Des chercheurs de la Kansas State University développe un nouvel essai rapide de détection des E. coli producteurs de shigatoxines

Les chercheurs de la Kansas State University, qui ont aidé à mettre au point une méthode plus rapide et plus efficace de détecter E. coli producteurs de shigatoxines dans la viande hachée bovine, comprennent Colin Stoy, technicien Lance Noll, scientifique principal, Elizabeth Porter, chef de laboratoire, Jianfa Bai, professeur de recherche et développement moléculaire, Yin Wang, doctorante en pathobiologie, Junsheng Dong, chercheur invité, Nanyan Lu, bioinformaticien, Cong Zhu, pré-docteur en médecine vétérinaire et Xuming Liu, professeur adjoint de recherche.

Les membres du corps professoral du Kansas State University College of Veterinary Medicine ont mis au point une méthode plus rapide et plus efficace pour détecter la production de E. coli producteurs de shigatoxines ou STEC, dans la viande hachée bovine, ce qui provoque souvent des rappels de viande hachée bovine et de légumes.

« La détection traditionnelle des STEC, qui nécessite une isolation et une caractérisation bactériennes, ne se prête pas aux paramètres à haut débit et nécessite souvent une semaine pour obtenir un résultat définitif », a déclaré Jianfa Bai, responsable de la recherche et du développement moléculaires au Kansas State Veterinary Diagnostic Laboratory.

La nouvelle méthode développée par Bai et ses collègues ne nécessite qu'une journée pour obtenir des résultats de confirmation en utilisant une méthode brevetée par la Kansas State University avec un système multicanaux de réaction en chaîne par polymérase numérique basé sur une partition de l'échantillon.

« Nous pensons que la nouvelle méthode numérique de détection par la réaction en chaîne par polymérase développée dans cette étude sera largement utilisée dans les services d'inspection et de sécurité des aliments pour la détection et la confirmation rapides des STEC et d'autres pathogènes d'origine alimentaire », a déclaré Jamie Henningson, directeur du Kansas State Veterinary Diagnostic. Laboratoire.

Lorsqu'il est ingéré par des aliments comme la viande hachée bovine et les légumes, le STEC peut provoquer des maladies avec des symptômes tels que des douleurs abdominales et de la diarrhée. Certaines maladies causées par les STEC peuvent entraîner une insuffisance rénale et mettre la vie en danger.

« Certaines souches de E. coli ne produisent pas de shigatoxines et n'affectent donc pas autant la santé humaine », a déclaré Xuming Liu, professeur adjoint de recherche. « Parce que les excréments de bovins et la viande hachée bovine peuvent contenir des E. coli inoffensifs ou moins pathogènes que le STEC, la réaction en chaîne par polymérase la plus couramment utilisée ne peut pas identifier les souches de E. coli pathogènes dans une matrice d'échantillon complexe. »

Le nouveau test numérique de réaction en chaîne par polymérase a été développé pour la recherche et les inspections en sécurité des aliments qui nécessitent un délai d'exécution plus court et un débit élevé, sans sacrifier la précision de détection.

« Bien que la méthode d'analyse couramment utilisée actuellement soit considérée comme la méthode de référence, elle est fastidieuse et nécessite plusieurs jours pour obtenir des résultats qui différencient adéquatement les bactéries », a déclaré Gary Anderson, directeur de l'International Animal Health and Food Safety Institute au Campus K-State Olathe.

L'étude « Single cell-based digital PCR detection and association of Shiga toxin-producing E. coli serogroups and major virulence genes » (Détection par PCR numérique d'une cellule unique et en association avec les sérogroupes des E. coli producteurs de shigatoxines et des principaux gènes de virulence), qui décrit la conception et les résultats de l'essai a été publiée dans le Journal of Clinical Microbiology.