Les infections à Campylobacter et E. coli grimpent en Nouvelle-Zélande et le lait cru est cité

« Les infections à Campylobacter et E. coli grimpent en Nouvelle-Zélande et le lait cru est cité », source article de Joe Whitworth paru le 4 janvier 2020 dans Food Safety News.

Les infections à Campylobacter, Yersinia, E. coli et Listeria ont toutes augmenté tandis que Salmonella a diminué, selon le rapport 2018 sur les maladies infectieuses d'origine alimentaire en Nouvelle-Zélande.

Campylobacter est resté le principal pathogène d'origine alimentaire. Le pays a un objectif de performance pour réduire les cas de campylobactériose d'origine alimentaire de 10 pour cent de 88,4 à 79,6 pour 100 000 habitants d'ici la fin de 2020. L'incidence estimée en 2018 était de 78,3 pour 100 000 habitants

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New Zealand Food Safety (NZFS) fait partie du Ministère des industries primaires (MPI) et dirige le système de sécurité des aliments du pays. EpiSurv est le système de surveillance des maladies à déclaration obligatoire du pays.

Le passage aux tests de diagnostic indépendants de la culture (CIDT) utilisant la méthodologie de la PCR pour détecter les pathogènes par les laboratoires médicaux en Nouvelle-Zélande s'est poursuivi en 2018.

Les taux de notification d'infection à E. coli producteurs de shigatoxines (STEC), de shigellose et de cryptosporidiose ont continué à augmenter fortement à mesure que de plus en plus de laboratoires mettent en œuvre les CIDT, malgré aucune preuve que les sources d'origine alimentaire augmentent.

Les taux de campylobactériose et de salmonellose restent constants, ce qui peut refléter un équilibre entre une augmentation possible de la sensibilité de détection à l'aide des CIDT et une réduction des maladies d'origine alimentaire alors que le NZFS et l'industrie mettent en œuvre des mesures de maîtrise des pathogènes, selon le rapport.

Quarante-trois éclosions d'origine alimentaire avec 580 cas d’infection se sont produites en 2018, le pathogène n'ayant pas été identifié dans 14 cas. Huit étaient causés par des norovirus, sept par Campylobacter, cinq par Salmonella, trois par le virus de l'hépatite A, deux par l'histamine et un chacun par Clostridium perfringens, Shigella, Staphylococcus aureus et Yersinia.

Lien avec le lait cru dans les éclosions à Campylobacter

En 2018, 6 957 cas de campylobactériose et aucun décès n'ont été signalés à EpiSurv, mais 780 personnes ont dû être hospitalisées. Au total, 6 482 cas d’infections à Campylobacter ont été enregistrées en 2017.

Il a été estimé après consultation d'experts que 63,8% de l'incidence de la campylobactériose est due à une transmission d'origine alimentaire, ce qui signifie 3 826 cas d’infections l'année dernière, et 75,4% de celles-ci sont dues aux volailles.

Le nombre de notifications a varié de 395 en avril à 918 en décembre. Les taux de notification par âge les plus élevés concernaient les enfants de 1 à 4 ans et les nourrissons de moins de 1 an. Les taux d'hospitalisation les plus élevés concernaient le groupe des 70 ans et plus et les nourrissons de moins de 1 an.

Sept des 16 foyers de cas provoqués par Campylobacter spp. et 24 des 92 cas associés ont été déclarés d'origine alimentaire. Le lait cru a été confirmé comme le véhicule d'infection dans une éclosion et suspecté dans trois autres, tandis que des rillettes de canard étaient impliquées dans l'autre éclosion.

De 2009 à 2018, à l'exception de 2014, le nombre d'épidémies d'origine alimentaire a oscillé entre quatre et 16 chaque année, avec entre 19 et 77 cas associés à une éclosion.

Légère baisse de Salmonella

En 2018, 1 100 cas de salmonellose et aucun décès n'ont été signalés à EpiSurv, mais 227 personnes ont dû être hospitalisées. Au total, 1 127 cas d’infection à Salmonella ont été enregistrées en 2017.

Les experts ont estimé que 417 cas de salmonellose étaient dues à une transmission d'origine alimentaire, dont 19 pour cent étaient dues aux volailles.

Le nombre de notifications a varié de 63 en juillet à 139 en août. Le taux de notifications était plus élevé pour les hommes que pour les femmes, mais les taux d'hospitalisation étaient similaires pour les deux sexes. Les taux de notification et d'hospitalisation étaient les plus élevés pour les nourrissons de moins d'un an.

Cinq des 14 éclosions à Salmonella avec 17 cas ont été classées comme d'origine alimentaire. Salmonella Bovismorbificans était liée à une épidémie causée par du poulet vendu en supermarché insuffisamment cuit et Salmonella Weltevreden lié à une épidémie impliquant du concombre de mer cru des Samoa. Une éclosion à Salmonella Typhimurium phage type 195 peut avoir été causée par du jambon cuit vendu en supermarché.

Le nombre d'épidémies d'origine alimentaire entre 2009 et 2018 variait de trois en 2015 à 12 en 2016 et les cas associés variaient entre 15 en 2017 et 104 en 2012.

Salmonella Typhimurium et Salmonella Enteritidis étaient les sérotypes les plus courants. Les autres sérotypes communs étaient Bovismorbificans, Brandebourg, Saintpaul et Stanley avec une augmentation annuelle pour Bovismorbificans depuis 2015.

Augmentation importante des STEC mais pas d’éclosions d'origine alimentaire

En 2018, 925 cas d'infection à STEC, 41 hospitalisations et deux décès ont été signalés à EpiSurv, contre 547 cas en 2017.

