Des champignons et des bactéries font équipe pour une meilleure santé des carottes

«Des champignons et des bactéries font équipe pour une meilleure santé des carottes», source ARS USDA.

Des chercheurs de l'ARS identifient des microbes du sol qui combattent les maladies et favorisent la croissance des carottes.

Le mystérieux monde souterrain des carottes pourrait contenir des réponses sur les puissantes défenses naturelles contre les maladies destructrices des plantes, selon le Dr Philipp Simon, généticien des plantes et directeur de recherche à l’ARS Vegetable Crops Research Unit à Madison, Wisconsin.

En collaboration avec le Dr Lori Hoagland de l'Université Purdue, Simon et son équipe ont identifié 13 genres spécifiques de champignons et de bactéries qui vivent à l'intérieur des plantes, collectivement appelés endophytes, qui peuvent s'accrocher aux carottes et combattre les maladies ou même favoriser la croissance des carottes.

Les résultats sont significatifs, car les carottes sont le sixième légume frais le plus consommé aux États-Unis et représentent la plus grande part de marché de toutes les cultures du secteur bio.

Les découvertes de Simon et Hoagland représentent une étape importante dans le maintien de cette culture en bonne santé.

«Lorsqu'elles étaient correctement ‘associées’ à ces microbes endophytes, les carottes étaient capables de mieux tolérer le stress induit par la brûlure foliaire Alternaria, une maladie causée par le champignon Alternaria dauci», a expliqué Simon. «La brûlure alternarienne des feuilles est un pathogène destructeur et coûteux de la carotte qui peut se propager rapidement s'il n'est pas contrôlé, de sorte que toute protection contre celle-ci peut avoir d'énormes implications pour les producteurs. Traditionnellement, des fongicides chimiques, des herbicides et des pesticides étaient utilisés pour lutter contre A. dauci, mais avec des endophytes, nous utilisons des alliés naturels.»

L'équipe a découvert que certaines familles bactériennes (Rhizobium, Bacililus, Stenotrophomonas et Pseudomonas) étaient capables de se déplacer vers les racines des plantes, d'entrer et de contourner le système immunitaire des plantes et de se fixer avec succès aux carottes. Ils ont également identifié deux facteurs cruciaux qui contribuent à favoriser les partenariats entre les carottes et les endophytes : les gènes de la carotte et les pratiques de construction du sol.

Après avoir examiné plus de 30 variétés commerciales et lignées de sélection différentes, ils ont observé que la constitution génétique de certaines variétés de carottes les rendait particulièrement réceptives à la liaison avec des endophytes. Ils ont également constaté que les tactiques de gestion des cultures axées sur la construction de meilleurs sols, en particulier en ajoutant des matières organiques, amélioraient la relation carotte-endophytes.

Hoagland a noté que plusieurs variables peuvent influencer la santé du sol et les microbes qui y vivent, notamment la capacité de rétention d'eau du sol, l'oxygène disponible et les niveaux de pH. Des pratiques telles que le travail du sol peuvent également influer indirectement sur l'activité microbienne, car le travail du sol épuise la matière organique du sol dont les microbes se nourrissent. Pour aider à reconstituer la matière organique et à créer une communauté microbienne bénéfique, Simon et Hoagland recommandent aux producteurs de réduire le travail du sol, d'ajouter du compost et d’utiliser des cultures de couverture.

«Bien que cette recherche soit encore en cours, nous constatons que l'utilisation de ces alliés microbiens pour lutter contre les maladies de la carotte comme la brûlure alternarienne des feuilles est tout à fait plausible», a dir Simon. «Des études sur d'autres cultures ont montré que les microbes associés aux plantes peuvent favoriser la croissance globale en aidant à augmenter la disponibilité des nutriments pour les plantes.»

Désormais, il semble que les carottes puissent également bénéficier de ce type d'alliance microbienne saine.

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