Notifications de l'hépatite A dans l'UE et de l’EEE, 2010-2019

«Notifications de l'hépatite A dans l'UE et de l’EEE, 2010-2019 : que pouvons-nous apprendre de la notification des cas au système européen de surveillance ?», source Eurosurveillance.

Les auteurs ont utilisé les données TESSy (The European Surveillance system) contenant les notifications HepA de 2010 à 2019, telles que rapportées par 29 pays de l'UE/EEE. 

Message clé de santé publique

Que vouliez-vous aborder dans cette étude ?

Nous voulions décrire les résultats des données recueillies en routine pour l'hépatite A dans les pays de l'Union européenne et l’Espace économique européen (UE/EEE) et montrer quelles zones et quels groupes de population sont les plus vulnérables à l'infection par le virus de l'hépatite A. Nous voulions également suggérer des améliorations qui pourraient rendre les données de surveillance de l'hépatite A plus utiles pour l'action de santé publique.

Qu'avons-nous appris de cette étude ?

Nous avons appris que l'épidémiologie de l'hépatite A présente des caractéristiques différentes selon les pays de l'UE et de l’EEE. Les pays de l'Est de l'UE ont enregistré le plus grand nombre d'infections, qui ont souvent touché des enfants ou de jeunes adultes. Les données étaient plus faibles dans d'autres pays de l'UE et de l’EEE où la population est sensible aux épidémies transfrontalières liées à l'alimentation ou aux pratiques sexuelles à risque, comme celles qui se sont produites en 2013-2014 et 2017, respectivement.

Quelles sont les implications de vos résultats pour la santé publique ?

L'hépatite A reste un problème de santé publique dans l'UE et de l’EEE. Les décideurs pourraient envisager d'améliorer la sécurité sanitaire des aliments, de renforcer la communication sur les risques et de vacciner les groupes à risque, conformément aux recommandations de l'OMS. La surveillance européenne de l'hépatite A pourrait être améliorée pour renforcer la planification des mesures de prévention ou de contrôle. La détection rapide, l'alerte et le partage transfrontalier d'informations sont des outils essentiels pour limiter l'étendue des éclosions d'hépatite A.

Dans la conclusion de l’article, il est rapporté,

TESSy reste un outil utile pour décrire l'épidémiologie de l'hépatite A dans les pays de l'UE/EEE. Cependant, sa capacité à planifier/évaluer les mesures de prévention/contrôle pourrait être améliorée en signalant des observations complètes et de haute qualité basées sur des cas concernant les antécédents de voyage, la voie de transmission et les résultats cliniques. De telles informations permettraient, par exemple, de planifier et de surveiller, ou d'envisager des politiques visant à augmenter la couverture vaccinale des voyageurs internationaux ou des groupes à risque accru d'issue grave. Cela permettrait également de hiérarchiser les réponses aux événements liés à la transmission alimentaire ou sexuelle.

Des milliers de cas à Yersinia sont potentiellement oubliés en Angleterre chaque année

Un tweet de Joe Whitworth de Food Safety News rapporte «Yersinia est déjà la 3e ou la 4e infection bactérienne d'origine alimentaire la plus courante dans l'UE, alors peut-être que cela pourrait et/ou devrait être difficile pour la 2e place ? En effet, Campylobacter et Salmonella sembent intouchables …

«Des milliers de cas à Yersinia sont potentiellement oubliés en Angleterre chaque année», source article de Joe Whitworth paru le 18 avril 2023 dans Food Safety News.

Des chercheurs ont estimé qu'environ 7 500 cas d’infections à Yersinia enterocolitica pourraient ne pas être diagnostiquées chaque année en Angleterre.

Les résultats suggèrent qu'un nombre considérable de cas de yersiniose ne sont pas enregistrés. Le montant apparemment faible est probablement dû à un manque d’analuses en laboratoire, ont dit des experts.

Des scientifiques ont examiné les données sur les cas à Yersinia en Angleterre entre 1975 et 2020 pour décrire les tendances dans le temps et pour estimer le nombre actuel de cas à Yersinia enterocolitica non diagnostiqués. Les résultats ont été publiés dans la revue Eurosurveillance, «Forgotten but not gone: Yersinia infections in England, 1975 to 2020.»

La yersiniose est l'un des agents bactériens d'origine alimentaire les plus répandus en Europe. Il existe une grande variation entre les pays, avec les taux les plus élevés au Danemark et en Finlande et les plus faibles en Roumanie et en Bulgarie. L'incidence signalée au Royaume-Uni est bien inférieure à la moyenne européenne.

Les normes britanniques stipulent que les échantillons fécaux ne doivent être testés que pour les espèces de Yersinia avec une suspicion clinique de yersiniose.

Impact d'un laboratoire

Dans l'ensemble, 8 023 cas d’infection à Yersinia confirmés en laboratoire ont été enregistrés en Angleterre entre 1975 et 2020. Les cas ont fortement augmenté au cours des années 1980 pour atteindre un pic en 1988 et 1989, suivi d'une forte diminution. L'incidence est restée faible jusqu'en 2016. La majorité des cas d’infection de 1975 à 2020 ont été causées par Yersinia enterocolitica.

De 2017 à 2020, une incidence accrue a été observée en association avec un laboratoire de Portsmouth dans le sud-est de l'Angleterre mettant en œuvre des tests PCR de routine.

Les cas à Yersinia enterocolitica signalés par le laboratoire de Portsmouth représentaient près de 60% des 546 patients signalés en Angleterre. L'incidence annuelle moyenne des infections pour la population desservie par le laboratoire était de 13,6 cas pour 100 000 habitants.

Si cette incidence était constante à travers l'Angleterre dans les populations ciblées par les laboratoires n'entreprenant pas de tests PCR de routine, une moyenne de 7 500 infections à Yersinia enterocolitica n'ont pas été diagnostiquées chaque année de 2017 à 2020, ont dit les chercheurs.