Les experts ont estimé que 29,9% de l'incidence du STEC O157 et 34% de l'incidence non-O157 sont dus à la transmission d'origine alimentaire. La consultation d'experts a également estimé que 30 pour cent de cela était dû à de la viande rouge.

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Il y a eu une forte augmentation des notifications à STEC par rapport aux années précédentes, poursuivant une tendance à partir de 2015. Le taux de notification en 2018 était environ deux fois plus élevé que la moyenne triennale précédente. Aucune des 15 éclosions avec 57 cas n'a été classée comme d'origine alimentaire.

Le nombre de notifications a varié de 42 en juin à 122 en février. Les taux de notification étaient légèrement plus élevés pour les femmes que pour les hommes, mais les hospitalisations étaient légèrement plus élevées pour les hommes.

Le taux de notification des infections à STEC était le plus élevé pour le groupe d'âge de moins d'un an et le groupe d'âge de 1 à 4 ans. Le nombre d'hospitalisations était le plus élevé dans le groupe des 70 ans et plus et variait entre zéro et six dans tous les autres groupes d'âge.

Le nombre d'épidémies d'origine alimentaire à STEC entre 2009 et 2018 variait de un à quatre, sans aucune éclosion pendant cinq ans sur les 10 années. Les cas associés aux flambées ont varié sur la même période avec des pics en 2014 à 15 et 2017 avec 157 cas.

Un total de 632 cas infectés par STEC ont été signalés. Parmi ceux-ci, 194 isolats étaient E. coli O157:H7, 376 non-O157 et pour 62 isolats, le sérotype n'a pas été identifié. Le pourcentage de cas à STEC non-O157 a augmenté depuis 2014, probablement en raison de changements dans les méthodes de laboratoire et du dépistage de tous les échantillons fécaux soumis pour une infection à STEC, selon le rapport.

Trente cas de listériose avec deux décès ont été signalés contre 21 cas d’infection en 2017. Tous les patients ont été hospitalisés mais il n'y a pas eu d'éclosion à Listeria. Entre 1998 et 2018, le nombre de notifications a oscillé entre 17 en 1998 et 37 en 2016.

Une consultation d'experts a estimé que 25 des 30 cas d’infection étaient dues à une transmission d'origine alimentaire et 55 pour cent étaient dues à la consommation de viandes prêtes à consommer.

Les taux de listériose étaient les plus élevés dans le groupe d'âge de plus de 70 ans pour les notifications et les hospitalisations. Le nombre de notifications était similaire pour les femmes et les hommes.

Norovirus, Yersinia et Shigella

Huit des 171 épidémies à norovirus et 362 des 4 280 cas associés à une épidémie étaient d'origine alimentaire. Des sandwichs aux œufs servis dans un camp étaient la source présumée d'une épidémie.

Entre 2009 et 2018, le nombre d'épidémies à norovirus d'origine alimentaire a varié de huit en 2018 à 30 en 2009 et les cas associés ont varié de 177 en 2013 à 552 en 2012.

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En 2018, 1 202 cas de yersiniose et aucun décès ont été signalés à EpiSurv, mais 152 personnes ont dû être hospitalisées. En 2017, 917 cas d’infection à Yersinia ont été enregistrés. Les experts ont estimé que 718 des 1 202 cas étaient dus à une transmission d'origine alimentaire et 70% étaient dus à la consommation de porc.

Une éclosion impliquant deux personnes était liée à la viande de porc. Entre 2009 et 2018, il y a eu trois foyers ou moins chaque année avec des cas associés allant de deux à 232 en 2014.

Une éclosion de Shigella avec trois cas d’infection serait d'origine alimentaire. Le véhicule alimentaire était inconnu mais suspecté d'être mangé à l'étranger. Le nombre d'épidémies de shigellose d'origine alimentaire variait entre zéro et cinq de 2009 à 2018, avec deux et 39 cas associés.

Une éclosion à Staphylococcus aureus d'origine alimentaire a été signalée avec neuf cas. La source alimentaire était inconnue mais elle provenait d'un restaurant, d'un café ou d'une boulangerie. Le nombre d'épidémies entre 2009 et 2018 variait de zéro à deux avec entre deux et 14 cas.

Clostridium perfringens, virus de l’hépatite A et intoxication aux poissons

Il y a eu une éclosion à Clostridium perfringens impliquant 21 personnes causée par un plat de viande de porc avec du riz et des légumes préparés à la maison. Entre 2009 et 2018, le nombre d'épidémies d'origine alimentaire a varié de une en 2016 et 2018 à neuf en 2013. La plupart des infections sont survenues en 2013 avec 208 cas.

Trois éclosions causées par le virus de l'hépatite A avec huit cas ont été associées à une source alimentaire. La source suspectée d'infection était des crustacés pour une éclosion et inconnue pour les deux autres incidents. Les éclosions liées au virus de l’hépatite A d'origine alimentaire sont rares, avec seulement sept cas signalés de 2009 à 2018.

Neuf cas d'empoisonnement à l'histamine (syndrome scombroïde) ont été signalés en 2018. Deux flambées ont concerné cinq cas, dont deux ont dû être hospitalisés. Le thon a été suspecté dans un foyer. Entre 2009 et 2018, le nombre d'épidémies d'intoxication liées au poisson par l’histamine variait chaque année de un à quatre, sauf en 2015, où il n’y en a pas eu.

Trois cas d'intoxication par des toxines de coqillages, mais aucun décès n'a été signalé, bien que deux cas aient dû être hospitalisés. Le type de toxine n'a été spécifié pour tous les cas. Tous les trois étaient des adultes âgés de 20 à 49 ans et avaient mangé des coquillages collectés à des fins récréatives. Deux étaient des hommes et une femme. Deux étaient d'origine ethnique maorie et un était européen ou autre.