Etats-Unis: Evaluation longitudinale de la dynamique de Escherichia coli, des coliformes totaux, de Enterococcus spp. et de Aeromonas spp. dans des sources d'eau d'irrigation alternatives

Voici un article, paru dans Applied and Envronmental Microbiology, qui s'intéresse à l'eau d'irrigation des fruits et des légumes aux Eats-Unis avec une évaluation longitudinale de la dynamique de Escherichia coli, des coliformes totaux, de Enterococcus spp. et de Aeromonas spp. dans des sources d'eau d'irrigation alternatives. Il s'agit d'une étude CONSERVE.

Résumé

Alors que le changement climatique continue de mettre à rude épreuve les ressources en eau douce, nous avons un besoin pressant d'identifier des sources alternatives (non traditionnelles) d'eau microbienne saine pour l'irrigation des produits frais.

Cette étude fait partie du centre CONSERVE, qui vise à faciliter l'adoption de sources d'eau agricoles adéquates. Une étude longitudinale de 26 mois a été menée dans 11 sites pour évaluer la prévalence des bactéries indiquant la qualité de l'eau, la contamination fécale et le risque de contamination des cultures (Escherichia coli, coliformes totaux [CT], Enterococcus et Aeromonas). 

Les sites comprenaient des rivières/ruisseaux d'eau douce sans marée (NF), une rivière saumâtre à marée (TB), des étangs d'irrigation (EI) et des sites d'eaux récupérées (ER). Les échantillons d'eau ont été filtrés pour la quantification bactérienne. E. coli, CT, les entérocoques (respectivement, ∼86%, 98% et 90% de positifs, n = 333) et Aeromonas (∼98% de positifs; n = 133) étaient répandus dans les échantillons d'eau testés. Les dénombrements les plus élevés de E. coli se trouvaient dans les rivières, les dénombrements de CT dans TB et les entérocoques dans les rivières et les étangs (P < 0,001 dans tous les cas) par rapport aux autres types d'eau.

Les dénombrements de Aeromonas étaient cohérents dans les sites. La dynamique saisonnière n'a été détectée que dans les échantillons de NF et de TB. Les dénombrements de E. coli étaient plus élevés pendant la saison de culture maraîchère (mai-octobre) que pendant la saison non cultivée (novembre-avril) dans tous les types d'eau (P < 0,05). Un seul site ER et deux sites EI espectaient les normes d'eau du Food Safety Modernization Act des États-Unis. 

Cependant, la mise en œuvre des mesures d'atténuation recommandées consistant à laisser du temps pour la mort microbienne entre l'irrigation et la récolte amènerait tous les autres sites en conformité dans les 2 jours. Cette étude fournit des données microbiennes complètes sur l'eau d'irrigation alternative et constitue une ressource importante pour la planification de la sécurité sanitaire des aliments et l'élaboration des politiques.

Importance

La demande croissante de fruits et légumes frais, un climat variable affectant la disponibilité de l'eau agricole et les objectifs de sécurité microbienne des aliments font pression sur la nécessité d'identifier de nouvelles sources d'eau d'irrigation sûres et alternatives. Notre étude a généré des données microbiennes recueillies sur une période de deux ans à partir de sources potentielles d'irrigation (rivières, étangs et sites de récupération des eaux). L'eau des étangs s'est avérée conforme aux normes microbiennes de la loi sur la modernisation de la sécurité des aliments (FSMA) aux Etats-Unis pour l'irrigation des fruits et légumes.

Les dénombrements bactériens dans l'eau récupérée, une ressource qui n'est pas universellement autorisée sur les produits frais aux États-Unis, respectaient généralement les normes microbiennes ou nécessitaient une atténuation minimale.

Nous avons détecté le plus de saisonnalité et les charges microbiennes les plus élevées dans l'eau des rivières, qui est apparue comme le type d'eau qui nécessiterait le plus d'atténuation pour être conforme aux normes établies de la FSMA.

Cet ensemble de données représente l'une des analyses longitudinales les plus complètes des sources alternatives d'eau d'irrigation aux États-Unis.