mercredi 22 janvier 2020

Des chercheurs constatent que la propagation de bactéries d'origine alimentaire dans les produits de la mer est probablement affectée par le commerce


« Des chercheurs constatent que la propagation de bactéries d'origine alimentaire dans les produits de la mer est probablement affectée par le commerce », source Food Safety News.

Une étude du Centers for Disease Control and Prevention a révélé que le commerce international des coquillages pourrait être impliqué dans la dispersion des populations de Vibrio parahaemolyticus aux États-Unis et en Espagne.

L'étude a révélé que les conditions météorologiques extrêmes, telles que les conditions El Niño au Pérou, offrent des conditions idéales pour la prolifération de Vibrio parahaemolyticus, Vibrio alginolyticus et Vibrio vulnificus.

Le CDC rapporte que par rapport à d'autres maladies d'origine alimentaire majeures, les infections à Vibrio parahaemolyticus ont augmenté régulièrement. Vibrio parahaemolyticus est la principale cause d'infections bactériennes liées aux produits de la mer dans le monde. Le CDC estime que l'incidence annuelle moyenne de toutes les infections à Vibrio a augmenté de 54% au cours de la période 2006-2017. Aux États-Unis, Vibrio parahaemolyticus serait responsable d'environ 35 000 cas d’infection humaine chaque année et est la principale cause de cas d'infection d'origine alimentaire en Chine depuis les années 1990.

La transition de la maladie de V. parahaemolyticus d'un pathogène régional à un pathogène mondial est liée à l'émergence d'isolats à potentiel épidémique.

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Processus d'étude et résultats:
Propagation transcontinentale de Vibrio parahaemolyticus séquence type 36, Amérique du Nord, Pérou et Espagne, 1985-2016. La chronologie a été estimée en utilisant BEAST (Bayesian evolutionary analysis by sampling trees). Les années sur la carte indiquent les dates présumées d'arrivée de la séquence de V. parahaemolyticus de type 36 dans ce pays. Old Pacific Northwest est la population ancestrale (dernière souche identifiée en 2002) du complexe de la lignée Pacifique Nord-Ouest, qui comprend également la lignée moderne (c'est-à-dire actuellement en circulation) de Pacifique Nord-Ouest, la lignée Pacifique Nord-Ouest 2, la lignée Atlantique Nord-Est et l'Amérique du Sud-groupe Europe de l'Ouest.

Le CDC a effectué une analyse phylogénétique à l'échelle du génome d'une collection mondiale de 111 isolats de séquence type 36 obtenus au cours des 30 dernières années aux États-Unis (côtes ouest et est), Canada, Espagne et Pérou.

Les résultats ont indiqué que les isolats du Pérou étaient de 2 variantes génétiques différentes: 5 groupées avec la lignée moderne (c'est-à-dire actuellement en circulation) du Pacifique Nord-Ouest et 2 groupées dans un groupe distinct comprenant des isolats de l'épidémie de 2012 en Espagne.

L'identification de la séquence type 36 au Pérou fournit des preuves supplémentaires de la dynamique extraordinaire des infections à Vibrio dans cette région.

Depuis l'émergence du choléra en 1991 et la mise en place subséquente d'un système de surveillance active des maladies à Vibrio au Pérou, plusieurs cas d'émergence de clones épidémiques majeurs de V. parahaemolyticus ont été signalés dans le pays.

Bien que les sources et les voies d'introduction de ces clones étrangers restent encore indéterminées, un nombre croissant de preuves a lié la dynamique épidémique et la propagation des maladies dans cette région particulière de l'Amérique du Sud à El Niño.

Au cours des 30 dernières années, l'émergence de cas au Pérou associés à de nouveaux clones de Vibrio a été fortement influencée par l'apparition des conditions El Niño, qui a également façonné l'étendue et la gravité des épidémies.

L'arrivée de conditions météorologiques extraordinaires provoquées par El Niño (c'est-à-dire une combinaison de fortes pluies et de vagues de chaleur) fournit les conditions idéales pour la prolifération de Vibrio spp. dans l'environnement.

Ces circonstances, ainsi que la perturbation des infrastructures sanitaires provoquée par les inondations et les glissements de terrain, peuvent contribuer à créer les conditions parfaites pour l'émergence explosive des maladies de Vibrio.

Malgré les preuves reliant l'épidémiologie de Vibrio au Pérou à El Niño, on sait peu de choses sur les mécanismes de dispersion mondiale et l'introduction de clones épidémiques étrangers dans la région. L'eau de ballast des cargos et des vagues de chaleur marines a été associée à certains cas d'émergence de maladies ailleurs.

Un autre mécanisme qui pourrait être impliqué dans la dispersion des populations de V. parahaemolyticus est le commerce international des coquillages, qui a été suggéré pour faciliter l'introduction de la séquence type 36 aux États-Unis et en Espagne.

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Conclusions de l'étude:
L'étude a signalé l'expansion transcontinentale de la séquence type 36 de V. parahaemolyticus en Amérique du Sud.

La présence de la séquence type 36 dans des contextes cliniques et environnementaux au Pérou souligne le potentiel épidémique exceptionnel du complexe Pacifique Nord-Ouest et de V. parahaemolyticus en tant que pathogène humain.

La persistance et la présence à long terme d'isolats environnementaux suggèrent l'établissement réussi de la séquence type 36 dans des réservoirs environnementaux.

La capacité de dispersion de la séquence type 36 intercontinentale, ainsi que sa nature hautement pathogène, font de cette population de Vibrio un problème de santé publique majeur.

Le Pérou a montré que la mise en œuvre d'une surveillance systématique des espèces de Vibrio peut faciliter la détection de souches épidémiques transnationales émergentes.

Cette stratégie peut jouer un rôle crucial dans des conditions climatiques exceptionelles où le risque accru de foyers de cas épdémiques est probable.

L’étude peut être retrouvée ici.

L’étude a été financée par le Natural Environment Research Council.

Plus d’informations sur les vibrioses, ses causes, prévention et symptomes peuvent être retrouvées ici.

A noter la mise à jour de décembre 2019 d ela fiche de danger biologique transmissible par les aliments de l’Anses, Vibrions entéropathogènes: Vibrio parahaemolyticus, Vibrio cholerae non-O1/ non-O139 et Vibrio vulnificus.

Enfin, on lira Vibrio impliqués en pathologie humaine: une étude de leur répartition dans des produits de la mer consommés en France, étude publiée dans le Bulletin épidémiologique, santé animale et alimentation n°68/Spécial Vigilance sur la chaîne alimentaire de mai 2015.

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