«Notre étude suggère que la véritable incidence des infections à Yersinia enterocolitica en Angleterre peut être aussi élevée, voire plus élevée que dans d'autres parties de l'Europe, que le déclin historique était artéfact et que nous manquons peut-être de bonnes données pour identifier la véritable tendance au fil du temps», ont-ils ajouté.

Sources d'infection et impact sur les patients

Les scientifiques ont dit que les changements dans l'épidémiologie de l'infection à Yersinia étaient passés inaperçus et pourraient refléter l'évolution des sources d'infection.

Il y a eu une diminution de la proportion de jeunes enfants malades et une augmentation des cas touchant les personnes âgées de 65 ans et plus. Près d'un tiers de tous les cas en Angleterre de 2017 à 2020 ont été diagnostiqués en mai et juin, alors qu'aucune tendance saisonnière de ce type n'a été observée dans les données antérieures.

Des questionnaires de surveillance ont été remplis par 45 des 115 patients couverts par le laboratoire de Portsmouth entre 2018 et 2019. Les symptômes courants étaient la diarrhée, les douleurs à l'estomac, les nausées et les maux de tête. Des douleurs articulaires et/ou dorsales, des vomissements, de la fièvre, des douleurs musculaires, du sang dans les selles et des étourdissements/évanouissements ont également été signalés.

La réalisation du questionnaire a eu lieu en moyenne 29 jours après que la date d'apparition des symptômes ait été signalée. Environ la moitié des répondants ont déclaré qu'ils étaient encore malades à ce moment-là. Pour ceux qui s'étaient rétablis, la durée moyenne de la maladie était de 16 jours. Lorsque les données étaient connues, neuf des 44 personnes avaient été admises à l'hôpital pendant une durée moyenne de deux jours.

Les résultats suggèrent que la yersiniose peut représenter un fardeau considérable pour les patients, la plupart présentant des symptômes persistants deux semaines après le début de la maladie.

Dix-huit personnes ont reçu un traitement contre la maladie avec des antibiotiques. Le voyage ou le retour au Royaume-Uni depuis l'étranger dans les sept jours précédant le signalement de la maladie a été rapporté par 10 personnes. Aucun contact avec des porcs n'a été mentionné, mais six personnes ont déclaré avoir manipulé du porc cru ou du jambon dans la semaine précédant la maladie.

Les chercheurs ont dit que les résultats fournissent un argument convaincant pour une approche de la surveillance de Yersinia en Angleterre et dans d'autres pays qui comprend des tests de routine et un suivi des cas par un questionnaire épidémiologique.

NB : L'image de Yersinia est issue du CDC.

Des données de surveillance montrent que la résistance aux antibiotiques de dernière intention augmente en Europe

«Des données de surveillance montrent que la résistance aux antibiotiques de dernière intention augmente en Europe», source article de Chris Dall paru le 14 avril 2023 dans CIDRAP News.

De nouvelles données publiées par le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) et l'Organisation mondiale de la santé (OMS) montrent une résistance élevée aux antibiotiques de dernière intention dans plusieurs pays européens.

Le deuxième rapport de surveillance conjoint sur la résistance aux antimicrobiens (RAM) en Europe, qui comprend des données sur les isolats bactériens invasifs signalés à deux réseaux de surveillance couvrant la région, montre des pourcentages élevés de Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii et Klebsiella pneumoniae résistants aux carbapénèmes dans les pays du sud et Europe de l'Est en 2021.

Les responsables de l'ECDC et de l'OMS disent que les niveaux élevés de résistance aux traitements de dernière intention menacent la sécurité des patients dans la région.

Niveaux de RAM plus élevés dans le sud et l'est de l'Europe

Bien que la situation varie selon les espèces bactériennes et les classes d'antibiotiques, les données du réseau OMS de surveillance de l'Asie centrale et de l'Europe de la résistance aux antimicrobiens (CAESAR pour Central Asian and European Surveillance of Antimicrobial Resistance) et du réseau européen de surveillance de la résistance aux antimicrobiens (EARS-Net pour European Antimicrobial Resistance Surveillance Network) de l'ECDC, qui couvrent ensemble 45 pays de la région, montrent généralement des niveaux plus élevés de RAM en Europe du Sud et de l'Est par rapport à l'Europe du Nord et de l'Ouest. C'est une tendance qui a été observée dans les rapports de surveillance précédents de la région.

Par exemple, moins de 1% des isolats de K. pneumoniae étaient résistants aux carbapénèmes dans 14 pays, tous situés dans les parties nord et ouest de la Région européenne de l'OMS. Les 15 pays où plus de 25% des isolats de K. pneumoniae sont résistants aux carbapénèmes se trouvent tous dans les parties sud et est de la région. Dans huit de ces pays, plus de 50% des isolats de K. pneumoniae étaient résistants aux carbapénèmes.

Des schémas similaires ont été observés pour K. pneumoniae résistants aux céphalosporines de troisième génération, ainsi que pour P. aeruginosa et A. baumannii résistants aux carbapénèmes, qui sont tous deux considérés comme des agents pathogènes prioritaires critiques par l'OMS. Alors que les taux de résistance aux carbapénèmes pour ces deux agents pathogènes étaient globalement plus élevés dans tous les pays de la région, les taux les plus faibles ont été signalés dans des pays comme le Danemark, les Pays-Bas, la Norvège, la Finlande et la Suède, et les plus élevés dans des pays comme l'Ukraine, la Biélorussie, la Serbie, Grèce et Russie.

Les antibiotiques carbapénèmes, qui comprennent le méropénème, l'imipénème et l'ertapénème, sont des antibiotiques à large spectre qui conservent leur activité contre de nombreux agents pathogènes multirésistants (MDR pour multidrug-resistant). La résistance croissante aux carbapénèmes signifie que les options de traitement des infections causées par des agents pathogènes multirésistants sont de plus en plus limitées.

«Ces résultats suggèrent la dissémination de clones résistants dans les établissements de santé et indiquent les sérieuses limitations des options de traitement auxquelles sont confrontés de nombreux pays pour les patients atteints d'infections causées par ces agents pathogènes», ont écrit les auteurs du rapport. «Comme les micro-organismes bactériens résistants aux antimicrobiens ne peuvent pas être confinés à l'intérieur des frontières ou des régions, ces résultats soulignent la nécessité d'une action concertée pour lutter contre la RAM dans toute la Région européenne de l'OMS et dans le monde.»

