Synthèse de rapport 2018 sur les zoonoses en Europe : Les STEC à la troisième place et Listeria continue d'augmenter

Annonce : S’agissant de l’information à propos des rappels de produits alimentaires, pour le moment, il ne faut pas faire confiance à nos autorités sanitaires (Ministère de l’agriculture et DGCCRF). Ces deux entités ont fait et font toujours preuve d’une incroyable légèreté et d’un manque d’informations fiables vis-à-vis des consommateurs avec comme corollaire une absence de transparence en matière de sécurité des aliments.

Le blog vous a proposé différents articles sur le rapport de l’EFSA/ECDC sur les zoonoses 2018 en Europe,

• Surveillance et suivi des STEC dans l’UE avec un focus sur la France
• Surveillance et suivi de Listeria dans l’UE avec un focus sur la France
• Surveillance et suivi de Salmonella dans l’UE avec un focus sur la France
• Surveillance et suivi de Campylobacter dans l’UE avec un focus sur la France
• La résistible ascension des toxi-infections alimentaires collectives en France et dans l’UE en 2018

Rappelons que le tiercé dans l’ordre des pathogènes alimentaires dans l’UE en 2018 est Campylobacter, Salmonella et STEC …

Voici un article qui fait en quelque sorte une synthèse de ce rapport de l’EFSA/ECDC ...

« Les STEC grimpent au troisième rang tandis que Listeria continue d'augmenter en Europe », source article de Joe Whitworth paru le 16 décembre 2019 dans Food Safety News.

Le nombre d'infections à E. coli producteurs de shigatoxines en Europe a bondi l'année dernière tandis que la tendance à la hausse des cas de Listeria s'est poursuivie, selon un rapport annuel sur les zoonoses.

L'analyse de l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) et du Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) a également révélé une légère augmentation de Salmonella et de Campylobacter. Pour plus d'informations sur les épidémies d'origine alimentaire, cliquez ici pour la couverture de Food Safety News dans un article connexe.

E. coli producteurs de shigatoxines (STEC) est devenu la troisième cause la plus courante de maladie d'origine alimentaire remplaçant la yersiniose avec une augmentation de 37% en 2017.

L'ECDC et l'EFSA ont déclaré que cela peut s'expliquer en partie par l'utilisation croissante des nouvelles technologies de laboratoire, ce qui rend la détection des cas sporadiques plus facile.

Les zoonoses les plus fréquemment signalées étaient la campylobactériose et la salmonellose. La tendance de l'UE pour les cas confirmés de ces deux maladies est restée stable de 2014 à 2018. L'an dernier, la campylobactériose était en tête, comme elle l'a été depuis 2005, représentant près de 70% des cas.

La campylobactériose a causé l'hospitalisation de près de 21 000 personnes et 60 décès, plus de 16 500 personnes ont dû être hospitalisées et 119 sont décédées des suites de la salmonellose, les infections à STEC ont été responsables de 1 151 hospitalisations et 11 décès, la yersiniose de 519 hospitalisations et trois décès et 1 049 personnes ont dû être hospitalisées. et 229 sont décédés des suites d'une listériose.

Impact du critère d'hygiène des procédés pour Campylobacter

Le total des cas confirmés de campylobactériose était de 246 571 contre 246 194 en 2017. Les taux d'hospitalisation les plus élevés ont été enregistrés en Lettonie, en Pologne, en Roumanie et au Royaume-Uni.

Les principaux taux de notification par pays étaient la République tchèque, la Slovaquie, le Luxembourg et le Royaume-Uni. Les plus faibles se trouvaient en Bulgarie, à Chypre, en Grèce, en Lettonie, en Pologne, au Portugal et en Roumanie.

Parmi les 15 210 cas associés aux voyages avec un pays d'infection connu, la plupart provenaient d'Espagne, Grèce et France. La Thaïlande, la Turquie et le Maroc ont été le plus souvent signalés comme pays d'infection probable en dehors de l'UE. Les niveaux de contamination les plus élevés ont été observés dans la viande fraîche de poulets de chair, suivie de la viande fraîche de dindes.

