Une étude s’intéresse à la présence de E. coli et de Campylobacter dans les exploitations agricoles et dans le lait cru en Finlande

« Une étude s’intéresse à la présence de E. coli et de Campylobacter dans les exploitations agricoles et dans le lait cru », source Food Safety News.

E. coli et Campylobacter peuvent persister dans les exploitations laitières pendant des mois et contaminer le lait du tank non pasteurisé vrac malgré certaines mesures d'hygiène, selon une thèse.

Les travaux d’Anniina Jaakkonen ont étudié la fréquence et les facteurs contributifs de la contamination du lait par les E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) et de Campylobacter jejuni dans les exploitations laitières finlandaises. Il s'appuient sur trois publications: une en 2017 dans la revue Zoonoses and Public Health, une autre en 2019 dans Applied Environmental Microbiology et la dernière en avril de cette année dans la revue PLoS ONE.

Dans les première et troisième études, une exploitation laitière a d'abord été échantillonnée en raison d'une suspicion d'épidémie. Le premier article décrit une épidémie à STEC O157 avec 11 cas identifiés dans le sud-ouest de la Finlande en juin 2012. Six enfants ont été hospitalisés, dont quatre avec un type d'insuffisance rénale appelée syndrome hémolytique et urémique (SHU), après avoir bu du lait de vache cru de la ferme locale. La ferme a été échantillonnée pendant l'épidémie et trois mois plus tard.

La troisième article est une étude de suivi d’une flambée de campylobactériose dans l’ouest de la Finlande en novembre 2012. Deux enfants ont été hospitalisés pour une diarrhée sanglante et une infection à Campylobacter jejuni après avoir consommé du lait de vache cru acheté dans une ferme locale. La ferme a été échantillonnée au cours des six mois suivant l'épidémie.

Dans le deuxième article de la recherche, trois fermes laitières ont été recrutées après un isolement préalable à la ferme de STEC O157:H7 et de Campylobacter jejuni. Elles ont été échantillonnées entre janvier 2014 et juin 2015. Malgré l'isolement simultané de STEC O157:H7 ou de Campylobacter jejuni provenant de bovins, ces bactéries ont rarement été isolées des filtres à lait et du lait.

E. coli et Campylobacter isolés dans les exploitations laitières

Les mesures d'hygiène comprenaient la désinfection continue des auges pour boire et pour manger et des zones contaminées. Des pratiques d'hygiène améliorées ont été appliquées à la traite et à la manipulation des aliments pour animaux et du fumier. Pour décontaminer le lait du tank vrac dans les fermes associées à l'épidémie, soit la salle de lait a été remplacée, soit la machine à traire et le tank ont été rincés à l'acide et les composants ont été remplacés.

En Finlande, les ventes à la ferme sont autorisées jusqu'à 2 500 kilogrammes par an sans approbation officielle. Les fermes qui vendent annuellement plus que cette quantité de lait non pasteurisé ont besoin d'avoir un établissement alimentaire approuvé et d'un plan de surveillance des pathogènes.

Dans la première étude, des STEC O157:H7 ont été isolés des excréments de bovins et de l'environnement de la ferme, à partir de neuf échantillons dans les trois mois suivant l'épidémie. Dans la deuxième étude, des STEC O157:H7 ont été isolés des trois fermes au cours d'une période d'échantillonnage d'un an. La contamination par des STEC se produit pendant la traite, lorsque le bétail excrète la bactérie, malgré une hygiène stricte à la ferme. Des STEC O157:H7 ont persisté dans deux troupeaux jusqu'à 12 mois.

Campylobacter jejuni a été isolé de toutes les fermes laitières dans les trois études, mais ce n'est que dans la troisième étape de la recherche que des isolats ont été récupérés à partir de lait du tank vrac. Il a contaminé de manière persistante le lait de tank vrac pendant sept mois malgré les mesures d'hygiène. Seule la souche à l'origine de l'épidémie de séquence type (ST) 883 a été isolée du lait, bien que d'autres types aient été isolés de la ferme.

Retouver et réduire la contamination

Les STEC étaient rarement isolés du lait du tank vrac et des filtres à lait et seulement simultanément avec l'isolement fécal. Les taux de détection plus élevés provenaient des filtres à lait que du lait par les méthodes de culture et par PCR en temps réel. Ainsi, les filtres à lait sont des cibles d'échantillonnage plus fiables pour la surveillance des STEC que le lait.

La contamination du lait par les bactéries STEC peut être réduite, mais pas évitée, par des pratiques à la ferme. L'effet de neuf facteurs de risque sur la contamination par stx du lait de tank vrac, en tant qu'indicateur de la contamination par les STEC, a été étudié. La réduction de la contamination du lait était associée à l'abattage des vaches laitières, au nettoyage majeur dans l'étable et au pâturage des vaches laitières.

Une température extérieure moyenne plus élevée était associée à une contamination accrue du lait. Aucun effet n'a été observé pour cinq facteurs de risque: anomalies dans l'alimentation, entretien et pauses de l'équipement de traite, nombre de jours de pluie, nombre total de bactéries et le nombre total de cellules.

Jaakkonen a conclu que toutes les fermes produisant du lait cru de consommation devraient appliquer des mesures d'hygiène économiques pour réduire le risque de contamination. Ces étapes ne peuvent pas prévenir totalement la contamination du lait et le traitement thermique du lait cru avant sa consommation est recommandé pour des raisons de sécurité sanitaire.