Alors que les taux de résistance sont plus variés et les gradients nord-sud et est-ouest et moins évidents pour d'autres combinaisons médicament-microbe, dont Escherichia coli résistant aux céphalosporines de troisième génération et Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline, les schémas sont toujours évidents. En Turquie, Russie, Ukraine et Macédoine du Nord, plus de 50% des E. coli, la cause la plus fréquente d'infections du sang et des voies urinaires, étaient résistants aux céphalosporines de troisième génération.

Les responsables de l'ECDC disent que le rapport souligne la nécessité de renforcer les efforts de détection et de prévention de la résistance aux antimicrobiens dans toute la région.

«Alors que des bactéries résistantes aux antibiotiques continuent d'émerger, des efforts supplémentaires sont nécessaires pour améliorer les pratiques de prévention et de contrôle des infections, réduire l'utilisation inutile d'antimicrobiens, concevoir et mettre en œuvre des programmes de gestion des antimicrobiens et garantir une capacité microbiologique adéquate», a dit Dominique Monnet, responsable de l'ECDC. de la Section de la résistance aux antimicrobiens et des infections nosocomiales, dans un communiqué de presse.

Sur une note plus encourageante, le rapport montre que plus de pays et de laboratoires de la région ont communiqué des données sur la RAM en 2021 que les années précédentes, et que le nombre de pays européens ayant élaboré un plan d'action national sur la RAM est passé de 34 en 2017 à 44.

L'association américaine Consumer Reports compile une liste de 10 «aliments à risque» à surveiller

Pas d’interdiction dans cette liste mais des conseils sur ces aliments à surveiller.

«Consumer Reports compile une liste de 10 «aliments à risque» à surveiller», source article de Coral Beach paru le le 31 mars 2023 dans Food Safety News.

Consumer Reports est une association américaine de consommateurs.

Consumer Reports a publié une nouvelle analyse de ce qu'il décrit comme des aliments à risque que les consommateurs devraient connaître.

La liste a été compilée après que l'association ait examiné les données de 2017 à 2022. Des chercheurs se sont concentrés sur les aliments largement consommés qui ont fait l'objet de rappels au cours de la période d'étude. Ils n'incluaient pas les aliments rappelés liés aux allergènes ou aux corps étrangers. Le rapport a classé les rappels en fonction du nombre de personnes décédées ou malades, ainsi que de l'étendue des épidémies et du nombre de fois qu'un aliment a été rappelé.

Les 10 aliments qui ont fait la liste sont :
- légumes verts à feuilles
- charcuterie et de la viande
- viande hachée bovine
- oignons
- dinde
- poulet
- papayes
- pêches
- melons cantaloups
- farine

«Nous ne disons pas que les consommateurs doivent éviter complètement ces aliments, a déclaré Brian Ronholm, directeur de la politique alimentaire chez Consumer Reports, qui a dirigé l'analyse.

«Après tout, ces aliments sont généralement sûrs et nombre d'entre eux font en fait partie des éléments d'une alimentation saine.» Au lieu de cela, dit-il, la liste souligne «l'importance de suivre les meilleures pratiques de sécurité des alimentw avec tous vos aliments, y compris de savoir comment suivre et répondre aux rappels d'aliments lorsqu'ils se produisent.»

Pour aider à réduire les risques pour les consommateurs, le gouvernement devrait s'engager dans une plus grande surveillance de la part des agences fédérales selon le rapport. L'inspection et la surveillance des exploitations agricoles et des parcs d'engraissement et l'octroi de plus d'autorité pour traiter les facteurs de risque critiques ainsi qu'une capacité accrue à suivre les aliments contaminés contribueraient grandement à rendre l'approvisionnement alimentaire américain plus sûr, selon les dirigeants de Consumer Reports.

Ils utilisent une lettre envoyée par le sénateur Dick Durbin, démocrate de l’Illinois, au commissaire de la FDA, Robert Califf, en février, comme exemple de l'étendue du problème. La lettre indiquait qu'il y avait plus de 81 000 établissements alimentaires enregistrés dans le pays et qu'ils relevaient tous de la juridiction de la FDA. Le nombre d'inspections a chuté de 60% de 2011 à 2021 avec respectivement 10 635 inspections contre 4 535,.

Du côté positif, la FDA a fait des progrès sur la règle de traçabilité alimentaire qui oblige les producteurs, les transformateurs, les emballeurs, les distributeurs, les épiceries et certains restaurants à concevoir des plans de traçabilité afin qu'ils puissent suivre d'où viennent les aliments et où ils vont. La règle entre en vigueur le 20 janvier 2026.

Parmi les bonnes nouvelles de l'industrie, mentionnons la publication de nouvelles lignes directrices par les associations de commercialisation des légumes verts à feuilles de Californie et d'Arizona. Les lignes directrices indiquent à quelle distance les producteurs peuvent planter des cultures par rapport aux endroits où les bovins sont élevés conformément aux exigences des tests avant récolte.

Au niveau de la vente au détail, trois grandes chaînes de distribution, Costco, Wegmans et Whole Foods, ont lancé des programmes qui exigent que certains produits de légumes verts à feuilles soient testés pour les agents pathogènes avant de pouvoir être expédiés dans leurs magasins.

Détails sur le Top 10 concernant les produits

Légumes verts à feuilles : Les produits qui ont été rappelés comprennent de la laitue romaine et des salades en sachet en raison de la contamination par E. coli et Listeria. Il est difficile d'éviter les agents pathogènes sur ces produits car ils sont généralement consommés crus, sans étape de destruction. Consumer Reports a constaté que les légumes verts à feuilles étaient à l'origine du plus grand nombre de décès et du deuxième plus grand nombre de rappels et d'épidémies avec 50. En comparaison, il y en avait enemble 30 pour le poulet, la dinde et le viane bovine hachée. Il y a eu 11 décès et 614 cas de maladie attribués aux légumes verts à feuilles. Plus de 2222 tonnes de produits ont été rappelées. Pour réduire leurs risques de tomber malades à cause des légumes verst à feuilles, Consumer Reports indique que les consommateurs devraient envisager d'acheter de la laitue pommée entière et d'enlever les feuilles extérieures où se trouvent souvent des agents pathogènes. Rincer les produits frais pour éliminer la saleté et les débris est une bonne idée, mais n'élimine pas les agents pathogènes tels que les bactéries.