L'Autriche, la République tchèque, l'Estonie, la France, la Hongrie, l'Irlande, l'Italie, la Lettonie, Malte, la Pologne, la Slovaquie, la Slovénie et l'Espagne ont connu des tendances à la hausse significatives entre 2009 et 2018, tandis que Chypre et les Pays-Bas ont signalé des tendances à la baisse au cours de cette période.

Dix pays ont déclaré des données collectées dans le cadre du critère d'hygiène des procédés pour Campylobacter en vigueur depuis janvier 2018, concernant la peau du cou provenant de carcasses de poulets de chair prises dans des abattoirs. La communication des résultats officiels des échantillons par les autorités devient obligatoire à partir de 2020.

Un échantillon sur cinq avec des résultats quantifiés dépassait 1 000 unités de formant colonies (UFC) par gramme. Sur les 3 746 échantillons de peau de cou provenant de carcasses de poulets de chair réfrigérées, 34,6% se sont révélés positifs. La Bulgarie, Chypre, le Danemark, l'Estonie, la France, la Pologne, la Roumanie et l'Espagne ont fourni des résultats quantifiés et 18,4% des 2 403 échantillons testés dépassaient 1 000 UFC/g.

La baisse de Salmonella se stabilise

Au total, 94 203 cas de salmonellose ont été signalés par 28 pays de l'UE en 2018 avec des infections confirmées à 91 857 contre 91 590 en 2017.

L'année dernière, les taux de notification les plus élevés ont été enregistrés par la Slovaquie et la République tchèque, tandis que les plus bas provenaient de Chypre, de la Grèce, de l'Italie et du Portugal.

La plupart des cas de salmonellose confirmés ont été acquis dans l'UE. Salmonella Enteritidis a augmenté de 2015 à 2018 dans les cas acquis au sein de l'UE. Parmi 8 047 cas liés aux voyages, la Thaïlande, l'Égypte et l'Inde étaient les destinations les plus fréquemment déclarées, l'Espagne et la Grèce occupant le premier rang au sein de l'UE.

Chypre, le Danemark, la Finlande, l'Allemagne, la Hongrie, l'Italie, la Lituanie et la Suède ont connu des tendances à la baisse de 2009 à 2018. Une augmentation a été observée en France, au Portugal, en Slovaquie et en Espagne de 2014 à 2018, mais l'augmentation en Espagne est due en partie à une meilleure surveillance . Les proportions les plus élevées de cas hospitalisés se trouvaient à Chypre, en Grèce, en Lituanie, en Pologne et au Royaume-Uni. Ce dernier pays a également signalé 57 décès.

Données par serovar

Comme les années précédentes, les trois sérotypes de Salmonella les plus courants étaient Enteritidis, Typhimurium et Typhimurium monophasique (1,4, [5],12:i:-), représentant près de 80% des cas acquis dans l'UE.

La proportion de ces sérotypes était la même qu'en 2017, ainsi que celle de Salmonella Infantis, qui était le quatrième plus courant. Le cinquième sérotype le plus courant, Newport, a augmenté de 18% par rapport à 2017. Salmonella Coeln a augmenté de 218,7% par rapport à 2016. Salmonella Braenderup est entrée dans le top 20 l'an dernier et a remplacé Kottbus.

La prévalence la plus élevée de prélèvements uniques positifs pour Salmonella provenant de contrôles officiels par les autorités était la viande de volaille et la viande hachée bovine et les préparations de viande bovine destinées à être cuites, quelle que soit l'espèce. La prévalence de Salmonella dans les ovoproduits était négligeable, selon les données de surveillance.

Sur 27 États membres déclarants, 16 ont atteint tous les objectifs de réduction de Salmonella pour la volaille, tandis que 11 ont échoué dans au moins un objectif. La prévalence dans le cheptel européen des sérotypes cibles de Salmonella chez les poules reproductrices, les poules pondeuses, les poulets de chair et les dindes d'engraissement a diminué ces dernières années mais a stagné chez les dindes reproductrices.

