Les décès causés par des infections bactériennes représentaient plus d’un décès sur huit en 2019 est lié à des infections bactériennes, la deuxième cause de décès dans le monde, cinq agents pathogènes représentant plus de la moitié de ces décès, a rapporté hier une équipe internationale de chercheurs dans The Lancet.
Les résultats de l'étude, «Global mortality associated with 33 bacterial pathogens in 2019: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2019», qui est la première à fournir une estimation mondiale des décès associés aux pathogènes bactériens courants, indiquent que les infections bactériennes étaient la deuxième cause de décès en 2019 derrière les cardiopathies ischémiques et affectaient tous les groupes d'âge. Les 7,7 millions de décès estimés associés à 33 agents pathogènes bactériens représentaient 13,6% de tous les décès dans le monde en 2019.
Plus de 75% de ces décès ont été causés par trois syndromes de maladies infectieuses, et l'impact a été le plus important dans les pays à revenu faible et intermédiaire (PRFI). Le taux de mortalité le plus élevé associé aux infections bactériennes était en Afrique subsaharienne.
Les auteurs de l'étude affirment que les résultats soulignent la menace posée par les pathogènes bactériens pour les jeunes et les moins jeunes, que ces agents pathogènes soient résistants ou sensibles aux antibiotiques.
«Il est de la plus haute importance de mettre ces résultats sur le radar des initiatives de santé mondiale afin qu'une plongée plus profonde dans ces pathogènes mortels puisse être menée et que des investissements appropriés soient faits pour réduire le nombre de décès et d'infections», a déclaré Christopher Murray, co-auteur de l’étude et directeur de l'Institute for Health Metrics and Evaluation (IHME) de la faculté de médecine de l'Université de Washington, dans un communiqué de presse. A noter qu’il existe une version française de ce communiqué ici.
En analysant 343 millions de dossiers individuels de patients (y compris les dossiers des causes de décès et des hôpitaux) et des isolats d'agents pathogènes, ils ont estimé le nombre total de décès dans lesquels l'infection a joué un rôle, la fraction des décès attribuables à un syndrome infectieux donné et la fraction des décès par syndrome infectieux attribuables à un agent pathogène donné.
Les auteurs notent que s'il existe des estimations de décès liés à des agents pathogènes bactériens spécifiques et à des infections bactériennes invasives, elles ont jusqu'à présent été limitées à certains groupes d'âge ou à des pays à revenu élevé.
«Bien que de telles estimations offrent des informations importantes, aucune estimation complète n'existe couvrant tous les lieux pour un large éventail de bactéries dans les principaux syndromes infectieux», ont-ils écrit. «Pour cette raison, ces agents pathogènes et les syndromes infectieux pertinents ont été profondément négligés dans les campagnes mondiales de sensibilisation visant à maximiser les interventions vitales.»
Parmi les agents pathogènes étudiés, cinq - Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae et Pseudomonas aeruginosa - représentaient 54,9% des 7,7 millions de décès, S. aureus étant associé à plus de 1,1 million de décès.
Les pathogènes associés aux taux de mortalité les plus élevés variaient en fonction de l’âge. Avec 940 000 décès, S. aureus était associé au plus grand nombre de décès chez les adultes de plus de 15 ans. Les décès les plus nombreux parmi les enfants de 5 à 14 ans étaient associés à Salmonella enterica sérovar Typhi, avec 49 000 décès. Chez les enfants plus âgés que les nouveau-nés mais de moins de 5 ans, S. pneumoniae était le pathogène le plus mortel, représentant 225 000 décès. Le pathogène associé à la plupart des décès néonatals était K. pneumoniae, responsable de 124 000 décès.
«Une réalité qui donne à réfléchir est qu'une lourde charge d'infections traitables s'est produit dans les très jeunes groupes d'âge», ont écrit les auteurs.
Les syndromes infectieux responsables de plus de 6 millions des 7,7 millions de décès liés aux infections étaient les infections des voies respiratoires inférieures, les infections du sang et les infections péritonéales et intra-abdominales. Les décès causés par ces infections variaient selon les régions. L'étude note que ces estimations placeraient ces infections devant le VIH, le cancer et l'automutilation en tant que principales causes de décès dans le monde en 2019.
Les chercheurs ont également découvert que les 33 agents pathogènes avaient le plus grand impact sur les PRFI, en particulier ceux d'Afrique subsaharienne, qui avaient un taux standardisé selon l'âge de 230 décès pour 100 000 habitants. En comparaison, les pays à revenu élevé avaient le taux standardisé selon l'âge le plus bas associé aux agents pathogènes étudiés, à 52,2 décès pour 100 000.
Cette constatation est similaire à ce qui a été observé dans le rapport GRAM, qui a estimé que l'Afrique subsaharienne avait le taux de mortalité le plus élevé associé aux agents pathogènes résistants aux antibiotiques. Mais les auteurs notent que ces résultats indiquent que, pour les PRFI, la résistance aux médicaments n'est qu'un des nombreux facteurs qui rendent les infections bactériennes plus mortelles.
«Des antimicrobiens efficaces existent pour les 33 bactéries étudiées, mais une grande partie de la charge disproportionnellement élevé dans les PRFI pourrait être attribuable à un accès insuffisant à des antimicrobiens efficaces, à des systèmes de santé faibles et à des programmes de prévention insuffisants», ont écrit les auteurs.
L'impact des différents agents pathogènes variait également selon la région. Par exemple, S. aureus représentait 23% des décès causés par des infections du sang dans les pays à revenu élevé, contre seulement 5% des décès dus à des infections du sang en Afrique subsaharienne, où K. pneumoniae était la principale cause de décès causés par des infections du sang.
«Jusqu’à présent, nous ne disposions d’aucune estimation nationale pour certaines parties du monde où les habitants sont les plus affectés par les infections bactériennes», indiquait Authia Gray, co-auteur de l’étude et boursière post-licence à l’IHME à la faculté de médecine de l’University of Washington. «Ces nouvelles données pourraient nous aider à remédier à la charge disproportionnellement élevée des infections bactériennes dans les pays à revenus faible et moyens et pourraient, à terme, permettre de sauver des vies et d’épargner aux gens des années de vie perdues en raison de maladies.»
En fin de compte, les chercheurs espèrent que leurs estimations conduiront à une meilleure appréciation de la charge des infections bactériennes, ainsi qu'à des efforts de prévention ciblés et à davantage d'investissements dans la santé publique. Ils citent une étude de 2020 sur le financement mondial des chercheurs en maladies infectieuses qui a révélé que, de 2000 à 2017, la recherche sur Staphylococcus spp. et E coli ont reçu respectivement 1,4 milliard de dollars et 800 millions de dollars de financement. En comparaison, la recherche sur le VIH a reçu 42 milliards de dollars au cours de la même période.
«Les investissements dans la recherche sur le VIH sont certainement justifiés et, bien que les infections bactériennes puissent être traitées avec différentes stratégies qui se chevauchent, cette disparité de financement pourrait avoir été due, en partie, au manque de données sur la charge mondiale de ces agents pathogènes bactériens», ont-ils écrit.