Fromages et charcuterie : Les produits rappelés comprennent des saucisses, du salami, du jambon, des charcuteries, les fromages en tranches et les fromages à pâte molle, y compris le brie et le queso fresco. La principale raison des rappels a été la contamination par Listeria, selon Consumer Reports. Listeria peut survivre à des températures réfrigérées, ce qui rend les réfrigérateurs de charcuterie sans possibilité de tuer les microbes. L'équipement utilisé pour trancher les charcuteries et les fromages est difficile à nettoyer et peut contaminer de grandes quantités d'aliments avec de très petites quantités de bactéries. Listeria est un agent pathogène particulièrement dangereux avec neuf personnes sur 10 infectées nécessitant une hospitalisation. Le meilleur conseil est d'éviter les charcuteries et les fromages et d'acheter des versions préemballées à la place, selon Consumer Reports. Les fromages et viandes de charcuterie ont causé sept décès et 409 cas de maladie. Plus de 7 484 tonnes ont été rappelées.

Viande hachée bovine : Cette forme populaire de protéines a provoqué deux épidémies et 643 cas de maladie. Plus de 6 214 tonnes ont été rappelés. Salmonella et E. coli étaient les agents pathogènes à l'origine des problèmes. Une partie du problème est qu'un morceau de bœuf contaminé peut contaminer de grandes quantités de viande lorsqu'il est haché. Les coupes de viande entières, comme le steak, présentent moins de risques, car les bactéries présentes sur la zone extérieure sont facilement tuées lorsqu'il est cuit correctement, à moins que la viande n'ait été attendrie, ce qui entraîne que les contaminants de surface peuvent migrer vers l’intérieur. Pour minimiser la contamination à la maison, assurez-vous que la viande hachée bovine est cuite à une température interne de 71°C. Ne mesurez pas la température en regardant ou en touchant la viande; utiliser un thermomètre à viande.

Oignons : «Voici la première grande surprise de notre liste», selon le document de Consumer Reports. «Comment sont-ils arrivés ici ? Principalement à cause de deux rappels très importants d'oignons rouges, blancs et jaunes à cause de Salmonella en 2020 et 2021.» Ensemble, les deux rappels étaient liés à 2 167 patients et 427 hospitalisés. Il y avait plus de 35 380 tonnes d'oignons rappelés. La FDA a découvert que l'eau d'irrigation contaminée était la cause la plus probable du problème. Pour aider à minimiser les risques liés aux oignons, les consommateurs doivent toujours bien les faire cuire et éviter d'en acheter qui sont meurtris ou qui présentent des entailles ou d'autres dommages.

Poulet et dinde : Salmonella a provoqué le rappel de poulet et de volaille, y compris de la viande hachée et en morceaux. Il y a eu un décès lié à la dinde et deux au poulet. La dinde a causé 398 cas de maladie tandis que le poulet en a causé 190. Plus de 176 tonnes de dinde ont été rappelées. Plus de 88 tonnes de poulet ont été rappelées. La viande hachée de volaille présente les mêmes dangers que la viande hachée bovine. Mais contrairement aux coupes entières de bœuf, les volailles entières et les parties sont susceptibles d'être contaminées par Salmonella car ce pathogène est particulièrement répandu. Le processus de plumage, qui peut propager la bactérie, complique la situation. La volaille est également plus manipulée que la viande bovine, ce qui peut entraîner davantage de contamination croisée. De plus, les poulets et les dindes sont généralement élevés dans des conditions sales et surpeuplées. Enfin, les producteurs peuvent légalement vendre de la volaille contaminée par Salmonella même s'ils savent qu'elle est contaminée. Pour aider à minimiser les risques liés au poulet et à la dinde, les consommateurs peuvent les séparer des autres aliments lorsqu'ils font leurs courses et à la maison. La volaille doit également être cuite à une température interne de 73,8°C. De plus, la volaille ne doit pas être lavée, ni rincée, car cela peut propager des gouttelettes d'eau microscopiques dans la cuisine et contaminer pratiquement tout.

Papayes, pêches et melons : Les produits rappelés comprenaient des melons cantaloups entiers, des papayes et des pêches, mais le cantaloup précoupé, les melons miel et la pastèque posaient également des problèmes. Les papayes étaient responsables de 2 décès et de 332 cas de maladie. Plus de 272 tonnes ont été rappelées. Les pêches étaient responsables de 101 cas de maladie mais aucun décès n'a été confirmé. Plus de 51 255 tonnes ont été rappelées. Le cantaloup était à l'origine de 302 cas de maladie, mais aucun décès n'a été signalé. Plus de 279 000 «unités de vente au détail» ont été rappelées avec des poids variables. Salmonella était l'agent pathogène à l'origine de toutes les épidémies et rappels pour ces fruits. Consumer Reports indique qu'une voie de contamination probable pour les pêches est les parcs d'engraissement des animaux et la poussière qu'ils produisent. Les cantaloups et autres melons sont souvent contaminés pendant le processus de découpe. Comme pour la viande hachée et la salade en sachet, le mélange de fruits contaminés avec des fruits propres est un problème. Les outils pour couper les melons sont aussi un vecteur de contamination croisée. Pour les papayes, le risque semble être le plus grave avec les fruits importés du Mexique, soulignant la difficulté que la Food and Drug Administration peut avoir à inspecter les zones de production en dehors des États-Unis, selon Consumer Reports. Les consommateurs feraient mieux de ne pas acheter de fruits et légumes prédécoupés. Lorsque vous achetez des produits frais, évitez ceux qui sont meurtris ou endommagés. Le lavage des produits peut éliminer la saleté et d'autres débris, mais il n'élimine pas les bactéries.

