Impact de diverses conditions d'élevage porcin sur la résistance aux antibiotiques

«Impact de diverses conditions d'élevage porcin sur la résistance aux antibiotiques», source AEM.

De grandes quantités d'antibiotiques sont utilisées en agriculture pour assurer le bien-être et la productivité des animaux et sont sans doute une force motrice pour la persistance de bactéries résistantes à l'environnement et aux aliments. Poulin-Laprade et coll. démontrent que la résistance aux céphalosporines de troisième génération était plus fréquente chez les animaux sans antibiotiques, tandis que les bactéries isolées à partir d'animaux recevant de la pénicilline étaient résistantes à un plus grand nombre d'antibiotiques en moyenne. De plus, il existe une co-sélection claire entre les gènes conférant une résistance aux antibiotiques pertinents pour la santé humaine et les antibiotiques couramment utilisés comme traitements curatifs dans les exploitations porcines canadiennes.

Le titre de l'article est, «Déterminants de la résistance et leur contexte génétique chez les entérobactéries à partir d'une étude longitudinale de porcs élevés dans diverses conditions d'élevage».

Résumé

Les porcs sont les principaux réservoirs d'entérobactéries résistantes qui peuvent atteindre les humains par la consommation de viande ou de légumes contaminés cultivés dans un sol fertilisé avec du fumier.

Des échantillons ont été prélevés sur des truies pendant la lactation et sur leurs porcelets à cinq moments du cycle de production. Les bactéries résistantes au céfotaxime ont été quantifiées et isolées des aliments pour animaux, des excréments, du fumier et des carcasses de porcs élevés dans des élevages utilisant de la pénicilline ou sans antibiotiques.

Les isolats ont été caractérisés par des tests de sensibilité aux antibiotiques, un séquençage du génome entier et des essais de conjugaison. Le phénotype des β-lactamases à spectre étendu (BLSE) était plus fréquent dans les isolats provenant d'animaux sans antibiotiques, tandis que les bactéries isolées d'animaux utilisant de la pénicilline étaient en moyenne résistantes à un plus grand nombre d'antibiotiques. Les gènes codant pour les BLSE identifiés étaient bla_CTX-M-1, bla_CTX-M-15 et bla_CMY-2, et ils se sont colocalisés sur des plasmides avec divers gènes codant pour la résistance aux β-lactames, au cotrimoxazole, aux phénicols et à la tétracycline, tous les antibiotiques. utilisé dans la production porcine. Les groupes de gènes conférant la résistance observée et les éléments mobiles disséminant la résistance multidantibiotiques ont été déterminés. La résistance observée aux β-lactamines était principalement due aux actions complémentaires des protéines de liaison à la pénicilline, une pompe à efflux et des β-lactamases. La plupart des déterminants de la résistance étaient partagés par les animaux élevés avec ou sans antimbiotiques. Cela suggère une contribution clé des entérobactéries indigènes transmises par la mère le long de la lignée des truies indépendamment de l'utilisation d'antibiotiques. On ne sait pas si la résistance aux antibiotiques observée dans les populations d'entérobactéries des troupeaux de porcs commerciaux étudiés était présente avant l'utilisation d'antibiotiques ou dans quelle mesure l'utilisation d'antiibiotiques historiques a exercé une pression sélective définissant les populations bactériennes résistantes dans les élevages utilisant la prophylaxie à la pénicilline.

Importance

La résistance aux antibiotiques est une menace mondiale qui doit être combattue sur de nombreux fronts le long du continuum 'Une seule santé'. De grandes quantités d'antibiotiques sont utilisées en agriculture pour assurer le bien-être et la productivité des animaux et sont sans doute une force motrice pour la persistance de bactéries résistantes à l'environnement et aux aliments. Cette étude a évalué l'impact des pratiques d'élevage conventionnelles, biologiques et autres sans antibiotique sur la fréquence et la nature des gènes de résistance aux antibiotiques et des entérobactéries multirésistantes. Elle fournit des connaissances sur la contribution relative des déterminants spécifiques de la résistance à la résistance aux antibiotiques observée. Elle montre également la co-sélection claire des gènes codant pour les bêta-lactamases à spectre étendu et des gènes codant pour la résistance aux antibiotiques couramment utilisés en prophylaxie ou dans les traitements curatifs dans les exploitations porcines.