Retour sur l'épidémie de listériose en Afrique du Sud associée à de la viande transformée ».

Voici un article, disponible intégralement et gratuitement, qui vient de paraître dans le New England Journal of Medicine à propos de « Épidémie de listériose en Afrique du Sud associée à de la viande transformée ».

Contexte

Une épidémie de listériose a été identifiée en Afrique du Sud en 2017. La source était inconnue.

Méthodes

Nous avons mené des investigations épidémiologiques, de traçabilité et environnementales et utilisé le séquençage du génome complet pour typer les isolats de Listeria monocytogenes. Un cas a été défini comme une infection à L. monocytogenes confirmée en laboratoire au cours de la période du 11 juin 2017 au 7 avril 2018.

Résultats

Au total, 937 cas ont été identifiés, dont 465 (50%) étaient associés à une grossesse; 406 des cas associés à la grossesse (87%) sont survenus chez des nouveau-nés. Sur les 937 cas, 229 (24%) sont survenus chez des patientes de 15 à 49 ans (à l'exclusion de celles qui étaient enceintes). Parmi les patientes chez qui le statut de virus d'immunodéficience humaine (VIH) était connu, 38% de celles ayant des cas associés à la grossesse (77 sur 204) et 46% des patientes restantes (97 sur 211) étaient infectées par le VIH.

Parmi 728 patients dont l'issue était connue, 193 (27%) sont décédés. Les isolats cliniques de 609 patients ont été séquencés et 567 (93%) ont été identifiés comme étant de séquence type 6 (ST6).

Dans une analyse cas-témoins, les patients infectés par ST6 étaient plus susceptibles d'avoir consomé de la saucisse polony (une viande transformée prête à consommer) que ceux présentant des infections non ST6 (odds ratio, 8,55; intervalle de confiance à 95%, 1,66 à 43,35).

La saucisse polony et les échantillons environnementaux ont également produit des isolats ST6, qui, avec les isolats des patients, appartenaient au même groupe par typage MLST avec pas plus de 4 différences alléliques ; ces résultats ont montré que la saucisse polony produite dans une seule installation était la source de l'épidémie. Un rappel de produits de viande transformés prêts à consommer de cette installation a été associé à une baisse rapide de l'incidence des infections à L. monocytogenes ST6.

Conclusions

Cette investigation a montré que dans un pays à revenu intermédiaire avec une prévalence élevée d'infection par le VIH, L. monocytogenes provoquait une maladie disproportionnée chez les filles et les femmes enceintes et les personnes infectées par le VIH. Le séquençage du génome complet a facilité la détection de l'épidémie et a guidé les recherches de traçabilité qui ont conduit à l'identification de la source.