Pour l'Italie, les Pays-Bas, la Pologne et l'Espagne, la proportion de résultats positifs sur la base de contrôles officiels était nettement plus élevée que celle de l'autosurveillance des carcasses de porcs. Compte tenu de toutes les données de surveillance de Salmonella provenant des carcasses de porcs envoyées par 17 pays, la proportion d'échantillons individuels positifs pour Salmonella provenant de carcasses sur la base de contrôles officiels était de 2,69% de 28246 échantillons par rapport à celle basée sur l'autosurveillance à 1,57% de 93 633 prlèvements.

Des proportions significativement plus faibles de troupeaux de dindes et de poulets de chair positifs pour Salmonella ont été signalées dans les prélèvements effectués par les entreprises alimentaires dans le cadre de l'autosurveillance que par les autorités dans les contrôles officiels.

STEC passe au troisième rang

Les infections à E. coli producteurs de shigatoxines étaient la troisième zoonose la plus fréquemment signalée en Europe et ont fortement augmenté en 2018. L'an dernier, 8 314 cas d’infections à STEC et 8 161 cas confirmés ont été signalés, contre 5 958 en 2017.

L'Irlande, la Suède, Malte et le Danemark ont enregistré les taux de notification par pays les plus élevés. La Bulgarie, Chypre, la Grèce, la Lituanie, la Pologne et la Roumanie ont enregistré les taux les plus faibles. Les proportions les plus élevées de cas hospitalisés se trouvaient en Estonie, en Grèce, en Lettonie, en Italie, au Luxembourg, en Pologne et en Slovaquie.

La plupart des cas à STEC signalés étaient infectés dans l'UE. Parmi 1 027 cas associés aux voyages, la Turquie a été le plus souvent signalée comme pays probable d'infection, suivie de l'Égypte, de l'Espagne, du Maroc et de la Grèce.

De 2009 à 2018, une tendance à la hausse significative a été observée en Autriche, Danemark, Finlande, France, Irlande, Italie, Slovénie et Suède. Aucun pays n'a connu de tendance à la baisse au cours de cette période.

E. coli O157 et O26 augmentent

Le sérogroupe le plus commun était O157, représentant 34,5% des cas avec un sérogroupe connu. Sa proportion a diminué de 2012 à 2017 mais a augmenté de 29% en 2018. Le deuxième sérogroupe O26 le plus courant a augmenté de 32%. Ils représentaient plus de la moitié du total des cas confirmés avec des sérogroupes connus en 2018.

Ils ont été suivis par les sérogroupes O103, O91, O146, O145 et O128. Deux nouveaux sérogroupes (O5 et O174) ont été ajoutés et O63 a été retiré du top 20 en 2018.

Un total de 411 cas de syndrome hémolytique et urémique (SHU) ont été enregistrés, ce qui était à peu près le même qu'en 2017. La plupart des patients avec un SHU étaient dans les groupes d'âge les plus jeunes de 0 à 4 ans (265 cas) à 5 à 14 ans (82 cas). Le top des sérogroupes étaient O26, O157, O145, O80 et O111.

Les catégories d'aliments les plus contaminées étaient d'origine animale. La viande des petits ruminants, d’animaux sauvages et d’élevage, présentait les valeurs les plus élevées (17,8% pour le cerf et 10,9% pour la viande ovine et caprine).

Le lait cru de vache était la deuxième catégorie la plus contaminée par des STEC avec moins de 6 pour cent des échantillons positifs. La viande bovine fraîche et les produits laitiers autres que le lait cru ont affiché des taux de contamination de 3,4% et 0,7%.

Listeria continue d'augmenter

Les cas de listériose confirmés ont encore augmenté en 2018, bien que Listeria dépasse rarement la limite de sécurité alimentaire de l'UE testée dans les aliments prêts à consommer.

