Hausse de la résistance aux antibiotiques observée chez les dauphins

« Hausse de la résistance aux antibiotiques observée chez les dauphins », source CIRAP News.

En 2009, Adam Schaefer faisait partie d’une équipe qui a rapporté la découverte de bactéries résistantes aux antibiotiques chez les dauphins vivant dans les eaux au large des côtes de la Floride et de la Caroline du Sud. Des bactéries cultivées à partir de grands dauphins dans le lagon d'Indian River en Floride, comprenant des agents pathogènes chez l’homme tels que Escherichia coli et Staphylococcus aureus, ont montré des niveaux élevés de résistance à de multiples antibiotiques utilisés en médecine humaine et vétérinaire.

Dix ans plus tard, une nouvelle étude menée par Schaefer, épidémiologiste à la Florida Atlantic University (FAU), a révélé que les niveaux de résistance aux antibiotiques des bactéries isolées chez les dauphins dans la lagune avaient augmenté au fil du temps et semblaient refléter les tendances observées au cours des dernières années en santé humaine. Schaefer pense que ces résultats mettent en évidence l'impact de l'utilisation d'antibiotiques chez l'homme sur le milieu aquatique.

« On ne prescrit pas d'antibiotiques à ces dauphins, donc les bactéries qu'ils ont; théoriquement, nous ne devrions pas voir toutes ces augmentations [de résistance], mais nous les avons, et cela nous dit qu'il existe de toute évidence un élément dans lequel l'environnement où ils vivent est touché », a dit Schaefer. « Les dauphins ne font que nous raconter cette histoire. »

Les résultats apparaissent dans la revue Aquatic Mammals.

Résistance croissante à plusieurs antibiotiques

Pour l'étude, Schaefer et ses collègues de l'Harbor Branch Oceanographic Institute, Georgia Aquarium de FAU, l'Université médicale de Caroline du Sud et de l'Université d'État du Colorado ont analysé des échantillons de bactéries prélevés sur des grands dauphins communs de 2003 à 2015 dans la lagune d'Indian River, un estuaire longeant la côte atlantique, hébergeant plus de 4 300 espèces animales et végétales. L’analyse, qui fait partie du projet d’évaluation de la santé et des risques du grand dauphin, comprend les données de l’étude de 2009.

« La résistance aux antibiotiques parmi les agents pathogènes potentiels et les bactéries a augmenté avec le temps, et nous voulions voir si le même schéma que nous observons dans les cas humains et cliniques se reflétait chez les dauphins », a dit Schaefer.

Parmi les 733 isolats recueillis auprès de 171 dauphins au cours de la période de l'étude, les espèces les plus communément isolées étaient Aeromonas hydrophila, E. coli, Edwardsiella tarda, Vibrio alginolyticus et S. aureus. Les tests de sensibilité aux antibiotiques sur les isolats ont montré que la prévalence globale de la résistance à au moins un antibiotique était de 88,2%. La prévalence de la résistance était la plus élevée avec l'érythromycine (91,6%), suivie de l'ampicilline (77,3%) et de la céphalothine (61,7%).

L’analyse a également révélé que l’indice de résistance à de multiples antibiotiques (AMR pMultiple Antibiotic Resistance), une mesure qui évalue la résistance globale aux antibiotiques et peut être utilisé pour refléter les impacts humains potentiels sur les isolats environnementaux, a augmenté entre les deux périodes d’échantillonnage (2003-2007 et 2010-2015) chez plusieurs agents pathogènes. Notamment, il y a eu des augmentations statistiquement significatives de l'index MAR pour Pseudomonas aeruginosa (de 0,54 à 0,63) et V. alginolyticus (de 0,32 à 0,37). Pour les isolats bactériens environnementaux, un index MAR supérieur à 0,20 est considéré comme un indicateur de pollution anthropique.

Schaefer a dit que l'augmentation de l'index MAR pour P. aeruginosa, qui peut provoquer des infections pulmonaires graves, est particulièrement remarquable car elle est comparable à ce qui a été rapporté dans les établissements de santé.

« C'est étonnant, car cette lagune n'est pas un hôpital, il ne devrait donc pas y avoir d'exposition massive à des antibiotiques », a-t-il dit. « Mais pourtant, il semble y en avoir, dans cette population bactérienne. »

Schaefer et ses collègues ont signalé une augmentation significative de la résistance au céfotaxime et à la ceftazidime - deux céphalosporines de troisième génération - au cours de deux périodes d'échantillonnage, une observation suggérant que cela pourrait refléter l'utilisation croissante d'antibiotiques chez l'homme dans les communautés adjacentes au lagon . En outre, la résistance à la ciprofloxacine chez E. coli a plus que doublé, reflétant les tendances récentes en matière d'infections cliniques chez l'homme.

Les résultats soulignent le concept One Health

Bien que les dauphins n'aient été infectés par aucun des agents pathogènes résistants, les résultats sont significatifs car les dauphins sont une espèce sentinelle. Leur santé peut fournir des indices sur ce qui se passe dans l'environnement et avertir des menaces potentielles pour la santé humaine.

« Nous savons que ces dauphins sont des résidents de cette région et que ce sont des eaux que les gens utilisent pour la pêche et les loisirs. Ils y nagent et en mangent la nourriture », a dit Schaefer. « Les dauphins nous fournissent donc des informations potentiellement importantes sur les risques pour la santé publique dans la région. »

Schaefer et ses co-auteurs pensent que la présence de taux aussi élevés de bactéries antibiorésistantes chez les dauphins est probablement due à la présence d'agents pathogènes résistants chez l'homme, ainsi qu'à la présence de résidus d'antibiotiques, susceptibles de créer une pression de sélection favorisant la résistance de bactéries aux antibiotiques pour partager des gènes et propager davantage la résistance. La présence de nitrates, de phosphates et de métaux lourds dans l'eau, tels que le mercure, peut faciliter ce processus, expliquent-ils.

La source de cette contamination n'est pas difficile à discerner. Près d'un million de personnes vivent et travaillent dans la région, environ 300 000 fosses septiques dans les cinq comtés environnants, des terres agricoles et un certain nombre de canaux résidentiels qui alimentent la lagune d'Indian River. Il s'agit d'un système complexe, a noté M. Schaefer, avec de multiples intrants et facteurs de stress pouvant contribuer à transformer le cours d'eau en réservoir de résistance aux antibiotiques.

Schaefer a dit que l'étude met en évidence le concept One Health - l'idée que la santé humaine, animale et environnementale, tout cela est liée.

« Ce n'est plus juste un problème d'écosystème ou de faune sauvage; ce sont des agents pathogènes potentiels qui peuvent affecter la santé humaine », a-t-il dit. « Nous constatons donc que nos impacts sur l'environnement commencent à se retourner… et ont potentiellement un impact sur les personnes qui vivent le long de la lagune. »

Schaefer a dit que les recherches sur les dauphins se poursuivraient, ainsi que sur deux autres espèces aquatiques se situant au sommet de la chaîne alimentaire - les requins et les raies. « Parce qu'elles sont au sommet de la chaîne alimentaire, elles peuvent nous fournir beaucoup d'informations précieuses », a-t-il dit.