel génétique non seulement entre bactéries de la même espèce, mais également entre espèces de pathogènes.

« La souche épidémique semble être apparue récemment parce que Newport présentant une sensibilité réduite à l'azithromycine n'a pas été détecté dans des isolats d'animaux, de viande au détail ou chez l'homme lors de la surveillance du ARMS [National Antimicrobial Resistance Monitoring System] avant 2016 », ont indiqué les auteurs.

Les auteurs concluent que « le séquençage du génome complet était utile pour lier les infections humaines à des sources alimentaires, distinguant la souche épidémique MDR d’une souche sensible aux antibiotiques provoquant une épidémie simultanée et prédisant la résistance aux antibiotiques. Dans cette épidémie, un patient sur trois a reçu des antibiotiques susceptibles d'avoir été inefficaces. »