Suivi des variations bactériennes dans le temps dans les zones positives pour Listeria monocytogenes dans l'industrie alimentaire

Annonce : S’agissant de l’information à propos des rappels de produits alimentaires, pour le moment, il ne faut pas faire confiance à nos autorités sanitaires (Ministère de l’agriculture et DGCCRF). Ces deux entités ont fait et font toujours preuve d’une incroyable légèreté et d’un manque d’informations fiables vis-à-vis des consommateurs avec comme corollaire une absence de transparence en matière de sécurité des aliments.

Faits saillants

• La variation de la composition des bactéries a été évaluée dans les zones positives pour L. monocytogenes.
• Un système d'échantillonnage in situ a été utilisé pour reproduire le bactériome réel.
• L'analyse de screening à haut débit a permis d'évaluer la dynamique de chaque communauté bactérienne.
• Dans des échantillons de l'industrie de la viande, les Actinobactéries et les Firmicutes constituaient les phyla les plus dominants.
• Dans des échantillons de l'industrie du poisson, les protéobactéries et les Bacteoidetes ont été prédominants.

Résumé

La variation de la composition microbienne au fil du temps a été évaluée dans des biofilms formés in situ sur des surfaces sélectionnées non alimentaires et en contact avec des aliments dans des industries de la viande et du poisson, précédemment identifiées comme ayant des zones positives en Listeria monocytogenes.

Premièrement, tous les échantillons ont été analysés pour la détection et la quantification de L. monocytogenes en utilisant respectivement les normes ISO 11290-1 et ISO 11290-2. Bien que l'agent pathogène ait été initialement détecté dans tous les échantillons, la quantification directe n'a pas été pas possible.

Le nombre de bactéries psychrotrophes figurait parmi le microbiote résident dans les échantillons de l'industrie de la viande (Moyenne_max = 6,14 logUFC/cm²) par rapport à ceux de l'industrie du poisson (Moyenne_max = 5,85 logUFC/cm²).

L'analyse visuelle des biofilms à l'aide d'une microscopie à épifluorescence a révélé une tendance à la formation de micro-colonies dans lesquelles des cellules endommagées/mortes agiraient en tant que structures d'ancrage. L'analyse métagénomique du gène de l'ARNr 16S a montré que, bien que des protéobactéries (71,37%) aient dominé initialement les communautés bactériennes d'un site de l'industrie de la viande, la composition a changé radicalement à mesure que les biofilms devenaient plus matures, les Actinobactéries (79,72%) devenant le principal phylum présent dans les échantillons plus tardifs. Ce changement était en grande partie dû à une augmentation de Norciardiaceae, Micrococcaceae et Microbacteriaceae.

Néanmoins, pour l'autre lieu d'échantillonnage, l'abondance relative du phylum dominant (Firmicutes) est demeurée constante pendant toute la période d'échantillonnage (moyenne = 63,02%). Dans les échantillons de l'industrie du poisson, les protéobactéries ont également dominé au début (90,69%), mais un échantillonnage ultérieur a montré une diversité plus élevée dans laquelle les bactéroïdes et les protéobactéries constituaient les phylums les plus abondants, représentant respectivement 48,04 et 37,98% lors de la dernière période d'échantillonnage.

Indépendamment de l'emplacement, les profils des communautés des échantillons finaux étaient similaires à ceux rapportés précédemment. Cela a montré que, dans un contexte industriel donné, il existe une tendance à établir une structure de biofilm déterminée en raison de facteurs environnementaux et du microbiote entrant de façon constante. Ces informations pourraient être utilisées pour améliorer les protocoles de désinfection existants ou pour concevoir de nouvelles stratégies.

Référence

Pedro Rodríguez-López, Juan José Rodríguez-Herrera, Marta López Cabo. Tracking bacteriome variation over time in Listeria monocytogenes-positive foci in food industry. https://www.sciencedirect.com/science/journal/01681605