vendredi 23 août 2019

Eclosions saisonnières liées à Salmonella Typhimurium chez des passereaux, des chats domestiques et des humains en Suède


Un passereau
Vient de paraître dans Eurosurveillance, un article sur « Eclosions saisonnières liées à Salmonella Typhimurium chez des passereaux, des chats domestiques et des humains en Suède ».

Je vous propose la traduction de la discussion.

La plupart des cas de salmonellose en Suède sont liés à des voyages à l'étranger ou à des aliments contaminés, mais la survenue de cas associés à des chats dans les premiers mois de l'année est connue de manière anecdotique depuis de nombreuses années.

Nous avons utilisé des données nationales provenant de sources multiples couvrant la période 2009-2016 pour montrer que des épidémies multi-espèces de S. enterica subsp. Enterica serovar Typhimurium (STm) associées aux passereaux se produisaient chez les passereaux, les chats domestiques et les humains au cours des premiers mois de certaines années, possiblement provoquées par les fluctuations de la population de passereaux et les événements de migration de masse.

Les données de Birdwatcher confirment que les passereaux en Suède recherchent des habitations humaines pour se nourrir en grand nombre certaines années, ce qui entraîne des niveaux d’exposition variables à STm associée aux passereaux d’une année sur l’autre, tant pour les chats domestiques que pour les humains.

Les facteurs sous-jacents de ce phénomène sont probablement complexes. De nombreuses espèces d'arbres produisent de grandes cultures de semences par intermittence, avec une production faible ou nulle pendant les années intermédiaires ; ces cycles peuvent être synchrones sur de grandes zones géographiques, affectant ainsi l'écologie des espèces animales qui se nourrissent des graines de l'arbre.

Par exemple, on sait que la production de graines d'épicéa et de bouleau influe sur la taille de la population et les mouvements hivernaux des chenilles rouges et des tarins des aulnes d'Europe, avec des années d'irruptions provoquant de faibles semis et une mortalité accrue.

D'autres facteurs, tels que la culture de semences de l'année précédente, les conditions météorologiques et la disponibilité de sources de nourriture alternatives (telles que les semences de plantes annuelles) ont également été pensés pour déclencher une migration irrégulière parmi les passereaux.

La prédation sur des oiseaux affaiblis avec une septicémie possible, par ex. autour des mangeoires pour oiseaux, est la voie d’infection la plus probable pour les chats, exposant probablement le chat à une dose infectieuse élevée.

L'incidence humaine de STm associée aux passereaux était significativement plus élevée dans les régions boréales du nord et du centre de la Suède.

Bien que cela puisse être un artefact du nombre limité d'observations et d'années d'échantillonnage, ainsi que d'autres incertitudes liées à la sous-déclaration de salmonellose chez l'homme, il est biologiquement plausible, que la Suède, du centre au nord étant plus riche en habitats forestiers d'épicéas et de bouleaux, a par conséquent des populations plus importantes d’espèces de passereaux.

Nous notons également une faible incidence dans la région de la capitale, le comté de Stockholm. Moins de ménages dans le comté de Stockholm que dans tout le pays ont un ou plusieurs chats (10% contre 17%) et plus de ménages vivent dans des immeubles à appartements (59% contre 41%). Ainsi, il est probable qu'une proportion plus faible de la population du comté de Stockholm interagisse avec un mangeur d'oiseaux de jardin ou un chat d'extérieur, par rapport aux autres comtés de la zone boreo-némorale, ce qui entraînerait probablement une exposition moindre à STm associée aux passereaux.

En Suède, STm associés aux passereaux chez les humains semblent toucher plus souvent les jeunes enfants et les personnes âgées. Il est possible que ces groupes soient davantage exposés aux chats d'extérieur, aux mangeoires d'oiseaux et aux environnements de jardin.

En outre, STm associée aux passereaux semble biaisée par l'hôte et ne possède pas de plasmide de virulence retrouvé dans de nombreuses autres souches de STm, caractéristique associée à un risque plus faible d'infection grave chez l'homme. Les adultes en bonne santé peuvent donc être hypothétiquement moins vulnérables à l’infection par ce variant de STm qu’avec d’autres variants.

Nous avons observé que STm associée aux passereaux était fortement saisonniers chez les passereaux, les chats et les humains. Les trois types d'hôtes ont connu un pic au début de l'année, en particulier en mars, des cas humains continuant de se produire au début de l'été, lorsque le nombre de cas chez les chats et les oiseaux a diminué.

Il est concevable que des oiseaux asymptomatiques ou une contamination persistante de l'environnement continuent de causer ces infections humaines plus tard dans la saison. Le pic de cette variante de STm contraste avec les autres infections domestiques à STm et la salmonellose en général en Suède, qui culmine à la fin de l'été.

La MLVA ainsi que le séquençage du génome complet ont confirmé le lien entre les différents hôtes de l'agent pathogène, bien que, comme prévu, les données de séquençage se soient révélées plus informatives.

L'épidémie de 2016 n'était pas clonale, ce qui correspond à une épidémie causée par des déclencheurs environnementaux agissant simultanément sur plusieurs sources d'infection - dans ce cas, des populations de passereaux dans différentes régions, par opposition aux souches hautement clonales fréquemment rencontrées chez une source unique, par exemple, des éclosions d'origine alimentaire.

Les données présentées doivent être interprétées avec prudence, car elles reposent largement sur une surveillance clinique passive. Une observation continue sur des périodes plus longues est donc justifiée. Cependant, bien que nous soyons loin de comprendre ce phénomène complexe, nous proposons que l'observation d'un nombre élevé de passereaux tels que le tarin des aulnes et le sizerin commun eurasiens en hiver puisse être utilisée comme un avertissement précoce d'un risque accru d'épidémies de salmonellose chez les chats et les humains.

Les sizerins flammés et les tarins des aulnes d'Eurasie sont des résidents dans la majeure partie du nord de l'Eurasie et plus au sud, par exemple. en Europe centrale et dans les Alpes, et sont aussi présents de manière saisonnière dans la plupart des pays d'Europe continentale.

Le bouvreuil eurasien réside dans la plupart des pays d’Europe. Comme mentionné précédemment, des épidémies de salmonellose chez ces oiseaux ont été signalées dans plusieurs pays européens.

En Amérique du Nord, le sizerin flammé commun est co-présent avec le tarin des pins (Spinus pinus), un proche parent du sizerin eurasien, les deux espèces connaissant des foyers périodiques de salmonellose.

Nos résultats sont donc susceptibles d'avoir des conséquences pour la santé publique et animale en dehors de notre zone d'étude en Suède. Les méthodologies de typage telles que MLVA et le séquençage du génome complet ont facilité l'échange de données entre les secteurs vétérinaire et de la santé publique, ainsi que la découverte de lignées distinctes d'agents pathogènes, améliorant ainsi la capacité de suivre la propagation zoonotique de bactéries.

L'utilisation continue de ces méthodes, ainsi que l'analyse rétrospective des isolats historiques et le partage international de données, devraient révéler davantage de lignées de STm adaptées à l'hôte et de liens épidémiologiques entre animaux et humains dans les années à venir.

Référence. 
Söderlund RobertJernberg CeciliaTrönnberg LindaPääjärvi AnnaÅgren ErikLahti Elina. Linked seasonal outbreaks of Salmonella Typhimurium among passerine birds, domestic cats and humans, Sweden, 2009 to 2016. 
Eurosurveill. 2019;24(34):pii=1900074. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2019.24.34.1900074

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