Dans une étude publiée l'année dernière dans The Lancet, une équipe internationale de chercheurs a estimé que 1,27 million de personnes sont décédées en 2019 d'une infection résistante aux antibiotiques, et près de 5 millions de décès étaient associés à la résistance aux antimicrobiens (RAM).
L'étude, l'une des premières à chiffrer concrètement le fardeau mondial de la résistance aux antimicrobiens, a révélé que les pathogènes bactériens résistants aux médicaments constituent une menace majeure pour la santé mondiale et sont aussi meurtriers que les maladies infectieuses comme le VIH et le paludisme. Et bien qu'ils constituent une menace pour le monde entier, la charge de la mortalité la plus élevée se trouve dans les pays à revenu faible et intermédiaire (LMICs pour low- and middle-income countries), en particulier ceux d'Afrique subsaharienne et d'Asie du Sud.
«Les charges élevées de la RAM liée aux bactéries sont fonction à la fois de la prévalence de la résistance et de la fréquence sous-jacente des infections critiques telles que les infections des voies respiratoires inférieures, les infections du sang et les infections intra-abdominales, qui sont plus élevées dans ces régions», ont écrit les auteurs de l'étude.
L'étude, ainsi que de nombreuses autres qui ont été menées dans les LMICs, a cité plusieurs raisons pour lesquelles la RAM a un impact disproportionné dans les milieux à faibles ressources. Parmi eux : l'utilisation inappropriée d'antibiotiques qui peuvent être facilement achetés sans ordonnance, les antibiotiques contrefaits et de qualité inférieure, et le manque d'assainissement et d'hygiène. Tous jouent un rôle dans l'augmentation des taux de résistance.
Mais le facteur le plus important est peut-être le manque d'outils de diagnostic qui peuvent déterminer le bon antibiotique nécessaire pour l'infection d'un patient ou si un antibiotique est nécessaire. La disponibilité limitée de ces diagnostics dans les pays pauvres, qu'il s'agisse d'un système automatisé capable d'identifier la bactérie spécifique à l'origine d'une infection et de tester la sensibilité aux antibiotiques, ou d'un test rapide capable de déterminer si une infection est bactérienne ou virale, entrave la capacité de ces pays à faire face à la menace croissante de la résistance aux antimicrobiens au niveau le plus élémentaire.
«La disponibilité d'aides au diagnostic pour soutenir ou informer l'utilisation prudente des médicaments antimicrobiens», a déclaré à CIDRAP News Otridah Kapona, scientifique au laboratoire spécialisé dans la résistance aux antimicrobiens à l'Institut national de santé publique de Zambie. «Et l'inverse est vrai : le manque de capacité de diagnostic, je dirais, soutient l'utilisation inappropriée des médicaments antimicrobiens.»
Dans la plupart des hôpitaux des pays riches, les cliniciens ont accès à des systèmes automatisés coûteux qui peuvent fournir une identification rapide des agents pathogènes et effectuer des tests de sensibilité aux antibiotiques (TSA) directement à partir d'échantillons de patients. Mais dans de nombreux hôpitaux des LMICs, les bactéries provenant d'échantillons de patients doivent être cultivées pour identifier l'agent pathogène spécifique et effectuer des tests de sensibilité aux antibiotiques, un processus qui peut prendre 2 à 3 jours.
En conséquence, les cliniciens dans ces milieux ne connaissent souvent pas la bactérie spécifique qui cause l'infection et finissent par traiter les patients en fonction de leurs symptômes et de leur propre expérience clinique. Le résultat typique est un traitement avec des antibiotiques à large spectre qui couvrent un large éventail de bactéries mais peuvent favoriser la résistance.
«Nous ciblons à peu près tout», a déclaré Kapona. "Nous ne sommes pas spécifiques dans notre gestion, et l'utilisation de tels médicaments accélère le rythme auquel la résistance aux antimicrobiens se développe dans des pays comme la Zambie.»
Des scénarios similaires sont observés dans d'autres LIMCs dépourvus du type de systèmes de diagnostic sophistiqués qui pourraient permettre aux cliniciens de déterminer rapidement l'antibiotique spécifique nécessaire. Une étude menée en 2020 par des chercheurs du Center for Disease Dynamics, Economics & Policy a révélé que l'utilisation d'antibiotiques «Watch», un étiquetage donné aux antibiotiques à large spectre qui, selon l'OMS, ne devrait pas être utilisée pour les infections de routine en raison de leur potentiel plus élevé de promotion de la résistance a augmenté de 165% dans les LIMCs de 2000 à 2015.
Les capacités de diagnostic limitées dans les hôpitaux et le manque de laboratoires de référence clinique capables d'effectuer des tests pour les hôpitaux ne sont pas les seules raisons de cette augmentation ; un mauvais assainissement et une incidence plus élevée d'infections résistantes aux médicaments sont également des facteurs. Mais le manque de capacité de diagnostic joue un rôle important.
«Il y a très peu de laboratoires capables de faire de la microbiologie, où ils peuvent identifier correctement un organisme et effectuer des tests de sensibilité aux antimicrobiens pour informer les antimicrobiens que le médecin doit utiliser pour traiter ce patient ou client particulier», a déclaré Kapona.
Et cela a un effet en cascade, selon Cecilia Ferreyra, directrice du programme RAM de la Foundation for Innovative New Diagnostics (FIND). Si les cliniciens hospitaliers n'envoient pas d'échantillons bactériens pour être cultivés et testés pour la sensibilité parce que le processus prend trop de temps, alors les hôpitaux n'ont pas une idée des profils de résistance pour divers agents pathogènes et ne peuvent pas élaborer de directives de traitement précises.
«Lorsqu'un patient se rend à l'hôpital et que nous n'avons pas de diagnostics qui peuvent rapidement me dire si ce patient a une infection à Klebsiella ou une infection à staphylocoque… je ne saurai pas quoi utiliser», a déclaré Ferreyra. «Et parce qu'il y a ce manque général de données sur ce qu'est un profil résistant dans ces contextes, je vais prescrire quelque chose qui pourrait ou non être vraiment utile du tout.»
Le manque de diagnostics affecte également la prescription d'antibiotiques au niveau communautaire dans les milieux à faibles ressources, où les petites cliniques de soins primaires ont encore moins de ressources. Comme Ferreyra, Kapona et leurs collègues l'ont noté dans un article publié l'année dernière dans PLOS Global Public Health, le test le plus largement utilisé dans ces contextes pour déterminer si une infection est virale ou bactérienne, le test de la protéine C réactive (CRP), ne peut pas distinguer si les niveaux élevés de CRP sont causés par des bactéries ou par le paludisme, la dengue ou la COVID-19. Et d'autres tests sur le marché sont trop chers pour les milieux à faibles ressources.
Sans tests rapides, précis et abordables au point de service qui peuvent rapidement distinguer si une infection est bactérienne ou virale, les adultes et les enfants qui entrent avec de la fièvre ou des symptômes respiratoires causés par un virus sont susceptibles de repartir avec des antibiotiques, ce qui sont souvent considérés comme une solution simple et rapide.