Farine : La farine crue et la pâte et la pâte à frire sont en faites sont dangereuses. Salmonella et E. coli ont été retrouvés dans de la farine crue et ont rendu malades au moins 44 personnes, sans compter une nouvelle épidémie d'infections à Salmonella qui vient d'être signalée par la FDA avec 12 personnes infectées d'un océan à l'autre. Le blé peut être contaminé par une variété de choses dans les champs et cette contamination peut se propager à de grandes quantités de farine au cours du processus de mouture. Les consommateurs ne devraient pas laisser les enfants jouer avec de la farine crue et personne ne devrait manger même de petites portions de pâte crue.

Allemagne : La surveillance des pathogènes s'est poursuivie malgré les pressions de la COVID-19

«Allemagne : La surveillance des pathogènes s'est poursuivie malgré les pressions de la COVID-19», source article de Joe Whitworth parue le 14 février 2023 dans Food Safety News.

La surveillance de certains pathogènes bactériens a été maintenue en Allemagne malgré une réduction des soumissions d'échantillons pendant la première partie de la pandémie liée au coronavirus, selon le Robert Koch Institute.

En mars 2020, des mesures de contrôle des infections ont été prises en Allemagne pour faire face à la COVID-19. En août, le nombre de cas de salmonellose signalés était de 45,4% inférieur à la moyenne pour la même période de 2015 à 2019. Campylobacter a diminué de 22%, les infections à E. coli entérohémorragiques (EHEC) de 46%, la shigellose de 83%, la listériose de 22% et la yersiniose de 7%.

Le Centre national de référence pour Salmonella et autres bactéries pathogènes (NRZ Salm) et le laboratoire consultant pour Listeria (KL Listeria) du Robert Koch Institute (RKI) ont constaté une baisse du nombre d'échantillons soumis.

Les 20 principaux expéditeurs vers NRZ Salm et KL Listeria ont déclaré être occupés par les tests Covid mais avoir la capacité de tester les agents pathogènes bactériens. Cependant, ils ont reçu moins de demandes pour de tels tests. L'une des raisons en était la baisse des visites chez le médecin. Un autre facteur a été la réduction des voyages à l'étranger.

Cette découverte signifie qu'un changement dans la priorité des analyses de laboratoire en raison des exigences de tests pour la Covid pourrait être largement exclues comme raison de la baisse des soumissions d'échantillons bactériens, selon les scientifiques.

Bien que le nombre de cas ou d'échantillons soumis soit inférieur, la surveillance de certains agents pathogènes s'est poursuivie et des cas groupés ont été identifiées, ont-ils ajouté.

Salmonella et E. coli

En 2020, 264 des 510 isolats de Salmonella Enteritidis analysés ont pu être attribués à 17 clusters. Six clusters avaient plus de 20 isolats. Le plus grand avait 44 isolats.

Pour deux épidémies à Salmonella Enteritidis dans plusieurs pays, des isolats allemands très étroitement apparentés ont été identifiés et soumis au Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC).

Cependant, les données de séquençage du génome entier (WGS) doivent être étayées par des informations épidémiologiques pour identifier les épidémies, car les isolats regroupés par WGS ne signifient pas automatiquement qu'il y ait une épidémie.

En 2020, 774 cultures d’EHEC ont été analysées. Au printemps, plusieurs cas de STEC O153 ont été enregistrés dans le nord-ouest de l'Allemagne. NRZ Salm a reçu 19 isolats d'une épidémie à E. coli O26:H11 qui a touché plusieurs établissements pour enfants du nord-ouest du Mecklembourg fin novembre et début décembre.

De fin juillet à début octobre 2020, 50 cas du syndrome hémolytique et urémique (SHU) ont été enregistrés, notamment en Bavière et dans le Bade-Wurtemberg dans le sud de l'Allemagne. Cependant, une éclosion a été exclue car parmi 22 isolats disponibles pour le séquençage, 12 types différents de E. coli ont été retrouvés et il n'y avait aucune correspondance dans les échantillons de patients.

La surveillance moléculaire a révélé 27 petits cas groupés avec deux à cinq isolats. Dans aucun d'entre eux, il n'y avait de preuves d'aliments spécifiques comme source d'infection.

Listeria et Campylobacter

En 2020, KL Listeria a reçu 441 soumissions d'isolats cliniques de Listeria monocytogenes en provenance d'Allemagne. Au total, 259 des isolats ont pu être attribués à 82 clusters. Un cluster comptait 55 isolats, un autre en avait 16 et deux en avaient 12.

En comparant les séquences avec le LNR pour Listeria monocytogenes de l'Institut fédéral allemand d'évaluation des risques (BfR), il a été possible d'identifier des isolats alimentaires pour 26 des clusters actifs en 2020.

Quatre grands clusters à Campylobacter ont été identifiés, qui avaient 18, 22, 27 et 71 isolats par cluster. Des isolats similaires d'autres pays, en particulier au Danemark et au Luxembourg, ont été retrouvés, il semble donc que des cas de maladie se soient produits au-delà des frontières, selon les scientifiques.

L'OMS poursuit l'urgence mondiale contre la poliomyélite tandis qu'une faille a été constatée dans une installation de fabrication de vaccins aux Pays-Bas

««L'OMS poursuit l'urgence mondiale contre la poliomyélite alors qu'une faille a été constatée dans une installation de fabrication de vandisaccins aux Pays-Bas»,  article de Lisa Schnirring paru le 2 février 2023 dans CIDRAP News.

Bien que des progrès aient été réalisés contre la poliomyélite, le risque de propagation internationale du poliovirus circulant dérivé d'un vaccin de type 2 (PVDVc2) reste élevé et lasource situation justifie toujours une urgence de santé publique de portée internationale (USPPI), a dit l'Organisation mondiale de la santé (OMS).

