Salmonella contre le microbiome

«Salmonella contre le microbiome», source revue parue dans Microbiology and Molecular Biology Reviews.

Résumé

Un microbiote intestinal équilibré contribue à la santé, mais les mécanismes de maintien de l'homéostasie restent insaisissables. L'assemblage du microbiote au cours de la petite enfance est régi par la compétition entre les espèces et par des facteurs environnementaux, appelés filtres d'habitat, qui déterminent la gamme de caractères réussis au sein de la communauté microbienne. Ces filtres d'habitat comprennent le régime alimentaire, les ressources dérivées de l'hôte et les métabolites dérivés du microbiote, tels que les acides gras à chaîne courte. Une fois le microbiote mûri, la compétition et le filtrage de l'habitat empêchent la greffe de nouveaux microbes, offrant ainsi une protection contre les infections opportunistes.

La compétition avec les entérobactéries endogènes, le filtrage de l'habitat par des acides gras à chaîne courte et un filtre d'habitat dérivé de l'hôte, l'hypoxie épithéliale, contribuent également à la résistance à la colonisation contre les sérotypes de Salmonella. Cependant, à une dose de challenge élevée, ces pathogènes francs peuvent surmonter la résistance à la colonisation en utilisant leurs facteurs de virulence pour déclencher une inflammation intestinale. À son tour, l'inflammation augmente la disponibilité luminale des ressources dérivées de l'hôte, telles que l'oxygène, le nitrate, le tétrathionate et le lactate, créant ainsi un état de filtrage anormal de l'habitat qui permet au pathogène de surmonter l'inhibition de la croissance par les acides gras à chaîne courte. Ainsi, l'étude du processus d'invasion des écosystèmes par les sérotypes de Salmonella clarifie que la résistance à la colonisation peut être affaiblie en perturbant le filtrage de l'habitat défini par l'hôte. Ces informations sont pertinentes pour comprendre comment l'inflammation déclenche la dysbiose liée aux maladies non transmissibles, conditions dans lesquelles les entérobactéries endogènes se développent dans le microbiote fécal en utilisant certaines des mêmes ressources limitant la croissance requises par les sérotypes de Salmonella pour l'invasion des écosystèmes. En substance, l'invasion des écosystèmes par les sérotypes de Salmonella suggère que l'homéostasie et la dysbiose représentent simplement des états où la compétition et le filtrage de l'habitat sont respectivement normaux ou anormaux.