Evaluation d'un un outil rapide de surveillance de la présence de Campylobacter, selon une étude multicentrique

Voici une étude multicentrique, parue dans Applied and Environmental Microbiology, afin d'évaluer un outil rapide de surveillance de la présence de Campylobacter, un pathogène d'origine alimentaire, dans les troupeaux de poulets.

Résumé

La présente étude multicentrique visait à évaluer les performances de l'échantillonnage de l'air en tant que nouvelle méthode de surveillance de Campylobacter comme mesure de biosécurité dans les élevages avicoles.

Nous avons comparé, à l'aide d'une procédure harmonisée, le protocole d'isolement bactériologique (ISO 10272-1: 2017) et une méthode par PCR utilisée sur des échantillons de filtres à air. Des prélèvements d'air et des écouvillons de chaussures ont été collectés dans 62 troupeaux dans cinq pays européens au cours de l'été 2019.

Pour les filtres à air, la fréquence des résultats positifs à par PCR était significativement plus élevée (n = 36; 58%) que celle obtenue avec les méthodes de culture (P < 0,01; résidus normalisés). Les protocoles de culture (un avec un bouillon d'enrichissement Bolton et un avec un bouillon d'enrichissement Preston) étaient comparables les uns aux autres mais ont montré moins d'échantillons positifs (0 à 8%).

L'association entre le type d'échantillon et la fréquence des résultats positifs par PCR a été statistiquement confirmée (P < 0,01; test exact de Fisher), bien qu'aucun filtre à air positif à la culture n'ait été détecté en utilisant une méthode sur boîtes. Pour les écouvillons des bottes, le plus grand nombre d'échantillons positifs a été détecté après enrichissement en bouillon Preston (n = 23; 37%), suivi d'une méthode sur boîtes après homogénéisation en bouillon Preston (n = 21; 34%) ou bouillon Bolton (n = 20 ; 32%).

Il est à noter que les troupeaux de Norvège, un pays connu pour avoir une faible prévalence de Campylobacter dans les troupeaux de poulets, ont été testés négatifs pour Campylobacter par la nouvelle approche sensible.

En conclusion, l'échantillonnage de l'air combiné à la PCR est proposé comme une méthode de dépistage polyvalente, peu coûteuse et pratique qui peut être jusqu'à quatre fois plus rapide et quatre fois plus sensible que le système actuel de test d'écouvillonnage des chaussures pour le dépistage de problèmes de biosécurité dans la production de poulets.

Importance

Les bactéries Campylobacter sont à l'origine de la grande majorité des cas enregistrés de maladies d'origine alimentaire dans le monde industrialisé. En fait, la bactérie a causé 24 6571 cas enregistrés de maladies d'origine alimentaire en 2018, ce qui équivaut à 70% de tous les cas enregistrés en Europe cette année-là.

Un outil important pour prévenir la présence de Campylobacter de rendre les consommateurs malades est une bonne donnée sur l'endroit dans la chaîne alimentaire où la bactérie est présente. La présente étude rapporte une nouvelle méthode d'analyse qui multiplie par quatre la probabilité d'identifier les troupeaux de poulets positif pour Campylobacter. Il est important d'identifier les troupeaux positifs pour Campylobacter avant leur arrivée à l'abattoir, car les troupeaux négatifs peuvent être abattus en premier afin d'éviter la contamination croisée le long de la chaîne de production.