L'annonce fait suite à une recommandation du comité d'urgence de l'OMS contre la poliomyélite, qui s'est réuni le 25 janvier pour discuter des derniers développements. Le groupe a également noté une faille dans le confinement du poliovirus sauvage de type 3 (WPV3 pour wild poliovirus type 3) chez un fabricant de vaccins aux Pays-Bas, que des chercheurs néerlandais ont détaillée dans le dernier numéro d'Eurosurveillance.

Cas en baisse en Afghanistan et au Pakistan

L'OMS a déclaré pour la première fois une USPPI pour la poliomyélite en mai 2014 en raison de la propagation internationale du poliovirus sauvage de type 1 (PVS1), et son comité d'urgence, qui se réunit généralement tous les 3 mois, s'est maintenant réuni 34 fois.

Dans sa déclaration, le comité d'urgence a noté que les cas de PVS1 en Afghanistan et au Pakistan ont considérablement diminué, mais que la détection de PVS1 dans l'environnement se poursuit, ce qui suggère une propagation continue. Le comité a déclaré qu'il ne restait que trois clusters génétiques du poliovirus sauvage de type 1 (WPV1), qui se trouvent en Afghanistan, en Afrique et au Pakistan, et que la diversité génétique du virus s'était réduite.

Bien que les cas de PVDVc2 diminuent, le risque de propagation internationale reste élevé en raison de la transmission en Afrique, de détections dans les Amériques, en Europe et en Israël, et d'une détection récente en Indonésie. Le groupe a également fait part de ses inquiétudes concernant le PVDVc1, la souche de type 1 dérivée du vaccin, en Afrique, en particulier dans le contexte des cas de PVS1 au Mozambique et des lacunes de l'immunité de la population.

La surveillance est cruciale pour identifier les failles de laboratoire

Dans un article paru dans Eurosurveillance, des chercheurs néerlandais ont décrit une détection de PVS3 en novembre 2022 dans le cadre de la surveillance entourant un laboratoire travaillant sur les vaccins de la poliomyélite à Bilthoven. Un échantillon d'eaux usées était positif pour le virus infectieux, qui était génétiquement similaire aux stocks de vaccins utilisés dans l'établissement.

De plus, les auteurs de l'étude ont trouvé de légères différences de mutation qui suggéraient une excrétion humaine. Les enquêteurs, utilisant des protocoles nationaux et internationaux, ont effectué des tests sérologiques et ont découvert qu'un employé avait probablement été récemment infecté. Des prélèvements de selles de l'employé entièrement vacciné et asymptomatique étaient positifs pour le PVS3.

L'employé a accepté de s'isoler volontairement dans une zone à forte couverture vaccinale le 8 décembre, sous la supervision des autorités sanitaires locales. L'excrétion du virus s'est poursuivie pendant 33 jours et l'employé a quitté l'isolement le 11 janvier. Aucun signe de transmission continue n'a été retrouvé.

Les auteurs ont écrit que l'affaire montre que des failles de confinement, dont celles qui conduisent à une infection, peuvent passer inaperçues et que la surveillance environnementale est cruciale pour les identifier.

Des données de surveillance montrent que les infections à Salmonella multirésistantes augmentent aux États-Unis

«Des données de surveillance montrent que les infections à Salmonella multirésistantes augmentent aux États-Unis», source article de Chris Dal paru le 17 janvier 2023 dans CIDRAP News.

Des chercheurs des Centers for Disease Control and Prevention et du département de la Santé du Minnesota ont signalé à la fin de la semaine dernière une augmentation des infections causées par une souche multirésistante aux antibiotiques (MDR pour multidrug-resistant) de Salmonella liée à des porcs.

Dans une étude publiée dans Emerging Infectious Diseases, les chercheurs ont examiné les données de cinq systèmes de surveillance nationaux pour décrire l'épidémiologie, la résistance aux antimicrobiens et la génétique moléculaire des infections causées par Salmonella enterica I sérotype 4,[5],12:i:-, qui est le cinquième sérotype de Salmonella le plus fréquemment signalé dans le pays. Les infections causées par cette souche sont en augmentation depuis les années 1990 et ces dernières années ont vu l'émergence d'isolats de cette souche résistants à l'ampicilline, à la streptomycine, au sulfaméthoxazole et à la tétracycline (ASSuT).

Parmi les isolats de Salmonella signalés au Laboratory-based Enteric Disease Surveillance System de 2009 à 2018, 19 212 (4,3%) provenant de 37 États étaient 4,[5],12:i:-. Quarante-neuf pour cent des isolats 4,[5],12:i:- inclus dans la surveillance des National Antimicrobial Resistance Monitoring Systems présentaient un profil de résistance incluant l'ASSuT, et 35% n'avaient qu'une résistance à l'ASSuT. De 2009-2013 à 2014-2018, la fréquence des infections à 4,[5],12:i:- est passée de 3,7% à 4,9% des infections à Salmonella signalées, et le pourcentage de 4,[5],12:i:- avec la résistance ASSuT passée de 1,1% à 2,6%.

Parmi les isolats séquencés par PulseNet de 2015 à 2018, 69% appartenaient au même clade phylogénétique MDR, et 77% des isolats de ce clade présentaient des déterminants génétiques de la résistance à l'ASSuT, tandis que 16% présentaient des déterminants génétiques d'une sensibilité réduite à la ciprofloxacine, la ceftriaxone, ou l'azithromycine.

Parmi les foyers liés aux 4,[5],12:i:- MDR signalés de 2009 à 2018, 63% étaient associés à la consommation de porc ou au contact avec des porcs.

«Nos résultats indiquent que les infections à 4,[5],12:i:- ont augmenté aux États-Unis en raison d'un clade MDR qui s'est étendu depuis 2010», ont écrit les auteurs de l'étude. «La maladie est susceptible d'avoir résulté de la transmission par les porcs qui la portent. Une sélection supplémentaire de cette souche chez les porcs pourrait être évitée en limitant l'utilisation agricole inutile des classes d'antibiotiques auxquelles la souche est résistante et en limitant l'utilisation inutile de métaux lourds dans les aliments pour animaux.»

«La maladie est probablement due à la transmission par des porcs qui l’hébergent.»

