Démêlage d'une épidémie à Salmonella liée à des fromages au lait cru en France, 2015 à 2016

Dans une époque antérieure, j'avais indiquais dans un article du 6 septembre 2012,

Selon le journal La Montagne.fr du 5 septembre 2012, 

L'affineur de fromage Dischamp a été informé, hier matin, par les services sanitaires de l'ARS que 48 personnes ont été intoxiquées par la présence de la bactérie de Salmonella Dublin dans l'un des lots de saint-nectaire fermier commercialisés. Ce lot n° D21950033 est celui de saint nectaire fermier vendu à la coupe entre le 10 août et le 5 septembre. Il représente 3.500 fromages, soit 5 tonnes.

Pour ce rappel ci-dessus, pas encore d'informations sur le site Internet du ministère de l'agriculture, ni sur celui de l'ARS Auvergne. Ce que je viens d'énoncer n'est plus exact car il y a désormais un communiqué, certes très tardif, mais il y a un communiqué du ministère de l'agriculture : Le GAEC FEREYROL (producteur des fromages fermiers) et la société DISCHAMP (distributeur des fromages) procèdent à un rappel de Fromage fermier au lait cru « Saint Nectaire. » En date du 7 septembre 2012, le minstère de l'agriculture communique sur Salmonelles dans du Saint-Nectaire : deux foyers de contamination. A suivre …

Malheureusement, il n'est plus possible d'avoir accès aux liens cités dépendant du ministère de l'agriculture, qui renvoient à la loi Egalim : Tout savoir sur la loi Agriculture et Alimentation, tout un programme … mais pas d'information ...

L'exemple du Saint-Nectaire souligne que le danger est assez présent dans les fromages au lait cru, mais ce dont il va être question ci-après ne concerne ni du Saint-Nectaire, ni du Reblochon, mais du Morbier et du Mont d'Or ...

« Le cru est risqué: Salmonella Dublin dans du fromage au lait cru, France, 2015-16 », selon Doug Powell du barblog. Le 'cru' étant du fromage au lait cru ...

La revue en ligne Eurosurveillance publie un article sur le « Démêlage d'une épidémie complexe à Salmonella Dublin, liée à la consommation de fromage au lait cru, à l'échelle nationale, France, 2015 à 2016 ».

ooOOoo

Salmonella non thyphi est une des principales causes d'infections d'origine bactérienne d'origine alimentaire en Europe. La majorité des infections humaines sont causées par un nombre limité de sérotypes de Salmonella parmi les 2600 décrits à ce jour. Le sérotype Dublin de Salmonella enterica (S. Dublin) est particulièrement invasif chez l'homme et conduit le plus souvent à une maladie grave et à des taux de mortalité plus élevés par rapport aux autres sérotypes. S. Dublin est adapté aux hôtes pour les bovins et est fréquemment isolé du bétail, avec du lait cru ou des fromages au lait cru comme véhicule typique des épidémies d'origine alimentaire.

En 2012, une épidémie majeure à S. Dublin est survenue en France, avec 103 cas liés à la consommation de Saint-Nectaire (fromage de lait cru bovin). En 2015, 34 cas de S. Dublin ont été rapportés liés à la consommation de Reblochon (fromage de lait cru bovin) (données non présentées; Santé publique France).

En France, le Centre national de référence (CNR) des Salmonella et l'Anses collectent et sérotypent régulièrement des isolats humains et non humains de Salmonella, respectivement, selon le schéma Kauffmann Schéma Blanc-Le Minor. Les isolats de S. Dublin collectés sont fréquemment sensibles à tous les antibiotiques et présentent un profil d'électrophorèse en champ pulsé (PFGE) indiscernable. Afin de mieux distinguer les isolats de S. Dublin, une analyse par MLVA a récemment été utilisée pour la surveillance et les investigations épidémiologiques. De plus, il a été démontré que le séquençage du génome entier (WGS) de Salmonella faisait la distinction entre des isolats étroitement apparentés de S. Dublin.

Le 18 janvier 2016, le CNRC français a signalé à Santé publique de France un excès d'infections à S. Dublin à travers le pays, avec 37 isolats de S. Dublin identifiés entre la mi-novembre 2015 et la mi-janvier. 2016, comparé à 10 isolats de S. Dublin au cours de la même période les deux années précédentes. Une équipe d’investigation épidémiologique composée d’experts de Santé publique de France, du CNR, de l’Anses et de la DGAL a lancé des investigations épidémiologiques, microbiologiques et alimentaires approfondies pour confirmer l’épidémie, identifier le vecteur de la transmission et proposer les mesures de maîtrise appropriées.

