Des scientifiques cartographient le génome de la peste porcine africaine

« Des scientifiques de Pirbright et de l'UCL cartographient le génome de la peste porcine africaine », source communiqué de l'Institut Pirbright.

Des scientifiques de l'Institut Pirbright ont travaillé avec l'University College London (UCL) pour cartographier l'expression des gènes à travers le génome entier du virus de la peste porcine africaine (VPPA), ce qui a aidé à établir leur ordre d'activation ainsi qu'à découvrir de nouveaux gènes. La recherche pourrait fournir des informations vitales à ceux qui développent de vaccins et de médicaments antiviraux pour prévenir la maladie mortelle du porc causée par ce virus.

Le VPPA provoque une fièvre hémorragique souvent mortelle chez les porcs domestiques et les sangliers. Les principales flambées de peste porcine africaine continuent de se propager à travers l'Europe de l'Est, l'Asie et l'Afrique, ce qui a entraîné la mort de près de sept millions de porcs en 2019. En l'absence de vaccin ou d'antiviraux, le seul moyen de prévenir les épidémies est de prendre des mesures de biosécurité.

Dans leur étude, publiée dans le Journal of Virology, les chercheurs ont utilisé le séquençage de nouvelle génération pour analyser les gènes exprimés par le VPPA. À partir de cela, ils ont créé la première feuille de route génétique complète, qui révèle l'ordre d'activation de différents ensembles de gènes du VPPA tout au long de son cycle d'infection.

Les gènes, y compris ceux du VPPA, sont activés par un processus appelé transcription. Ceci est effectué par une machine moléculaire appelée ARN polymérase, qui sert de 'gatekeeper' en garantissant que les informations codées dans l'ADN sont exprimées au bon moment pendant l'infection. L'ARN polymérase trouve des gènes basés sur des séquences d'ADN spécifiques, ou 'promoteurs', qui sont situés avant un gène.

L'équipe a démontré que les gènes exprimés au début de l'infection ont des promoteurs différents de ceux exprimés plus tard, permettant au virus de modifier le profil des gènes activés en fonction du stade de l'infection. Les gènes utilisés pour la réplication de l'ADN et l'évasion du système immunitaire sont activés au début du cycle d'infection, tandis que ceux impliqués dans la création de protéines pour les nouvelles particules virales sont activés plus tard.

« Le VPPA possède un très grand génome d'ADN. À titre de comparaison, le virus de la grippe exprime huit gènes, tandis que le VPPA exprime entre 150 et 190, ce qui a jusqu'à présent rendu difficile pour les scientifiques d'identifier et de déterminer la signification de chaque gène. Notre étude permet de démêler les gènes qui sont importants au cours des différents stades de l'infection pour mieux comprendre leurs fonctions », a déclaré la Dr Linda Dixon, chef du groupe du virus de la peste porcine africaine à Pirbright.

« Nos données montrent que le VPPA possède une méthode complexe et semblable à celle des mammifères pour contrôler l'expression des gènes, qui utilise des promoteurs spécifiques pour permettre à l'ARN polymérase de différencier les gènes qu'elle devrait exprimer lors d'une infection virale. Notre étude a également découvert plus de 30 nouveaux gènes qui étaient auparavant inconnus », a déclaré Finn Werner, professeur de biophysique moléculaire à l'UCL.

En faisant progresser les connaissances sur la biologie fondamentale de le VPPA, cette étude fournit des informations vitales qui aideront à faire avancer la recherche sur les méthodes de contrôle des maladies dont on a désespérément besoin.

Cette recherche a été financée par Wellcome.

Découvrez comment vous pouvez aider à prévenir la propagation de la peste porcine africaine et les recherches sur les vaccins et antiviraux de Pirbright ici.