Etats-Unis : Un rapport montre une résistance croissante chez les bactéries d'origine alimentaire

Annonce : S’agissant de l’information à propos des rappels de produits alimentaires, pour le moment, il ne faut pas faire confiance à nos autorités sanitaires (Ministère de l’agriculture et DGCCRF). Ces deux entités ont fait et font toujours preuve d’une incroyable légèreté et d’un manque d’informations fiables vis-à-vis des consommateurs avec comme corollaire une absence de transparence en matière de sécurité des aliments.

Dans un précédent article, il était question aux Etats-Unis, selon le CDC de la ‘menace mortelle’ de la résistance aux antibiotiques.

Voici que le rapport du National Antimicrobial Resistance Monitoring Systems (NARMS) montre une une résistance croissante chez les bactéries d'origine alimentaire, source CIDRAP News.

Les dernières données d'un système de surveillance national qui surveille la résistance aux antibiotiques des bactéries d'origine alimentaire montrent une résistance croissante aux antibiotiques couramment utilisés pour traiter les infections à Salmonella.

USDA / Keith Weller

Les conclusions proviennent du résumé intégré du National Antimicrobial Resistance Monitoring Systems (NARMS) 2016-2017, qui combine des données des Centers for Disease Control and Prevention (CDC), de la Food and Drug Administration (FDA) et du ministère américain de l'agriculture (USDA). Le rapport fournit un aperçu des profils de résistance aux antibiotiques retrouvés dans les bactéries isolées chez l'homme, dans les viandes crues au détail (poulet, dinde hachée, bœuf haché et côtelettes de porc) et chez des animaux sains abattus.

En plus de trouver une résistance croissante aux antibiotiques de première intention dans des isolats humains de Salmonella, les données du NARMS montrent également une augmentation du nombre de Salmonella multirésistants récupérés chez des poulets et de Campylobacter coli multirésistants isolés de bovins de boucherie et de vaches laitières.

Concernant les tendances de Salmonella

Dans l’ensemble, la résistance aux antibiotiques de Salmonella isolée des humains reste faible, mais le rapport du NARMS montre certaines tendances inquiétantes. La résistance à la ceftriaxone est passée de 2,8% en 2015 à 3,4% en 2017 et la sensibilité réduite à la ciprofloxacine est passée de 5,8% en 2015 à 8,4% en 2017. Le rapport suggère qu'une diminution de la sensibilité à la ciprofloxacine serait en grande partie imputable à Salmonella Enteritidis et pourrait être liée aux voyages internationaux.

La résistance à l'azithromycine dans les isolats humains de Salmonella était rare, mais 26 isolats résistants à l'azithromycine (1,1%) ont été identifiés en 2017 (comparé à 26 détectés de 2011 à 2016). De plus, le pourcentage d'isolats humains de Salmonella résistants à au moins trois classes d'antibiotiques a légèrement augmenté.

La sensibilité réduite à la ciprofloxacine a également augmenté chez Salmonella, isolée de viande de poulet et de dinde vendue au détail et de poulets et de dindons échantillonnés de manière systématique.

Le rapport indique que cette augmentation était en grande partie liée à une augmentation de Salmonella Infantis multirésistant. Chez les poulets échantillonnés régulièrement, la présence de Salmonella multirésistants est passée de 9,5% en 2015 à 18% en 2017 et de 15% à 25% dans les échantillons caecaux de poulets.

Les données de surveillance montrent que le pourcentage de Campylobacter jejuni résistants à la ciprofloxacine retrouvé chez l'homme est passé de 25% en 2015 à 28% en 2017. La résistance à la ciprofloxacine a été observée chez 39,4% des isolats de Campylobacter coli d'origine humaine en 2017, soit à peu près le même niveau qu'en 2015. Mais la proportion d'isolats de C. jejuni d'origine humaine et de poulet résistants aux macrolides est restée faible et inchangée (moins de 3%), et la résistance aux macrolides parmi les isolats de C. coli d'origine humaine a diminué de 13% à 7%.

Cependant, C. coli multirésistants a augmenté chez les bovins (de 7% en 2015 à 15% en 2017) et les vaches laitières (de 4% à 11%). Et la FDA a mis en garde que le taux de résistance aux macrolides chez Campylobacter isolé chez les porcs et la résistance aux fluoroquinolones chez Campylobacter isolés des bovins méritent une surveillance supplémentaire.

La surveillance de la résistance aux antibiotiques chez Salmonella et Campylobacter est importante car les deux agents pathogènes sont les principales causes de maladies d'origine alimentaire aux États-Unis. Le CDC estime que les infections à Salmonella causent plus de 1,2 millions de cas de maladie et 450 décès par an, tandis que les infections à Campylobacter sont responsables de plus de 1,3 millions de cas de maladie et de 120 décès. Le rapport du NARMS surveille également la résistance à Escherichia coli et Enterococci.

Données plus opportunes nécessaires

Sur une note positive, aucune résistance aux antibiotiques carbapénèmes, qui sont utilisés pour traiter les infections multirésistantes d'origine alimentaire, n'a été trouvée chez les isolats de Salmonella provenant de personnes, de viande au détail ou d'animaux.

Cependant, neuf isolats de Salmonella et un isolat pathogène de E. coli chez l'homme ont été identifiés comme porteurs de MCR-1, un gène mobile conférant la résistance à la colistine, un antibiotique devenu la dernière option en matière de traitement des infections qui ne répondent pas aux autres agents. Le rapport indique que les dix patients ont voyagé à l’étranger avant le début de leur maladie, ce qui suggère qu’ils l’auraient peut-être contractée au cours de leur voyage.

En outre, les tests génomiques ont identifié un nouveau gène de résistance à la colistine, MCR-9.1, dans plusieurs isolats humains et toutes sources d'origine animale et destinés à la vente au détail. La FDA a annoncé que d'autres travaux étaient en cours pour caractériser complètement le gène.

« Nous savons que la colistine est l'un de ces antibiotiques de dernier recours qui sont malheureusement devenus très importants en médecine humaine, car de nombreux autres traitements ne fonctionnent plus », a déclaré Karin Hoelzer, responsable du projet sur la résistance aux antibiotiques du Pew Charitable Trust. « Donc, voir la résistance émerger à ces médicaments, et voir une augmentation de la multirésistance, ce sont des tendances inquiétantes. »

La FDA a déclaré qu'à l'avenir, les données disponibles dans les rapports du NARMS seront mises à jour sur une base continue, ce qui devrait réduire le délai entre la collecte d'échantillons de bactéries et la publication des résultats de résistance aux antibiotiques. Hoelzer a déclaré qu'il était essentiel d'obtenir les données plus rapidement.

« Avoir des données en temps opportun est vraiment important », a déclaré Hoelzer. « La publication de ces données tant d'années après leur collecte limite réellement son utilité. Plus les données seront disponibles rapidement, mieux ce sera. »

De plus, les prochains rapports contiendront davantage de données provenant du Veterinary Laboratory Investigation and Response Network (Vet-LIRN) de la FDA, qui analyse les agents pathogènes isolés d’animaux d’aliments malades et d’animaux de compagnie. Le rapport actuel est une première où de telles données sont incluses.