Des indicateurs à propos de la viande de poulet montrent sur de faibles nombres de Campylobacter en Lettonie

« Des indicateurs à propos de la viande de poulet montrent sur de faibles nombres de Campylobacter en Lettonie », source Food Safety News.

Selon une étude, le faible taux de contamination de la viande de poulet en Lettonie pourrait expliquer en partie le nombre plus faible d’infections à Campylobacter dans le pays.

Des chercheurs ont analysé les données de surveillance microbiologique et de résistance aux antimicrobiens (AMR) de Campylobacter en 2008 et de 2014 à 2016. Les données concernant les poulets, la volaille, les porcs, les veaux et l'homme ont été utilisées pour déterminer la prévalence.

La Lettonie a l'un des taux de campylobactériose les plus bas de l'Union européenne (UE) avec 4,6 cas pour 100 000 habitants en 2016, mais il est probable que la plupart des infections ne sont pas signalées. La prévalence de Campylobacter dans les autres pays baltes est de 22,6 et 42,4 cas pour 100 000 habitants en Estonie et en Lituanie.

La viande fraîche contaminée, en particulier la volaille, en raison de sa consommation élevée et de ses produits laitiers, constitue la principale source d’infection humaine.

Inférieure à la moyenne de l'UE

La prévalence de Campylobacter était de 50,2% chez les poulets, avec Campylobacter jejuni comme espèce prédominante. La proportion de cas positifs de viande de poulet réfrigérée était inférieure à la moyenne de l'UE en 2016, sur la base de données provenant de 14 pays.

Des chercheurs ont collecté des données sur les deux mêmes abattoirs de poulets en 2008, 2014 et 2016. Ils ont trouvé la prévalence la plus faible en 2008 et la plus élevée en 2014, suggérant qu'il n'y a pas de tendance générale, mais divers facteurs peuvent affecter la contamination par Campylobacter dans les troupeaux de poulets.

Les données peuvent servir de point de départ à une étude plus approfondie de la population de poulets pour évaluer les facteurs contribuant à l'infection à Campylobacter, selon l'étude publiée dans la revue Eurosurveillance.

La prévalence de Campylobacter était de 83,3% chez le porc, de 16,1% chez le veau et de 5,3% chez l'homme. Chez le porc, Campylobacter coli était la principale espèce. La prévalence chez les animaux d’élevage est élevée, en particulier chez les porcs et les poulets, mais chez les volailles et l’homme, elle était inférieure à celle d’autres pays européens.

Des échantillons d'animaux et d'aliments ont été collectés et testés dans le cadre du programme national de surveillance de Campylobacter en Lettonie.

Entre 2008 et 2016, la présence de Campylobacter spp. a été analysée sur 1 303 échantillons, dont 434 ont été retrouvés positifs.

Pour les échantillons de poulets, 255 (50,6%) étaient positifs pour l'agent pathogène. Campylobacter jejuni a été détecté dans 95,7% de tous les isolats de Campylobacter, tandis que Campylobacter coli était présent dans certains échantillons en 2008.

Utilisation du WGS

La prévalence des échantillons de volaille prélevés en distribution était inférieure à celle des poulets sortis de l’abattoir: 12,9% contre 50,6% sur trois ans et seule la présence de Campylobacter jejuni a été détectée.

La prévalence la plus élevée concernait le porc, 114 des 127 isolats contenaient Campylobacter coli et 11 Campylobacter lanienae.

Les échantillons de selles humaines présentaient la prévalence la plus faible, à 5,3%. Parmi les 23 cas positifs, 22 contenaient Campylobacter jejuni.

L'analyse des données du séquençage du génome complet a été utilisée pour caractériser la diversité des populations de Campylobacter provenant de diverses sources et pour étudier la corrélation entre les sources et le génotype.

Les preuves par WGS (whole genome sequencing) peuvent être utilisées pour confirmer qu'une contamination systématique s'est produite dans la chaîne de production alimentaire.

« Nos résultats démontrent l’importance d’une surveillance rigoureuse de la contamination par Campylobacter dans les chaînes de fabrication alimentaire, en utilisant des procédures analytiques normalisées et un partage régulier des données entre au moins les pays voisins », ont dit les chercheurs.