La FDA publie son rapport sur l'épidémie liée à de la laitue romaine

Doug Powell du barfblog signale que « Scott Gottlieb et Frank Yiannas ont mis en ligne un communiqué sur le site de la FDA le 13 février détaillant les conclusions de l'investigation de l'agence sur plus de 50 cas de maladies à E. coli O157 à l'automne 2018. »

Nous annonçons aujourd’hui les résultats de cette investigation et nos meilleures hypothèses sur la manière dont cette contamination aurait pu se produire. Dans le cas d'une exploitation agricole ayant un prélèvement positif précédemment référencé, la FDA estime que la manière la plus probable de la contamination de la laitue romaine dans cette exploitation agricole spécifique a été l'utilisation de l'eau de ce réservoir en tant qu'eau agricole. On pense que cette eau est entrée en contact avec une partie récoltée de la laitue romaine, car la souche épidémique de E. coli O157:H7 a été retrouvée dans les sédiments du réservoir et dans aucun autre lieu prélevé. L’eau du réservoir n’explique pas en quoi la laitue cultivée dans d’autres exploitations agricoles identifiées par la traçabilité peut avoir été contaminée. Donc, cette exploitation agricole ne peut pas expliquer l'intégralité de l'épidémie. 

La découverte de la souche épidémique dans les sédiments du réservoir d’eau est importante, car des études ont montré que E. coli générique peut survivre dans les sédiments beaucoup plus longtemps que dans les eaux sous-jacentes. Il est possible que la souche épidémique ait été présente dans le réservoir d’eau de l'exploitation agricole pendant quelques mois, voire des années, avant que l’équipe d’investigation ait recueilli le prélèvement positif. Il est également possible que la souche épidémique ait été introduite à plusieurs reprises dans le réservoir à partir d'une source inconnue.

Les équipes ont trouvé des preuves d'une activité intense d'animaux sauvages, notamment de la sauvagine, des rongeurs, des coyotes, etc., et des terriers pour des animaux près du réservoir contaminé. Cela mérite probablement d'être considéré comme une source possible de l'agent pathogène humain présent dans le réservoir d'eau de l'exploitation agricole. C'est un autre facteur sur lequel nous allons travailler avec l'exploitation agricole. De plus, l’utilisation des terres adjacentes, y compris l’utilisation d’amendements du sol, ou le pâturage d’animaux sur des terres avoisinantes, pourraient avoir contribué à cette évolution.

Le rapport complet peut être trouvé ici.

Ma partie préférée du rapport, selon Doug Powell, est cette recommandation des enquêteurs:

Effectuez une analyse des causes profondes lorsqu'un agent pathogène d'origine alimentaire est identifié dans l'environnement de cultures, dans les intrants agricoles (par exemple, les amendements pour l'eau ou le sol agricoles), dans les produits agricoles bruts ou dans les produits fraîchement découpés prêts à être consommés. Une analyse de la cause fondamentale a pour objectif de déterminer la source probable de la contamination, si les mesures de prévention ont échoué et si des mesures supplémentaires sont nécessaires pour empêcher leur réapparition.

D'après mon expérience, cette approche d'analyse des causes fondamentales est aléatoire lorsque des agents pathogènes sont détectés au cours de prélèvements de routine (mais un lecteur de barfblog peut peut-être me fournir des détails pour savoir s'il sait que des personnes le font).