Le Danemark touché par une épidémie à E. coli O157:H7 avec 10 cas

« Le Danemark touché par une épidémie à E. coli O157:H7 avec 10 cas », source article de Joe Whitworth paru le 18 juillet 2019 dans Food Safety News.

Des responsables danois investiguent sur une épidémie à E. coli qui a rendu malade 10 personnes.

Le Statens Serum Institut (SSI) signale qu’une éclosion à E. coli O157:H7 a débuté en mai et que la source de l'infection n'est pas encore connue.

Huit personnes ont eu une diarrhée sanglante, symptôme typique d'une infection par ce type de E. coli producteurs de shigatoxines (STEC). Six personnes ont été hospitalisées mais aucun cas n'a développé de syndrome hémolytique et urémique (SHU), un type d'insuffisance rénale associé à une infection à E. coli. Les personnes nécessitant une hospitalisation sont sorties de l'hôpital et aucun décès n'a été signalé.

Ceux qui sont malades vivent au Danemark, n’ont pas voyagé, ni partagé d’événements communs avant de tomber malades, principalement au cours des deux premières semaines de juin. Quatre personnes sont malades dans le Midtjylland, trois à Hovedstaden, deux à Syddanmark et une à Nordjylland.

La démographie des patients fournit des indices

Les patients sont six hommes et quatre femmes dont l'âge médian est 29 ans. La moitié d'entre eux ont entre 16 et 37 ans, et la gamme complète d’âge va de 8 à 63 ans. Les enquêteurs affirment que E. coli O157:H7 infecte souvent des personnes plus jeunes, souvent âgées de moins de cinq ans.

Laura Espenhain, épidémiologiste au Statens Serum Institut, a déclaré à Food Safety News que cela pourrait être un indice pour retrouver la source.

« Potentiellement, et nous prenons en compte le profil d’âge lorsque nous émettons une hypothèse sur la source. Pour l'instant, malheureusement, nous n'avons pas d'hypothèse claire », a-t-elle déclaré.

« Les derniers patients sont tombés malades dans les premières semaines de juin. Nous ne pouvons pas exclure que l'épidémie soit toujours en cours, car il s'écoule quelques semaines entre le moment où un patient fournit un prélèvement et le résultat du séquençage. »

« Le SSI a notifié au Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) et à d'autres pays par le biais du système d'information sur les épidémies (EPIS). Rien n'indique qu'une éclosion de la même souche soit en cours dans d'autres pays. »

Le SSI enquête sur l'épidémie en collaboration avec l'administration vétérinaire et alimentaire danoise (Fødevarestyrelsen) et l'Institut national de l'alimentation, Université technique du Danemark. Les agences investiguent également sur 23 personnes infectées par une souche rare de Salmonella, dont près de la moitié ont besoin d'être hospitalisées.

Epidémies passées et STEC au Danemark

Pour trouver ce qui a pu rendre les personnes malades par E. coli, des entretiens sont en cours avec eux ou avec leurs proches pour obtenir des informations sur les aliments pertinents, le contact avec les animaux et d'autres expositions.

La souche épidémique a le sérotype O157:H7 et code pour les gènes de la shigatoxine (Stx) 1a et Stx2a. Stx2a est plus souvent associé à une maladie grave et au SHU. Grâce au séquençage du génome complet a été découvert que les isolats de 10 cas étaient étroitement liés et du type de séquence 11.

Depuis 2014, le Danemark a connu environ 40 cas d’infections à STEC O157 chaque année, sur une plage allant de 33 à 51 cas.

La dernière épidémie à STEC O157:H7 au Danemark remonte à 2012, lorsque 13 cas ont été déclarés sur une période de six semaines.

Dans cette éclosion, les patients étaient plus jeunes, avec un âge médian de 14 ans et un intervalle de 3 à 68 ans par rapport à la nouvelle éclosion, et huit des 13 atteints ont eu un SHU. L'investigation sur l'éclosion de 2012 a mis en évidence de laviande bovine hachée, provenant probablement du même lot, comme cause de l'infection.

Le nombre de personnes infectées par STEC au Danemark a presque doublé, passant de 281 en 2014 à 495 en 2018, et la plus forte augmentation a été observée de 2017 à 2018. Les isolats de STEC doivent être soumis au SSI où ils ont été séquencés pour leur génome complet depuis 2014.

« Les diagnostics par PCR et davantage de patients potentiels examinés pour des STEC expliquent en partie ou en totalité cette augmentation, mais nous avons néanmoins lancé plusieurs activités pour mieux comprendre les voies de transmission, y compris des études scientifiques, parmi lesquelles une vaste étude cas-témoins des facteurs de risque des infections sporadiques », a déclaré Espenhain.