Des nouvelles des foyers de cas de maladies infectieuses d'origine alimentaire en France et dans l'UE

«Des foyers de cas à Salmonella et à Listeria discutés lors d'un événement de l'UE», source article de Joe Whitworth paru le 4 décembre 2021 dans Food Safety News et complété par mes soins -aa.

Près de 50 personnes sont tombées malades en France avec des infections à Salmonella l'année dernière liées à du poulet d'un abattoir. Des cas à Salmonella présents dans de la viande bovine en provenance d'Allemagne ont également été documentés.

Sans le séquençage du génome entier (WGS), l'épidémie persistante de faible intensité n'aurait pas pu être détectée, selon une présentation à la Conférence scientifique européenne sur l'épidémiologie appliquée aux maladies infectieuses (European Scientific Conference on Applied Infectious Disease Epidemiology ou ESCAIDE), organisée par le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies.

Des scientifiques ont recommandé de renforcer la surveillance par le séquençage systématique de tous les isolats humains, alimentaires et environnementaux de Salmonella.

En juin 2020, le Centre National de Référence de Salmonella a signalé à Santé Publique de France un cluster de cas à Salmonella de sérotype 4,5,12:i:- identifiés par le WGS depuis janvier 2020.

Quarante-neuf cas ont été détectés dont 46 résidant en Ile-de-France. Ils étaient âgés de quelques mois à 76 ans avec une médiane de 3 ans. Parmi les 24 personnes interrogées, l'apparition des symptômes s'est déroulée du 15 janvier au 18 octobre 2020. Neuf patients ont été hospitalisés mais aucun décès n'a été enregistré.

Vingt-trois patients ont déclaré avoir mangé du poulet et huit personnes malades ont acheté de la viande directement dans un abattoir. Les enquêtes sur le lieu d'achat pour d'autres cas ont été entravées par une documentation de traçabilité inadéquate des canaux de distribution, ont rapporté des responsables.

Les inspections à l'abattoir ont identifié plusieurs lacunes en matière d'hygiène dans l'entretien des équipements et les pratiques du personnel. Fin juillet, la souche épidémique a été isolée dans des échantillons de poulet et de l'environnement sur le site.

L'abattoir a été fermé de fin juillet à fin septembre et les pratiques d'hygiène ont été corrigées. Quatre personnes malades interrogées, sur 10, ont rapporté après la fermeture de l'abattoir, avoir toutes mangé du poulet acheté avant sa fermeture et congelé après achat. Aucun autre cas n'a été identifié après la mi-octobre 2020.

Source Résumé du poster d’Athinna Nisavanh proposé dans ce document et disponible en fin d’article*, Using WGS for the detection of a persistent low-level outbreak of Salmonella serotype 4,5,12:i:- (monophasic variant of S.Typhimurium) in Ile de France region in 2020, France.

Salmonella dans de la viande bovine d'Allemagne

Dans une autre présentation, le laboratoire national de référence a informé l'Institut norvégien de santé publique (FHI) d'une éventuelle épidémie fin février de cette année après que cinq cas de Salmonella Enteritidis ont été identifiés par le WGS et quatre d'entre eux ont été hospitalisés.

Au total, 30 personnes malades ont été identifiées, avec plus de femmes que d'hommes malades, âgées de 2 à 91 ans avec un âge médian de 59 ans. Les patients vivaient dans neuf comtés différents. Treize personnes ont été hospitalisées, une a développé une septicémie, mais aucun décès n'a été signalé.

Huit personnes malades ont été interrogées avec un questionnaire standardisé sur Salmonella afin d’évaluer la consommation alimentaire une semaine avant l'apparition des symptômes. Les autres disposaient d'un questionnaire ciblé portant sur de la viande hachée et les produits de bœuf. Dans l'ensemble, 15 des 19 patients interrogés ont consommé de la viande hachée bovine tandis que huit ont mangé de la viande hachée non cuite.

Après que l'Institut vétérinaire norvégien ait partagé les données WGS d'isolats récents de Salmonella Enteritidis à partir d'échantillons de viande, il a été découvert qu'un isolat d'une carcasse bovine provenant d'Allemagne correspondait à la souche épidémique. Cette souche a également été détectée chez des patients du Danemark et de France mais les enquêteurs n'ont pas pu confirmer la même source.

