Comme le relate Joe
Whitworth dans un tweet, «Comme si les pathogènes alimentaires
ne suffisaient pas, ils sont aussi résistants aux antimicrobiens
...».
«Une étude met en évidence des
gènes de résistance chez les E. coli producteurs de shigatoxines»,
source article
de Chris Dall paru le 7 août 2023 dans CIDRAP News.
Le séquençage du génome entier d'e Escherichia coli producteurs de
shigatoxines (STEC) à partir de prélèvements fécaux humains a
révélé que près de 15% hébergeaient des gènes de résistance
aux antimicrobiens (RAM), ont rapporté des chercheurs anglais dans
Journal of Antimicrobial Therapy.
Dans
l'étude,
des chercheurs de la UK Health Security Agency ont extrait et
séquencé l'ADN de prélèvements fécaux de patients en Angleterre
suspectés d'infections gastro-intestinales, qui sont testés pour
une gamme de pathogènes gastro-intestinaux. Ils se sont concentrés
sur STEC O157:H7, le sérotype de STEC le plus fréquemment détecté
au Royaume-Uni, et ont utilisé un séquençage à lecture longue
pour décrire l'occurrence et la fréquence des déterminants de la
RAM dans les isolats de STEC O157:H7.
Dans l'ensemble, 216 (14,7%) des 1 473 isolats de STEC O157:H7
avaient au moins un déterminant de la RAM, bien que la proportion
d'isolats présentant une RAM variait selon la sous-lignée. Les
proportions les plus élevées de déterminants de la RAM ont été
détectées dans les sous-lignées Ib (28/64, 43,7%), I/II (18/51,
35,3%) et IIc (122/440, 27,7%).
Dans les sept sous-lignées, les gènes de la RAM les plus couramment
détectés conféraient une résistance aux aminoglycosides (11,7%),
aux tétracyclines (11,3%), aux sulfamides (11,7%) et aux
bêta-lactamines (8,8%). Les gènes de l’AMR conférant une
résistance aux fluoroquinolones, aux macrolides et aux
céphalosporines de troisième génération ont été rarement
détectés, et aucun gène de carbapénèmase n'a été détecté.
Les auteurs de l'étude disent que la proportion d'isolats de STEC
O157:H7 en Angleterre présentant une résistance à au moins une
classe d'antibiotiques a diminué au cours des deux dernières
décennies, passant de 20% dans les études précédentes à 14,7%
dans cette étude, une conclusion qu'ils suggèrent. pourrait être
lié à une utilisation plus réglementée des antibiotiques dans le
bétail britannique. En outre, ils notent que les souches associées
aux voyages en dehors du Royaume-Uni étaient plus susceptibles
d'héberger des gènes de résistance.
Ils disent que la mise en œuvre du séquençage à lecture longue
dans la surveillance de routine permettra aux responsables de la
santé publique de surveiller l'émergence et la propagation d'agents
pathogènes entériques résistants aux médicaments.
«La
surveillance de la RAM dans les agents pathogènes gastro-intestinaux
peut fournir une alerte précoce des risques émergents pour la santé
publique concernant la gestion clinique et le traitement empirique
des maladies infectieuses», ont-ils écrit.