La listériose était la zoonose la plus grave avec le taux d'hospitalisation et de létalité le plus élevé. Un cas sur six confirmé a été mortel. La listériose invasive à long terme a montré une tendance à la hausse significative depuis le début de la surveillance de l'UE en 2008.

En 2018, 28 pays ont signalé 2 549 cas de listériose invasifs confirmés, contre 2 479 en 2017. Les infections à Listeria concernaient principalement le groupe d'âge de plus de 64 ans et en particulier celui de plus de 84 ans.

Les taux de notification les plus élevés concernaient l'Estonie, la Finlande, la Suède et le Danemark. Les plus faibles ont été signalés par la Bulgarie, la Croatie, Chypre et la Roumanie.

La Belgique, l'Estonie, la Finlande, la France, l'Allemagne, la Grèce, la Hongrie, l'Irlande, l'Italie, les Pays-Bas, la Pologne, la Roumanie, la Slovénie et l'Espagne ont connu une tendance à la hausse significative de cas de listériose confirmée depuis 2009. Aucun pays n'a connu de tendance à la baisse significative entre 2009 et 2018. La Pologne a signalé le plus de cas mortels avec 56, suivie de la France avec 42 décès.

L’occurrence de Listeria monocytogenes variait selon la catégorie d'aliments prêt à consommer et variait de 0,09 pour cent pour les fromages à pâte dure à base de lait pasteurisé à 3,1 pour cent pour la viande bovine pête à consommer

L'EFSA a été invitée par la Commission européenne à émettre un avis scientifique sur le risque pour la santé publique posé par Listeria monocytogenes, et peut-être d'autres pathogènes, qui peuvent contaminer les fruits, les légumes et les herbes qui sont transformés avant d'être mis sur le marché congelés. Les travaux devraient être adoptés par le groupe scientifique de l’EFSA sur les dangers biologiques en mars 2020.

Yersinia, Brucella et Trichinella

La yersiniose était la quatrième infection la plus fréquemment signalée avec une tendance stable de 2014 à 2018.

En 2018, 370 cas de brucellose, dont 358 confirmés, ont été notifiés contre 378 en 2017. Un décès a été enregistré par l'Espagne en 2018.

La Grèce, l'Italie, le Portugal et l'Espagne ne sont pas officiellement indemnes de brucellose chez les bovins, les ovins ou les caprins et représentaient 69,8% de tous les cas confirmés en 2018. L'Italie, le Portugal et l'Espagne ont connu une tendance à la baisse de 2009 à 2018. L'exposition d'origine alimentaire est normalement limitée aux personnes consommant du lait non pasteurisé, des produits laitiers ou de la viande insuffisamment cuite en provenance de pays où la brucellose chez les animaux est endémique.

Parmi 58 cas liés aux voyages, les destinations les plus courantes en dehors de l'UE étaient la Turquie, l'Iraq, l'Albanie et la Bosnie-Herzégovine. La Roumanie et la Bulgarie étaient les plus courantes pour les infections liées aux voyages au sein de l'UE.

En 2018, 85 cas de trichinellose, dont 66 confirmés, ont été signalés contre 168 en 2017. La Bulgarie a enregistré le taux de notification le plus élevé, suivie de la Roumanie. Les deux pays représentaient 83,3% de tous les cas confirmés au niveau de l'UE.

Quatre foyers ont été signalés en Bulgarie, avec 50 personnes malades malgré l'absence de porcs domestiques signalés comme positifs pour l'infection à Trichinella. En revanche, la Croatie n'a signalé aucun cas humain, alors que 134 porcs domestiques se sont révélés positifs. La Roumanie a dénombré le plus de porcs domestiques positifs, suivie par la Croatie, la Pologne, l'Italie, l'Espagne et la France.

Environ 200 millions de porcs ont été testés pour Trichinella en 2018, sur environ 246 millions de porcs élevés dans l'UE, avec seulement 322 animaux positifs, environ 1,3 par million de porcs élevés.