Limites

Nos investigations ont souffert de plusieurs limites. Premièrement, les cas ont été interviewés par téléphone, tandis que les témoins ont rempli un questionnaire en ligne plus court, ce qui aurait pu permettre d’obtenir des données sur l’exposition avec différents degrés de précision. Pour minimiser ce biais, nous avons utilisé les mêmes questions pour les cas et les témoins. Deuxièmement, la distribution par âge et par sexe des témoins différait de celle des cas. Nous avons donc inclus l'âge et le sexe dans l'analyse multivariée pour ajuster ces caractéristiques. Troisièmement, il était difficile d'identifier les sources exactes de contamination en raison probablement du faible taux contamination par S. Dublin des lots de fromages. La contamination du bétail étant diffuse, il était difficile d'incriminer certains producteurs de fromage de la région Bourgogne-Franche-Comté en tant que sources de la contamination. En outre, les lots suspects de fromage identifiés au cours d'enquêtes de traçabilité n'étaient plus disponibles pour des essais. Ensuite, même si des investigations épidémiologiques ont été menées sur une période très limitée pour permettre le lancement d'analyses microbiologiques ad hoc à l'appui des hypothèses émises, nous avons dû faire face à l'impossibilité de passer tout le processus en raison du manque de produits.

Conclusions et recommandations

Les preuves microbiologiques, épidémiologiques et environnementales indiquaient que deux fromages au lait cru, Morbier et Vacherin Mont d’Or, seraient des vecteurs des infections à S. Dublin. L’utilisation des méthodes de sous-typage MLVA et WGS a permis d’identifier différents groupes et les vecteurs potentiels de l’infection, en soulignant l’importance de méthodes de sous-typage adéquates lors des éclosions à Salmonella et la pertinence du système de surveillance microbiologique interne à l’entreprise. En conséquence, le WGS a maintenant été mis en œuvre de manière routinière au CNR français et les résultats de cette enquête multidisciplinaire ont abouti à un plan de contrôle renforcé des usines de transformation de fromages au lait cru afin de prévenir de futures épidémies.

ooOOoo

Le 22 novembre 2016n j'écrivais un article France : L’absence de communication de la DGAL face à la problématique Salmonella dans certains fromages.

On y apprenait que L’Anses a été saisie le 28 juillet 2016 par la Direction générale de l’alimentation (DGAl) d’une demande d’avis relatif à l’évaluation des protocoles d’échantillonnage des laits et fromages morbier et mont d’or en vue de réduire le risque épidémique de salmonellose.

Dans cet avis de l'Anses du 24 avril 2018, on découvrait,

En région Franche-Comté, les données de surveillance des salmonelles en filière bovine indiquent une contamination régulière des laits et de certains fromages au lait cru par Salmonella Dublin. Malgré la vigilance de la filière vis-à-vis de cette contamination, une épidémie ayant touché principalement des personnes âgées ou fragilisées et responsable de 92 malades et 10 décès, a été attribuée à la consommation de morbier et mont d’or contaminés par Salmonella Dublin, au cours de la période de novembre 2015 à avril 2016. Les protocoles d’autocontrôle sur les fromages ont été renforcés à partir de février 2016. Depuis août 2016, les protocoles d’autocontrôle sur le lait ont eux aussi été renforcés.

Malgré cette vigilance, le contrôle d’un lot réalisé après la mise sur le marché, mi-juillet 2016, a révélé la présence de Salmonella Dublin dans un établissement, entraînant des mesures correctives. Dans ce contexte épidémique, la question de l’efficacité des contrôles du lait et des fromages pour les périodes considérées normales et les périodes à risque se pose.

La suite, vous la connaissez maintenant ... Ah oui, il reste un dernier point,

Un article du 28 avril 2018, on apprenait par le Dauphiné.com, Une dizaine de morts à cause de morbier et Mont-d’Or contaminés.

Une dizaine de personnes sont mortes et près de quatre-vingt ont été malades en 2015 et 2016. Elles auraient été contaminées par du fromage notamment du morbier et du Mont d’Or, selon de la cellule investigation de Radio France.