L'analyse génomique de E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) chez un enfant révèle des informations sur un pathogène virulent et émergent d'origine alimentaire

« L'analyse génomique de E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) chez un enfant révèle des informations sur un pathogène virulent et émergent d'origine alimentaire », source communiqué de l’Université de Buffalo (UB).

Les résultats d’une infection grave d’un enfant en bas âge pourraient aider à identifier des marqueurs génétiques et des vaccins potentiels pour ce pathogène de plus en plus courant.

Les agents pathogènes d'origine alimentaire sont très courants et généralement bénins, mais certaines souches virulentes d'agents pathogènes peuvent entraîner des maladies graves et même la mort. Distinguer des souches spécifiques d'agents pathogènes peut aider les scientifiques à mieux les comprendre et à développer des biomarqueurs pour les détecter chez les patients, accélérant ainsi le diagnostic et le traitement.

Des chercheurs de l'Université de Buffalo ont maintenant terminé l'analyse génomique d'une souche spécifique de E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) qui peut provoquer de graves épidémies et est de plus en plus courant. La recherche pourrait jouer un rôle dans l'élargissement de la compréhension des infections à STEC et, potentiellement, dans le développement de vaccins contre elles.

Selon les Centers for Disease Control and Prevention, les STEC sont à l'origine de plus de 265 000 infections par an aux États-Unis et sont associées à plus de 3 600 hospitalisations et à environ 30 décès.

Publié dans BMC Genomics le mois dernier, l'article décrit l'analyse génomique réalisée sur une souche STEC unique isolée d'un enfant de 2 ans et demi par ailleurs en bonne santé vivant dans le comté de Davidson, Tennessee. L'agent pathogène a provoqué une maladie grave, y compris le syndrome hémolytique et urémique, une maladie qui détruit les globules rouges, abaisse les plaquettes et bloque les vaisseaux sanguins dans les reins, entraînant une anémie et des lésions rénales.

L'enfant a survécu mais a été hospitalisée pendant un mois et a subi de graves complications affectant plusieurs systèmes organiques, notamment ses poumons, son cœur, ses reins, son cerveau, son système circulatoire et son tractus gastro-intestinal.

Une préoccupation de santé publique croissante

La bactérie E. coli producteurs de shigatoxines dont elle a été infectée est un STEC non-O157. Alors que les agents pathogènes classés comme infections à STEC O157 sont généralement plus courants et entraînent une maladie plus grave, le nombre d'agents pathogènes émergents non-O157 STEC est en augmentation. Certains mènent à des maladies graves, créant un problème de santé publique croissant, selon les chercheurs de l'UB.

L’article indique qu'il existe plus de 400 de ces souches STEC non-O157, et plus d'un quart sont signalés comme provoquant des maladies gastro-intestinales, se présentant souvent d'abord comme une diarrhée sanglante avec syndrome hémolytique et urémique et, si elles ne sont pas traitées, dans de rares cas, la mort.

Le pathogène spécifique avec lequel l'enfant était infecté était un STEC O145:H25. « Étant donné que les études génomiques sur les STEC émergents non-O157 sont limitées, nos études sont importantes car elles révèlent la composition génétique des STEC O145:H25 émergents par rapport aux autres souches de STEC », a dit Oscar G. Gómez-Duarte, auteur correspondant sur l'article, professeur et chef de la division des maladies infectieuses pédiatriques du département de pédiatrie de la Jacobs School of Medicine and Biomedical Sciences de l'UB et pédiatre de l'UBMD Pediatrics.

« Les résultats révèlent comment ce STEC émergent provoque une maladie grave et qu'il peut être aussi virulent, voire plus virulent, que les souches STEC plus courantes, conduisant à une maladie grave et même mortelle chez les hôtes sensibles », a-t-il dit. « Il fournit également des informations sur la manière dont cette infection potentiellement évitable continue d'affecter les personnes vulnérables. »

Gènes de virulence

Une conclusion clé de l'étude, a-t-il dit, était que ce sérotype O145:H25 conduit à une infection particulièrement grave. De plus, en plus de porter des gènes de virulence présents dans les STEC O157, il possède des gènes supplémentaires et de nouveaux gènes de virulence potentiels par rapport aux autres souches non-O157 qui ont été étudiées. « Ces résultats méritent une analyse plus approfondie pour comprendre la pathogenèse de ces infections émergentes à STEC », a déclaré Gómez-Duarte.

Lire le communiqué de l’Académie nationale de médecine : Masquez-vous, masquez-vous, masquez-vous