Suite à une intoxication alimentaire à norovirus, les huîtres de l'étang Thau ont-elles été interdites trop tard ?

Le blog avait signalé que plusieurs rappels d’huîtres de Bouzigues le 1er janvier s’étaient déroulés bien après la date de commercialisation. En effet, environ 181 lots d’huîtres ont été commercialisé du 16 au 29 décembre 2022.

D’où cette information de France bleu, «Une famille scandalisée après avoir été intoxiquée par les huîtres de l'étang de Thau.»

Les huîtres de l'étang Thau ont-elles été interdites trop tard ? C'est ce que dénonce une famille de Perpignan victime d'une intoxication aux huîtres de l'étang de Thau. Selon eux, la préfecture de l'Hérault a tardé avant de prendre des mesures.

Paul habite près de Perpignan. Pour les fêtes, il achète des lots d'huîtres sans savoir qu'à l'intérieur se trouve des coquillages de Bouzigues (Hérault). Huit membres de sa famille sont tombés malades dans la soirée du 26 décembre. «Notre réveillon est tombé à l'eau, avec en plus, un arrêt de travail» dit-il. Ils ont tous eu la gastro-entérite et ont contaminé d'autres personnes de l'entourage.

Aujourd'hui, Paul dénonce le laxisme de la part de la préfecture de l'Hérault. Pour lui, les autorités de santé auraient dû faire des tests dans l'étang de Thau bien avant par précaution. «Les huîtres ont été probablement contaminées suite à un épisode pluvieux du 14 au 16 décembre, malheureusement ça n'a pas suffit pour déclencher des tests de l'eau pour détecter le virus. C'est regrettable, en période de fête, les autorités auraient dû faire ces analyses par précaution.»

Un complement, ces analyses ne sont pas réalisées par précaution par prévention.

Le préfet de l'Hérault a suspendu la récolte et la vente des huîtres, des moules et des palourdes sur le bassin de l'étang de Thau à partir du 30 décembre pour tous les coquillages récoltés après le 15 décembre. Selon le directeur de la Direction départementale de la protection de la population, Yann Louguiet, impossible de faire des tests en amont. «C'est difficile d'anticiper. Le norovirus peut se trouver alors même qu'il est inactif» explique-t-il. L'arrêté préfectoral a été mis en place au moins jusqu'à mi-janvier.

Dans la note de service de la DGAL (DGAL/SDSSA/2021-990) du 28-12-2021 sur la «Gestion du risque norovirus en lien avec la consommation de coquillages.»

Les zones de production de coquillages ne font pas l’objet de surveillance règlementaire pour les norovirus. En revanche, certains événements susceptibles de contaminer le milieu par des pollutions d’origine humaine ou animale sont pris en compte dans la surveillance microbiologique des zones de production de coquillages (REMI) et peuvent générer des alertes préventives (dites «de niveau zéro»). Ainsi, la surveillance microbiologique régulière des zones de production participe à la maîtrise du danger norovirus et donc à la prévention des viroses alimentaires dues aux norovirus. Ces mesures de prévention se fondent sur la prise en compte de signaux d’alerte (cf. NS DGAL/SDSSA/N2013-8166) tels que la pluviométrie, le dysfonctionnement de systèmes d’assainissement ou des résultats d’autocontrôles défavorables….  

Ce qui est à préciser et à documenter,

- y a-t-il eu déclenchement d’une alerte après l’épisode de pluviométrie du 14 au 16 décembre 2022 par les autorités sanitaires ?

- y a-t-il eu des autocontrôles suite à cet épisode de pluviométrie ?

- la réponse du directeur de la DDPP reste une énigme, je ne sais ce que signifie, «Le norovirus peut se trouver alors même qu'il est inactif.» En d’autres termes qu’est un nororovirus 'inactif' dans l'environnement ?

- contrairement à ce que rapporte le directeur de la DDPP, «impossible de faire des tests en amont. C'est difficile d'anticiper.» En fait, cela est tout à fait possible car «la surveillance microbiologique régulière des zones de production participe à la maîtrise du danger norovirus et donc à la prévention des viroses alimentaires dues aux norovirus.»

- Ce qui est arrivé à cette famille et à ses proches sera-t-il en compte comme toxi-infection alimentaire collective ?

On lira aussi la version juin 2022 de la fiche de l’Anses sur norovirus.

De la fraude aux sushis en Allemagne

Second article sur l’Allemagne, après la surveillance microbiologiques des salades prêtes à consommer, voici un bref article sur la fraude aux suhis.

En plus du riz et des légumes, les sushis contiennent souvent du poisson et des fruits de mer. En plus des «classiques» comme le saumon ou le thon, des espèces plus chères sont également proposées. Cependant, les fraudeurs de produits alimentaires les échangent illégalement contre des types bon marché et augmentent ainsi illégalement leurs profits. Selon l'Office fédéral de la protection des consommateurs et de la sécurité des aliments (BVL) dans 8,1% de tous les prélèvements, une espèce animale autre que celle spécifiée a été détectée.

En 2021, le plan national 2021 de surveillance a examiné 186 prélèvements de sushis, dont certains étaient proposés dans des ensembles de différents types de sushis. Au total, 229 sous-échantillons, dont 191 poissons et 38 crustacés et mollusques, ont été contrôlés pour les espèces animales.

Les sushis au saumon et au thon ont été examinés le plus fréquemment. Dans ces cas, les espèces de poissons déclarées correspondaient aux espèces détectées dans tous les prélèvements examinés. Cependant, dans plus d'un tiers des échantillons (35,9%) des autres poissons examinés, des espèces animales autres que celles spécifiées ont été détectées. Le plus souvent, dans 8 échantillons sur 9, le maquereau a été utilisé.

L'incitation à la contrefaçon dépend, entre autres, de la facilité de la manipulation, du profit qui peut être réalisé et de la difficulté à prouver la fraude. Après avoir transformé le poisson, par exemple, après filetage, il est difficile d'identifier les espèces de poissons en fonction de la forme extérieure. Il peut donc être intéressant pour les fabricants de transformer des poissons bon marché issus de l'aquaculture, tels que le pangasius ou le tilapia, au lieu de poissons de mer coûteux.

