Augmentation mondiale des gènes de résistance aux antibiotiques dans les plasmides conjugatifs. Plus que jamais One Health ?

Très intéressant article paru dans Microbiology Spectrum, une revue de l’American Society for Microbiogogy qui traite de l’augmentation mondial des gènes de résistance aux antibiotiques dans les plasmides conjugatifs (Global Increase of Antibiotic Resistance Genes in Conjugative Plasmids). Article disponible en intégralité.

Globalement, un plasmide conjugatif est un plasmide possédant des gènes permettant son transfert d’une bactérie à une autre lors de la conjugaison.  Ces gènes peuvent être des gènes de résistance aux antibiotiques (GRA).

Résumé

La résistance aux antibiotiques se propage dans le monde entier, mais les mécanismes de diffusion prédominants ne sont pas entièrement compris. Ici, nous rapportons que l'abondance des gènes de résistance aux antibiotiques (GRA) dans les plasmides conjugatifs qui sont enregistrés dans la base de données de plasmides RefSeq du National Center for Biotechnology Information (NCBI) augmente à l'échelle mondiale, ce qui est probablement un facteur clé dans la propagation de la résistance.

L'abondance de GRA dans les plasmides a été multipliée par 10 à l'échelle mondiale entre 2000 et 2020 (de 0,25 à 2,93 copies de GRA/plasmide), une augmentation plus prononcée étant observée dans les pays à revenu faible à intermédiaire. Cette tendance à la hausse des GRA d’origine plasmidique a été corroborée par un rééchantillonnage bootstrap pour chaque année de la base de données de plasmides NCBI RefSeq.

Les résultats d'une analyse de corrélation impliquent que si la consommation d'antibiotiques continue de croître aux taux actuels, une augmentation globale de 2,7 fois de l'abondance des GRA des plasmides cliniquement pertinents pourrait être atteinte d'ici 2030. Des similitudes de séquence élevées de plasmides conjugatifs cliniquement pertinents qui sont isolés à la fois en clinique et dans l'environnement soulèvent des inquiétudes quant au résistome environnemental servant de réservoir de maintenance des GRA potentiels qui facilite la transmission à travers ces frontières écologiques.

Importance

La propagation de la résistance aux antibiotiques est une préoccupation importante en raison de ses impacts prévus sur la santé mondiale et l'économie.

Cependant, les mécanismes de propagation mondiaux ne sont pas entièrement compris, dont les tendances régionales et temporelles de l'abondance des plasmides de résistance qui facilitent la dissémination des gènes de résistance aux antibiotiques (GRA).

Cette étude sans précédent rapporte que l'abondance de GRA dans les plasmides conjugatifs qui sont enregistrés dans la base de données du National Center for Biotechnology Information (NCBI) et hébergent des GRA augmente à l'échelle mondiale avec la consommation d'antibiotiques, en particulier dans les pays à revenu faible à intermédiaire.

Grâce à des analyses génomiques en réseau et comparatives, nous avons également trouvé des similitudes élevées de séquence de plasmides conjugatifs de résistance cliniquement pertinents qui ont été isolés à partir de sources cliniques et environnementales, suggérant une transmission entre ces frontières écologiques. Par conséquent, cette étude éclaire la perspective One Health pour développer des stratégies efficaces permettant de freiner la propagation de la résistance aux antibiotiques d'origine plasmidique.