Les conseils aux résidents norvégiens leur ont dit de ne pas consommer de viande hachée crue et il a été rappelé aux importateurs de suivre la réglementation. Un examen des lignes directrices sur les essais d'importation pour la viande a également été recommandé.

Listeria dans de la truite fumée a rendu malades 50 personnes

Une troisième présentation a donné plus de détails sur les incidents qui avaient déjà été signalés. Il s'agissait d'une épidémie mortelle à Listeria liée à la truite fumée.

L'épidémie à Listeria monocytogenes a touché quatre pays et a été détectée par séquençage du génome entier d'isolats cliniques en Allemagne en octobre 2020.

De septembre 2020 à août 2021, 54 patients ont été identifiés, dont 33 de sexe masculin. La tranche d'âge allait de 0 à 93 ans avec une médiane de 79 ans. Trois personnes sont décédées. Deux cas étaient liés à la grossesse, dont un nouveau-né atteint de sepsis et de méningite.

Quarante-neuf malades ont été signalés en Allemagne, deux en Autriche et au Danemark et un en Suisse. Seize des 19 patients interrogés avaient mangé de la truite fumée.

Le même type de Listeria monocytogenes qui avait rendu des personnes malades a été retrouvé dans de la truite fumée d'une marque analysée en Bavière, Allemagne, et dans un échantillon d'un sachet vide de truite dans le réfrigérateur d'un patient en Rhénanie-Palatinat, Allemagne.

Des investigations menées à l'usine de transformation au Danemark ont identifié Listeria monocytogenes mais ce n'était pas le même type qui avait rendu les personnes malades et la source de contamination n'a pas été trouvée.

Comme la truite fumée était le véhicule probable de l'épidémie, elle a été rappelée en Allemagne en décembre 2020 et les autorités alimentaires danoises ont renforcé les contrôles dans l'installation de transformation de la truite. Après le rappel, le nombre de cas a diminué, le dernier cas a ei lieu en mai 2021 en Allemagne.

*Résumé du poster cité plus haut.

Using WGS for the detection of a persistent low-level outbreak of Salmonella serotype 4,5,12:i:- (monophasic variant of S.Typhimurium) in Ile de France region in 2020, France.

Background

In June 2020, the National Reference Centre for Salmonella (NRC) reported to Santé publique France a new genomic cluster of Salmonella serotype 4,5,12:i:- identified by Whole Genome Sequencing (WGS) since January 2020. We investigated to assess the extent of the outbreak, the vehicle of transmission and implement control measures.

Methods

We defined a case as a person with S.4,5,12:i:- isolated in stool since January 2020, belonging to genomic cluster HC5_143285 (cgMLST). Data on risk exposures was collected by telephone interviews. Implicated premises were inspected, and trace-back/trace-forward investigations were conducted. Food and environmental samples were cultured for Salmonella and WGS was performed on all isolates.

Results

Forty-nine cases were identified with 46 (94%) living in Ile-de-France region. Among cases interviewed (n=24), symptom onset ranged from 15 January-18 October. Twenty-three (96%) reported having eaten chicken. No other common exposures were identified. Eight cases (33%) reported buying meat directly from slaughterhouse X. Trace-back investigations for the place of purchase for other cases was hampered by inadequate documentation of distribution channels. Inspections at slaughterhouse X identified several hygiene deficiencies in equipment maintenance and staff practices. On 27 July, the outbreak strain was isolated in chicken and environmental samples at slaughterhouse X.

Conclusions

Our findings identified chicken meat from slaughterhouse X as the most likely vehicle of transmission. To prevent further cases, slaughterhouse X was closed from 29 July-25 September, and hygiene practices were corrected. No further cases were identified after 20 October 2020. This outbreak highlights the importance of equipment maintenance and adherence to hygiene procedures among staff in slaughterhouses. Without WGS, this persistent low-level outbreak could have gone undetected. We recommend strengthening surveillance by systematic sequencing of all Salmonella isolates.

Commentaire. Je n'ai pas eu l'impression que l'on ait été informé de cette épidémie à Salmonella en France ... transparence, où est tu ?

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