Friedel Cramer, président de l'Office fédéral de la protection des consommateurs et de la sécurité des aliments (BVL), déclare : «La fraude alimentaire impliquant du poisson est souvent à peine reconnaissable par les consommateurs. C'est d'autant plus important que le contrôle alimentaire officiel continue d'être actif ici et arrête les fraudeurs.»

De la surveillance microbiologiques des salades prêtes à consommer en Allemagne

Premier volet d'une série de quatre articles courts sur la sécurité des aliments en Allemagne. Selon le BVL, l'Office fédéral de la protection des consommateurs et de la séurité des aliments, «Des salades conditionnées prêtes à l’emploi sont souvent contaminées par des germes. Les groupes de consommateurs sensibles doivent s'abstenir de consommer.»

Dans le cadre de la surveillance 2021 des zoonoses, plus de 400 échantillons de mâche, roquette et laitue préemballés ont été examinés en 2021. Bacillus cereus présumé a été détecté dans presque un échantillon sur deux (46,7%), ce qui peut entraîner des vomissements et de la diarrhée si le nombre de germes est élevé. Dans une moindre mesure ont également été des STEC (E. coli producteurs de shigatoxines) et Listeria monocytogenes. Étant donné que les salades sont consommées crues et que les germes ne sont pas tués par la chaleur, l'Office fédéral de la protection des consommateurs et de la sécurité des aliments (BVL) indique que les groupes de consommateurs sensibles doivent s'abstenir de consommer de la salade préemballée par précaution.

Dans le cadre du suivi des zoonoses 2021, plus de 400 échantillons de mâche, roquette et laitue préemballés ont été examinés. Bacillus cereus présumé a été détecté dans 200 des 428 échantillons (46,7%). La consommation d'aliments contaminés par Bacillus cereus présumé peut provoquer des vomissements ou de la diarrhée. Un danger potentiel pour la santé provient notamment de taux élevés de germes supérieurs à 10⁵ unités formant colonies par gramme (UFC/g), comme cela a été détecté dans 2,1% des prélèvements examinés.

De plus, dans 8 des 423 prélèvements de laitue (1,9%), des STEC ont été retrouvés qui peuvent provoquer une inflammation intestinale aiguë. 10 des 433 échantillons (2,3%) contenaient un petit nombre de Listeria monocytogenes.

«Contrairement à ce que pensent de nombreux consommateurs, la laitue emballée n'est pas complètement sûre. Elle peut héberger des risques microbiens», explique le professeur Michael Kühne pour le groupe de travail national sur la protection des consommateurs (BAS). Par mesure de précaution, les personnes dont le système immunitaire est affaibli ne doivent pas manger de salades préemballées.» Au lieu de cela, il est conseillé de préparer soi-même des salades à partir d'ingrédients frais et soigneusement lavés peu de temps avant la consommation.

NB : La photo illustre un tweet du BVL sur les résultats. Traduction par Google.

Norvège, surveillance des toxines d’algues dans les coquillages en 2021

«Le programme de surveillance des toxines d’algues dans les coquillages en 2021», source Matilsynet.

De manière générale, moins de coquillages toxiques ont été détectés durant les années Covid-19 2020 et 2021 que durant les trois années précédentes. Nous ne pouvons pas déterminer si cela est dû à moins d'échantillons ou moins de proliférations de plancton d’algues toxiques.

n 2021, un total de 723 prélèvements de coquillages ont été réalisés et analysés pour diverses toxines ; 384 échantillons du programme de surveillance annuel de l'Autorité norvégienne de sécurité des aliments (y compris la Mussel Alert ou Alerte aux moules) et 339 échantillons des propres échantillons de contrôle des producteurs.

Le nombre d'échantillons de l'industrie était un peu moins important en 2021 car la demande de coquillages était plus faible en raison de la Covid-19 avec des restaurants et des hôtels fermés.

Sur la surveillance des toxines d’algues dans les coquillages

La côte norvégienne est surveillée tout au long de l'année pour détecter les toxines d'algues marines dans les coquillages dans le cadre de la récolte commerciale et du commerce en plus des alertes aux moules.

Les échantillons de coquille sont analysés à la fois pour les toxines liposolubles DSP ou diarrheic shellfish poisoning (groupe OA), AZA, YTX et PTX et les toxines hydrosolubles avec la neurotoxine PSP ou Paralytic Shellfish Poisoning (groupe STX ou saxitoxine), et pour la toxine amnésique ASP (groupe DA).

Qu'avons-nous enquêté ?

Principalement des moules, mais aussi des pétoncles, des huîtres plates, des huîtres du Pacifique, des coques, des palourdes, des palourdes, des couteaux, des clams, des palourdes rondes, des escargots royaux et des oursins.

Période : 2021

Que cherchions-nous ? 

Les toxines d'algues DSP, YTX, PTX et AZA, PSP et ASP. 

Qu'avons-nous trouvé ?

Environ 98% de toutes les moules analysées étaient inférieures à la valeur limite pour le DSP (groupe OA).
Pour PSP (groupe STX), environ 95% étaient en dessous de la valeur limite, tandis qu'environ 99% étaient en dessous de la valeur limite pour ASP.
Pour les groupes de toxines YTX, PTX et AZA, tous les échantillons étaient inférieurs aux valeurs limites.
Moules : elles ont eu le plus de détections de DSP et de PSP au-dessus de la valeur limite, mais l'ASP a également été détecté au-dessus de la valeur limite
Pétoncles : PSP et ASP ont été détectés au-dessus de la valeur limite
Huîtres plates : PSP a été détecté au-dessus de la valeur limite dans l'ouest de la Norvège pendant une période en avril
PSP : comme les années précédentes, a été principalement détecté au printemps et au début de l'été.
DSP : les détections au-dessus de la valeur limite ont été réparties sur toute l'année d'avril à octobre avec un pic en septembre. Ceci est cohérent avec les années précédentes où DSP se produit principalement à la fin de l'été et à l'automne.